Virus Lloviu - Lloviu virus - Wikipedia

Pro počítačový virus (virus ILOVEYOU), viz MILUJI TĚ.

Lloviu cuevavirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Negarnaviricota
Třída:Monjiviricetes
Objednat:Mononegavirales
Rodina:Filoviridae
Rod:Cuevavirus
Druh:
Lloviu cuevavirus
Členský virus

Virus Lloviu (LLOV)

Druh Lloviu cuevavirus (/ˈjɒprotijuːˌkwɛprotiəˈprotiaɪrəs/ YOV- jo KWEV-ə-VY-rəs ) je taxonomické domov viru, který tvoří vláknitý virion, Virus Lloviu (LLOV). Tento druh je zahrnut do rodu Cuevavirus.[1][2] LLOV je vzdálený příbuzný běžně známých Virus ebola a Virus Marburg.

Použití termínu

The druh Lloviu cuevavirus je virologický taxon (tj. umělý pojem ) zahrnuty do rodu Cuevavirus, rodina Filoviridae, objednat Mononegavirales.[1] Tento druh má jediný virus člen, virus Lloviu.[1] Název Lloviu cuevavirus je odvozen z Cueva del Lloviu (jméno a španělština jeskyně, ve které Lloviu cuevaviry byly poprvé objeveny) a taxonomické přípona virus (který označuje druh viru).[1]

V roce 2010 druh a rod cuevavirus byly navrženy jako nezávislé druhy a rody.[1] V červenci 2013 druh a rod cuevavirus byly ratifikovány Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV), který má být zahrnut do jeho zprávy, proto má být název nyní kurzívou.[3]

Kritéria pro zařazení druhů

Virus, který splňuje kritéria pro členství v rodu "Cuevavirus „je členem druhu„ Lloviu cuevavirus “, pokud má vlastnosti„ cuevaviruses “(protože v současnosti existuje pouze„cuevavirus "druh) a pokud se jeho genom liší od genomu viru Lloviu (varianta Bat86) o <30% na úrovni nukleotidů.[1]

Virus Lloviu (/ˈjɒprotijuː/ YOV- jo;[1] LLOV) je virus vzdáleně příbuzný dobře známým patogenům Virus ebola a Virus Marburg.[1][2]

Virus Lloviu je jediným členem tohoto druhu Lloviu cuevavirus, který je součástí rodu Cuevavirus, rodina Filoviridae, objednat Mononegavirales.[1][2] Název viru Lloviu je odvozen od Cueva del Lloviu, jméno a španělština jeskyně ve kterém byl poprvé objeven.[1]

Podle pravidel pro pojmenování taxonů stanovených v Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV), název virus Lloviu má být vždy kapitalizováno (protože „Lloviu“ je vlastní podstatné jméno), ale nikdy není kurzíva, a možná zkráceně (LLOV je oficiální zkratka).

Dějiny

LLOV byl objeven v roce 2011 v Schreibersovy dlouhé prsty (druh Miniopterus schreibersii) které byly nalezeny mrtvé v Cueva del Lloviu již v roce 2002, Asturie, Španělsko, stejně jako v jeskyních ve španělštině Kantábrie a v jeskyních v Francie a Portugalsko.[2] Dosud nebylo prokázáno, že virus je etiologický původce nové choroby netopýrů, ale u zdravých Schreibersových netopýrů s dlouhými prsty nebylo zjištěno, že obsahují stopy virů, což alespoň naznačuje, že virus může být patogenní u některých netopýrů. Nekropsie mrtvých netopýrů neodhalila makroskopické patologie, ale mikroskopický doporučeno vyšetření virová pneumonie.[2] Nejsou k dispozici žádné informace o tom, zda LLOV infikuje lidi.[4] Cueva del Lloviu však navštěvuje turisty a dosud nebyly pozorovány žádné lidské infekce nebo nemoci, což naznačuje, že je možné, že LLOV může být druhý filovirus to není pro člověka patogenní (první bytost Reston virus (RESTV) ).[Citace je zapotřebí ]

Seroreaktivita dalších Schreibersovy dlouhé prsty byly hlášeny ze severního Španělska od roku 2015, což naznačuje cirkulaci viru mezi těmito koloniemi netopýrů. nicméně PCR pozitivní zvířata nebyla nalezena.[5]

Další Schreibersova dlouhoprstá netopýr události odumření byly hlášeny z Maďarsko v letech 2013, 2016 a 2017. Přítomnost LLOV byla u jatečně upravených těl netopýrů z roku 2016 potvrzena s hemoragickými příznaky.[6] Aktualizované údaje o genomu byly získány z maďarských vzorků v roce 2020 pomocí metody Nanopore sekvenování technika.[7]

Virologie

Genom

LLOV musí být ještě izolován tkáňová kultura nebo žijící zvířata, ale jeho genom byl stanoven jako celek s výjimkou 3' a 5 'UTR.[2] Jako všichni mononegaviry, LLOV viriony obsahují neinfekční, lineární nesegmentovaný, jednořetězcový RNA genom negativní polarity, která s největší pravděpodobností má inverzně-komplementární 3 'a 5' konce, nemá a 5 'čepice, není polyadenylovaný, a není kovalentně spojené s a protein.[8] Genom LLOV je pravděpodobně přibližně 19 kb dlouhý a obsahuje sedm geny v pořadí 3'-UTR -NP-VP35-VP40-GP-VP30-VP24-L-5'-UTR. Na rozdíl od ebolaviry a marburgviry, které syntetizují sedm mRNA k expresi sedmi strukturních proteinů, zdá se, že LLOV produkuje pouze šest mRNA, tj. jedna mRNA (VP24/L) je považován za bicistronic. Genomická LLOV transkripční terminační stránky jsou identické s genomy ebolaviru, ale liší se od genomu marburgviru. LLOV transkripční iniciační místa jsou jedinečné.[2]

Struktura

Struktura LLOV virionů dosud nebyla popsána. Jako všichni ostatní filoviry Očekává se, že viriony LLOV budou vláknité částice, které se mohou objevit ve tvaru pastýřského gauče nebo ve tvaru „U“ nebo „6“ a mohou být stočené, toroidní nebo rozvětvené. Předpokládá se, že jejich průměr bude 80 nm šířka, ale liší se délkou.[9] Genom LLOV naznačuje, že částice LLOV sestávají ze sedmi strukturních proteinů. Ve středu by byl spirálovitý ribonukleokapsid, který by sestával z genomové RNA omotané kolem a polymer z nukleoproteiny (NP). S ribonukleoproteinem by byl spojen RNA-dependentní RNA polymeráza (L) s polymerázovým kofaktorem (VP35) a transkripčním aktivátorem (VP30). Ribonukleoprotein by byl zabudován do matrice, tvořené hlavními (VP40) a vedlejšími (VP24) matricovými proteiny. Tyto částice by byly obklopeny a lipidová membrána odvozený z membrány hostitelské buňky. Membrána by ukotvila glykoprotein (GP1,2), který promítá 7 až 10 nm hroty pryč od jeho povrchu. I když jsou strukturou téměř identické s ebolaviriony a marburgviriony, mohou být lloviuviriony antigenně odlišné od obou (stejně jako od sebe navzájem).[původní výzkum? ]

Replikace

LLOV životní cyklus Předpokládá se, že začíná připojením virionu ke specifickému povrchu buňky receptory, následovaná internalizací, fúze obálky virionu s endozomální membrány a současné uvolňování viru nukleokapsid do cytosol. Glykoprotein LLOV (GP) je štěpen endozomálními cysteinovými proteázami (katepsiny ) a štěpený glykoprotein interaguje s intracelulárním vstupním receptorem, Niemann-Pick C1 (NPC1 ).[10] Virus RdRp by částečně odkryl nukleokapsid a přepsat the geny do pozitivního vlákna mRNA, což by pak bylo přeloženo na strukturální a nestrukturální bílkoviny. LLOV L by se vážil k jedinému promotér nachází se na 3 'konci genomu. Transkripce by buď skončila po genu, nebo by pokračovala k dalšímu genu po proudu. To znamená, že geny blízko 3 'konce genomu by byly transkribovány v největším množství, zatímco ty směrem k 5' konci by byly nejméně pravděpodobně transkribovány. Pořadí genů by proto bylo jednoduchou, ale účinnou formou regulace transkripce. Nejhojněji vyráběným proteinem by byl nukleoprotein, jehož koncentrace v buňce by určoval, kdy L přepne z transkripce genu na replikaci genomu. Replikace by vedla k pozitivním řetězcům s plnou délkou pozitivních řetězců, které by se zase přepisovaly do kopií genomu potomstva negativního řetězce viru. Nově syntetizované strukturní proteiny a genomy by se samy shromažďovaly a hromadily poblíž vnitřku buněčná membrána. Viriony ano pupen pryč z buňky a získávat své obálky z buněčné membrány, ze které budují. Zralé částice potomstva by pak infikovaly další buňky, aby cyklus opakovaly.[8]

Reference

  1. ^ A b C d E F G h i j Kuhn, J. H .; Becker, S .; Ebihara, H .; Geisbert, T. W .; Johnson, K. M .; Kawaoka, Y .; Lipkin, W. I .; Negredo, A. I .; Netesov, S. V .; Nichol, S. T .; Palacios, G .; Peters, C. J .; Tenorio, A .; Volchkov, V. E .; Jahrling, P. B. (2010). „Návrh revidované taxonomie čeledi Filoviridae: Klasifikace, názvy taxonů a virů a zkratky virů“. Archivy virologie. 155 (12): 2083–2103. doi:10.1007 / s00705-010-0814-x. PMC  3074192. PMID  21046175.
  2. ^ A b C d E F G Negredo, A .; Palacios, G .; Vázquez-Morón, S .; González, F.L .; Dopazo, H. N .; Molero, F .; Juste, J .; Quetglas, J .; Savji, N .; de la Cruz Martínez M; Herrera, J. E .; Pizarro, M .; Hutchison, S.K .; Echevarría, J. E .; Lipkin, W. I .; Tenorio, A. (2011). Basler, Christopher F (ed.). „Objev filoviru podobného ebolaviru v Evropě“. PLOS patogeny. 7 (10): e1002304. doi:10.1371 / journal.ppat.1002304. PMC  3197594. PMID  22039362.
  3. ^ "Historie taxonomie ICTV pro Lloviu cuevavirus". Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 7. března 2015.
  4. ^ Heinz Feldmann, Friederike Feldmann, Andrea Marzi (2018). „Ebola: Poučení z vývoje vakcín“. Výroční přehled mikrobiologie. 72: 423–46. doi:10.1146 / annurev-micro-090817-062414. PMID  30200851.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
  5. ^ Ramírez de Arellano, Eva; Sanchez-Lockhart, Mariano; Perteguer, Maria J .; Bartlett, Maggie; Ortiz, Marta; Campioli, Pamela; Hernández, Ana; Gonzalez, Jeanette; Garcia, Karla; Ramos, Manolo; Jiménez-Clavero, Miguel Ángel (19. dubna 2019). „První důkazy o protilátkách proti viru Lloviu u Schreiberových Bent-Winged Insectivorous Netopýři prokazují široký oběh viru ve Španělsku“. Viry. 11 (4): 360. doi:10,3390 / v11040360. ISSN  1999-4915. PMC  6521100. PMID  31010201.
  6. ^ Kemenesi, Gábor; Kurucz, Kornélia; Dallos, Bianka; Zana, Brigitta; Földes, Fanni; Boldogh, Sándor; Görföl, Tamás; Carroll, Miles W; Jakab, Ferenc (18. dubna 2018). „Znovuobjevení viru Lloviu u netopýrů Miniopterus schreibersii, Maďarsko, 2016“. Rozvíjející se mikroby a infekce. 7 (1): 66. doi:10.1038 / s41426-018-0067-4. ISSN  2222-1751. PMC  5906664. PMID  29670087.
  7. ^ Kemenesi, Gabor (31. května 2020). „Historický okamžik ve výzkumu #filovirus, sekvenování kompletního genomu #lloviuviru za 50 minut po deseti letech. @Nanopore @ TthGborEndre1 #filoviridae #emergingdisease #bat # virologypic.twitter.com / 4a5fiWaIuz“. @GaborKemenesi. Citováno 1. června 2020.
  8. ^ A b Easton, A .; Pringle, C. R. (2011), „Order Mononegavirales“, in King, Andrew M. Q .; Adams, Michael J .; Carstens, Eric B .; et al. (eds.), Virová taxonomie - devátá zpráva Mezinárodního výboru pro taxonomii virů, Londýn, Velká Británie: Elsevier / Academic Press, s. 653–657, ISBN  978-0-12-384684-6
  9. ^ Geisbert, T. W .; Jahrling, P. B. (1995). "Diferenciace filovirů elektronovou mikroskopií". Virový výzkum. 39 (2–3): 129–150. doi:10.1016/0168-1702(95)00080-1. PMID  8837880.
  10. ^ Ng M, Ndungo E, Jangra RK, Cai Y, Postnikova E, Radoshitzky SR, Dye JM, Ramirez de Arellano E, Negredo A, Palacios G, Kuhn JH, Chandran K (2014). „Vstup buněk novým evropským filovirem vyžaduje hostitelské endozomální cysteinové proteázy a Niemann – PickC1“. Virologie. 468–470: 637–46. doi:10.1016 / j.virol.2014.08.019. PMC  4252868. PMID  25310500.

externí odkazy