GDP-manóza 3,5-epimeráza - GDP-mannose 3,5-epimerase

v enzymologie, a GDP-manóza 3,5-epimeráza (ES 5.1.3.18 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

GDP-manóza ${ displaystyle rightleftharpoons}$ GDP-L-galaktóza + GDP-L-gulosa - úvodní přehled reakcí (aktualizováno v roce 2020, viz níže)

Tento enzym tedy jeden má Podklad, GDP-manóza a dva produkty, GDP-L-galaktóza a GDP-L-gulosa

Protože v reakční směsi byl nalezen pouze GDP-L-gulosa (C5-epimer GDP-D-manózy), předpokládalo se, že enzym provádí C5-epimerizaci před C3-epimerizací. Nicméně, GDP-D-altrose byl nedávno nalezen jako reakční produkt, což znamená, že mohou nastat obě reakční cesty: C5-před-k-C3 a C3-před-k-C5. To také znamená, že 3,5-epimeráza GDP-manózy má tři reakční produkty, a to hlavní produkt GDP-L-galaktóza (C3,5-epimer) a dva vedlejší produkty GDP-L-gulosa (C5-epimer) + GDP-D-altrose (C3-epimer).

GDP-D-manóza ${ displaystyle rightleftharpoons}$ GDP-L-galaktóza (C3,5-epimer) + GDP-L-gulosa (C5-epimer) + GDP-D-altrosa (C3-epimer) - aktualizace přehledu reakcí v roce 2020

Tento enzym patří do rodiny izomerázy, konkrétně ty racemázy a epimerázy jednající na sacharidy a deriváty. The systematické jméno této třídy enzymů je GDP-manóza 3,5-epimeráza. Mezi další běžně používaná jména patří GDP-D-manóza: GDP-L-galaktózová epimeráza, guanosin 5'-difosfát D-manóza: guanosin 5'-difosfát, a L-galaktosa epimeráza. Tento enzym se účastní metabolismus askorbátu a aldarátu.

Strukturální studie

Ke konci roku 2007, 4 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 2C54, 2C59, 2C5A, a 2C5E.

Reference

• Barber GA, Hebda PA (1982). „GDP-D-manosa: GDP-L-galactose epimerase from Chlorella pyrenoidosa“. Metody Enzymol. Metody v enzymologii. 83: 522–5. doi:10.1016/0076-6879(82)83046-2. ISBN  978-0-12-181983-5. PMID  7098948.
• Hebda PA, Behrman EJ, Barber GA (1979). "Guanosin 5'-difosfát D-manóza: guanosin 5'-difosfát L-galaktóza epimeráza z Chlorella pyrenoidosa. Chemická syntéza guanosin 5'-difosfát L-galaktózy a další studie enzymu a reakce, kterou katalyzuje." Oblouk. Biochem. Biophys. 194 (2): 496–502. doi:10.1016/0003-9861(79)90644-1. PMID  443816.
• Gevaert O, Van Overtveldt S, Beerens K, Desmet T (2019). "Charakterizace první bakteriální a termostabilní GDP-manózy 3,5-epimerázy". Int. J. Mol. Sci. 20 (14): E3530. doi:10,3390 / ijms20143530. PMC  6678494. PMID  31330931.
• Gevaert O, Van Overtveldt S, Da Costa M, Beerens K, Desmet T (2020). „GDP-altrose as new product of GDP-mannose 3,5-epimerase: Revisiting its response mechanism“. Int J Biol Makromol. 165 (Pt B): 1862–1868. doi:10.1016 / j.ijbiomac.2020.10.067. PMID  33075338.