Gen kódující proteiny u druhu Homo sapiens
Faktor shromáždění cytochrom c oxidázy 6 je protein že u lidí je kódován COA6 gen .[3] Mitochondriální dýchací řetězec Komplex IV , nebo cytochrom c oxidáza, je složka dýchacího řetězce, která katalyzuje přenos elektronů z mezimembránový prostor cytochrom c až molekulární kyslík v matice a v důsledku toho přispívá k protonový gradient podílí se na mitochondriích ATP syntéza.[4] [5] COA6 Gen kóduje montážní faktor pro mitochondriální komplex IV a je členem cytochrom c oxidázy podjednotka 6B rodina .[3] [6] SCO2 a COX2 . Stabilizuje nově vytvořený COX2 a je součástí mitochondriálního měděného reléového systému.[7] Mutace v tomto genu vede k fatální infantilní kardioencefalomyopatii.[6]
Struktura The COA6 gen se nachází na rameni q chromozom 1 na pozici 42,2 a zabírá 10 612 párů bází.[3] aminokyseliny .[8] [9] TMEM177 , COX20 , MT-CO2 / COX2, COX18 , SCO1 a SCO2.[4] [5] [10] [11]
Funkce The COA6 kóduje protein, který je montážním faktorem pro komplex IV.[3] biogeneze a stabilita; nepřítomnost tohoto proteinu způsobí rychle obrat nově syntetizovaného COX2. Přítomnost CHCH domény usnadňuje jeho funkci jako thiol-disulfidového redukčního činidla, protože usnadňuje přenos mědi z SCO1 na COX2.[10]
Klinický význam V tomto proteinu byly identifikovány dvě mutace: W66R a W59C. Druhá mutace vede k nesprávnému cílení proteinu na mitochondriální matrici, což vede ke ztrátě interakce s SCO2 a COX2.[4] [5] Dědictví této mutace je autozomálně recesivní a vede k fenotyp fatální infantilní kardioencefalomyopatie v důsledku nedostatku komplexu IV.[6] Hypertrofické kardiomyopatie , levá komora nezhutnění , laktátová acidóza a metabolické hypotonie .[4] [5]
Interakce Tento protein interaguje přechodně s katalyzátorem obsahujícím měď doména nově syntetizovaného COX2 prostřednictvím jeho C-terminál ocas vystavený mezimembránovému prostoru. Rovněž selektivně interaguje s mědí metallochaperone SCO2 způsobem závislým na COX2 a s COX20 způsobem závislým na COX2 a COX18.[7] COA1 , SCO1, COX16 , TTC19 , DTX2 , NADSYN1 , GABARAP , AIFM1 , COX4I1 , CD81 , COX14 , SFXN1 , a PLGRKT .[4] [5] [12]
Reference ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168275 - Ensembl , Květen 2017^ „Human PubMed Reference:“ . Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna .^ A b C d „Entrez Gene: Cytochrome c oxidase assembly factor 6“ . Citováno 2018-08-08 .^ A b C d E „COA6 - Homolog cytochrom c oxidázy s faktorem montáže 6 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein COA6“ . www.uniprot.org . Citováno 2018-08-07 .CC BY 4.0 licence.^ A b C d E „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“ . Výzkum nukleových kyselin . 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi :10.1093 / nar / gkw1099 . PMC 5210571 PMID 27899622 .^ A b C Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM): 614772 ^ A b Pacheu-Grau D, Bareth B, Dudek J, Juris L, Vögtle FN, Wissel M a kol. (Červen 2015). „Spolupráce mezi COA6 a SCO2 při zrání COX2 během montáže cytochrom c oxidázy spojuje dvě mitochondriální kardiomyopatie“ . Buněčný metabolismus . 21 (6): 823–33. doi :10.1016 / j.cmet.2015.04.012 PMID 25959673 . ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“ . Výzkum oběhu . 113 (9): 1043–53. doi :10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475 PMID 23965338 . ^ „COA6 - homolog cytochromu c oxidázy s montážním faktorem 6“ . Znalostní databáze Atlas srdečních organelárních proteinů (COPaKB) . Archivovány od originál dne 09.08.2018. Citováno 2018-08-09 .^ A b COA6 je strukturálně naladěn tak, aby fungoval jako thiol-disulfid oxidoreduktáza při dodávání mědi do mitochondriální cytochrom C oxidázy - PubMed ^ Strukturální a funkční charakterizace mitochondriálního komplexu IV montážního faktoru Coa6 - PubMed ^ IntAct. „Interakce COA6“ . www.ebi.ac.uk . Citováno 2018-08-08 . Další čtení Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA, Goedert JJ, Kirk GD, Gomperts ED, Buchbinder SP, Troyer JL, O'Brien SJ (září 2010). „Genetické varianty v jaderně kódovaných mitochondriálních genech ovlivňují progresi AIDS“ . PLOS One . 5 (9): e12862. Bibcode :2010PLoSO ... 512862H . doi :10.1371 / journal.pone.0012862 . PMC 2943476 PMID 20877624 . Calvo SE, Compton AG, Hershman SG, Lim SC, Lieber DS, Tucker EJ, Laskowski A, Garone C, Liu S, Jaffe DB, Christodoulou J, Fletcher JM, Bruno DL, Goldblatt J, Dimauro S, Thorburn DR, Mootha VK (Leden 2012). „Molekulární diagnostika infantilní mitochondriální nemoci s cíleným sekvenováním nové generace“ . Science Translational Medicine . 4 (118): 118ra10. doi :10.1126 / scitranslmed.3003310 . PMC 3523805 PMID 22277967 . Szklarczyk R, Wanschers BF, Cuypers TD, Esseling JJ, Riemersma M, van den Brand MA, Gloerich J, Lasonder E, van den Heuvel LP, Nijtmans LG, Huynen MA (únor 2012). „Iterativní predikce ortologie odhaluje nové mitochondriální proteiny a identifikuje C12orf62 jako lidský ortolog COX14, proteinu podílejícího se na sestavení cytochrom c oxidázy“ . Genome Biology . 13 (2): R12. doi :10.1186 / gb-2012-13-2-r12 . PMC 3334569 PMID 22356826 . Szklarczyk R, Wanschers BF, Cuypers TD, Esseling JJ, Riemersma M, van den Brand MA, Gloerich J, Lasonder E, van den Heuvel LP, Nijtmans LG, Huynen MA (únor 2012). „Iterativní predikce ortologie odhaluje nové mitochondriální proteiny a identifikuje C12orf62 jako lidský ortolog COX14, proteinu podílejícího se na sestavení cytochrom c oxidázy“ . Genome Biology . 13 (2): R12. doi :10.1186 / gb-2012-13-2-r12 . PMC 3334569 PMID 22356826 . Shivatheja Soma; Marcos N Morgada; Mandar T Naik; Aren Boulet; Anna A Roesler; Nathaniel Dziuba; Alok Ghosh; Qinhong Yu; Paul A Lindahl; James B Ames; Scot C Leary; Alejandro J Vila; Vishal M Gohil (prosinec 2019). „COA6 je strukturálně naladěn tak, aby fungoval jako thiol-disulfid oxidoreduktáza při dodávání mědi do mitochondriální cytochrom C oxidázy“ . Zprávy buněk . 29 (12): 4114–26. doi :10.1016 / j.celrep.2019.11.054 . PMC 6946597 PMID 31851937 . Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine , který je v veřejná doména .
Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.