Mikrobiální genetika - Microbial genetics - Wikipedia

Mikrobiální genetika je oborová oblast uvnitř mikrobiologie a genetické inženýrství. Mikrobiální genetika studuje mikroorganismy pro různé účely. Pozorované mikroorganismy jsou bakterie a archaea. Některé houby a prvoky jsou také předměty používané ke studiu v této oblasti. Studie mikroorganismů zahrnují studie genotypu a expresního systému. Genotypy jsou zděděné složení organismu. (Austin, „Genotype,“ n.d.) Genetické inženýrství je obor práce a studia v rámci mikrobiální genetiky.[1] Procesem této práce je použití technologie rekombinantní DNA.[1] Tento proces zahrnuje vytváření molekul rekombinantní DNA manipulací se sekvencí DNA.[1] Vytvořená DNA je pak v kontaktu s hostitelským organismem. Klonování je také příkladem genetického inženýrství.[1]

Od objevu mikroorganismů Robertem Hookem a Antoni van Leeuwenhoekem v období 1665-1885[2] oni byli používáni ke studiu mnoha procesů a měli aplikace v různých oblastech studia v genetice. Například: Rychlý růst mikroorganismů a krátké generační časy jsou vědci využívány ke studiu evoluce. Objevy Roberta Hookea a Antoniho van Leeuwenhoeka zahrnovaly vyobrazení, pozorování a popisy mikroorganismů.[3] Mucor je mikroskopická houba, kterou Hooke představil a vylíčil.[4] Jeho přínos je, Mucor jako první mikroorganismus, který má být ilustrován. Příspěvek Antoniho van Leeuwenhoeka k mikroskopickým prvokům a mikroskopickým bakteriím přinesl vědecká pozorování a popisy.[4] Těchto příspěvků bylo dosaženo jednoduchým mikroskopem, který vedl k pochopení dnešních mikrobů a pokračuje v porozumění vědců.[5]Mikrobiální genetika má také aplikace ve schopnosti studovat procesy a cesty podobné těm, které se nacházejí u lidí, jako je metabolismus léčiv.[6]

Role v porozumění evoluci

Mikrobiální genetika se může soustředit na práci Charlese Darwina a vědci pokračovali ve studiu jeho práce a teorií pomocí mikrobů.[7] Konkrétně se jako zdroj používá Darwinova teorie přirozeného výběru. Studium evoluce pomocí mikrobiální genetiky zahrnuje vědce, kteří hledají evoluční rovnováhu.[1] Příkladem toho, jak toho mohou dosáhnout, je studium přirozeného výběru nebo driftu mikrobů.[7] Aplikace těchto znalostí pochází z hledání přítomnosti nebo nepřítomnosti různými způsoby.[7] Mezi způsoby patří identifikace určitých drah, genů a funkcí. Jakmile je subjekt pozorován, může jej vědec porovnat se sekvencí konzervovaného genu.[1] Proces studia mikrobiální evoluce tímto způsobem postrádá schopnost poskytnout časové měřítko, kdy k evoluci došlo.[7] Testováním evoluce tímto způsobem se však vědec může naučit rychlosti a výsledky evoluce. Studium vztahu mezi mikroby a prostředím je klíčovou součástí evoluce mikrobiální genetiky.[8]

Mikroorganismy, jejichž studium je obsaženo v mikrobiální genetice

Bakterie

Bakterie jsou klasifikovány podle jejich tvaru.

Bakterie jsou na této planetě přibližně 3,5 miliardy let a jsou klasifikovány podle jejich tvaru.[9] Bakteriální genetika studuje mechanismy jejich dědičných informací, jejich chromozomy, plazmidy, transpozice, a fágy.[10]

Zahrnují systémy přenosu genů, které byly rozsáhle studovány u bakterií genetická transformace, časování a transdukce. Přirozená transformace je bakteriální adaptace pro přenos DNA mezi dvěma buňkami intervenujícím médiem. Příjem dárcovské DNA a její rekombinační inkorporace do chromozomu příjemce závisí na expresi mnoha bakteriálních genů, jejichž produkty řídí tento proces.[11][12] Transformace je obecně složitý vývojový proces vyžadující energii, který se jeví jako adaptace na opravu poškození DNA.[13]

Bakteriální konjugace je přenos genetického materiálu mezi bakteriální buňky přímým kontaktem z buňky na buňku nebo mostovým spojením mezi dvěma buňkami. Bakteriální konjugace byla rozsáhle studována v Escherichia coli, ale také se vyskytuje v jiných bakteriích, jako jsou Mycobacterium smegmatis. Konjugace vyžaduje stabilní a prodloužený kontakt mezi kmenem dárce a příjemce DNase rezistentní a přenesená DNA je začleněna do chromozomu příjemce pomocí homologní rekombinace. E-coli konjugace je zprostředkována expresí plazmid geny, zatímco mykobakteriální konjugace je zprostředkována geny na bakteriálním chromozomu.[14]

Transdukce je proces, kterým cizí DNA je zaveden do buňky pomocí a virus nebo virový vektor. Transdukce je běžný nástroj používaný molekulárními biology ke stabilnímu zavedení cizího genu do hostitelské buňky genom.

Archaea

Archaea je doménou organismů, které jsou prokaryotický, jednobuněčné a předpokládá se, že se vyvinuly před 4 miliardami let. „Ve svých buňkách nemají buněčné jádro ani žádné jiné organely.“ Archaea se asexuálně replikuje v procesu známém jako binární štěpení. Cyklus buněčného dělení zahrnuje, když se chromozomy dceřiných buněk replikují. Protože archea má chromozom singulární struktury, oddělují se tyto dvě dceřiné buňky a dělí se buňky. Archaea má pohyblivost včetně bičíků, což je struktura podobná ocasu. Archaální chromozomy se replikují z různých počátků replikace a produkují dvě haploidní dceřiné buňky.[15] "[16] Sdílejí společného předka bakterie, ale ve srovnání s bakteriemi mají užší vztah k eukaryotům.[17] Některé Archaea jsou schopny přežít extrémní prostředí, což vede k mnoha aplikacím v oblasti genetiky. Jednou z takových aplikací je použití archaálních enzymů, které by lépe dokázaly přežít drsné podmínky in vitro.[18]

Genový přenos a genetická výměna byly studovány v halofilní archaeon Halobacterium volcanii a hypertermofilní archeonové Sulfolobus solfataricus a Sulfolobus acidocaldarius. H. sopky tvoří cytoplazmatické můstky mezi buňkami, které se zřejmě používají pro přenos DNA z jedné buňky do druhé v obou směrech.[19] Když S. solfataricus a S. acidocaldarius jsou vystaveni látkám poškozujícím DNA, je vyvolána druhově specifická buněčná agregace. Buněčná agregace s vysokou frekvencí zprostředkovává výměnu chromozomálních markerů a genetickou rekombinaci. Předpokládá se, že buněčná agregace zvyšuje druhově specifický přenos DNA mezi nimi Sulfolobus buňky za účelem zajištění zvýšené opravy poškozené DNA pomocí homologní rekombinace.[20][21][22] Archaea jsou rozděleny do 3 podskupin, kterými jsou halofily, methanogeny a termoacidofily. První skupina, methanogeny, jsou archaeobakterie, které žijí v bažinách a močálech i ve střevech lidí. Hrají také hlavní roli při rozpadu a rozkladu s mrtvými organismy. Methanogeny jsou anaerobní organismy, které se zabíjejí, když jsou vystaveny kyslíku. Druhá podskupina archeabakterií, halofily, jsou organismy, které jsou přítomny v oblastech s vysokou koncentrací solí, jako je Velké slané jezero a Mrtvé moře. Třetí podskupina thermoacidophiles také volal termophiles, jsou organismy, které žijí v kyselých oblastech. Jsou přítomny v oblastech s nízkými hodnotami pH, jako jsou horké prameny a gejzíry. Většina termofilů se nachází v Yellowstonském národním parku.[23]

Archaeal Genetics je studium genů, které se skládají z buněk bez jader.[24] Archaea má jediný kruhový chromozom, který obsahuje více počátků replikace pro zahájení syntézy DNA.[25] Replikace DNA Archaey zahrnuje podobné procesy včetně iniciace, prodloužení a ukončení. Primáza použitá k syntéze RNA primeru se liší než u eukaryot. Primáza z archea je vysoce odvozená verze rozpoznávacího motivu RNA (RRM).[25] Archaea pochází z grampozitivních bakterií, které mají jednu lipidovou dvojvrstvu, která je odolná vůči antibiotikům. Archaea jsou podobné mitochondriím u eukaryot v tom, že uvolňují energii jako adenosintrifosfát (ATP) chemickou reakcí zvanou metabolismus.[25] Některé archaea známé jako fototrofní archea využívají sluneční energii k produkci ATP. ATP syntáza se používá jako fotofosforylace k přeměně chemických látek na ATP.[15]

Archea a bakterie jsou strukturálně podobné, i když ve stromu života nejsou úzce spjaty. Tvary bakterií i buněk archaea se liší od sférického tvaru známého jako kokus nebo tyčového tvaru známého jako bacil. Jsou také spojeny s žádnou vnitřní membránou a buněčnou stěnou, která pomáhá buňce udržovat svůj tvar. I když mají buňky archaealy buněčné stěny, neobsahují peptidoglykan, což znamená, že archaea neprodukuje celulózu ani chitin. Archaea jsou nejblíže příbuzné eukaryotům kvůli tRNA přítomné v archaea, ale ne v bakteriích. Archaea mají stejné ribozomy jako eukaryota, které se syntetizují do proteinů.[26] Kromě morfologie archea a bakterií existují mezi těmito doménami další rozdíly. Archaea, které žijí v extrémním a drsném prostředí s nízkými hodnotami pH, jako jsou solná jezera, oceány a ve střevech přežvýkavců a lidí, jsou také známé jako extremofily. Naproti tomu bakterie se nacházejí v různých oblastech, jako jsou rostliny, zvířata, půda a kameny.[27]

Houby

Houby mohou být mnohobuněčné i jednobuněčné organismy a odlišují se od ostatních mikroby mimochodem, jak získávají živiny. Houby vylučují enzymy do jejich okolí, rozložit organickou hmotu.[9] Plísňová genetika používá droždí a vláknité houby jako modelové organismy pro eukaryotický genetický výzkum, včetně buněčný cyklus nařízení, chromatin struktura a genová regulace.[28]

Studie houba Neurospora crassa podstatně přispěly k pochopení toho, jak geny práce. N. crassa je druh červeného chleba plíseň z kmen Ascomycota. Používá se jako modelový organismus protože se snadno pěstuje a má haploidní životní cyklus, který dělá genetický analýza jednoduchá, protože u potomků se projeví recesivní rysy. Analýzu genetické rekombinace usnadňuje uspořádané uspořádání produktů redukční dělení buněk v askospory. Ve svém přirozeném prostředí N. crassa žije hlavně v tropických a subtropických oblastech. Často ho lze nalézt na mrtvé rostlinné hmotě po požárech.

Neurospora byl používán uživatelem Edward Tatum a George Beadle ve svých experimentech[29] za kterou vyhráli Nobelova cena za fyziologii nebo medicínu v roce 1958. Výsledky těchto experimentů vedly přímo k jedna hypotéza gen-jeden enzym to konkrétní geny kód pro konkrétní bílkoviny. Tento koncept se ukázal být úvodní zbraní v tom, co se stalo molekulární genetika a veškerý vývoj, který z toho vyplynul.[30]

Saccharomyces cerevisiae je droždí z kmen Ascomycota. Během vegetativního růstu, ke kterému obvykle dochází, když je dostatek živin, S. cerevisiae reprodukuje mitóza tak jako diploidní buňky. Když však tyto buňky vyhladoví, podstoupí je redukční dělení buněk tvořit haploidní výtrusy.[31] K páření dochází, když jsou haploidní buňky opačné typy páření MATa a MATα přicházejí do styku. Ruderfer a kol.[32] poukázal na to, že v přírodě jsou takové kontakty mezi blízce příbuznými kvasinkovými buňkami časté ze dvou důvodů. První je, že buňky opačného typu páření jsou přítomny společně ve stejném acus vak, který obsahuje buňky přímo produkované jedinou redukční dělení buněk a tyto buňky se mohou navzájem spojit. Druhým důvodem je to haploidní buňky jednoho typu páření po dělení buněk často produkují buňky opačného typu páření. Analýza původu přírodních S. cerevisiae kmeny dospěly k závěru, že k křížení dochází velmi zřídka (jen asi jednou za 50 000 dělení buněk).[32] Relativní vzácnost meiotických událostí, které jsou výsledkem křížení, naznačuje, že možné dlouhodobé výhody křížení (např. Generování rozmanitosti) je nepravděpodobné, že by stačily k obecnému udržení pohlaví z jedné generace na druhou. Spíše krátkodobá výhoda, jako je meiotická rekombinační oprava poškození DNA způsobená stresujícími podmínkami (jako je hladovění)[33] může být klíčem k udržení sexu v S. cerevisiae.

Candida albicans je diploidní houba, která roste jako kvasnice i jako vlákno. C. albicans je nejběžnější houba patogen u lidí. Způsobuje jak oslabující infekce sliznic, tak potenciálně život ohrožující systémové infekce. C. albicans si udržuje propracovaný, ale do značné míry skrytý spojovací aparát.[34] Johnson[34] navrhl, že to mohou pářící strategie umožnit C. albicans přežít v nepřátelském prostředí savčího hostitele.

Mezi 250 známými druhy aspergilli, přibližně 33% má identifikovaný sexuální stav.[35] Mezi nimi Aspergillus druhy, které vykazují pohlavní cyklus, jsou drtivé většiny v přírodě homotalický (samooplodňující).[35] Selfing v homothalické houbě Aspergillus nidulans Zahrnuje aktivaci stejných cest páření charakteristických pro pohlaví u druhů, které procházejí křížením, tj. samooplodnění neobchází požadované cesty pro křížení pohlaví, ale místo toho vyžaduje aktivaci těchto cest u jediného jedince.[36] Fúze haploidních jader probíhá v reprodukčních strukturách nazývaných kleistothecie, ve kterém diploidní zygota podléhá meiotickému dělení za vzniku haploidu askospory.

Prvoci

Prvoci jsou jednobuněčné organismy, které mají jádra, a ultramikroskopická buněčná těla v jejich cytoplazmě.[9] Jeden konkrétní aspekt prvoků, který je zajímavý pro lidské genetiky, je jejich bičíky, které jsou velmi podobné lidským spermie bičíky.

Studie z Paramecium přispěly k našemu pochopení funkce meiózy. Jako všichni náčelníci, Paramecium má polyploidní makronukleus a jeden nebo více diploidní mikrojader. The makronukleus řídí nereprodukční funkce buněk a vyjadřuje geny potřebné pro každodenní fungování. The mikrojader je generativní, nebo zárodečná linie jádro obsahující genetický materiál, který se předává z jedné generace na druhou.[37]

V asexuální fázi štěpení růstu, během níž dochází k dělení buněk mitóza spíše než redukční dělení buněk nastává klonální stárnutí vedoucí k postupné ztrátě vitality. U některých druhů, jako jsou dobře studované Paramecium tetraurelia, asexuální linie klonálně stárnoucí paramecie ztrácí vitalitu a vyprší po asi 200 štěpeních, pokud buňky nepodstoupí meiózu následovanou buď autogamií (samooplodnění) nebo konjugací (křížení) (viz stárnutí v Paramecium ). Poškození DNA se dramaticky zvyšuje během postupného dělení klonálních buněk a je pravděpodobnou příčinou klonálního stárnutí v P. tetraurelia.[38][39][40]

Když klonálně stárl P. tetraurelia jsou stimulovány k podstoupení meiózy ve spojení s kterýmkoli z nich autogamie nebo časování potomci jsou omlazeni a mohou mít mnohem více mitotických dělení na binární štěpení. Během jednoho z těchto procesů podstoupí mikrojader buňky (buněk) meiózu, starý makronukleus se rozpadne a nový makronukleus se vytvoří replikací mikrojaderné DNA, která meioze nedávno prošla. Zjevně je malé, pokud vůbec, poškození DNA v novém makronukleu, což naznačuje, že omlazení je spojeno s opravou těchto poškození v mikronukleu během meiózy.[Citace je zapotřebí ]

Viry

Viry jsou kapsid -kódující organismy složené z proteinů a nukleových kyselin, které se mohou po replikaci v hostitelské buňce samy sestavit pomocí replikačního aparátu hostitele.[41] Ve vědě panuje neshoda ohledně toho, zda viry žijí kvůli jejich nedostatku ribozomy.[41] Porozumění virovému genomu je důležité nejen pro studium genetiky, ale také pro pochopení jejich patogenních vlastností.[42]

Mnoho druhů virů je schopných genetické rekombinace. Když buňku infikují dva nebo více jednotlivých virů stejného typu, mohou se jejich genomy navzájem rekombinovat za vzniku potomstva rekombinantního viru. Jak DNA, tak RNA viry mohou podstoupit rekombinaci. Když dva nebo více virů, z nichž každý obsahuje smrtelné genomové poškození, infikuje stejnou hostitelskou buňku, virové genomy se často mohou navzájem spárovat a podstoupit homologní rekombinační opravu za vzniku životaschopného potomstva.[43][44] Tento proces je znám jako multiplicitní reaktivace.[43][45] Enzymy používané při multiplicitní reaktivaci jsou funkčně homologní s enzymy používanými při bakteriální a eukaryotické rekombinační opravě. Bylo zjištěno, že k reaktivaci multiplicity dochází u patogenních virů včetně viru chřipky, HIV-1, opičího viru adenoviru 40, viru vakcínie, reoviru, polioviru a viru herpes simplex, stejně jako u mnoha bakteriofágů.[45]

Každý živý organismus může nakazit virus tím, že dá parazitům příležitost růst. Paraziti se živí živinami jiného organismu, což umožňuje viru prospívat. Jakmile lidské tělo detekuje virus, vytvoří potom bojové buňky, které zaútočí na parazita / virus; doslova, což způsobilo válku v těle.[46] Virus může postihnout jakoukoli část těla a způsobit širokou škálu nemocí, jako je chřipka, nachlazení a pohlavně přenosné choroby.[46] Chřipka je virus přenášený vzduchem, který prochází malými kapičkami a je formálně známý jako chřipka. Paraziti cestují vzduchem a útočí na dýchací systém člověka. Lidé, kteří jsou původně infikováni tímto virem, přenášejí infekci běžnou každodenní činností, jako je mluvení a kýchání. Když člověk přijde do styku s virem, na rozdíl od běžného nachlazení virus chřipky postihuje lidi téměř okamžitě. Příznaky tohoto viru jsou velmi podobné běžnému nachlazení, ale mnohem horší. Bolesti těla, bolest v krku, bolesti hlavy, studený pot, bolesti svalů a únava patří k mnoha příznakům, které virus doprovází.[47] Virová infekce v horních dýchacích cestách vede k nachlazení.[48] S příznaky, jako je bolest v krku, kýchání, malá horečka a kašel, je nachlazení obvykle neškodné a má sklon k úlevě asi za týden. Nachlazení je také virus, který se šíří vzduchem, ale může také projít přímým kontaktem. U této infekce se projeví příznaky několik dní; na rozdíl od chřipky jde o postupný proces.[48]

Aplikace mikrobiální genetiky

Taq polymeráza, která se používá při polymerázové řetězové reakci (PCR)

Mikroby jsou ideální pro biochemické a genetika studie a významně přispěly k těmto vědním oblastem, například k prokázání, že DNA je genetický materiál,[49][50] že gen má jednoduchou lineární strukturu,[51] že genetický kód je tripletový kód,[52] a tato genová exprese je regulována specifickými genetickými procesy.[53] Jacques Monod a François Jacob použitý Escherichia coli, druh bakterie, za účelem vývoje operon model genová exprese, které stanoví základ genové exprese a regulace.[54] Kromě toho dědičný procesy jednobuněčných eukaryotických mikroorganismů jsou podobné procesům v mnohobuněčných organismech, což vědcům umožňuje také shromažďovat informace o tomto procesu.[55] Další bakterie, která významně přispěla k poli genetika je Thermus aquaticus, což je bakterie, která snáší vysoké teploty. Z tohoto mikroba vědci izolovali enzym Taq polymeráza, který se nyní používá v silné experimentální technice, Polymerázová řetězová reakce (PCR).[56] Dále vývoj technologie rekombinantní DNA díky použití bakterií vedlo ke vzniku moderních genetické inženýrství a biotechnologie.[9]

Pomocí mikrobů byly vyvinuty protokoly pro vložení genů do bakterií plazmidy, s využitím jejich rychlé reprodukce, aby biofaktory pro požadovaný gen. Tyto geneticky upravené bakterie mohou produkovat léčiva jako inzulín, lidský růstový hormon, interferony a faktory srážení krve.[9] Tyto biofaktory jsou obvykle mnohem levnější na provoz a údržbu než alternativní postupy výroby farmaceutik. Jsou jako miliony malých farmaceutických strojů, které k výrobě velkého množství produktu vyžadují pouze základní suroviny a správné prostředí. Využití samotného začlenění genu lidského inzulínu mělo hluboký dopad na lékařský průmysl. Předpokládá se, že biofaktory mohou být konečným klíčem ke snížení ceny drahých život zachraňujících farmaceutických sloučenin.

Mikroby syntetizují řadu enzymů pro průmyslové aplikace, jako jsou fermentované potraviny, laboratorní testovací činidla, mléčné výrobky (jako např. renin ), a dokonce i v oblečení (např Trichoderma houba, jejíž enzym se používá k tomu, aby džínům dodával vzhled omývaný kamenem).[9]

V současné době existuje potenciál pro použití mikrobů jako alternativy povrchově aktivních látek na bázi ropy. Mikrobiální povrchově aktivní látky by stále měly stejný druh hydrofilní a hydrofobní funkční skupiny jako jejich protějšky na bázi ropy, ale oproti své konkurenci mají řadu výhod. Pro srovnání, mikrobiální amphiphillic sloučeniny mají silnou tendenci zůstat funkční v extrémních prostředích, jako jsou oblasti s vysokou teplotou nebo extrémní ph. to vše je biologicky odbouratelné a méně toxické pro životní prostředí. Tento efektivní a levný způsob výroby by mohl být řešením stále rostoucí globální spotřeby povrchově aktivních látek. Je ironií, že aplikací pro biologicky aktivní povrchově aktivní látky s největší poptávkou je ropný průmysl, který používá povrchově aktivní látky při obecné výrobě i při vývoji specifických olejových složení.[57]

Mikroby jsou bohatým zdrojem lipázy které mají širokou škálu průmyslových a spotřebitelských aplikací. Enzymy vykonávat širokou škálu funkcí uvnitř buněk živých věcí, takže má smysl pouze to, že je můžeme použít k podobným účelům ve větším měřítku. Mikrobiální enzymy jsou typicky výhodné pro hromadnou výrobu kvůli široké škále dostupných funkcí a jejich schopnosti hromadně vyrábět. Rostlinné a živočišné enzymy jsou obvykle příliš drahé na to, aby se vyráběly hromadně, ale není tomu tak vždy. Zvláště v rostlinách. Průmyslové aplikace lipáz obecně zahrnují enzym jako účinnější a nákladově efektivnější katalyzátor při výrobě komerčně cenných chemikálií z tuků a olejů, protože jsou schopny udržet si své specifické vlastnosti v mírných podmínkách se snadnou údržbou a pracovat ve zvýšené míře . Mezi další již úspěšné aplikace lipolytických enzymů patří výroba biopaliv, polymerů, nesteroidních farmaceutik, zemědělských sloučenin a látek zlepšujících chuť.[58]

Pokud jde o průmyslovou optimalizaci, výhodou metody výroby biofaktorů je schopnost přímé optimalizace pomocí řízené evoluce. Efektivita a specifičnost výroby se časem zvýší zavedením umělého výběru. Tato metoda zvyšování efektivity není v zemědělství nic nového, ale je to relativně nový koncept v průmyslové výrobě. Předpokládá se, že tato metoda bude mnohem lepší než konvenční průmyslové metody, protože máte optimalizaci na více frontách. První věcí je, že mikroorganismy, které tvoří biofaktory, lze vyvinout podle našich potřeb. Druhým prvkem je konvenční metoda optimalizace způsobená integrací pokrokových technologií. Tato kombinace konvenčního a biologického pokroku se teprve nyní využívá a poskytuje prakticky neomezený počet aplikací.[59]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C d E F "Mikroby a nástroje genetického inženýrství | Mikrobiologie". courses.lumenlearning.com. Citováno 17. listopadu 2018.
  2. ^ Gest, Hau (22. května 2004). „Objev mikroorganismů Robert Hooke a Antoni van Leeuwenhoek, členové Královské společnosti“. Poznámky a záznamy Královské společnosti v Londýně. 58 (2): 137–201. doi:10.1098 / rsnr.2004.0055. PMID  15209075. S2CID  8297229.
  3. ^ „BBC - Historie - Historické osobnosti: Antonie van Leeuwenhoek (1632 - 1723)“. Citováno 17. listopadu 2018.
  4. ^ A b „antonie van leeuwenhoek: Topics by Science.gov“. www.science.gov. Citováno 17. listopadu 2018.
  5. ^ Mortlock, Robert (2013). Mikroorganismy jako modelové systémy pro studium evoluce. Springer Verlag. p. 2. ISBN  978-1-4684-4846-7.
  6. ^ Murphy, Cormac D. (2. září 2014). "Metabolismus léčiv v mikroorganismech". Biotechnologické dopisy. 37 (1): 19–28. doi:10.1007 / s10529-014-1653-8. hdl:10197/7674. PMID  25179825. S2CID  16636885.
  7. ^ A b C d Buckley, veselý; Reid, Ann (2011). Mikrobiální evoluce.
  8. ^ Chakraborty, Ranajit; Budowle, Bruce (2011). „Populační genetické úvahy při statistické interpretaci mikrobiálních forenzních dat ve srovnání s forenzním standardem lidské DNA“. Mikrobiální forenzní. 561–580. doi:10.1016 / B978-0-12-382006-8.00033-5. ISBN  978-0-12-382006-8.
  9. ^ A b C d E F Weeks, Benjamin S. (2012). Mikroby a společnost Alcamo (3. vyd.). Sudbury, MA: Jones & Bartlett Learning. ISBN  978-0-7637-9064-6.
  10. ^ "Bakteriální genetika". Příroda. Macmillan Publishers Limited. Citováno 8. listopadu 2015.
  11. ^ Chen I, Dubnau D (2004). "Příjem DNA během bakteriální transformace". Příroda Recenze Mikrobiologie. 2 (3): 241–9. doi:10.1038 / nrmicro844. PMID  15083159. S2CID  205499369.
  12. ^ Johnsborg O, Eldholm V, Håvarstein LS (2007). "Přirozená genetická transformace: prevalence, mechanismy a funkce". Výzkum v mikrobiologii. 158 (10): 767–78. doi:10.1016 / j.resmic.2007.09.004. PMID  17997281.
  13. ^ Michod RE, Bernstein H, Nedelcu AM (2008). "Adaptivní hodnota pohlaví v mikrobiálních patogenech". Infekce, genetika a evoluce. 8 (3): 267–85. doi:10.1016 / j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.
  14. ^ Gray TA, Krywy JA, Harold J, Palumbo MJ, Derbyshire KM (2013). „Distribuční manželský přenos v mykobakteriích generuje potomky s meiotickým mozaicismem podobným genomu, což umožňuje mapování lokusu identity páření“. PLOS Biology. 11 (7): e1001602. doi:10.1371 / journal.pbio.1001602. PMC  3706393. PMID  23874149.
  15. ^ A b Hogan, Michael. „Co jsou Archaea? - Encyklopedie života“. Encyklopedie života.
  16. ^ „Encyklopedie života“.
  17. ^ "Archaea". Svět mikrobů. Svět mikrobů. Archivovány od originál dne 23. listopadu 2015. Citováno 8. listopadu 2015.
  18. ^ Chambers, Cecilia R .; Patrick, Wayne M. (2015). „Archaealové nukleové kyseliny a jejich potenciál v biotechnologiích“. Archaea. 2015: 170571. doi:10.1155/2015/170571. PMC  4606414. PMID  26494982.
  19. ^ Rosenshine I, Tchelet R, Mevarech M (1989). "Mechanismus přenosu DNA v systému páření archaebacterium". Věda. 245 (4924): 1387–9. Bibcode:1989Sci ... 245.1387R. doi:10.1126 / science.2818746. PMID  2818746.
  20. ^ Fröls S, Ajon M, Wagner M, Teichmann D, Zolghadr B, Folea M, Boekema EJ, Driessen AJ, Schleper C, Albers SV (2008). „UV-indukovatelná buněčná agregace hypertermofilního archaeonu Sulfolobus solfataricus je zprostředkována tvorbou pili“ (PDF). Molekulární mikrobiologie. 70 (4): 938–52. doi:10.1111 / j.1365-2958.2008.06459.x. PMID  18990182. S2CID  12797510.
  21. ^ Fröls S, White MF, Schleper C (2009). "Reakce na poškození UV zářením v modelu archaeon Sulfolobus solfataricus". Transakce s biochemickou společností. 37 (Pt 1): 36–41. doi:10.1042 / BST0370036. PMID  19143598.
  22. ^ Ajon M, Fröls S, van Wolferen M, Stoecker K, Teichmann D, Driessen AJ, Grogan DW, Albers SV, Schleper C (2011). „UV-indukovatelná výměna DNA v hyperthermophilic archaea zprostředkovaná pili typu IV“ (PDF). Molekulární mikrobiologie. 82 (4): 807–17. doi:10.1111 / j.1365-2958.2011.07861.x. PMID  21999488. S2CID  42880145.
  23. ^ „Příklady archeobakterií“. BiologyWise.
  24. ^ "Archaeal genetics - nejnovější výzkumy a zprávy | Příroda". www.nature.com.
  25. ^ A b C "Archaeal Genetics | Boundless Microbiology". courses.lumenlearning.com.
  26. ^ "Morfologie Archaea". www.ucmp.berkeley.edu.
  27. ^ „Archaea vs Bacteria - rozdíl a srovnání | Rozlišit“.
  28. ^ "Houbová genetika". Nature.com. Macmillan Publishers Limited. Citováno 9. listopadu 2015.
  29. ^ Beadle GW, Tatum EL (1941). "Genetická kontrola biochemických reakcí v Neurospora". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 27 (11): 499–506. Bibcode:1941PNAS ... 27..499B. doi:10.1073 / pnas.27.11.499. PMC  1078370. PMID  16588492.
  30. ^ Horowitz NH, Berg P, Singer M, Lederberg J, Susman M, Doebley J, Crow JF (2004). „Sté výročí: George W. Beadle, 1903-1989“. Genetika. 166 (1): 1–10. doi:10.1534 / genetika.166.1.1. PMC  1470705. PMID  15020400.
  31. ^ Herskowitz I (1988). "Životní cyklus pučících kvasinek Saccharomyces cerevisiae". Mikrobiologické recenze. 52 (4): 536–53. doi:10.1128 / MMBR.52.4.536-553.1988. PMC  373162. PMID  3070323.
  32. ^ A b Ruderfer DM, Pratt SC, Seidel HS, Kruglyak L (2006). "Populační genomová analýza křížení a rekombinace v kvasinkách". Genetika přírody. 38 (9): 1077–81. doi:10.1038 / ng1859. PMID  16892060. S2CID  783720.
  33. ^ Birdsell, John A .; Wills, Christopher (2003). „Evoluční původ a udržování sexuální rekombinace: Přehled současných modelů“. Evoluční biologie. str. 27–138. doi:10.1007/978-1-4757-5190-1_2. ISBN  978-1-4419-3385-0.
  34. ^ A b Johnson A (2003). „Biologie páření u Candida albicans“. Příroda Recenze Mikrobiologie. 1 (2): 106–16. doi:10.1038 / nrmicro752. PMID  15035040. S2CID  1826178.
  35. ^ A b Dyer PS, O'Gorman CM (2012). „Sexuální vývoj a kryptická sexualita hub: poznatky z druhu Aspergillus“. Recenze mikrobiologie FEMS. 36 (1): 165–92. doi:10.1111 / j.1574-6976.2011.00308.x. PMID  22091779.
  36. ^ Paoletti M, Seymour FA, Alcocer MJ, Kaur N, Calvo AM, Archer DB, Dyer PS (2007). „Typ páření a genetický základ samoplodnosti u modelové houby Aspergillus nidulans“. Aktuální biologie. 17 (16): 1384–9. doi:10.1016 / j.cub.2007.07.012. PMID  17669651. S2CID  17068935.
  37. ^ Prescott DM (1994). „DNA řasinkatých prvoků“. Mikrobiologické recenze. 58 (2): 233–67. doi:10.1128 / MMBR.58.2.233-267.1994. PMC  372963. PMID  8078435.
  38. ^ Smith-Sonneborn J (1979). "Oprava DNA a zajištění dlouhověkosti u Paramecium tetraurelia". Věda. 203 (4385): 1115–7. Bibcode:1979Sci ... 203.1115S. doi:10.1126 / science.424739. PMID  424739.
  39. ^ Holmes GE, Holmes NR (1986). "Akumulace poškození DNA ve stárnutí Paramecium tetraurelia". Molekulární a obecná genetika. 204 (1): 108–14. doi:10.1007 / bf00330196. PMID  3091993. S2CID  11992591.
  40. ^ Gilley D, Blackburn EH (1994). "Nedostatek zkrácení telomer během stárnutí v Paramecium". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (5): 1955–8. Bibcode:1994PNAS ... 91.1955G. doi:10.1073 / pnas.91.5.1955. PMC  43283. PMID  8127914.
  41. ^ A b Raoult, Didier; Forterre, Patrick (3. března 2008). "Předefinování virů: lekce z Mimiviru". Příroda Recenze Mikrobiologie. 6 (4): 315–319. doi:10.1038 / nrmicro1858. PMID  18311164. S2CID  24447407.
  42. ^ Seto, Donald (30. listopadu 2010). „Virová genomika a bioinformatika“. Viry. 2 (12): 2587–2593. doi:10,3390 / v2122587. PMC  3185590. PMID  21994632.
  43. ^ A b Bernstein C (1981). "Oprava deoxyribonukleové kyseliny v bakteriofágu". Mikrobiologické recenze. 45 (1): 72–98. doi:10.1128 / MMBR.45.1.72-98.1981. PMC  281499. PMID  6261109.
  44. ^ Chen D, Bernstein C (1987). "Rekombinační oprava poškození peroxidu vodíku v DNA fága T4". Mutační výzkum. 184 (2): 87–98. doi:10.1016/0167-8817(87)90064-2. PMID  3627145.
  45. ^ A b Michod RE, Bernstein H, Nedelcu AM (květen 2008). "Adaptivní hodnota pohlaví v mikrobiálních patogenech". Infekce, genetika a evoluce. 8 (3): 267–85. doi:10.1016 / j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.http://www.hummingbirds.arizona.edu/Faculty/Michod/Downloads/IGE%20review%20sex.pdf
  46. ^ A b Tennant, Paula (12. března 2018). Viry: molekulární biologie, interakce s hostiteli a aplikace v biotechnologiích. Fermin, Gustavo, Foster, Jerome E. San Diego, CA. ISBN  9780128111949. OCLC  1028979396.
  47. ^ 1956-, Quinn, Tom (2008). Chřipka: sociální historie chřipky. Londýn: New Holland. ISBN  9781845379414. OCLC  232713128.CS1 maint: číselné názvy: seznam autorů (odkaz)
  48. ^ A b Greenhough, Beth (6. ledna 2012). „Tam, kde se druhy setkávají a mísí: endemické vztahy mezi lidmi a viry, ztělesněná komunikace a agentura více než člověka na Společné studené jednotce 1946–1990“. Kulturní geografie. 19 (3): 281–301. doi:10.1177/1474474011422029. ISSN  1474-4740.
  49. ^ Avery OT, MacLeod CM, McCarty M (1979). "Studie o chemické povaze látky vyvolávající transformaci pneumokokových typů. Indukce transformace frakcí desoxyribonukleové kyseliny izolované z pneumokoka typu III". Journal of Experimental Medicine. 149 (2): 297–326. doi:10.1084 / jem.149.2.297. PMC  2184805. PMID  33226.
  50. ^ Hershey AD, Chase M (1952). "Nezávislé funkce virového proteinu a nukleové kyseliny v růstu bakteriofága". Journal of General Physiology. 36 (1): 39–56. doi:10.1085 / jgp.36.1.39. PMC  2147348. PMID  12981234.
  51. ^ Benzer S (1959). „O topologii genetické jemné struktury“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 45 (11): 1607–20. Bibcode:1959PNAS ... 45.1607B. doi:10.1073 / pnas.45.11.1607. PMC  222769. PMID  16590553.
  52. ^ Crick FH, Barnett L, Brenner S, Watts-Tobin RJ (1961). "Obecná povaha genetického kódu pro bílkoviny". Příroda. 192 (4809): 1227–32. Bibcode:1961 Natur.192.1227C. doi:10.1038 / 1921227a0. PMID  13882203. S2CID  4276146.
  53. ^ Jacob F, Monod J (1961). "Genetické regulační mechanismy při syntéze proteinů". Journal of Molecular Biology. 3 (3): 318–56. doi:10.1016 / S0022-2836 (61) 80072-7. PMID  13718526.
  54. ^ „Mikrobiální genetika“. Svět mikrobiologie a imunologie. 2003. Citováno 9. listopadu 2015.
  55. ^ Bainbridge, B.W. (1987). Genetika mikrobů (2. vyd.). Glasgow: Blackie. ISBN  978-0-412-01281-5.
  56. ^ Terpe, Kay (1. listopadu 2013). "Přehled termostabilních DNA polymeráz pro klasické aplikace PCR: od molekulárních a biochemických základů po komerční systémy". Aplikovaná mikrobiologie a biotechnologie. 97 (24): 10243–10254. doi:10.1007 / s00253-013-5290-2. PMID  24177730. S2CID  13920919.
  57. ^ Banat, I. M .; Makkar, R. S .; Cameotra, S. S. (15. května 2000). "Potenciální komerční aplikace mikrobiálních povrchově aktivních látek". Aplikovaná mikrobiologie a biotechnologie. 53 (5): 495–508. doi:10,1007 / s002530051648. ISSN  0175-7598. PMID  10855707. S2CID  1706157.
  58. ^ Hasan, Fariha; Shah, Aamer Ali; Hameed, Abdul (26. června 2006). "Průmyslové aplikace mikrobiálních lipáz". Enzymová a mikrobiální technologie. 39 (2): 235–251. doi:10.1016 / j.enzmictec.2005.10.016. ISSN  0141-0229.
  59. ^ Kondo, Akihiko; Ishii, červen; Hara, Kiyotaka Y .; Hasunuma, Tomohisa; Matsuda, Fumio (20. ledna 2013). „Vývoj továren na mikrobiální buňky pro biorafinérii prostřednictvím syntetického bioinženýrství“. Journal of Biotechnology. 163 (2): 204–216. doi:10.1016 / j.jbiotec.2012.05.021. ISSN  0168-1656. PMID  22728424.