Disimilační sulfitreduktáza - Dissimilatory sulfite reductase

disimilační sulfitreduktáza
Identifikátory
EC číslo1.8.99.5
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO

Disimilační sulfitreduktáza (ES 1.8.99.5 ) je enzym který se účastní metabolismus síry v disimilační redukce síranu.[1]

Enzym je nezbytný v prokaryotickém energetickém metabolismu na bázi síry, včetně organismů redukujících sulfáty / siřičitany, bakterií oxidujících síru a organosulfonátových reduktorů. U reduktorů síry katalyzuje redukci siřičitanu na sulfid (reakce 1), zatímco u oxidátorů síry katalyzuje opačnou reakci (reakce 2).[2] Reakce zahrnuje malý protein DsrC, který je přítomen ve všech organismech, které obsahují disimilační sulfitreduktázu.[3] Během procesu se mezi dvěma L-cysteinovými zbytky DsrC a atomem síry ze siřičitanu vytvoří intramolekulární trisulfid.[4] Tento trisulfid může být redukován řadou proteinů včetně DsrK a TcmB.[5]

Reakce v organismech provádějících disimilační redukci síranů:

(1) siřičitan + [DsrC protein] -dithiol + 2 redukovaný akceptor + 2 H+ = sirovodík + [DsrC protein] -disulfid + 2 akceptor + 3 H2O (celková reakce)
(La) siřičitan + [DsrC protein] -dithiol + 2 redukovaný akceptor + 2H+ = a [DsrC protein] -S-sulfanyl-L-cystein + 2 akceptor + 3 H2Ó
(1b) a [DsrC protein] -S-sulfanyl-L-cystein = sirovodík + a [DsrC protein] -disulfid

Reakce v organismech provádějících oxidaci síry:

(2) [DsrC protein] -S-sulfanyl-L-cystein + 3 akceptor + 3 H2O = siřičitan + [DsrC protein] -disulfid + 3 redukovaný akceptor + 2H+ (celková reakce)
(2a) a [DsrC protein] -S-sulfanyl-L-cystein + 3 akceptor + 3 H2O = a [DsrC] -S-sulfo-L-cystein + 3 redukovaný akceptor + H+
(2b) a [DsrC] -S-sulfo-L-cystein = siřičitan + [DsrC protein] -disulfid

The systematické jméno této třídy enzymů je sirovodík: [DsrC protein nosiče síry], akceptor oxidoreduktáza.

Tento enzym se liší od EC 1.8.1.2, asimilační sulfitreduktázy (NADPH) a EC 1.8.7.1, asimilační sulfitreduktázy (ferredoxinu), které se účastní asimilace síranem.

Reference

  1. ^ Parey K, Warkentin E, Kroneck PM, Ermler U (říjen 2010). "Reakční cyklus disimilační sulfitreduktázy z Archaeoglobus fulgidus". Biochemie. 49 (41): 8912–21. doi:10.1021 / bi100781f. PMID  20822098.
  2. ^ Schedel M, Vanselow M, Trüper HG (1979). "Siroheme sulfitreduktáza izolovaná z Chromatium vinosum. Čištění a zkoumání některých jejích molekulárních a katalytických vlastností". Archiv mikrobiologie. 121 (1): 29–36. doi:10.1007 / BF00409202. S2CID  22126920.
  3. ^ Oliveira TF, Vonrhein C, Matias PM, Venceslau SS, Pereira IA, Archer M (prosinec 2008). „Krystalová struktura disulfilační sulfitreduktázy desulfovibrio vulgaris vázaná na DsrC poskytuje nový pohled na mechanismus sulfátového dýchání.“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (49): 34141–9. doi:10,1074 / jbc.M805643200. PMC  2662231. PMID  18829451.
  4. ^ Santos AA, Venceslau SS, Grein F, Leavitt WD, Dahl C, Johnston DT, Pereira IA (prosinec 2015). „Trisulfid proteinu spojuje disimilační redukci síranu s úsporou energie“. Věda. 350 (6267): 1541–5. Bibcode:2015Sci ... 350.1541S. doi:10.1126 / science.aad3558. PMID  26680199. S2CID  206643054.
  5. ^ Venceslau SS, Stockdreher Y, Dahl C, Pereira IA (červenec 2014). „Bakteriální heterodisulfid“ DsrC je klíčovým proteinem v disimilačním metabolismu síry. “. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bioenergetika. 1837 (7): 1148–64. doi:10.1016 / j.bbabio.2014.03.007. PMID  24662917.