Cytochrom c nitritreduktáza - Cytochrome c nitrite reductase

Cytochrom C nitrit reduktáza
1GU6.png
Krystalografická struktura a homodimer cytochrom c nitritreduktázy z Escherichia coli (duhová karikatura, modrá = N-konec, červená = C-konec ) v komplexu s heme C. (tyčinky).[1]
Identifikátory
EC číslo1.7.2.2
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO

Cytochrom C nitrit reduktáza (ccNiR) (ES 1.7.2.2 ) je bakteriální enzym že katalyzuje šest elektronů snížení z dusitany na amoniak; důležitý biologický krok dusíkový cyklus.[2] Enzym katalyzuje druhý krok dvoustupňové přeměny dusičnanu na amoniak, což umožňuje určitým bakteriím používat dusitany jako terminální akceptor elektronů místo kyslíku během anaerobní podmínky. Během tohoto procesu ccNiR čerpá elektrony z chinolový bazén, které nakonec poskytuje a dehydrogenáza jako mravenčan dehydrogenáza nebo hydrogenáza. Tyto dehydrogenázy jsou odpovědné za generování a hnací síla protonu.[3]

Cytochrom C Nitrite Reductase je homodimer který obsahuje pět h typu c kofaktory na monomer.[4] Čtyři z hemových center jsou ligována bis-histidinem a pravděpodobně slouží k přenosu elektronů na aktivní místo. Hem aktivního místa je však jedinečně ligován jediným lysinovým zbytkem.

Tento enzym patří do rodiny oxidoreduktázy, konkrétně těch, které působí na jiné dusíkaté sloučeniny jako dárce s cytochromem jako akceptorem. The systematické jméno této třídy enzymů je amoniak: ferricytochrom-c oxidoreduktáza.

Cytochrom_NNT
Identifikátory
SymbolCytochrom_NNT
PfamPF03264
Pfam klanCL0317
InterProIPR005126
OPM nadčeleď175
OPM protein2j7a

Reference

  1. ^ PDB: 1GU6​; Bamford VA, Angove HC, Seward HE, Thomson AJ, Cole JA, Butt JN, Hemmings AM, Richardson DJ (březen 2002). "Struktura a spektroskopie periplazmatické cytochrom c nitritreduktázy z Escherichia coli". Biochemie. 41 (9): 2921–31. doi:10.1021 / bi015765d. PMID  11863430.
  2. ^ Clarke TA, Mills PC, Poock SR, Butt JN, Cheesman MR, Cole JA, Hinton JC, Hemmings AM, Kemp G, Söderberg CA, Spiro S, Van Wonderen J, Richardson DJ (2008). "Escherichia coli cytochrom c nitritreduktáza NrfA". Pervitin Enzymol. Metody v enzymologii. 437: 63–77. doi:10.1016 / S0076-6879 (07) 37004-3. ISBN  9780123742780. PMID  18433623.
  3. ^ Simon J (srpen 2002). „Enzymologie a bioenergetika amonifikace dusičnanů dýchacích“. FEMS Microbiol. Rev. 26 (3): 285–309. doi:10.1111 / j.1574-6976.2002.tb00616.x. PMID  12165429.
  4. ^ Einsle O, Messerschmidt A, Stach P, GP Bourenkova, Bartunik HD, Huber R, Kroneck PM (červenec 1999). "Struktura nitrátreduktázy cytochromu c". Příroda. 400 (6743): 476–80. Bibcode:1999 Natur.400..476E. doi:10.1038/22802. PMID  10440380. S2CID  4403452.

Další čtení