Chondroitin B lyáza - Chondroitin B lyase - Wikipedia

v enzymologie, a chondroitin B lyáza (ES 4.2.2.19 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

Eliminativní štěpení dermatansulfátu obsahujícího 1,4-beta-D-hexosaminylové a 1,3-beta-D-glukurosonylové nebo 1,3-alfa-L-iduronosylové vazby na disacharidy obsahující 4-deoxy-beta-D-gluc-4 -enuronosylové skupiny, čímž se získá 4,5-nenasycený dermatansulfát disacharid (deltaUA-GalNAc-4S).

Tento enzym patří do rodiny lyázy, konkrétně ty lyázy uhlík-kyslík působící na polysacharidy. The systematické jméno této třídy enzymů je chondroitin B lyáza. Mezi další běžně používaná jména patří chondroitináza B, ChonB, a ChnB.

Reference

• Gu K, Linhardt RJ, Laliberte M, Gu K, Zimmermann J (1995). „Čištění, charakterizace a specificita chondroitin lyáz a glykuronidázy z Flavobacterium heparinum“. Biochem. J. 312 (Pt 2): 569–77. doi:10.1042 / bj3120569. PMC  1136300. PMID  8526872.
• Pojasek K, Raman R, Kiley P, Venkataraman G, Sasisekharan R (2002). "Biochemická charakterizace aktivního místa chondroitinázy B". J. Biol. Chem. 277 (34): 31179–86. doi:10,1074 / jbc.M201552200. PMID  12063249.
• Pojasek K, Shriver Z, Kiley P, Venkataraman G, Sasisekharan R (2001). "Rekombinantní exprese, čištění a kinetická charakterizace chondroitinázy AC a chondroitinázy B z Flavobacterium heparinum". Biochem. Biophys. Res. Commun. 286 (2): 343–51. doi:10.1006 / bbrc.2001.5380. PMID  11500043.
• Suzuki K, Terasaki Y, Uyeda M (2002). „Inhibice hyaluronidáz a chondroitináz mastnými kyselinami“. J. Enzym. Inhib. Med. Chem. 17 (3): 183–6. doi:10.1080/14756360290032930. PMID  12443044.
• Ototani N, Yosizawa Z (1979). „Čištění chondroitinázy B a chondroitinázy C pomocí glykosaminoglykanu vázané AH-Sepharose 4B“. Sacharidy. Res. 70 (2): 295–306. doi:10.1016 / S0008-6215 (00) 87109-8. PMID  427837.
• K, Zimmermann JJ; Su H (2000). „Izolace a exprese cslA a cslB v Escherichia coli, geny kódující enzymy degradující chondroitin sulfát, chondroitinázu AC a chondroitinázu B, respektive z Flavobacterium heparinum“. Appl. Environ. Microbiol. 66 (1): 29–35. doi:10.1128 / AEM.66.1.29-35.2000. PMC  91781. PMID  10618199.
• V, Sasisekharan R, Cygler M (2004). „Struktura chondroitin B lyázy v komplexu s glykosaminoglykanovými oligosacharidy rozvíjí katalytický aparát závislý na vápníku“. J. Biol. Chem. 279 (31): 32882–96. doi:10,1074 / jbc.M403421200. PMC  4135467. PMID  15155751.
• Li Y, Matte A, Su H, Cygler M (1999). "Krystalizace a předběžná rentgenová analýza chondroitinázy B z Flavobacterium heparinum". Acta Crystallogr. D. 55 (Pt 5): 1055–7. doi:10.1107 / S0907444999002097. PMID  10216304.
• Huang W, Matte A, Li Y, Kim YS, Linhardt RJ, Su H, Cygler M (1999). „Krystalová struktura chondroitinázy B z Flavobacterium heparinum a jejího komplexu s disacharidovým produktem při rozlišení 1,7 A“. J. Mol. Biol. 294 (5): 1257–69. doi:10.1006 / jmbi.1999.3292. PMID  10600383.
• Lauder RM; Nieduszynski, IA; Giannopoulos, M; Týdny, SD; Sadler, IH; Lauder, RM (2005). "Charakterizace oligosacharidů z chondroitin / dermatan sulfátů. 1H-NMR a 13C-NMR studie redukovaných trisacharidů a hexasacharidů". FEBS J. 272 (24): 6276–86. doi:10.1111 / j.1742-4658.2005.05009.x. PMID  16336265.