Sulfolobus solfataricus - Sulfolobus solfataricus
Sulfolobus solfataricus | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | |
Druh: | S. solfataricus |
Binomické jméno | |
Saccharolobus solfataricus (Stetter a Zillig 1980) Sakai a Kurosawa 2018 |
Saccharolobus solfataricus je druh z termofilní archaeon. Byl převeden z rodu Sulfolobus do nového rodu Saccharolobus s popisem Saccharolobus caldissimus v roce 2018.[1]
Poprvé byl izolován a objeven v Solfatara sopka (podle níž byla následně pojmenována) v roce 1980 dvěma německými mikrobiology Karlem Setterem a Wolframem Zilligem v sopce Solfatara (Pisciarelli-Campania, Itálie).[2]
Tyto organismy však nejsou izolovány od sopek, ale nacházejí se po celém světě na místech, jako jsou horké prameny. Tento druh roste nejlépe při teplotách kolem 80 ° C, při hodnotě pH mezi 2 a 4 a při dostatečném množství síry solfataricus metabolizovat za účelem získání energie. Tyto podmínky ji kvalifikují jako extremophile a to je konkrétně známé jako termoacidofil protože dává přednost vysokým teplotám a nízkým hodnotám pH a je také v aerobní a heterotropní kategorii pro svůj metabolický systém.[3] Obvykle má sférický tvar buněk a vytváří časté laloky. Být autotrofní přijímá energii z růstu na síře nebo dokonce na různých organických sloučeninách.[4]
V současné době je to nejvíce studovaný organismus, který je uvnitř Crenarchaeota větev. Solfataricus jsou zkoumány pro jejich metody replikace DNA, buněčného cyklu, chromozomální integrace, transkripce, zpracování RNA a translace. Všechna data ukazují, že organismus má velké procento archaeal-specifických genů, což ukazuje rozdíly mezi třemi typy mikrobů: archaea, bakterie, a eukarya.
Genom
Sulfolobus solfataricus je nejvíce studovaný mikroorganismus z molekulárního, genetického a biochemického hlediska pro schopnost prospívat v extrémním prostředí; je snadno kultivovatelný v laboratoři; kromě toho může vyměňovat genetický materiál prostřednictvím procesů transformace, transdukce a konjugace.
Hlavní motivací pro sekvenování těchto mikroorganismů je kvůli termostabilita z bílkoviny že normálně denaturace na vysoké teplota. Kompletní sekvence genom z S. solfataricus byla dokončena v roce 2001.[5] Na jednom chromozomu je 2 992 245 párů bází, které kódují 2977 bílkoviny a hojné RNA. Jedna třetina z S. solfataricus kódované proteiny nemají homology v jiných genomech. U zbývajících kódovaných proteinů je 40% specifických pro Archaea, 12% je sdíleno s Bakterie a 2,3% je sdíleno s Eukarya.;[6] 33% těchto proteinů je kódováno výhradně v Sulfolobus. Vysoký počet ORF (otevřený čtecí rámec) je si velmi podobný Termoplazma.[3]
Malé nukleolární RNA (snoRNA), které jsou již přítomny v eukaryotech, byly také identifikovány v S.Solfataricus a S.acidolcaldarius. Jsou již známí svou rolí, kterou hrají při posttranskripčních úpravách a odstraňování introny z ribozomální RNA v Eukaryi.[7]
Genom Sulfolobus je charakterizován přítomností krátkých tandemových opakování, vkládání a opakujících se prvků, má širokou škálu rozmanitosti, protože má 200 různých prvků sekvence vkládání IS.
Termofilní reverzní gyáza
Stabilizace dvojité šroubovice proti denaturaci v Archea je způsobena přítomností konkrétního specifického termofilního enzym, reverzní gyráza. Byl objeven u hypertermofilních a termofilních Archea a bakterií. Existují dva geny v Sulfolobus že každý kóduje reverzní gyrázu.[8] Je definován atypický Dna topoizomerázy a základní činnost spočívá ve výrobě pozitivních supercoilů v uzavřeném kruhovém Dna. Pozitivní překroucení je důležité, aby se zabránilo tvorbě otevřených komplexů. Reverzní gyázy se skládají ze dvou domén: první je helikáza a druhou je topoizomeráza I. Možnou rolí reverzní gyrázy může být použití pozitivní nadšroubovice pro sestavení struktur podobných chromatinu.[9] V roce 1997 vědci objevili další důležitou vlastnost Sulfolobus : tento mikroorganismus obsahuje topoizomerázu typu II zvanou TopoVI, jejíž podjednotka A je homologní s meiotický rekombinační faktor, Spo11 který hraje převládající roli při iniciaci meiotické rekombinace ve všech Eukaryách.[10][11]
S. solfataricus se skládá ze tří topoizomeráz typu I, TopA a dvou reverzních gyráz, TopR1 a TopR2, a jedné topoizomerázy typu II, TopoVI.[12]
Proteiny vázající DNA
V kmeni Crenarchaeota existují tři proteiny, které vážou vedlejší drážku Dna jako histony: Alba, Cren7 a Sso7d, které jsou upraveny po procesu překladu. Jsou malé a byly nalezeny v několika kmenech Sulfolobus, ale ne v jiném genomu. Sulfolobus představují 1-5% z celkového počtu. Mohou mít strukturální i regulační funkce. Vypadají jako lidské proteiny HMG-boxu, protože mají vliv na genomy, na expresi a stabilitu a na epigenetické procesy.[13] U druhů bez histonů mohou být acetylovány a methylovány jako eukaryotické histony.[14][15][16][17] Sulfolobus kmeny představují různé zvláštní proteiny vázající DNA, jako je rodina proteinů Sso7d. Stabilizují dvojitou spirálu a zabraňují denaturace při vysoké teplotě a tím podporuje žíhání nad bod tání.[18]
Hlavní složkou archaelového chromatinu je protein rodiny Sac10b známý jako Alba (acetylace snižuje vazebnou afinitu).[19][20] Tyto proteiny jsou malé, bazické a dimerní proteiny vázající nukleové kyseliny. Kromě toho je konzervován ve většině sekvenovaných archálních genomů.[21][22] Acetylační stav Alby jako příklad ovlivňuje přístup promotoru a transkripci in vitro, zatímco metylační stav jiného Sulfolobus chromatinový protein, Sso7D, se mění teplotou kultury.[23][24]
Práce skupiny Wolframa Zilliga, představující rané důkazy o eukaryotických charakteristikách transkripce v Archea, od té doby Sulfolobus ideální modelový systém pro transkripční studie. Nedávné studie v Sulfolobusu se kromě jiných druhů archaealů zaměřují hlavně na složení, funkci a regulaci transkripčního aparátu v těchto organismech a na základní konzervované aspekty tohoto procesu jak v Eucaryi, tak v Archaei.[25]
Přenos DNA
Vystavení Saccharolobus solfataricus na látky poškozující DNA UV záření, bleomycin nebo mitomycin C. indukuje buněčnou agregaci.[26] Jiné fyzikální stresory, jako jsou změny pH nebo teplotní posun, neindukují agregaci, což naznačuje, že indukce agregace je způsobena konkrétně poškozením DNA. Ajon a kol.[27] ukázalo, že UV-indukovaná buněčná agregace zprostředkovává výměnu chromozomálních markerů s vysokou frekvencí. Míra rekombinace překročila míru neindukovaných kultur až o tři řády. Frols a kol.[26][28] a Ajon a kol.[27] předpokládal, že proces přenosu DNA indukovatelný UV zářením a následný homologní rekombinace Oprava představuje důležitý mechanismus k udržení integrity chromozomu. Tato odpověď může být primitivní formou sexuální interakce, podobně jako studovanější bakteriální transformace, která je také spojena s přenosem DNA mezi buňkami, což vede k homologní rekombinační opravě poškození DNA.[Citace je zapotřebí ]
Metabolismus
Sulfolobus solfataricus je známo, že roste chemoorganotroficky za přítomnosti kyslíku na různých organických sloučeninách, jako jsou cukry, alkoholy, aminokyseliny a aromatické sloučeniny, jako je fenol.[29]
Používá upravený Entner-Doudroff cesta oxidace glukózy a výsledné molekuly pyruvátu mohou být zcela mineralizovány TCA cyklus.[29]
Molekulární kyslík je jediný známý akceptor elektronů na konci elektronový transportní řetězec.[30] Jiné než organické molekuly, tohle Archea druhy mohou také využít sirovodík[6] a elementární síra jako dárci elektronů a opravit CO2, případně prostřednictvím cyklu HP / HB,[29] což je také schopné žít chemoautotroficky. Nedávné studie také zjistily schopnost růst, i když pomalu, oxidujícího molekulárního vodíku.[1]
Ferredoxin
Ferredoxin je podezření, že působí jako hlavní metabolický nosič elektronů v S. solfataricus. To je v rozporu s většinou druhů v bakteriích a eukarijích, na které se obecně spoléhají NADH jako hlavní elektronový nosič. S. solfataricus má silné eukaryotické rysy spojené s mnoha jedinečnými archaealovými schopnostmi. Výsledky nálezů pocházejí z různých metod jejich mechanismů DNA, buněčných cyklů a přechodného aparátu. Celkově byla studie ukázkovým příkladem rozdílů zjištěných v crenarchaea a euryarchaea.[6][31]
Ekologie
Místo výskytu
S. solfataricus je extrémní termofil Archea, jako zbytek druhu rodu Sulfolobus, má optimální podmínky růstu v oblastech silné sopečné činnosti, s vysokou teplotou a velmi kyselým pH,[32] tyto specifické podmínky jsou typické pro vulkanickou oblast jako gejzíry nebo prameny Theraml, ve skutečnosti jsou nejvíce studované země, kde byly nalezeny mikroorganismy: USA (Yellowstonský národní park),[33] Nový Zéland,[34] Ostrov a Itálie, proslulé slavnými vulkanickými jevy, jako jsou tyto. Studie provedená týmem indonéských vědců prokázala přítomnost komunity Sulfolobus také na Západní Jávě a potvrdila, že vysoké obavy, nízký obsah ph a síry jsou nezbytnými podmínkami pro růst těchto mikrobů.[35]

Okyselování půdy
S. solfataricus je schopen oxidovat síru podle metabolické strategie, jedním z produktů těchto reakcí je H + a následně vede k pomalému okyselení okolí. Okyselování půdy se zvyšuje tam, kde dochází k emisím znečišťujících látek z průmyslové činnosti, a tento proces snižuje počet heterotrofních bakterií, které se podílejí na rozkladu, což je zásadní pro recyklaci organické hmoty a nakonec pro hnojení půdy.[36]
Biotechnologie: Uvolnění zdroje Sulfolobus
Dnes máme zájem o použití v mnoha oblastech použití Sulfolobus sulfataricus jako zdroj enzymů tepelné stability pro výzkum a diagnostiku, stejně jako v potravinářském, textilním a čisticím průmyslu a v papírenském a papírenském průmyslu. Kromě toho je tento enzym přetížen kvůli své katalytické rozmanitosti, vysoké hodnotě pH a teplotní stabilitě, zvýšené organickým rozpouštědlům a odolnosti proti proteolýze.[37][38]
V současné době jsou stále důležitější tetraesterové lipidy, membránové vezikuly s antimikrobiálními vlastnostmi, složky trehalózy a nové β-galaktooligosacharidy.[39]
β-galaktosidáza
Termostabilní enzym β-galaktosidáza izolován od extrémního termofilního archaebakteria Sulfolobus solfataricus, kmen MT-4.
Tento enzym se používal při mnoha průmyslových procesech tekutin obsahujících laktózu při čištění a charakterizaci jejich fyzikálně-chemických vlastností.[40]
Proteázy
Tento průmysl se zajímá o stabilní proteázy a také o mnoho různých proteáz sulfolobus, které byly studovány.[41]
Aktivní aminopeptidáza spojené s chaperonin byl popsán Solfobulus solfataricus MT4.[42]
Sommaruga et al. (2014)[43] také zlepšila stabilitu a výtěžek reakce dobře charakterizované karboxypeptidáza ze S.solfataricus MT4 magnetickými nanočásticemi imobilizujícími enzym.
Esterázy /Lipázy
Nový termostabilní extracelulární lipolytický enzym serin arylesteráza který je původně objeven pro jejich velký účinek při hydrolýze organofosfáty z termoacidofilního archeona Sulfolobus solfataricus P1.[44]
Chaperoniny
V reakci na teplotní šok (50,4 ° C) v E-coli buněk, byl ke zlepšení tolerance účinně použit malý teplý omračující protein (S.so-HSP20) od S.solfataricus P2.[45]
S ohledem na skutečnost, že chaperonin Ssocpn (920 kDa), který zahrnuje ATP, K + a Mg2 +, ale neprodukoval žádné další proteiny v S.solfataricus pro dodávání zhroucených a dynamických proteinů z denaturovaných materiálů, byl uložen na ultrafiltrační buňku, zatímco renaturované substráty se pohybovaly filmem.[46]
Liposomy
Díky svému tetraether-lipidovému materiálu je membrána extrémně teplomilné Archaey jedinečná svým složením. Lipidy Archaea jsou slibným zdrojem liposomů s výjimečnou stabilitou teploty a pH a těsností proti úniku rozpuštěné látky. Takové archeosomy jsou možnými nástroji pro dodávání léků, vakcín a genů.[47]
Reference
- ^ A b Sakai HD, Kurosawa N (duben 2018). „Saccharolobus caldissimus gen. Nov., Sp. Nov., Fakultativně anaerobní hypertermofilní archaeon redukující železo izolovaný z kyselého suchozemského horkého pramene a překlasifikace Sulfolobus solfataricus na Saccharolobus solfataricus comb. Nov. A Sulfolobus shibatae jako Saccharolobus shibatae. ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 68 (4): 1271–1278. doi:10.1099 / ijsem.0.002665. PMID 29485400.
- ^ "Kde byl poprvé nalezen Sulfolobus solfataricus?". www.intercept.cnrs.fr.
- ^ A b Ciaramella M, Pisani FM, Rossi M (srpen 2002). “Molekulární biologie extremophiles: nedávný pokrok na hyperthermophilic archaeon Sulfolobus”. Antonie van Leeuwenhoek. 81 (1–4): 85–97. doi:10.1023 / A: 1020577510469. PMID 12448708.
- ^ Brock TD, Brock KM, Belly RT, Weiss RL (1972). „Sulfolobus: nový rod bakterií oxidujících síru žijících při nízkém pH a vysoké teplotě“. Archiv für Mikrobiologie. 84 (1): 54–68. doi:10.1007 / bf00408082. PMID 4559703.
- ^ Charlebois RL, Gaasterland T, Ragan MA, Doolittle WF, Sensen CW (červen 1996). „Projekt genomu Sulfolobus solfataricus P2“. FEBS Dopisy. 389 (1): 88–91. doi:10.1016 / s0014-5793 (97) 81281-1. PMID 8682213.
- ^ A b C Ona Q, Singh RK, Confalonieri F, Zivanovic Y, Allard G, Awayez MJ a kol. (Červenec 2001). „Kompletní genom crenarchaeonu Sulfolobus solfataricus P2“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (14): 7835–40. Bibcode:2001PNAS ... 98.7835S. doi:10.1073 / pnas.141222098. PMC 35428. PMID 11427726.
- ^ Omer AD, Lowe TM, Russell AG, Ebhardt H, Eddy SR, Dennis PP (duben 2000). „Homology of small nucleolar RNAs in Archaea“. Věda. 288 (5465): 517–22. Bibcode:2000Sci ... 288..517O. doi:10.1126 / science.288.5465.517. PMID 10775111.
- ^ Couturier M, Bizard AH, Garnier F, Nadal M (září 2014). „Pohled na buněčné zapojení dvou reverzních gyráz z hypertermofilní archaeon Sulfolobus solfataricus“. BMC Molekulární biologie. 15 (1): 18. doi:10.1186/1471-2199-15-18. PMC 4183072. PMID 25200003.
- ^ Déclais AC, Marsault J, Confalonieri F, de La Tour CB, Duguet M (červen 2000). „Reverzní gyráza, tyto dvě domény úzce spolupracují na podpoře pozitivního převíjení“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (26): 19498–504. doi:10,1074 / jbc.m910091199. PMID 10748189.
- ^ Bergerat A, de Massy B, Gadelle D, Varoutas PC, Nicolas A, Forterre P (březen 1997). "Atypická topoizomeráza II z Archea s důsledky pro meiotickou rekombinaci". Příroda. 386 (6623): 414–7. Bibcode:1997 Natur.386..414B. doi:10.1038 / 386414a0. PMID 9121560.
- ^ Forterre P, Bergerat A, Lopez-Garcia P (květen 1996). „Jedinečná topologie DNA a DNA topoizomerázy hypertermofilní archy“. Recenze mikrobiologie FEMS. 18 (2–3): 237–48. doi:10.1111 / j.1574-6976.1996.tb00240.x. PMID 8639331.
- ^ Couturier M, Gadelle D, Forterre P, Nadal M, Garnier F (listopad 2019). „Reverzní gyráza TopR1 je zodpovědná za homeostatickou kontrolu nadšroubovění DNA v hypertermofilním archaeonu Sulfolobus solfataricus“. Molekulární mikrobiologie. 113 (2): 356–368. doi:10,1111 / mmi.14424. PMID 31713907.
- ^ Malarkey CS, Churchill ME (prosinec 2012). „Skupinová schránka pro vysokou mobilitu: konečný užitný hráč buňky“. Trendy v biochemických vědách. 37 (12): 553–62. doi:10.1016 / j.tibs.2012.09.003. PMC 4437563. PMID 23153957.
- ^ Payne S, McCarthy S, Johnson T, North E, Blum P (listopad 2018). "Sulfolobus solfataricus". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 115 (48): 12271–12276. doi:10.1073 / pnas.1808221115. PMC 6275508. PMID 30425171.
- ^ Guagliardi A, Cerchia L, Moracci M, Rossi M (říjen 2000). „Chromozomální protein sso7d crenarchaeonu Sulfolobus solfataricus zachraňuje agregované proteiny způsobem závislým na hydrolýze ATP“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (41): 31813–8. doi:10.1074 / jbc.m002122200. PMID 10908560.
- ^ Shehi E, Granata V, Del Vecchio P, Barone G, Fusi P, Tortora P, Graziano G (červenec 2003). „Tepelná stabilita a DNA vazebná aktivita variantní formy proteinu Sso7d z archeonu Sulfolobus solfataricus zkráceného na leucin 54“. Biochemie. 42 (27): 8362–8. doi:10.1021 / bi034520t. PMID 12846585.
- ^ Baumann H, Knapp S, Karshikoff A, Ladenstein R, Härd T (duben 1995). "DNA vázající povrch proteinu Sso7d ze Sulfolobus solfataricus". Journal of Molecular Biology. 247 (5): 840–6. doi:10.1006 / jmbi.1995.0184. PMID 7723036.
- ^ Guagliardi A, Napoli A, Rossi M, Ciaramella M (duben 1997). „Žíhání komplementárních řetězců DNA nad bodem tání duplexu podporovaného archaealním proteinem“. Journal of Molecular Biology. 267 (4): 841–8. doi:10.1006 / jmbi.1996.0873. PMID 9135116.
- ^ Forterre P, Confalonieri F, Knapp S (květen 1999). „Identifikace genu kódujícího proteiny vázající DNA specifické pro archeal z rodiny Sac10b“. Molekulární mikrobiologie. 32 (3): 669–70. doi:10.1046 / j.1365-2958.1999.01366.x. PMID 10320587.
- ^ Xue H, Guo R, Wen Y, Liu D, Huang L (červenec 2000). „Hojný protein vázající DNA z hypertermofilního archaeonu Sulfolobus shibatae ovlivňuje supercoiling DNA způsobem závislým na teplotě“. Journal of Bacteriology. 182 (14): 3929–33. doi:10.1128 / JB.182.14.3929-3933.2000. PMC 94576. PMID 10869069.
- ^ Goyal M, Banerjee C, Nag S, Bandyopadhyay U (květen 2016). "Rodina proteinů Alba: Struktura a funkce". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bílkoviny a proteomika. 1864 (5): 570–83. doi:10.1016 / j.bbapap.2016.02.015. PMID 26900088.
- ^ Wardleworth BN, Russell RJ, Bell SD, Taylor GL, White MF (září 2002). "Struktura Alby: archaeal chromatinový protein modulovaný acetylací". Časopis EMBO. 21 (17): 4654–62. doi:10.1093 / emboj / cdf465. PMC 125410. PMID 12198167.
- ^ Bell SD, Botting CH, Wardleworth BN, Jackson SP, White MF (duben 2002). „Interakce Alby, konzervativního proteinu archaeal chromatinu, se Sir2 a jeho regulace pomocí acetylace“. Věda. 296 (5565): 148–51. Bibcode:2002Sci ... 296..148B. doi:10.1126 / science.1070506. PMID 11935028.
- ^ Baumann H, Knapp S, Lundbäck T, Ladenstein R, Härd T (listopad 1994). "Struktura roztoku a vlastnosti DNA vázající termostabilní protein z archaeonu Sulfolobus solfataricus". Přírodní strukturní biologie. 1 (11): 808–19. doi:10.1038 / nsb1194-808. PMID 7634092.
- ^ Zillig W, Stetter KO, Janeković D (červen 1979). „DNA-dependentní RNA polymeráza z archaebacterium Sulfolobus acidocaldarius“. European Journal of Biochemistry. 96 (3): 597–604. doi:10.1111 / j.1432-1033.1979.tb13074.x. PMID 380989.
- ^ A b Fröls S, Ajon M, Wagner M, Teichmann D, Zolghadr B, Folea M a kol. (Listopad 2008). „UV-indukovatelná buněčná agregace hypertermofilního archaeonu Sulfolobus solfataricus je zprostředkována tvorbou pili“ (PDF). Molekulární mikrobiologie. 70 (4): 938–52. doi:10.1111 / j.1365-2958.2008.06459.x. PMID 18990182.
- ^ A b Ajon M, Fröls S, van Wolferen M, Stoecker K, Teichmann D, Driessen AJ a kol. (Listopad 2011). „UV-indukovatelná výměna DNA v hyperthermophilic archaea zprostředkovaná pili typu IV“ (PDF). Molekulární mikrobiologie. 82 (4): 807–17. doi:10.1111 / j.1365-2958.2011.07861.x. PMID 21999488.
- ^ Fröls S, White MF, Schleper C (únor 2009). „Reakce na poškození UV zářením u modelu Archaeon Sulfolobus solfataricus“. Transakce biochemické společnosti. 37 (Pt 1): 36–41. doi:10.1042 / BST0370036. PMID 19143598.
- ^ A b C Ulas T, Riemer SA, Zaparty M, Siebers B, Schomburg D (2012-08-31). „Rekonstrukce v měřítku genomu a analýza metabolické sítě v hypertermofilním archaeonu Sulfolobus solfataricus“. PLOS ONE. 7 (8): e43401. Bibcode:2012PLoSO ... 743401U. doi:10.1371 / journal.pone.0043401. PMC 3432047. PMID 22952675.
- ^ Simon G, Walther J, Zabeti N, Combet-Blanc Y, Auria R, van der Oost J, Casalot L (říjen 2009). "Vliv koncentrací O2 na Sulfolobus solfataricus P2". Mikrobiologické dopisy FEMS. 299 (2): 255–60. doi:10.1111 / j.1574-6968.2009.01759.x. PMID 19735462.
- ^ Zillig W, Stetter KO, Wunderl S, Schulz W, Priess H, Scholz I (duben 1980). „Sulfolobus-„ Caldariella “skupina: taxonomie na základě struktury DNA-závislých RNA polymeráz. Archiv mikrobiologie. 125 (3): 259–69. doi:10.1007 / BF00446886.
- ^ Grogan DW (prosinec 1989). „Fenotypová charakterizace archaebakteriálního rodu Sulfolobus: srovnání pěti kmenů divokého typu“. Journal of Bacteriology. 171 (12): 6710–9. doi:10.1128 / jb.171.12.6710-6719.1989. PMC 210567. PMID 2512283.
- ^ "Sulfolobus". Microbewiki.
- ^ Hetzer A, Morgan HW, McDonald IR, Daughney CJ (červenec 2007). "Mikrobiální život v Champagne Pool, geotermální pramen ve Waiotapu na Novém Zélandu". Extremophiles. 11 (4): 605–14. doi:10.1007 / s00792-007-0073-2. PMID 17426919.
- ^ Aditiawati P, Yohandini H, Madayanti F (2009). "Mikrobiální rozmanitost kyselého horkého pramene (kawah hujan B) v geotermálním poli oblasti kamojang, západní jáva-indonésie". Otevřený mikrobiologický deník. 3: 58–66. doi:10.2174/1874285800903010058. PMC 2681175. PMID 19440252.
- ^ Bryant RD, Gordy EA, Laishley EJ (1979). „Vliv okyselování půdy na půdní mikroflóru“. Znečištění vodou, vzduchem a půdou. 11 (4): 437. Bibcode:1979 WASP ... 11..437B. doi:10.1007 / BF00283435.
- ^ Štěpánková, Veronika (14. října 2013). „Strategie pro stabilizaci enzymů v organických rozpouštědlech“. ACS katalýza. 3 (12): 2823–2836. doi:10.1021 / cs400684x.
- ^ DANIEL, R. M. (1982). „Korelace mezi termostabilitou proteinu a odolností proti proteolýze“. Biochemical Journal. 207 (3): 641–644. doi:10.1042 / bj2070641. PMC 1153914. PMID 6819862.
- ^ Quehenberger, Julian (2017). „Sulfolobus - potenciální klíčový organizmus v budoucích biotechnologiích“. Hranice v mikrobiologii. 8: 2474. doi:10.3389 / fmicb.2017.02474. PMC 5733018. PMID 29312184.
- ^ M. PISANI, Francesca (1990). „Thermostable P-galactosidase from the archaebacterium Sulfolobus solfataricus“. European Journal of Biochemistry. 187 (2): 321–328. doi:10.1111 / j.1432-1033.1990.tb15308.x. PMID 2105216.
- ^ Hanner, Markus (1990). Izolace a charakterizace intracelulární aminopeptidázy z extrémní termofilní archaebakterie Sulfolobus solfataricus. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Obecné předměty. 1033. Elsevier B.V. str. 148–153. doi:10.1016 / 0304-4165 (90) 90005-H. ISBN 0117536121. PMID 2106344.
- ^ Byt, Ivano; Ruggero, Davide (1998). "Nová aminopeptidáza spojená s 60 kDa chaperoninem v termofilním archaeonu Sulfolobus solfataricus. Mol. Microbiol". Molekulární mikrobiologie. 29 (3): 775–785. doi:10.1046 / j.1365-2958.1998.00971.x. PMID 9723917.
- ^ Sommaruga, Silvia (2014). „mmobilizace karboxypeptidázy ze Sulfolobus solfataricus na magnetických nanočásticích zlepšuje stabilitu a funkčnost enzymů v organickém médiu. BMC Biotechnol“. BMC biotechnologie. 14 (1): 82. doi:10.1186/1472-6750-14-82. PMC 4177664. PMID 25193105.
- ^ Park, Young-Jun (2016). "Čištění a charakterizace nového indukovatelného termostabilního extracelulárního lipolytického enzymu z termoacidofilního archaeonu Sulfolobus solfataricus P1". Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic. 124: 11–19. doi:10.1016 / j.molcatb.2015.11.023.
- ^ Li, Dong-Chol (srpen 2011). „Termotolerance a funkce molekulárního chaperonu malého proteinu tepelného šoku HSP20 z hypertermofilního archaeonu, Sulfolobus solfataricus P2.. Stres buněk a chaperony. 17 (1): 103–108. doi:10.1007 / s12192-011-0289-z. PMC 3227843. PMID 21853411.
- ^ Cerchia, Laura (7. srpna 1999). „Archaický reaktor na bázi chaperoninu pro renaturaci denaturovaných proteinů. Extremophile“. Extremophiles: Život v extrémních podmínkách. 4 (1): 1–7. doi:10.1007 / s007920050001. PMID 10741831.
- ^ B. Patel, Girishchandra (1999). „Archeobakteriální etherové lipidové liposomy (archeosomy) jako nové systémy vakcín a dodávek léčiv“. Kritické recenze v biotechnologii. 19 (4): 317–357. doi:10.1080/0738-859991229170. PMID 10723627.
Další čtení
- Fiorentino G, Del Giudice I, Petraccone L, Bartolucci S, Del Vecchio P (červen 2014). "Konformační stabilita a ligandové vazebné vlastnosti BldR, člena rodiny MarR, od Sulfolobus solfataricus". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bílkoviny a proteomika. 1844 (6): 1167–72. doi:10.1016 / j.bbapap.2014.03.011. PMID 24704039.
- de Rosa M, Bemporad F, Pellegrino S, Chiti F, Bolognesi M, Ricagno S (září 2014). „Edge strand engineering helps native-like aggregation in Sulfolobus solfataricus acylphosphatase“. FEBS Journal. 281 (18): 4072–84. doi:10.1111 / febs.12861. PMID 24893801.
- Gamsjaeger R, Kariawasam R, Touma C, Kwan AH, White MF, Cubeddu L (říjen 2014). „Páteřní a postranní řetězce HH, ³³C a ⁵⁵N rezonanční přiřazení OB domény jednořetězcového proteinu vázajícího DNA ze Sulfolobus solfataricus a mapování chemického posunu rozhraní vázajícího DNA“. Přiřazení biomolekulárních NMR. 8 (2): 243–6. doi:10.1007 / s12104-013-9492-4. PMID 23749431.
- Wang J, Zhu J, Min C, Wu S (květen 2014). „CBD vazebná doména fúzovaná γ-laktamáza ze Sulfolobus solfataricus je účinným katalyzátorem pro produkci (-) γ-laktamu“. BMC biotechnologie. 14: 40. doi:10.1186/1472-6750-14-40. PMC 4041915. PMID 24884655.
'