Seznam naváděcích míst pro dělení endonukleáz - List of homing endonuclease cutting sites

Legenda o nukleové báze
KódNukleotid zastoupeny
AAdenin (A)
CCytosin (C)
GGuanine (G)
TTymin (T)
NA, C, G nebo T
MA nebo C.
RA nebo G.
ŽA nebo T
YC nebo T
SC nebo G.
K.G nebo T
HA, C nebo T
BC, G nebo T.
PROTIA, C nebo G
DA, G nebo T

Naváděcí endonukleázy jsou zvláštním typem restrikční enzymy kódováno uživatelem introny nebo inteins. Působí na buňku DNA buňky, která je syntetizuje; abych byl přesný, naopak alela z gen které je zakódují.[1]

Další informace: Naváděcí endonukleáza.

Naváděcí endonukleázy

Seznam obsahuje některé z nejvíce studovaných příkladů. Byly podrobné následující koncepty:

EnzymSFKód PDBZdrojDSCLSekvence rozpoznáváníStřih
I-AniI[2]H11P8K​Aspergillus nidulansEmito 5 'TTGAGGAGGTTTCTCTGTAAATAA
3 'AACTCCTCCAAAGAGACATTTATT 		5 '--- TTGAGGAGGTTTC   TCTGTAAATAA --- 3 '
3 '--- AACTCCTCC   AAAGAGACATTTATT --- 5 '
I-CeuI[3][4][5][6]H12EX5​Chlamydomonas eugametosEchlor 5 'TAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGA
3 'ATTGATATTGCCAGGATTCCATCGCT 		5 '--- TAACTATAACGGTCCTAA   GGTAGCGA --- 3 '
3 '--- ATTGATATTGCCAG   GATTCCATCGCT --- 5 '
I-ChuI[7][8]H1Q32001Chlamydomonas humicolaEchlor 5 'GAAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATC
3 'CTTCCAAACCGTGGAGCTACAGCCGAGTAG		 5 '--- GAAGGTTTGGCACCTCG   ATGTCGGCTCATC --- 3 '
3 '--- CTTCCAAACCGTG   GAGCTACAGCCGAGTAG --- 5 '
I-CPaI[8][9]H1Q39562Chlamydomonas pallidostigmataEchlor 5 'CGATCCTAAGGTAGCGAAATTCA
3 'GCTAGGATTCCATCGCTTTAAGT 		5 '--- CGATCCTAAGGTAGCGAA   ATTCA --- 3 '
3 '--- GCTAGGATTCCATC   GCTTTAAGT --- 5 '
I-CpaII[10]H1Q39559Chlamydomonas pallidostigmataEchlor 5 'CCCGGCTAACTCTGTGCCAG
3 'GGGCCGATTGAGACACGGTC 		5 '--- CCCGGCTAACTC   TGTGCCAG --- 3 '
5 '--- GGGCCGAT   TGAGACACGGTC --- 3 '
I-CreI[11]H11BP7​Chlamydomonas reinhardtiiEchlor 5 'CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG
3 'GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC 		5 '--- CTGGGTTCAAAACGTCGTGA   GACAGTTTGG --- 3 '
3 '--- GACCCAAGTTTTGCAG   CACTCTGTCAAACC --- 5 '
I-DmoIH11B24​Desulfurococcus mobilisAchrm 5 'ATGCCTTGCCGGGTAAGTTCCGGCGCGCAT
3 'TACGGAACGGCCCATTCAAGGCCGCGCGTA 		5 '--- ATGCCTTGCCGGGTAA   GTTCCGGCGCGCAT --- 3 '
3 '--- TACGGAACGGCC   CATTCAAGGCCGCGCGTA --- 5 '
H-DreI[12]H11 MOW​Hybridní: I-DmoI a I-CreIAE 5 'CAAAACGTCGTAAGTTCCGGCGCG
3 'GTTTTGCAGCATTCAAGGCCGCGC 		5 '--- CAAAACGTCGTAA   GTTCCGGCGCG --- 3 '
3 '--- GTTTTGCAG   CATTCAAGGCCGCGC --- 5 '
I-HmuI[13][14]H31U3E​Bacillus subtilis fág SP01Bfág 5 'AGTAATGAGCCTAACGCTCAGCAA
3 'TCATTACTCGGATTGCGAGTCGTT		  Nicking endonukleáza: *
  3 '--- TCATTACTCGGATTGC   GAGTCGTT --- 5 '
I-HmuII[14][15]H3Q38137Bacillus subtilis fág SP82Bfág 5 'AGTAATGAGCCTAACGCTCAACAA
3 'TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTT		  Nicking endonukleáza: *
  3 '--- TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTTN35   NNNN --- 5 '
I-LlaI[16][17]H3P0A3U1Lactococcus lactisBchrm 5 'CACATCCATAACCATATCATTTTT
3 'GTGTAGGTATTGGTATAGTAAAAAA 		5 '--- CACATCCATAA   CCATATCATTTTT --- 3 '
3 '--- GTGTAGGTATTGGTATAGTAA   AAA --- 5 '
I-MsoIH11M5X​Monomastix sp.E 5 'CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG
3 'GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC 		5 '--- CTGGGTTCAAAACGTCGTGA   GACAGTTTGG --- 3 '
3 '--- GACCCAAGTTTTGCAG   CACTCTGTCAAACC --- 5 '
PI-PfuIH11DQ3​Pyrococcus furiosus Vc1A 5 'GAAGATGGGAGGAGGGACCGGACTCAACTT
3 'CTTCTACCCTCCTCCCTGGCCTGAGTTGAA 		5 '--- GAAGATGGGAGGAGGG   ACCGGACTCAACTT --- 3 '
3 '--- CTTCTACCCTCC   TCCCTGGCCTGAGTTGAA --- 5 '
PI-PkoIIH12CW7​Pyrococcus kodakarensis BAA-918A 5 'CAGTACTACGGTTAC
3 'GTCATGATGCCAATG 		5 '--- CAGTACTACG  GTTAC --- 3 '
3 '--- GTCATG  ATGCCAATG --- 5 '
I-PorI[18][19]H3Pyrobaculum organotrophumAchrm 5 'GCGAGCCCGTAAGGGTGTGTACGGG
3 'CGCTCGGGCATTCCCACACATGCCC 		5 '--- GCGAGCCCGTAAGGGT   GTGTACGGG --- 3 '
3 '--- CGCTCGGGCATT   CCCACACATGCCC --- 5 '
I-PpoIH41EVX​Physarum polycephalumEplazmid 5 'TAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAAT
3 'ATTGATACTGAGAGAATTCCATCGGTTTA		 5 '--- TAACTATGACTCTCTTAA   GGTAGCCAAAT --- 3 '
3 '--- ATTGATACTGAGAG   AATTCCATCGGTTTA --- 5 '
PI-PspIH1Q51334Pyrococcus sp.Achrm 5 'TGGCAAACAGCTATTATGGGTATTATGGGT
3 'ACCGTTTGTCGATAATACCCATAATACCCA 		5 '--- TGGCAAACAGCTATTAT   GGGTATTATGGGT --- 3 '
3 '--- ACCGTTTGTCGAT   AATACCCATAATACCCA --- 5 '
I-ScaI[20][21]H1P03873Saccharomyces capensisEmito 5 'TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC
3 'ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG 		5 '--- TGTCACATTGAGGTGCACT   AGTTATTAC --- 3 '
3 '--- ACAGTGTAACTCCAC   GTGATCAATAATG --- 5 '
I-SceI[4][5]H11R7M​Saccharomyces cerevisiaeEmito 5 'AGTTACGCTAGGGATAACAGGGTAATATAG
3 'TCAATGCGATCCCTATTGTCCCATTATATC 		5 '--- AGTTACGCTAGGGATAA   CAGGGTAATATAG --- 3 '
3 '--- TCAATGCGATCCC   TATTGTCCCATTATATC --- 5 '
PI-SceI[22][23]H11 VDE​Saccharomyces cerevisiaeE 5 'ATCTATGTCGGGTGCGGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA
3 'TAGATACAGCCCACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT 		5 '--- ATCTATGTCGGGTGC   GGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA --- 3 '
3 '--- TAGATACAGCC   CACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT --- 5 '
I-SceII[24][25][26]H1Saccharomyces cerevisiaeEmito 5 'TTTTGATTCTTTGGTCACCCTGAAGTATA
3 'AAAACTAAGAAACCAGTGGGACTTCATAT 		5 '--- TTTTGATTCTTTGGTCACCC   TGAAGTATA --- 3 '
3 '--- AAAACTAAGAAACCAG   TGGGACTTCATAT --- 5 '
I-SecIII[24][27][28]H1Saccharomyces cerevisiaeEmito 5 'ATTGGGGTTTTGGTAACTATTTATTACC
3 'TAACCTCCAAAACCATTGATAAATAATGG 		5 '--- ATTGGAGGTTTTGGTAAC   TATTTATTACC --- 3 '
3 '--- TAACCTCCAAAACC   ATTGATAAATAATGG --- 5 '
I-SceIV[24][29][30]H1Saccharomyces cerevisiaeEmito 5 'TCTTTTCTCTTGATTAGCCCTCTAATCTACG
3 'AGAAAAGAGAACTAATCGGGATTAGATGC 		5 '--- TCTTTTCTCTTGATTA   GCCCTAATCTACG --- 3 '
3 '--- AGAAAAGAGAAC   TAATCGGGATTAGATGC --- 5 '
I-SceV[24][31]H3Saccharomyces cerevisiaeEmito 5 'AATAATTTTCTTCTTAGTAATGCC
3 'TTATTAAAAGAAGAATCATTACGG 		5 '--- AATAATTTTCT   TCTTAGTAATGCC --- 3 '
3 '--- TTATTAAAAGAAGAATCATTA   CGG --- 5 '
I-SceVI[24][32]H3Saccharomyces cerevisiaeEmito 5 'GTTATTTAATGTTTTAGTAGTTGG
3 'CAATAAATTACAAAATCATCAACC 		5 '--- GTTATTTAATG   TTTTAGTAGTTGG --- 3 '
3 '--- CAATAAATTACAAAATCATCA   ACC --- 5 '
I-SceVII[20]H1Saccharomyces cerevisiaeEmito 5 'TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC
3 'ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG		  Neznámý **
I-Ssp6803IH52OST​Synechocystis sp. PCC 6803B 5 'GTCGGGCTCATAACCCGAA
3 'CAGCCCGAGTATTGGGCTT 		5 '--- GTCGGGCT   CATAACCCGAA --- 3 '
3 '--- CAGCCCGAGTA   TTGGGCTT --- 5 '
I-TevI[33][34][35]H21I3J​Escherichia coli fág T4Bfág 5 'AGTGGTATCAACGCTCAGTAGATG
3 'TCACCATAGT TGCGAGTCATCTAC 		5 '--- AGTGGTATCAAC   GCTCAGTAGATG --- 3 '
3 '--- TCACCATAGT   TGCGAGTCATCTAC --- 5 '
I-TevII[33][36]H2Escherichia coli fág T4Bfág 5 'GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGTTATTC
3 'CGAATACTCATACTTCACTTGTGCAATAAG 		5 '--- GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGT   TATTC --- 3 '
3 '--- CGAATACTCATACTTCACTTGTG   CAATAAG --- 5 '
I-TevIII[37]H3Escherichia coli fág RB3Bfág 5 'TATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC
3 'ATACATAGAAAAACGCACATGGAAATTGAAG 		5 '--- T.   ATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC --- 3 '
3 '--- AT   ACATAGAAAACGCACATGGAAATTGAAG --- 5 '
PI-TliI[38][39]H1Thermococcus litoralisAchrm 5 'TAYGCNGAYACNGACGGYTTYT
3 'ATRCGNCTRTGNCTGCCTAARA 		5 '--- TAYGCNGAYACNGACGG   YTTYT --- 3 '
3 '--- ATRCGNCTRTGNC   TGCCTAARA --- 5 '
PI-TliII[22][39][40]H1Thermococcus litoralisAchrm 5 'AAATTGCTTGCAAACAGCTATTACGGCTAT
3 'TTTAACGAACGTTTGTCGATAATGCCGATA		  Neznámý **
I-Tsp061IH12DCH​Termoproteus sp. IC-061A 5 'CTTCAGTATGCCCCGAAAC
3 'GAAGTCATACGGGGCTTTG 		5 '--- CTTCAGTAT   GCCCCGAAAC --- 3 '
3 '--- GAAGT   CATACGGGGCTTTG --- 5 '
I-Vdi141IH13E54​Vulcanisaeta distributa IC-141A 5 'CCTGACTCTCTTAAGGTAGCCAAA
3 'GGACTGAGAGAATTCCATCGGTTT 		5 '--- CCTGACTCTCTTAA   GGTAGCCAAA --- 3 '
3 '--- GGACTGAG   AGAATTCCATCGGTTT --- 5 '

*: Nicking endonukleáza: Tyto enzymy štěpí pouze jedno vlákno DNA a druhé vlákno zůstávají nedotčené.
**: Neznámý web pro řezání: Vědci dosud nebyli schopni určit přesné místo řezu těchto enzymů.

Viz také

Informační zdroje

Databáze a seznamy restrikčních enzymů:

  • Velmi komplexní databáze restrikčních enzymů podporovaná společností New England Biolabs ©. Zahrnuje všechny druhy biologických, strukturálních, kinetických a obchodních informací o tisících enzymů. Zahrnuje také související literaturu pro každou molekulu: Roberts RJ, Vincze T, Posfai J, Macelis D. „REBASE“. Citováno 2010-01-07. Databáze restrikčních enzymů.
  • Databáze inteinů, hostovaná společností New England Biolabs ©. Perler FB. „InBase“. Archivovány od originál dne 2. 8. 2010. Citováno 2010-02-05. Databáze a registr Intein.[41]
  • Podrobné informace pro biochemické experimenty: "Vyhledávač enzymů". Archivovány od originál dne 08.01.2010. Citováno 2010-01-07. Vyhledávač enzymů New England Biolabs ©.
  • Abecední seznam enzymů a jejich restrikčních míst: „Webová stránka Enzymu s omezením GenScript ©“. Archivovány od originál dne 4. 7. 2009. Citováno 2010-01-07.
  • Obecné informace o restrikčních místech a biochemických podmínkách pro restrikční reakce: „Zdroj omezení enzymů“. Archivovány od originál dne 2002-02-03. Citováno 2010-01-07. Webová stránka restrikčních enzymů Promega ©.

Databáze proteinů:

  • Databáze proteinových struktur řešených při atomovém rozlišení: "PDB". Výzkumné spolupracovníky pro strukturní bioinformatiku (RCSB). Archivovány od originál dne 04.04.2015. Citováno 2010-01-25. RCSB Proteinová datová banka.
  • Databáze proteinů: Švýcarský institut pro bioinformatiku (SIB); Evropský bioinformatický institut (EBI). „UniProtKB / Swiss-Prot & TrEMBL“. Citováno 2010-01-25. Swiss-Prot je kurátorovaná databáze sekvencí proteinů, která se snaží poskytovat vysokou úroveň anotací (jako je popis funkce proteinu, jeho struktura domén, posttranslační úpravy, varianty atd.), minimální úroveň redundance a vysoká úroveň integrace s jinými databázemi. TrEMBL je počítačově anotovaný doplněk Swiss-Prot, který obsahuje všechny překlady EMBL položky nukleotidové sekvence ještě nejsou integrovány do Swiss-Prot.

Poznámky a odkazy

  1. ^ Lambowitz AM, Belfort M (1993). "Introny jako mobilní genetické prvky". Annu Rev Biochem. 62: 587–622. doi:10.1146 / annurev.bi.62.070193.003103. PMID  8352597.
  2. ^ Naito T, Kusano K, Kobayashi I (únor 1995). "Sobecké chování systémů omezení a modifikace". Věda. 267 (5199): 897–99. Bibcode:1995Sci ... 267..897N. doi:10.1126 / science.7846533. PMID  7846533.
  3. ^ Jacquier A, Dujon B (červen 1985). „Protein kódovaný intronem je aktivní v procesu genové přeměny, který rozšiřuje intron do mitochondriálního genu“. Buňka. 41 (2): 383–94. doi:10.1016 / S0092-8674 (85) 80011-8. PMID  3886163.
  4. ^ A b Gauthier A, Turmel M, Lemieux C (leden 1991). „Intron skupiny I v genu rRNA velké podjednotky chloroplastu Chlamydomonas eugametos kóduje dvouvláknovou endonukleázu, která štěpí naváděcí místo tohoto intronu.“ Curr Genet. 19 (1): 43–47. doi:10.1007 / BF00362086. PMID  2036685.
  5. ^ A b Marshall P, Lemieux C (srpen 1991). „Vzorek štěpení naváděcí endonukleázy kódovaný pátým intronem v chloroplastové velké podjednotce gen kódující rRNA Chlamydomonas eugametos.“ Gen. 104 (2): 241–5. doi:10.1016 / 0378-1119 (91) 90256-B. PMID  1916294.
  6. ^ Turmel M, Boulanger J, Schnare MN, Gray MW, Lemieux C (březen 1991). „Šest intronů skupiny I a tři vnitřní transkribované spacery v chloroplastové genové ribozomální RNA velké podjednotky zelené řasy Chlamydomonas eugametos“. J Mol Biol. 218 (2): 293–311. doi:10.1016 / 0022-2836 (91) 90713-G. PMID  1849178.
  7. ^ Côté V, Mercier JP, Lemieux C, Turmel M (červenec 1993). „Jediný intron skupiny I v chloroplastovém rrnL genu Chlamydomonas humicola kóduje místně specifickou DNA endonukleázu (I-Chuli)“. Gen. 129 (1): 69–76. doi:10.1016/0378-1119(93)90697-2. PMID  8335261.
  8. ^ A b Turmel M, Gutell RR, Mercier JP, Otis C, Lemieux C (červenec 1993). „Analýza chloroplastové velké podjednotky genu ribozomální RNA ze 17 taxonů Chlamydomonas. Tři vnitřní transkribované spacery a 12 míst pro vložení intronu skupiny I.“ J Mol Biol. 232 (2): 446–67. doi:10.1006 / jmbi.1993.1402. PMID  8393936.
  9. ^ Turmel M, Côté V, Otis C, Mercier JP, Gray MW, Lonergan KM, Lemieux C (červenec 1995). „Evoluční přenos intronů skupiny I obsahující ORF mezi různými subcelulárními kompartmenty (chloroplasty a mitochondrie)“. Mol Biol Evol. 12 (4): 533–45. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040234. PMID  7659010.
  10. ^ Turmel M, Mercier JP, Côté V, Otis C, Lemieux C (červenec 1995). „Lokálně specifická endonukleáza DNA kódovaná intronem skupiny I v chloroplastové malé podjednotce rRNA genu Chlamydomonas pallidostigmatica zavádí jednořetězcový zlom při nízkých koncentracích Mg2 +“. Nucleic Acids Res. 23 (13): 2519–25. doi:10.1093 / nar / 23.13.2519. PMC  307060. PMID  7630730.
  11. ^ Jurica MS, Monnat RJ, Stoddard BL (říjen 1998). "Rozpoznávání a štěpení DNA pomocí naváděcí endonukleázy I-CreI LAGLIDADG". Mol. Buňka. 2 (4): 469–76. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80146-X. PMID  9809068.
  12. ^ Chevalier BS, Kortemme T, Chadsey MS, Baker D, Monnat RJ, Stoddard BL (říjen 2002). „Návrh, aktivita a struktura vysoce specifické umělé endonukleázy“. Mol. Buňka. 10 (4): 895–905. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00690-1. PMID  12419232.
  13. ^ Goodrich-Blair H, Scarlato V, Gott JM, Xu M, Shub DA (říjen 1990). „Self-splicing group I intron in the DNA polymerase gen of Bacillus subtilis bakteriophage SPO1“. Buňka. 63 (2): 417–24. doi:10.1016 / 0092-8674 (90) 90174-D. PMID  2119891.
  14. ^ A b Goodrich-Blair H, Shub DA (leden 1996). „Kromě navádění: konkurence mezi intronovými endonukleázami poskytuje selektivní výhodu v sousedních genetických markerech“. Buňka. 84 (2): 211–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80976-9. PMID  8565067.
  15. ^ Goodrich-Blair H, Shub DA (září 1994). „Geny DNA polymerázy několika HMU-bakteriofágů mají podobné introny skupiny I s vysoce odlišnými otevřenými čtecími rámy“. Nucleic Acids Res. 22 (18): 3715–21. doi:10.1093 / nar / 22.18.3715. PMC  308352. PMID  7937082.
  16. ^ Shearman C, Godon JJ, Gasson M (červenec 1996). "Sestřih intronu skupiny II ve funkčním přenosovém genu Lactococcus lactis". Mol Microbiol. 21 (1): 45–53. doi:10.1046 / j.1365-2958.1996.00610.x. PMID  8843433.
  17. ^ Mills DA, McKay LL, Dunny GM (červen 1996). „Sestřih intronu skupiny II podílející se na konjugativním přenosu pRS01 v laktokokech“. J Bacteriol. 178 (12): 3531–8. doi:10.1128 / jb.178.12.3531-3538.1996. PMC  178122. PMID  8655550.
  18. ^ Lykke-Andersen J, Thi-Ngoc HP, Garrett RA (listopad 1994). „DNA substrátová specificita a kinetika štěpení archaální naváděcí endonukleázy z Pyrobaculum organotrophum“. Nucleic Acids Res. 22 (22): 4583–90. doi:10.1093 / nar / 22.22.4583. PMC  308504. PMID  7984405.
  19. ^ Dalgaard JZ, Garrett RA (listopad 1992). „Introny kódující bílkoviny z genu kódujícího 23S rRNA tvoří stabilní kruhy v hypertermofilním archaeonu Pyrobaculum organotrophum“. Gen. 121 (1): 103–10. doi:10.1016 / 0378-1119 (92) 90167-N. PMID  1427083.
  20. ^ A b Szczepanek T, Lazowska J (červenec 1996). „Nahrazení dvou nesousedících aminokyselin v intronem kódované RNA maturase S. cerevisiae bi2 je dostatečné pro získání aktivity naváděcí endonukleázy“. EMBO J.. 15 (14): 3758–67. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00746.x. PMC  452048. PMID  8670880.
  21. ^ Lazowska J, Szczepanek T, Macadre C, Dokova M (1992). „Dva homologní mitochondriální introny z blízce příbuzných druhů Saccharomyces se ve svých otevřených rámcích pro čtení liší pouze několika náhradami aminokyselin: jeden je mobilní, druhý nikoli“. C. R. Acad. Sci. Paříž. 315 (2): 37–41. PMID  1330224.
  22. ^ A b Kane PM, Yamashiro CT, Wolczyk DF, Neff N, Goebl M, Stevens TH (listopad 1990). „Proteinové sestřih konvertuje produkt genu kvasinek TFP1 na 69-kD podjednotku vakuolární H (+) - adenosintrifosfatázy“. Věda. 250 (4981): 651–7. Bibcode:1990Sci ... 250..651K. doi:10.1126 / science.2146742. PMID  2146742.
  23. ^ Gimble FS, Thorner J (květen 1992). "Navádění genu pro endonukleázu DNA pomocí konverze meiotického genu v Saccharomyces cerevisiae". Příroda. 357 (6376): 301–6. Bibcode:1992 Natur.357..301G. doi:10.1038 / 357301a0. PMID  1534148.
  24. ^ A b C d E Bonitz SG, Coruzzi G, Thalenfeld BE, Tzagoloff A, Macino G (prosinec 1980). "Sestava mitochondriálního membránového systému. Struktura a nukleotidová sekvence genu kódujícího podjednotku 1 kvasinkové cytochrme oxidázy". J Biol Chem. 255 (24): 11927–41. PMID  6254986.
  25. ^ Hanson DK, Lamb MR, Mahler HR, Perlman PS (březen 1982). "Důkazy pro přeložené intervenující sekvence v mitochondriálním genomu Saccharomyces cerevisiae". J Biol Chem. 257 (6): 3218–24. PMID  6277926.
  26. ^ Delahodde A, Goguel V, Becam AM, Creusot F, Perea J, Banroques J, Jacq C (únor 1989). „Site-specific DNA endonukleáza a RNA maturasové aktivity dvou homologních proteinů kódovaných intronem z kvasinkových mitochondrií“. Buňka. 56 (3): 431–41. doi:10.1016/0092-8674(89)90246-8. PMID  2536593.
  27. ^ Sargueil B, Delahodde A, Hatat D, Tian GL, Lazowska J, Jacq C (únor 1991). "Nová specifická aktivita DNA endonukleázy v mitochondriích kvasinek". Mol Gen Genet. 225 (2): 340–1. doi:10.1007 / BF00269867. PMID  1848651.
  28. ^ Perea J, Desdouets C, Schapria M, Jacq C (leden 1993). „I-Sce III: nová skupina I intronově kódované endonukleázy z kvasinkových mitochondrií“. Nucleic Acids Res. 21 (2): 358. doi:10.1093 / nar / 21.2.358. PMC  309119. PMID  8441645.
  29. ^ Moran JV, Wernette CM, Mecklenburg KL, Butow RA, Perlman PS (srpen 1992). „Intron 5 alfa genu COXI kvasinkové mitochondriální DNA je intron mobilní skupiny I“. Nucleic Acids Res. 20 (15): 4069–76. doi:10.1093 / nar / 20.15.4069. PMC  334089. PMID  1324475.
  30. ^ Seraphin B, Faye G, Hatat D, Jacq C (duben 1992). "Kvasinový mitochondriální intron aI5 alfa: asociovaná aktivita endonukleázy a mobilita in vivo". Gen. 113 (1): 1–8. doi:10.1016 / 0378-1119 (92) 90663-A. PMID  1314207.
  31. ^ Liang F, Romanienko PJ, Weaver DT, Jeggo PA, Jasin M (srpen 1996). „Oprava chromozomálního dvouřetězcového zlomu v buňkách s deficitem Ku80“. PNAS. 93 (17): 8929–33. Bibcode:1996PNAS ... 93,8929L. doi:10.1073 / pnas.93.17.8929. PMC  38571. PMID  8799130.
  32. ^ Yang J, Zimmerly S, Perlman PS, Lambowitz AM (květen 1996). „Efektivní integrace intronové RNA do dvouvláknové DNA reverzním sestřihem“. Příroda. 381 (6580): 332–5. Bibcode:1996 Natur.381..332Y. doi:10.1038 / 381332a0. PMID  8692273.
  33. ^ A b Bell-Pedersen D, Quirk S, Clyman J, Belfort M (červenec 1990). „Intronová mobilita ve fágu T4 je závislá na charakteristické třídě endonukleáz a nezávislá na DNA sekvencích kódujících intronové jádro: mechanické a evoluční důsledky“. Nucleic Acids Res. 18 (13): 3763–70. doi:10.1093 / nar / 18.13.3763. PMC  331075. PMID  2165250.
  34. ^ Chu FK, Maley G, Pedersen-Lane J, Wang AM, Maley F (květen 1990). "Charakterizace restrikčního místa prokaryotické intronem kódované endonukleázy". PNAS. 87 (9): 3574–8. Bibcode:1990PNAS ... 87.3574C. doi:10.1073 / pnas.87.9.3574. PMC  53944. PMID  2159153.
  35. ^ Bell-Pedersen D, Quirk SM, Aubrey M, Belfort M (říjen 1989). "Lokálně specifická endonukleáza a společná přeměna lemujících exonů spojených s mobilním td intronem fága T4". Gen. 82 (1): 119–26. doi:10.1016 / 0378-1119 (89) 90036-X. PMID  2555262.
  36. ^ Shub DA, Gott JM, Xu MQ, Lang BF, Michel F, Tomaschewski J, Pedersen-Lane J, Belfort M (únor 1988). „Strukturální ochrana mezi třemi homologními introny bakteriofága T4 a introny skupiny I eukaryot“. PNAS. 85 (4): 1151–5. Bibcode:1988PNAS ... 85.1151S. doi:10.1073 / pnas.85.4.1151. PMC  279724. PMID  3422485.
  37. ^ Eddy SR, Gold L (červen 1991). „Intron fága T4 nrdB: deleční mutant verze nalezené ve volné přírodě“. Genes Dev. 5 (6): 1032–41. doi:10,1101 / gad. 5.6.632. PMID  2044951.
  38. ^ Xu M, Southworth MW, Mersha FB, Hornstra LJ, Perler FB (prosinec 1993). "In vitro proteinové sestřih purifikovaného prekurzoru a identifikace rozvětveného meziproduktu". Buňka. 75 (7): 1371–7. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90623-X. PMID  8269515.
  39. ^ A b Perler FB, Comb DG, Jack WE, Moran LS, Qiang B, Kučera RB, Benner J, Slatko BE, Nwankwo DO, Hempstead SK, Carlow CK, Jannasch H (červen 1992). „Interferující sekvence v genu DNA polymerázy Archaea“. PNAS. 89 (12): 5577–81. Bibcode:1992PNAS ... 89.5577P. doi:10.1073 / pnas.89.12.5577. PMC  49335. PMID  1608969.
  40. ^ Hirata R, Ohsumk Y, Nakano A, Kawasaki H, Suzuki K, Anraku Y (duben 1990). "Molekulární struktura genu, VMA1, kódující katalytickou podjednotku H (+) - translokační adenosintrifosfatázy z vakuolárních membrán Saccharomyces cerevisiae". J Biol Chem. 265 (12): 6726–33. PMID  2139027.
  41. ^ Perler FB (leden 2002). „InBase: databáze Intein“. Nucleic Acids Res. 30 (1): 383–4. doi:10.1093 / nar / 30.1.383. PMC  99080. PMID  11752343.