Molekulární léze - Molecular lesion

Ball and Stick Model of Double Helical DNA

A molekulární léze, nebo bodová léze, je poškození struktury a biologická molekula jako DNA, RNA nebo protein. Toto poškození může vést ke snížení nebo absenci normální funkce a ve výjimečných případech k získání nové funkce. Léze v DNA mohou sestávat z zlomů nebo jiných změn v chemické struktuře šroubovice, což nakonec brání transkripci. Mezitím se léze v proteinech skládají jak z rozbitých vazeb, tak z nesprávných skládací z aminokyselinový řetězec. Zatímco mnoho lézí nukleových kyselin je obecně napříč DNA a RNA, některé jsou specifické pro jednu, jako např dimery tyminu nachází se výhradně v DNA. Několik celulárních opravné mechanismy existují, od globálních po konkrétní, aby se zabránilo trvalému poškození způsobenému lézemi.

Příčiny

Existují dvě široké příčiny lézí nukleových kyselin, endogenní a exogenní faktory. Endogenní faktory, nebo endogenní, odkazují na výsledné podmínky, které se vyvíjejí v organismu. To je v rozporu s exogenními faktory, které pocházejí z vnějšku organismu. Léze DNA a RNA způsobené endogenními faktory se obvykle vyskytují častěji než poškození způsobené exogenními faktory.[1]

Endogenní faktory

Endogenní zdroje specifického poškození DNA zahrnují cesty jako hydrolýza, oxidace, alkylace nesoulad bází DNA, depurinace, depyrimidinace, dvouvláknové zlomy (DSS) a cytosinová deaminace. Léze DNA mohou také přirozeně nastat při uvolňování specifických sloučenin, jako jsou reaktivní formy kyslíku (ROS), reaktivní druhy dusíku (RNS), reaktivní karbonylové druhy (RCS), peroxidace lipidů produkty, adukty, a alkylační činidla prostřednictvím metabolických procesů. ROS je jedním z hlavních endogenních zdrojů poškození DNA a nejvíce studovaným oxidativním DNA aduktem je 8-oxo-dG. Další známé adukty, které se tvoří, jsou adukty DNA odvozené od etheno-, propano- a malondialdehydu. Aldehydy vytvořené peroxidací lipidů také představují další hrozbu pro DNA.[2] Proteiny, jako jsou „poškození“ proteiny (DDP), mohou podporovat endogenní poškození DNA buď zvýšením množství reaktivního kyslíku transmembránovými transportéry, ztrátou chromozomů vazbou replisomu a zastavením replikace transkripčními faktory.[3] Konkrétně pro léze RNA patří mezi nejhojnější typy endogenního poškození oxidace, alkylace a chlorování.[4] Fagocytické buňky produkují radikální druhy, které zahrnují kyselina chlorná (HOCl), oxid dusnatý (NE •) a peroxynitrit (ONOO-) v boji proti infekcím a mnoho buněčných typů používá jako signální molekulu oxid dusnatý. Tyto radikální druhy však mohou také způsobit cesty, které tvoří léze RNA.[5]

Fotodimer tyminu způsobený UV zářením

Exogenní faktory

Ultrafialová radiace

UV záření, forma ionizujícího záření, způsobuje přímé poškození DNA zahájením syntézy mezi dvěma molekulami thyminu. Výsledný dimer je velmi stabilní. I když je lze odstranit excizními opravami, při velkém poškození UV se celá molekula DNA rozpadne a buňka zemře. Pokud poškození není příliš rozsáhlé, ze zdravých buněk se vytvoří prekancerózní nebo rakovinné buňky.[6]

Chemoterapeutické léky

Chemoterapeutika záměrně indukují poškození DNA a jsou zaměřena na rychle se dělící rakovinné buňky.[7] Tyto léky však nemohou poznat rozdíl mezi nemocnými a zdravými buňkami, což má za následek poškození normálních buněk.[8]

Alkylační činidla

Alkylační činidla jsou typem chemoterapeutického léčiva, které chrání buňku před podstupováním mitózy poškozením její DNA. Pracují ve všech fázích buněčného cyklu. Použití alkylačních činidel může vést k leukémii, protože je schopna cílit na buňky kostní dřeně.[8]

Látky způsobující rakovinu

Je známo, že karcinogeny způsobují řadu lézí DNA, jako jsou jednořetězcové zlomy, dvouřetězcové zlomy a kovalentně vázané chemické adukty DNA. Tabákové výrobky jsou jedním z nejběžnějších činitelů způsobujících rakovinu současnosti.[9] Mezi další látky způsobující rakovinu způsobující rakovinu patří azbest, který může způsobit poškození fyzickou interakcí s DNA nebo nepřímým spuštěním reaktivních forem kyslíku,[10] nadměrné vystavení niklu, které může potlačit cesty poškození a opravy DNA,[11] aflatoxiny, které se nacházejí v potravinách,[9] a mnoho dalších.

Léze nukleových kyselin

Druhy poškození strukturní DNA molekulární lézí

Oxidační léze

Oxidační léze jsou zastřešující kategorií lézí způsobených reaktivní formy kyslíku (ROS), reaktivní druhy dusíku (RNS), další vedlejší produkty buněčný metabolismus a exogenní faktory, jako jsou ionizující nebo ultrafialová radiace.[12] Vedlejší produkty oxidačního dýchání jsou hlavním zdrojem reaktivních látek, které způsobují základní hladinu oxidačních lézí v buňce. Tím je ovlivněna jak DNA, tak RNA a bylo zjištěno, že oxidační léze RNA jsou u lidí hojnější ve srovnání s DNA. To může být splatné cytoplazmatický RNA mající bližší blízkost k elektronový transportní řetězec.[13] Známých oxidačních lézí charakterizovaných v DNA a RNA je mnoho, protože oxidované produkty jsou nestabilní a mohou rychle odeznít. The hydroxylový radikál a singletový kyslík jsou běžné reaktivní formy kyslíku odpovědné za tyto léze.[14] 8-oxo-guanin (8-oxoG) je nejhojnější a nejlépe charakterizovaná oxidační léze, která se nachází jak v RNA, tak v DNA. Akumulace 8-oxoG může způsobit vážné poškození uvnitř mitochondrie a je považován za klíčového hráče v procesu stárnutí.[15] Oxidace RNA má přímé důsledky v produkce bílkovin. mRNA ovlivněn oxidačními lézemi je stále rozpoznáván ribozom, ale ribozom projde zablokováním a dysfunkcí. To má za následek, že proteiny mají buď sníženou expresi nebo zkrácení, což vede k agregaci a obecné dysfunkci.[16]

Strukturální přestavby

  • Depurinace je způsobeno hydrolýza a vede ke ztrátě, pokud purinový základ nukleové kyseliny. DNA je k tomu náchylnější, protože přechodový stav v depurační reakci má mnohem větší energii v RNA.[17]
  • Tautomerizace je chemická reakce, která je primárně relevantní v chování aminokyselin a nukleových kyselin. Oba jsou korelovány s DNA a RNA. Proces tautomerizace DNA bází probíhá během replikace DNA. Schopnost chybného tautomeru jedné ze standardních nukleových bází spárovat způsobuje během procesu replikace DNA mutaci, která může být pro buňku cytotoxická nebo mutagenní. Výsledkem těchto chybných párování je přechod, transverze, shifthift, vymazání a / nebo duplikační mutace.[18] Některá onemocnění, která jsou výsledkem poškození DNA vyvolaných tautomerizací, zahrnují Kearns-Sayreho syndrom, Syndrom křehkého X, Kennedyho choroba, a Huntingtonova choroba.[18]
  • Cytosin deaminace běžně se vyskytuje za fyziologických podmínek a je to v podstatě deaminace cytosinu. Tento proces poskytuje uracil jako produkt, který není párem bází nalezeným v DNA. Tento proces způsobuje rozsáhlé poškození DNA. Rychlost tohoto procesu je významně zpomalena u dvouvláknové DNA ve srovnání s jednořetězcovou DNA.[19]

Single a Double Stranded Breaks

K jednořetězcovým zlomům (SSB) dochází, když jedno vlákno dvojité šroubovice DNA zažívá v tomto bodě zlomení jednoho nukleotidu doprovázené poškozenými 5'- a / nebo 3'-konci. Jeden běžný zdroj SSB je způsoben oxidativním útokem fyziologickým reaktivní formy kyslíku (ROS), jako je peroxid vodíku. H2Ó2 způsobuje SSB třikrát častěji než dvouřetězcové zlomy (DSB). Alternativní metody získávání SSB zahrnují přímý rozpad oxidovaného cukru nebo opravu poškozených bází pomocí DNA base-excision repair (BER). Navíc mohou buněčné enzymy provádět chybnou aktivitu vedoucí k SSB nebo DSB různými mechanismy. Jedním z takových příkladů by bylo, kdyby štěpný komplex tvořil DNA topoizomeráza 1 (TOP1) uvolňuje DNA během transkripce a replikace přechodnou tvorbou a přezdívka. Zatímco TOP1 krátce poté tento nick normálně uzavře, může dojít ke kolizi těchto štěpných komplexů RNA nebo DNA polymerázy nebo být proximálně k jiným lézím, což vede k SSB vázaným na TOP1 nebo DSB vázaným na TOP1.[20]

Chemické adukty

A DNA adukt je segment DNA, který se váže na chemický karcinogen. Některé adukty, které způsobují poškození DNA, zahrnovaly oxidativně modifikované báze, adukty indukované propano-, etheno- a MDA.[2] 5-Hydroxymethyluracil je příkladem oxidačně modifikované báze, kde dochází k oxidaci methylové skupiny thyminu.[21] Tento adukt interferuje s vazbou transkripčních faktorů na DNA, která se může spustit apoptóza nebo vést k delečním mutacím.[21] Propanové adukty jsou odvozeny od druhů generovaných peroxidací lipidů. Například, HNE je hlavním toxickým produktem procesu.[22] Reguluje expresi genů, které se účastní regulace buněčného cyklu a apoptózy. Některé z aldehydů z peroxidace lipidů lze převést na epoxyaldehydy oxidačními reakcemi.[23] Tyto epoxyaldehydy mohou poškodit DNA produkcí ethenoaduktů. Zvýšení tohoto typu léze DNA vykazuje podmínky vedoucí k oxidační stres o kterém je známo, že je spojen se zvýšeným rizikem rakoviny.[24] Malondialdehyd (MDA) je další vysoce toxický produkt z peroxidace lipidů a také při syntéze prostaglandinu. MDA reaguje s DNA za vzniku aduktu M1dG, který způsobuje poškození DNA.[2]

Účinky nemoci

Existuje mnoho systémů k opravě lézí DNA a RNA, ale je možné, aby léze těmto opatřením unikly. To může vést k mutacím nebo velkým abnormalitám genomu, které mohou ohrozit schopnost buňky nebo organismu žít. Několik rakovin je důsledkem lézí DNA. Dokonce i opravné mechanismy k vyléčení poškození mohou nakonec způsobit větší škody. Neshoda opravy defekty například způsobují nestabilitu, která predisponuje ke kolorektálním a endometriálním karcinomům.[9]

Léze DNA v neuronech mohou vést k neurodegenerativním poruchám, jako je Alzheimerova choroba, Huntington's a Parkinsonova choroba nemoci. Ty pocházejí z toho, že neurony jsou obecně spojovány s vysokým mitochondriálním dýcháním a produkcí redoxních druhů, které mohou poškodit jadernou DNA. Vzhledem k tomu, že tyto buňky nelze po poškození často vyměnit, poškození, které na nich bylo způsobeno, má strašlivé následky. Mezi další poruchy pramenící z lézí DNA a jejich asociace s neurony patří mimo jiné syndrom Fragile X, Friedrichova ataxie, a spinocerebelární ataxie.[9]

V průběhu replikace, obvykle DNA polymerázy nejsou schopny projít kolem poškozené oblasti, nicméně některé buňky jsou vybaveny speciálními polymerázami, které umožňují translesionovou syntézu (TLS). TLS polymerázy umožňují replikaci minulých lézí DNA a riziko generování mutací s vysokou frekvencí. Běžné mutace, ke kterým dojde po podstoupení tohoto procesu, jsou bodové mutace a mutace posunu snímků. Výsledkem tohoto procesu je několik nemocí, včetně několika druhů rakoviny a Xeroderma pigmentosum.[25]

Účinek oxidačně poškozené RNA vedl k řadě lidských onemocnění a je zvláště spojen s chronickou degenerací. Tento typ poškození byl pozorován u mnoha neurodegenerativních onemocnění, jako je Amyotrofní laterální skleróza,[9] Alzheimerova choroba, Parkinsonova choroba, demence s Lewyho tělísky a několik prionových onemocnění.[26] Je důležité si uvědomit, že tento seznam rychle roste a údaje naznačují, že k oxidaci RNA dochází časně ve vývoji těchto onemocnění, spíše než jako účinek buněčného rozpadu.[9] Léze RNA a DNA jsou spojeny s vývojem diabetes mellitus typ 2.[9]

Opravné mechanismy

Odpověď na poškození DNA

Když je DNA poškozený například v důsledku léze je aktivována složitá signální transdukční dráha, která je zodpovědná za rozpoznání poškození a podněcování odpovědi buňky na opravu. Ve srovnání s jinými mechanismy opravy lézí je DDR nejvyšší úrovní opravy a používá se u nejsložitějších lézí. DDR se skládá z různých drah, z nichž nejběžnější jsou signální kaskády DDR kinázy. Ty jsou řízeny kinázy související s fosfatidylinositol 3-kinázou (PIKK) a pohybují se od DNA-dependentní protein kinázy (DNA-PKcs) a ataxie telangiectasia-mutované (ATM), které se nejvíce podílejí na opravách DSB, na univerzálnější související s Rad3 (ATR). ATR je zásadní pro životaschopnost lidských buněk, zatímco mutace ATM způsobují závažnou poruchu ataxia-telangiektázie což vede k neurodegeneraci, rakovině a imunodeficienci. Všechny tyto tři DDR kinázy rozpoznávají poškození prostřednictvím interakcí protein-protein, které lokalizují kinázy do oblastí poškození. Dále další interakce protein-protein a posttranslační úpravy (PTM) dokončují aktivaci kinázy a dochází k řadě fosforylačních událostí. DDR kinázy provádějí regulaci opravy na třech úrovních - prostřednictvím PTM, na úrovni chromatin, a na úrovni jádro.[27]

Cesta BER

Oprava základní excize

Oprava základní excize (BER ) je odpovědný za odstranění poškozených bází v DNA. Tento mechanismus konkrétně pracuje na vyříznutí malých bazálních lézí, které na rozdíl od oprava nukleotidové excize cesta, která se používá při opravě výraznějších zkreslujících lézí. DNA glykosylázy iniciují BER jak rozpoznáním vadných nebo nesprávných bází, tak jejich odstraněním a formováním AP stránky chybí jakýkoli purin nebo pyrimidin. AP endonukleáza poté štěpí místo AP a jednořetězcový zlom se buď zpracovává krátkou náplastí BER, aby nahradil jeden nukleotid, dlouhou náplastí BER, aby se vytvořily 2-10 náhradní nukleotidy.[28]

Oprava jednoploškového zlomu

DNA DSB Repair System

Jednořetězcové zlomy (SSB) mohou vážně ohrozit genetickou stabilitu a přežití buněk, pokud nejsou rychle a správně opraveny, takže buňky vyvinuly rychlé a účinné mechanismy opravy SSB (SSBR). Zatímco globální systémy SSBR extrahují SSB v celém genomu a během mezifáze, procesy SSBR specifické pro S-fázi pracují společně s homologní rekombinací na replikačních vidlicích.[29]

Oprava dvojitého lankového zlomu

Dvouřetězcové zlomy (DSB) představují hrozbu pro všechny organismy, protože mohou způsobit buněčnou smrt a rakovinu. Mohou být způsobeny exogenně v důsledku záření a endogenně z chyb v replikaci nebo setkání s lézemi DNA replikační vidličkou.[30] Oprava DSB dochází různými způsoby a mechanismy, aby se tyto chyby správně opravily.

Nucleotide Excision and Mismatch Repair

Oprava nukleotidové excize je jedním z hlavních mechanismů používaných k odstranění objemných aduktů z lézí DNA způsobených chemoterapeutickými léky, mutageny prostředí a hlavně UV zářením.[9] Tento mechanismus funguje uvolněním krátkého poškození obsahujícího oligonukleotid z místa DNA a poté je tato mezera vyplněna a opravena NER.[9] NER rozpoznává řadu strukturálně nesouvisejících lézí DNA díky flexibilitě samotného mechanismu, protože NER je vysoce citlivý na změny v Spirálová struktura DNA.[31] Zdá se, že objemné adukty spouští NER.[31] Heterotrimer XPC-RAD23-CETN2 zapojený do NER má klíčovou roli v rozpoznávání lézí DNA.[32] Kromě dalších obecných lézí v genomu, UV poškozený DNA vazebný proteinový komplex (UV-DDB) má také důležitou roli jak v rozpoznávání, tak v opravě UV fotovolionů DNA.[32]

Neshoda opravy (MMR) mechanismy v buňce korigují základní párové spárování, ke kterým dochází během replikace pomocí různých cest. Má vysokou afinitu k cílení na léze DNA se specifičností, jako alterace v stohování párů bází které se vyskytují v místech poškození DNA, ovlivňují spirálová struktura.[33] Toto je pravděpodobně jeden z mnoha signálů, které spouští MMR.

Reference

  1. ^ Chakarov, Stoyan; Petkova, Rumena; Russev, George Ch; Zhelev, Nikolai (2014-02-23). "Poškození DNA a mutace. Druhy poškození DNA". BioDiscovery. 11 (11): e8957. Bibcode:2014BioDi..11 .... 1C. doi:10.7750 / BioDiscovery.2014.11.1. ISSN  2050-2966.
  2. ^ A b C De Bont, Rinne; van Larebeke, Nik (01.05.2004). „Endogenní poškození DNA u lidí: přehled kvantitativních údajů“. Mutageneze. 19 (3): 169–185. doi:10.1093 / mutage / geh025. ISSN  0267-8357. PMID  15123782.
  3. ^ Xia, červen; Chiu, Li-Ya; Nehring, Ralf B .; Núñez, María Angélica Bravo; Mei, Qian; Perez, Mercedes; Zhai, Yin; Fitzgerald, Devon M .; Pribis, John P .; Wang, Yumeng; Hu, Chenyue W. (01.01.2019). „Síť proteinů mezi bakteriemi a lidmi odhaluje původ poškození endogenní DNA“. Buňka. 176 (1–2): 127–143.e24. doi:10.1016 / j.cell.2018.12.008. ISSN  0092-8674. PMC  6344048. PMID  30633903.
  4. ^ Yan, Liewei L .; Zaher, Hani S. (2019-10-11). „Jak se buňky vyrovnávají s poškozením RNA a jeho důsledky?“. The Journal of Biological Chemistry. 294 (41): 15158–15171. doi:10.1074 / jbc.REV119.006513. ISSN  0021-9258. PMC  6791314. PMID  31439666.
  5. ^ Wurtmann, Elisabeth J .; Wolin, Sandra L. (2009). „RNA at attack: Cellular handling of RNA damage“. Kritické recenze v biochemii a molekulární biologii. 44 (1): 34–49. doi:10.1080/10409230802594043. ISSN  1040-9238. PMC  2656420. PMID  19089684.
  6. ^ „Jak ultrafialové světlo zabíjí buňky?“. Scientific American. Citováno 2020-11-30.
  7. ^ Woods, Derek; Turchi, John J. (01.05.2013). „Odpověď na poškození DNA vyvolaná chemoterapií“. Biologie a terapie rakoviny. 14 (5): 379–389. doi:10,4161 / cbt.23761. ISSN  1538-4047. PMC  3672181. PMID  23380594.
  8. ^ A b „Jak fungují chemoterapeutické léky“. www.cancer.org. Citováno 2020-11-30.
  9. ^ A b C d E F G h i Jackson, Stephen P .; Bartek, Jiří (22.10.2009). „Reakce na poškození DNA v biologii a nemoci člověka“. Příroda. 461 (7267): 1071–1078. Bibcode:2009Natur.461.1071J. doi:10.1038 / nature08467. ISSN  0028-0836. PMC  2906700. PMID  19847258.
  10. ^ Okayasu, Ryuichi; Takahashi, Sentaro; Yamada, Shigeru; Ahoj, Tom K .; Ullrich, Robert L. (01.01.1999). „Azbest a DNA Double Strand Breaks“. Výzkum rakoviny. 59 (2): 298–300. ISSN  0008-5472. PMID  9927035.
  11. ^ Guo, Hongrui; Liu, Huan; Wu, Hongbin; Cui, Hengmin; Fang, Jing; Zuo, Zhicai; Deng, Junliang; Li, Yinglun; Wang, Xun; Zhao, Ling (2019-09-21). „Mechanismus karcinogeneze niklu: poškození DNA“. International Journal of Molecular Sciences. 20 (19): 4690. doi:10,3390 / ijms20194690. ISSN  1422-0067. PMC  6802009. PMID  31546657.
  12. ^ Cooke, Marcus S .; Evans, Mark D .; Dizdaroglu, Miral; Lunec, Joseph (2003). „Oxidační poškození DNA: mechanismy, mutace a nemoci“. FASEB Journal. 17 (10): 1195–1214. doi:10.1096 / fj.02-0752rev. ISSN  1530-6860. PMID  12832285.
  13. ^ Weimann, Allan; Belling, Dorthe; Poulsen, Henrik E. (2002-01-15). „Kvantifikace 8-oxo-guaninu a guaninu ve formě nukleobáze, nukleosidu a deoxynukleosidu v lidské moči pomocí vysoce účinné kapalinové chromatografie - elektrosprejová tandemová hmotnostní spektrometrie“. Výzkum nukleových kyselin. 30 (2): e7. doi:10.1093 / nar / 30.2.e7. ISSN  0305-1048. PMC  99846. PMID  11788733.
  14. ^ Calabretta, Alessandro; Küpfer, Pascal A .; Leumann, Christian J. (2015-05-19). „Vliv lézí bází RNA na translaci mRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 43 (9): 4713–4720. doi:10.1093 / nar / gkv377. ISSN  1362-4962. PMC  4482091. PMID  25897124.
  15. ^ Radak, Zsolt; Boldogh, Istvan (2010-08-15). „8-oxo-7,8-dihydroguanin: vazba na genovou expresi, stárnutí a obranu proti oxidačnímu stresu“. Radikální biologie a medicína zdarma. 49 (4): 587–596. doi:10.1016 / j.freeradbiomed.2010.05.008. ISSN  0891-5849. PMC  2943936. PMID  20483371.
  16. ^ Poulsen, Henrik E .; Specht, Elisabeth; Broedbaek, Kasper; Henriksen, Trine; Ellervik, Christina; Mandrup-Poulsen, Thomas; Tonnesen, Morten; Nielsen, Peter E .; Andersen, Henrik U .; Weimann, Allan (2012-04-15). „Modifikace RNA oxidací: nový mechanismus onemocnění?“. Radikální biologie a medicína zdarma. 52 (8): 1353–1361. doi:10.1016 / j.freeradbiomed.2012.01.009. ISSN  1873-4596. PMID  22306201.
  17. ^ Cavalieri, Ercole; Saeed, Muhammad; Zahid, Muhammad; Cassada, David; Snow, Daniel; Miljkovic, Momcilo; Rogan, Eleanor (únor 2012). „Mechanismus vylučování DNA karcinogeny ve vztahu k iniciaci rakoviny“. IUBMB Life. 64 (2): 169–179. doi:10.1002 / iub.586. ISSN  1521-6543. PMC  4418633. PMID  22162200.
  18. ^ A b Griffiths, Anthony JF; Miller, Jeffrey H .; Suzuki, David T .; Lewontin, Richard C .; Gelbart, William M. (2000). „Spontánní mutace“. Úvod do genetické analýzy. 7. vydání.
  19. ^ „Poškození DNA - hlavní příčina chybějících kousků z puzzle DNA | NEB“. www.neb.com. Citováno 2020-12-01.
  20. ^ Caldecott, Keith W. (srpen 2008). „Oprava zlomení jednoho vlákna a genetické onemocnění“. Genetika hodnocení přírody. 9 (8): 619–631. doi:10.1038 / nrg2380. ISSN  1471-0064. PMID  18626472.
  21. ^ A b Rogstad, Daniel K .; Liu, Pingfang; Burdzy, Artur; Lin, Susan S .; Sowers, Lawrence C. (2002-06-25). „Endogenní DNA léze mohou inhibovat vazbu transkripčního faktoru AP-1 (c-Jun)“. Biochemie. 41 (25): 8093–8102. doi:10.1021 / bi012180a. ISSN  0006-2960. PMID  12069602.
  22. ^ Esterbauer, H .; Eckl, P .; Ortner, A. (květen 1990). „Možné mutageny odvozené od lipidů a lipidových prekurzorů“. Mutační výzkum. 238 (3): 223–233. doi:10.1016/0165-1110(90)90014-3. ISSN  0027-5107. PMID  2342513.
  23. ^ Chung, F.L .; Chen, H. J .; Nath, R. G. (říjen 1996). „Peroxidace lipidů jako potenciální endogenní zdroj pro tvorbu exocyklických DNA aduktů“. Karcinogeneze. 17 (10): 2105–2111. doi:10.1093 / carcin / 17.10.2105. ISSN  0143-3334. PMID  8895475.
  24. ^ Bartsch, H .; Nair, J. (2000-11-16). „Ultrasenzitivní a specifické detekční metody pro adukty exocylické DNA: markery pro peroxidaci lipidů a oxidační stres“. Toxikologie. 153 (1–3): 105–114. doi:10.1016 / s0300-483x (00) 00307-3. ISSN  0300-483X. PMID  11090950.
  25. ^ Pagès, Vincent; Fuchs, Robert PP (prosinec 2002). „Jak se léze DNA přeměňují na mutace v buňkách?“. Onkogen. 21 (58): 8957–8966. doi:10.1038 / sj.onc.1206006. ISSN  1476-5594. PMID  12483512. S2CID  25226350.
  26. ^ Fimognari, Carmela (2015). „Úloha poškození oxidační RNA u chronicko-degenerativních onemocnění“. Oxidační medicína a buněčná dlouhověkost. 2015: 358713. doi:10.1155/2015/358713. ISSN  1942-0900. PMC  4452857. PMID  26078805.
  27. ^ Sirbu, Bianca M .; Cortez, David (srpen 2013). „Odpověď na poškození DNA: tři úrovně regulace oprav DNA“. Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 5 (8): a012724. doi:10.1101 / cshperspect.a012724. ISSN  1943-0264. PMC  3721278. PMID  23813586.
  28. ^ Krokan, Hans E .; Bjørås, Magnar (duben 2013). "Oprava základní excize". Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 5 (4): a012583. doi:10.1101 / cshperspect.a012583. ISSN  1943-0264. PMC  3683898. PMID  23545420.
  29. ^ Jackson, Stephen P. (01.05.2002). „Snímání a oprava dvouřetězcových zlomů DNA“. Karcinogeneze. 23 (5): 687–696. doi:10.1093 / carcin / 23.5.687. ISSN  0143-3334. PMID  12016139.
  30. ^ Cannan, Wendy J .; Pederson, David S. (leden 2016). "Mechanismy a důsledky tvorby dvouřetězcové DNA přerušení v chromatinu". Journal of Cellular Physiology. 231 (1): 3–14. doi:10,1002 / jcp.25048. ISSN  0021-9541. PMC  4994891. PMID  26040249.
  31. ^ A b de Boer, Jan; Hoeijmakers, Jan H. J. (03.03.2000). „Nukleotidová excize a lidské syndromy“. Karcinogeneze. 21 (3): 453–460. doi:10.1093 / carcin / 21.3.453. ISSN  0143-3334. PMID  10688865.
  32. ^ A b Kusakabe, Masayuki; Onishi, Yuki; Tada, Haruto; Kurihara, Fumika; Kusao, Kanako; Furukawa, Mari; Iwai, Shigenori; Yokoi, Masayuki; Sakai, Wataru; Sugasawa, Kaoru (2019-01-25). "Mechanismus a regulace rozpoznávání poškození DNA při opravě excize nukleotidů". Geny a prostředí. 41 (1): 2. doi:10.1186 / s41021-019-0119-6. ISSN  1880-7062. PMC  6346561. PMID  30700997.
  33. ^ Hsieh, Peggy; Yamane, Kazuhiko (2008). „Oprava nesouladu DNA: Molekulární mechanismus, rakovina a stárnutí“. Mechanismy stárnutí a rozvoje. 129 (7–8): 391–407. doi:10.1016 / j.mad.2008.02.012. ISSN  0047-6374. PMC  2574955. PMID  18406444.