SCO2 - SCO2
Sestava SCO2 cytochrom c oxidázy (také známý jako SCO2 homolog, mitochondriální a Homolog s nedostatkem SCO cytochromoxidázy 2) je protein že u lidí je kódován SCO2 gen.[5][6][7] Kódovaný protein je jedním z cytochrom c oxidáza (COX) (Complex IV) montážní faktory. Člověk KORMIDELNÍK je multimerní proteinový komplex to vyžaduje několik montážních faktorů. Cytochrom c oxidáza (COX) katalyzuje přenos elektronů z cytochrom c na molekulární kyslík, který pomáhá udržovat protonový gradient přes vnitřní mitochondriální membrána to je nezbytné pro aerobik ATP Výroba. Kódovaný protein je a metallochaperone který se podílí na biogenezi cytochrom c oxidáza podjednotka II. Mutace v tomto genu jsou spojeny s fatální infantilní encefalokardiomyopatií a krátkozrakost 6.[7]
Struktura
The SCO2 gen se nachází na q rameno z chromozom 22 na pozici 13,33 a pokrývá 2871 párů bází.[7] The SCO2 Gen produkuje 15,1 kDa protein složený ze 136 aminokyseliny.[8][9] Protein obsahuje N-terminál předvolba mitochondriálního cílení 41 aminokyseliny a sdílí identitu s droždí protein v oblastech mezi glycin -102 a glycin -242 v lidském SCO2.[10] SCO2 je podjednotka enzymu Savčí cytochrom c oxidáza (COX) (Komplex IV).[7]
Funkce
The SCO2 gen kóduje a protein nezbytné pro montáž a funkci Savčí cytochrom c oxidáza (COX) (Komplex IV) mitochondriální dýchací řetězec. SCO2 funguje jako metallochaperone podílí se na biogeneze z cytochrom c oxidáza podjednotka II, základní podjednotka Komplex IV který přenáší elektrony z cytochrom c do bimetalového středu katalytická podjednotka 1 přes jeho dvoujaderné centrum mědi A.[11] Biogeneze zahrnuje transport mědi do místa Cu (A) na cytochrom c oxidáza podjednotka II což vede ke správné syntéze a zrání podjednotky. Kromě toho SCO2 působí jako a thiol -disulfid oxidoreduktáza regulovat redoxní stav cysteiny v SCO1 během zrání cytochrom c oxidáza podjednotka II. Zrání a syntéza cytochrom c oxidáza podjednotka II je vyžadován pro funkci Savčí cytochrom c oxidáza (COX) (Komplex IV).[12][13]Komplex IV, multimerní proteinový komplex to vyžaduje několik montážních faktorů, katalyzuje převod redukčních ekvivalentů z cytochrom c na molekulární kyslík a čerpadla protony přes vnitřní mitochondriální membrána.[7]
Klinický význam
Mutace v SCO2 které mění nařízení o měď a kyslík bylo zjištěno, že jsou spojeny s fatální infantilní kardioencefalomyopatií v důsledku nedostatku cytochrom c oxidázy 1 (CEMCOX1), Krátkozrakost 6 (MYP6) a Leighův syndrom (LS).[14][12] CEMCOX1 je charakterizován poruchami charakterizovanými hypotonie, vývojové zpoždění, Hypertrofické kardiomyopatie, laktátová acidóza, glióza, ztráta neuronů v bazální ganglia, mozkový kmen a mícha, a cytochrom c oxidáza nedostatek. Krátkozrakost 6 je charakterizován a refrakční chyba oka, při které se paralelní paprsky vzdáleného objektu zaostří před sítnice, vidění je lepší pro blízké objekty než pro vzdálené. Konečně Leighův syndrom je progresivní neurodegenerativní porucha charakterizována přítomností ohniskových, bilaterálních léze v jedné nebo více oblastech centrální nervový systém včetně mozkový kmen, thalamus, bazální ganglia, mozeček a mícha. Klinické projevy mohou zahrnovat psychomotorická retardace, hypotonie, ataxie slabost, ztráta zraku, pohyb očí abnormality, záchvaty, a dysfagie.[12] Patogenní mutace G1541A u pacienta prokázala silné důkazy u novorozenců hypotonie s fenotypem SMA 1 a bylo zjištěno, že má za následek méně KORMIDELNÍK nedostatky.[15] Bylo zjištěno, že mutace 1602T> G vede k rychle progresivnímu onemocnění fenotypy.[16] Mezi další patogenní mutace patří a missense mutace společnosti E140K, a nesmyslná mutace Q53X a mutace 1541G> A, která vedla k těžké nestabilitě proteinu.[17][18][19]
Interakce
Vedle komplexních interakcí bylo zjištěno, že SCO2 interaguje s COA6, THEM177 v COX20 -závislým způsobem, COX20, COX16, SCO1, a další.[12][20]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000284194 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000091780 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Paret C, Ostermann K, Krause-Buchholz U, Rentzsch A, Rödel G (březen 1999). "Lidští členové rodiny genů SCO1: analýza komplementace v kvasinkách a intracelulární lokalizace". FEBS Dopisy. 447 (1): 65–70. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00266-5. PMID 10218584.
- ^ Horng YC, Leary SC, Cobine PA, Young FB, George GN, Shoubridge EA, Winge DR (říjen 2005). „Lidský Sco1 a Sco2 fungují jako proteiny vázající měď“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (40): 34113–22. doi:10,1074 / jbc.M506801200. PMID 16091356.
- ^ A b C d E „Entrez Gene: SCO2 SCO2 cytochrom c oxidáza montážní protein [ Homo sapiens (člověk)] ".
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ "Protein SCO2 homolog, mitochondriální". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
- ^ Papadopoulou LC, Sue CM, Davidson MM, Tanji K, Nishino I, Sadlock JE, Krishna S, Walker W, Selby J, Glerum DM, Coster RV, Lyon G, Scalais E, Lebel R, Kaplan P, Shanske S, De Vivo DC, Bonilla E, Hirano M, DiMauro S, Schon EA (listopad 1999). "Fatální infantilní kardioencefalomyopatie s nedostatkem COX a mutacemi v SCO2, COX montážním genu". Genetika přírody. 23 (3): 333–7. doi:10.1038/15513. PMID 10545952.
- ^ „MT-CO2 - podjednotka 2 cytochrom c oxidázy - Homo sapiens (člověk) - gen a protein MT-CO2“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-31.
Tento článek obsahuje [text www.uniprot.org] UniProt dostupný pod CC BY 4.0 licence.
- ^ A b C d „SCO2 - Protein SCO2 homolog, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - SCO2 gen a protein“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-31.
Tento článek obsahuje [text www.uniprot.org] společnosti UniProt, který je k dispozici na webu CC BY 4.0 licence.
- ^ „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ Jaksch M, Paret C, Stucka R, Horn N, Müller-Höcker J, Horvath R, Trepesch N, Stecker G, Freisinger P, Thirion C, Müller J, Lunkwitz R, Rödel G, Shoubridge EA, Lochmüller H (prosinec 2001) . „Nedostatek cytochrom c oxidázy způsobený mutacemi v SCO2, kódující mitochondriální protein vázající měď, je zachráněn mědí v lidských myoblastech“. Lidská molekulární genetika. 10 (26): 3025–35. doi:10,1093 / hmg / 10,26,3025. PMID 11751685.
- ^ Tarnopolsky MA, Bourgeois JM, Fu MH, Kataeva G, Shah J, Simon DK, Mahoney D, Johns D, MacKay N, Robinson BH (březen 2004). „Nová mutace SCO2 (G1521A) projevující se jako fenotyp spinální svalové atrofie typu I“. American Journal of Medical Genetics. Část A. 125A (3): 310–4. doi:10,1002 / ajmg.a.20466. PMID 14994243.
- ^ Knuf M, Faber J, Huth RG, Freisinger P, Zepp F, Kampmann C (leden 2007). „Identifikace nové sloučeniny s heterozygotní mutací SCO2 v cytochrom c oxidase deficitní infantilní kardioencefalomyopatii s deficitem“. Acta Paediatrica. 96 (1): 130–2. doi:10.1111 / j.1651-2227.2007.00008.x. PMID 17187620.
- ^ Salviati L, Sacconi S, Rasalan MM, Kronn DF, Braun A, Canoll P, Davidson M, Shanske S, Bonilla E, Hays AP, Schon EA, DiMauro S (květen 2002). „Nedostatek cytochrom c oxidázy způsobený novou mutací SCO2 napodobuje Werdnig-Hoffmannovu chorobu“. Archivy neurologie. 59 (5): 862–5. doi:10,1001 / archneur.59.5.862. PMID 12020273.
- ^ Tay SK, Shanske S, Kaplan P, DiMauro S (červen 2004). „Sdružení mutací v SCO2, genu pro shromáždění cytochrom c oxidázy, s časnou letální úmrtností“. Archivy neurologie. 61 (6): 950–2. doi:10.1001 / archneur.61.6.950. PMID 15210538.
- ^ Joost K, Rodenburg R, Piirsoo A, van den Heuvel B, Zordania R, Ounap K (březen 2010). „Nová mutace v genu SCO2 u novorozenců s časným nástupem kardioencefalomyopatie“. Dětská neurologie. 42 (3): 227–30. doi:10.1016 / j.pediatrneurol.2009.10.004. PMID 20159436.
- ^ Kerrien S, Alam-Faruque Y, Aranda B, Bancarz I, Bridge A, Derow C, Dimmer E, Feuermann M, Friedrichsen A, Huntley R, Kohler C, Khadake J, Leroy C, Liban A, Lieftink C, Montecchi-Palazzi L, Orchard S, Risse J, Robbe K, Roechert B, Thorneycroft D, Zhang Y, Apweiler R, Hermjakob H (leden 2007). „IntAct - zdroj open source pro data molekulární interakce“. Výzkum nukleových kyselin. 35 (Problém s databází): D561–5. doi:10.1093 / nar / gkl958. PMC 1751531. PMID 17145710.
Další čtení
- Jaksch M, Ogilvie I, Yao J, Kortenhaus G, Bresser HG, Gerbitz KD, Shoubridge EA (březen 2000). „Mutace v SCO2 jsou spojeny s výraznou formou hypertrofické kardiomyopatie a deficitu cytochrom c oxidázy“. Lidská molekulární genetika. 9 (5): 795–801. doi:10,1093 / hmg / 9,5,795. PMID 10749987.
- Jaksch M, Horvath R, Horn N, Auer DP, Macmillan C, Peters J, Gerbitz KD, Kraegeloh-Mann I, Muntau A, Karcagi V, Kalmanchey R, Lochmuller H, Shoubridge EA, Freisinger P (říjen 2001). „Homozygotnost (E140K) v SCO2 způsobuje opožděný infantilní nástup kardiomyopatie a neuropatie“. Neurologie. 57 (8): 1440–6. doi:10.1212 / mn. 57.8.1440. PMID 11673586.
- Jaksch M, Paret C, Stucka R, Horn N, Müller-Höcker J, Horvath R, Trepesch N, Stecker G, Freisinger P, Thirion C, Müller J, Lunkwitz R, Rödel G, Shoubridge EA, Lochmüller H (prosinec 2001) . „Nedostatek cytochrom c oxidázy způsobený mutacemi v SCO2, kódující mitochondriální protein vázající měď, je zachráněn mědí v lidských myoblastech“. Lidská molekulární genetika. 10 (26): 3025–35. doi:10,1093 / hmg / 10,26,3025. PMID 11751685.
- Salviati L, Hernandez-Rosa E, Walker WF, Sacconi S, DiMauro S, Schon EA, Davidson MM (duben 2002). „Suplementace mědi obnovuje aktivitu cytochrom c oxidázy v kultivovaných buňkách od pacientů s mutacemi SCO2“. The Biochemical Journal. 363 (Pt 2): 321–7. doi:10.1042/0264-6021:3630321. PMC 1222481. PMID 11931660.
- Collins JE, Goward ME, Cole CG, Smink LJ, Huckle EJ, Knowles S, Bye JM, Beare DM, Dunham I (leden 2003). „Přehodnocení anotace lidského genu: analýza druhé generace chromozomu 22“. Výzkum genomu. 13 (1): 27–36. doi:10,1101 / gr. 695703. PMC 430954. PMID 12529303.
- Sacconi S, Salviati L, Sue CM, Shanske S, Davidson MM, Bonilla E, Naini AB, De Vivo DC, DiMauro S (únor 2003). "Mutační screening u pacientů s izolovaným nedostatkem cytochrom c oxidázy". Pediatrický výzkum. 53 (2): 224–30. doi:10.1203 / 01.PDR.0000048100.91730.6A. PMID 12538779.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
- Leary SC, Kaufman BA, Pellecchia G, Guercin GH, Mattman A, Jaksch M, Shoubridge EA (září 2004). „Lidský SCO1 a SCO2 mají nezávislé kooperativní funkce při dodávání mědi do cytochrom c oxidázy“. Lidská molekulární genetika. 13 (17): 1839–48. doi:10,1093 / hmg / ddh197. PMID 15229189.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
- Stiburek L, Vesela K, Hansikova H, Pecina P, Tesařova M, Černá L, Houstek J, Zeman J (prosinec 2005). "Poruchy sestavy cytochrom c oxidázy specifické pro tkáň způsobené mutacemi v SCO2 a SURF1". The Biochemical Journal. 392 (Pt 3): 625–32. doi:10.1042 / BJ20050807. PMC 1316303. PMID 16083427.
- Matoba S, Kang JG, Patino WD, Wragg A, Boehm M, Gavrilova O, Hurley PJ, Bunz F, Hwang PM (červen 2006). "p53 reguluje mitochondriální dýchání". Věda. 312 (5780): 1650–3. doi:10.1126 / science.1126863. PMID 16728594.
- Leary SC, Cobine PA, Kaufman BA, Guercin GH, Mattman A, Palaty J, Lockitch G, Winge DR, Rustin P, Horvath R, Shoubridge EA (leden 2007). „Faktory seskupení lidského cytochrom c oxidázy SCO1 a SCO2 mají regulační roli při udržování buněčné homeostázy mědi“. Buněčný metabolismus. 5 (1): 9–20. doi:10.1016 / j.cmet.2006.12.001. PMID 17189203.
- Banci L, Bertini I, Ciofi-Baffoni S, Gerothanassis IP, Leontari I, Martinelli M, Wang S (září 2007). "Strukturální charakterizace lidského SCO2". Struktura. 15 (9): 1132–40. doi:10.1016 / j.str.2007.07.011. PMID 17850752.
externí odkazy
- SCO2 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
- SCO2 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.