DEK (gen) - DEK (gene)
Člověk DEK gen kóduje DEK protein.[5][6]
Funkce
Tento gen kóduje protein s jednou doménou SAP. Protein se váže na cruciform a superhelical DNA a indukuje pozitivní supercoily do uzavřené kruhové DNA. Podílí se také na výběru místa sestřihu během mRNA zpracovává se. Chromozomální aberace zahrnující tuto oblast zvyšují expresi tohoto genu a přítomnost protilátek proti tomuto proteinu jsou spojeny s různými chorobami.[6]
Interakce
DEK interaguje s TFAP2A.[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124795 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021377 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ von Lindern M, Fornerod M, van Baal S, Jaegle M, de Wit T, Buijs A, Grosveld G (duben 1992). „Translokace (6; 9), spojená se specifickým podtypem akutní myeloidní leukémie, má za následek fúzi dvou genů, dek a can, a expresi chimérické, leukemicky specifické dek-can mRNA.“. Mol. Buňka. Biol. 12 (4): 1687–97. doi:10.1128 / mcb.12.4.1687. PMC 369612. PMID 1549122.
- ^ A b „Entrez Gene: DEK DEK onkogen (DNA binding)“.
- ^ Campillos M, García MA, Valdivieso F, Vázquez J (březen 2003). „Aktivace transkripce pomocí AP-2alfa je modulována onkogenem DEK“. Nucleic Acids Res. 31 (5): 1571–5. doi:10.1093 / nar / gkg247. PMC 149840. PMID 12595566.
Další čtení
- von Lindern M, Fornerod M, Soekarman N, van Baal S, Jaegle M, Hagemeijer A, Bootsma D, Grosveld G (1992). „Translokace t (6; 9) u akutní nelymfocytární leukémie vede k tvorbě fúzního genu DEK-CAN“. Baillièrova klinická hematologie. 5 (4): 857–79. doi:10.1016 / s0950-3536 (11) 80049-1. PMID 1308167.
- Waldmann T, Scholten I, Kappes F, Hu HG, Knippers R (2004). "DEK protein - hojná a všudypřítomná složka savčího chromatinu". Gen. 343 (1): 1–9. doi:10.1016 / j.gene.2004.08.029. PMID 15563827.
- Denisenko ON, O'Neill B, Ostrowski J, Van Seuningen I, Bomsztyk K (1996). „Zik1, transkripční represor, který interaguje s heterogenním proteinem K nukleární ribonukleoproteinové částice“. J. Biol. Chem. 271 (44): 27701–6. doi:10.1074 / jbc.271.44.27701. PMID 8910362.
- Fu GK, Grosveld G, Markovitz DM (1997). „DEK, autoantigen podílející se na chromozomální translokaci u akutní myeloidní leukémie, se váže na zesilovač HIV-2“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (5): 1811–5. Bibcode:1997PNAS ... 94.1811F. doi:10.1073 / pnas.94.5.1811. PMC 19999. PMID 9050861.
- Murray KJ, Szer W, Grom AA, Donnelly P, Levinson JE, Giannini EH, Glass DN, Szer IS (1997). "Protilátky proti 45 kDa DEK jadernému antigenu u pauciartikulárního nástupu juvenilní revmatoidní artritidy a iridocyklitidy: selektivní asociace s MHC genem". J. Rheumatol. 24 (3): 560–7. PMID 9058666.
- Forero L, Zwirner NW, Fink CW, Fernández-Viña MA, Stastny P (1998). „Juvenilní artritida, HLA-A2 a vazba DEK onkogenových peptidů“. Hučení. Immunol. 59 (7): 443–50. doi:10.1016 / S0198-8859 (98) 00034-2. PMID 9684994.
- Dong X, Michelis MA, Wang J, Bose R, DeLange T, Reeves WH (1998). "Autoprotilátky proti DEK onkoproteinu u pacienta se systémovým lupus erythematodes a sarkoidózou". Artritida Rheum. 41 (8): 1505–10. doi:10.1002 / 1529-0131 (199808) 41: 8 <1505 :: AID-ART23> 3.0.CO; 2-N. PMID 9704652.
- Wichmann I, Garcia-Lozano JR, Respaldiza N, Gonzalez-Escribano MF, Nuñez-Roldan A (1999). „Autoprotilátky proti transkripčním regulačním proteinům DEK a ALY u pacienta se systémovým lupus erythematodes“. Hučení. Immunol. 60 (1): 57–62. doi:10.1016 / S0198-8859 (98) 00085-8. PMID 9952027.
- Alexiadis V, Waldmann T, Andersen J, Mann M, Knippers R, Gruss C (2000). „Protein kódovaný protoonkogenem DEK mění topologii chromatinu a snižuje účinnost replikace DNA způsobem specifickým pro chromatin“. Genes Dev. 14 (11): 1308–12. PMC 316669. PMID 10837023.
- McGarvey T, Rosonina E, McCracken S, Li Q, Arnaout R, Mientjes E, Nickerson JA, Awrey D, Greenblatt J, Grosveld G, Blencowe BJ (2000). „Akutní protein spojený s akutní myeloidní leukémií, DEK, tvoří interakci závislou na sestřihu s komplexy exon-produkt“. J. Cell Biol. 150 (2): 309–20. doi:10.1083 / jcb.150.2.309. PMC 2180225. PMID 10908574.
- Grottke C, Mantwill K, Dietel M, Schadendorf D, Lage H (2000). "Identifikace rozdílně exprimovaných genů v buňkách lidského melanomu se získanou rezistencí na různé antineoplastické léky". Int. J. Cancer. 88 (4): 535–46. doi:10.1002 / 1097-0215 (20001115) 88: 4 <535 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-V. PMID 11058868.
- Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2000). „Spliceosom ukládá více proteinů 20–24 nukleotidů před mRNA exon-exonové spoje“. EMBO J.. 19 (24): 6860–9. doi:10.1093 / emboj / 19.24.6860. PMC 305905. PMID 11118221.
- Kappes F, Burger K, Baack M, Fackelmayer FO, Gruss C (2001). „Subcelulární lokalizace lidského protoonkogenního proteinu DEK“. J. Biol. Chem. 276 (28): 26317–23. doi:10,1074 / jbc.M100162200. PMID 11333257.
- Waldmann T, Eckerich C, Baack M, Gruss C (2002). „Všudypřítomný chromatinový protein DEK mění strukturu DNA zavedením pozitivních supercoilů“. J. Biol. Chem. 277 (28): 24988–94. doi:10,1074 / jbc.M204045200. PMID 11997399.
- Larramendy ML, Niini T, Elonen E, Nagy B, Ollila J, Vihinen M, Knuutila S (2002). „Nadměrná exprese fúzních genů asociovaných s translokací FGFRI, MYC, NPMI a DEK, ale absence translokací při akutní myeloidní leukémii. Analýza microarray“. Haematologica. 87 (6): 569–77. PMID 12031912.
- Hollenbach AD, McPherson CJ, Mientjes EJ, Iyengar R, Grosveld G (2002). „Daxx a histon-deacetyláza II se asociují s chromatinem prostřednictvím interakce s jádrovými histony a proteinem Dek souvisejícím s chromatinem.“ J. Cell Sci. 115 (Pt 16): 3319–30. PMID 12140263.
- Krithivas A, Fujimuro M, Weidner M, Young DB, Hayward SD (2002). „Proteinové interakce zaměřené na latentní nukleární antigen herpesviru spojeného s Kaposiho sarkomem na buněčné chromozomy“. J. Virol. 76 (22): 11596–604. doi:10.1128 / JVI.76.22.11596-11604.2002. PMC 136775. PMID 12388720.
externí odkazy
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro Human Protein DEK
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |