Sulfolobales - Sulfolobales
Sulfolobales | |
---|---|
![]() | |
Elektronový mikrofotografie Sulfolobus infikován Sulfolobus virus STSV1. Pruh = 1 μm. | |
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | Sulfolobales Stetter, 1989 |
Rodina | |
v taxonomie, Sulfolobales jsou objednat z Thermoprotei.[1]
Přenos DNA
Vystavení Sulfolobus solfataricus na látky poškozující DNA UV záření, bleomycin nebo mitomycin C. indukuje buněčnou agregaci.[2] Jiné fyzikální stresory, jako je pH nebo teplotní posun, neindukují agregaci, což naznačuje, že indukce agregace je způsobena konkrétně poškozením DNA. Ajon a kol.[3] ukázaly, že UV-indukovaná buněčná agregace zprostředkovává výměnu chromozomálních markerů s vysokou frekvencí. Míra rekombinace překročila míru neindukovaných kultur až o tři řády. Frols a kol.[2][4] a Ajon a kol.[3] předpokládal, že proces přenosu DNA indukovatelný UV zářením a následný homologní rekombinace Oprava představuje důležitý mechanismus k udržení integrity chromozomu. Tato odpověď může být primitivní formou sexuální interakce, podobně jako studovanější bakteriální transformace, která je také spojena s přenosem DNA mezi buňkami, což vede k homologní rekombinační opravě poškození DNA.[Citace je zapotřebí ] U jiného příbuzného druhu Sulfolobus acidocaldariusUV záření také zvyšuje frekvenci rekombinace v důsledku genetické výměny.[5]
The UPS operon
![]() | Tato sekce chybí informace o ilustraci UPS organizace (s UniProt ID).Květen 2020) ( |
The UPS (UV-indukovaný pilus) operon Sulfolobus druh je vysoce indukován UV zářením. The pili kódované tímto operonem se používají k podpoře buněčné agregace, která je nezbytná pro následnou výměnu DNA mezi buňkami, což vede k homologní rekombinace.[6]
Studie Sulfolobales acidocaldarius ups operon ukázal, že jeden z genů pod operonem, saci-1497, kóduje endonukleáza III, který škrábe DNA poškozenou UV zářením; a další gen operonu, saci-1500, kóduje a RecQ-like helikáza který je schopen uvolnit homologní rekombinační meziprodukty jako např Křižovatky Holliday.[6] Bylo navrženo, aby Saci-1497 a Saci-1500 fungovaly v homologním rekombinačním mechanismu opravy DNA, který používá přenesenou DNA jako templát.[6] Proto se předpokládá, že UPS Systém v kombinaci s homologní rekombinací poskytuje odpověď na poškození DNA, která se zachrání Sulfolobales před hrozbami poškozujícími DNA.[6]
Reference
- ^ Viz NCBI webová stránka na Sulfolobales. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.
- ^ A b Fröls S, Ajon M, Wagner M, Teichmann D, Zolghadr B, Folea M, Boekema EJ, Driessen AJ, Schleper C, Albers SV (2008). „UV-indukovatelná buněčná agregace hypertermofilního archaeonu Sulfolobus solfataricus je zprostředkována tvorbou pili“ (PDF). Mol. Microbiol. 70 (4): 938–52. doi:10.1111 / j.1365-2958.2008.06459.x. PMID 18990182.
- ^ A b Ajon M, Fröls S, van Wolferen M, Stoecker K, Teichmann D, Driessen AJ, Grogan DW, Albers SV, Schleper C (2011). „UV-indukovatelná výměna DNA v hyperthermophilic archaea zprostředkovaná pili typu IV“ (PDF). Mol. Microbiol. 82 (4): 807–17. doi:10.1111 / j.1365-2958.2011.07861.x. PMID 21999488.
- ^ Fröls S, White MF, Schleper C (2009). "Reakce na poškození UV zářením v modelu archaeon Sulfolobus solfataricus". Biochem. Soc. Trans. 37 (Pt 1): 36–41. doi:10.1042 / BST0370036. PMID 19143598.
- ^ Wood ER, Ghané F, Grogan DW (1997). „Genetické reakce termofilního archaeonu Sulfolobus acidocaldarius na UV záření krátkých vln“. J. Bacteriol. 179 (18): 5693–8. doi:10.1128 / jb.179.18.5693-5698.1997. PMC 179455. PMID 9294423.
- ^ A b C d van Wolferen M, Ma X, Albers SV (2015). „Proteiny zpracovávající DNA podílející se na zátěžové reakci sulfolobalů na UV záření“. J. Bacteriol. 197 (18): 2941–51. doi:10.1128 / JB.00344-15. PMC 4542170. PMID 26148716.
Další čtení
Vědecké časopisy
- Soudní komise Mezinárodního výboru pro systematiku prokaryot (2005). „Názvoslovné typy řádů Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales a Verrucomicrobiales jsou rody Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus, Thermococcus, Termoproteus a Verrucomicrobium, resp. Názor 79 ". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 55 (Pt 1): 517–518. doi:10.1099 / ijs.0.63548-0. PMID 15653928.
- Driessen, Arnold; Yang, Nuan (8. ledna 2014). „Odstranění cdvB paralogních genů Sulfolobus acidocaldarius narušuje buněčné dělení“. Extremophiles. 18 (2): 331–339. doi:10.1007 / s00792-013-0618-5. PMID 24399085.
- Euzeby JP; Tindall BJ (2001). „Nomenklaturní typ objednávek: nutné opravy podle pravidel 15 a 21a Bakteriologického kodexu (revize z roku 1990) a označení vhodných nomenklaturních typů tříd a podtříd. Žádost o stanovisko“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2): 725–727. doi:10.1099/00207713-51-2-725. PMID 11321122.
- Cavalier-Smith, T (2002). „Neomuranský původ archebakterií, negibakteriální kořen univerzálního stromu a bakteriální megaklasifikace“. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 1): 7–76. doi:10.1099/00207713-52-1-7. PMID 11837318.
Vědecké knihy
- Reysenbach, A-L (2001). „Třída I. Třída Thermoprotei. Nov.“. V DR Boone; RW Castenholz (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria (2. vyd.). New York: Springer Verlag. p.169. ISBN 978-0-387-98771-2.
- Stetter, KO (1989). „Řád III. Sulfolobales ord. Nov. Čeleď Sulfolobaceae fam. Nov.“. V JT Staley; Poslanec Bryant; N Pfennig; JG Holt (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 3 (1. vyd.). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. str. 169.
Vědecké databáze
- PubMed reference pro Sulfolobales
- PubMed Central reference pro Sulfolobales
- Reference Google Scholar pro Sulfolobales