Aciredukton dioxygenáza (vyžaduje železo (II)) - Acireductone dioxygenase (iron(II)-requiring) - Wikipedia

aciredukton dioxygenáza [vyžaduje železo (II)]
Identifikátory
EC číslo1.13.11.54
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO

Aciredukton dioxygenáza [vyžaduje železo (II)] (ES 1.13.11.54 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

1,2-dihydroxy-5- (methylthio) pent-l-en-3-on + O2 4- (methylthio) -2-oxobutanoát + mravenčan

Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou 1,2-dihydroxy-5- (methylthio) pent-l-en-3-on a kyslík, zatímco jeho dva produkty jsou 4-methylthio-2-oxobutanoát a mravenčan.

Tento enzym patří do rodiny oxidoreduktázy, zejména těch, kteří jednají s jedinými dárci s O2 jako oxidant a inkorporace dvou atomů kyslíku do substrátu (oxygenázy). Obsažený kyslík nemusí být odvozen od O2. The systematické jméno této třídy enzymů je 1,2-dihydroxy-5- (methylthio) pent-1-en-3-on: kyslík-oxidoreduktáza (formující). Mezi další běžně používaná jména patří ARD ', 2-hydroxy-3-keto-5-thiomethylpent-1-en dioxygenáza (nejednoznačný), aciredukton dioxygenáza (nejednoznačný), E-2 ', a E-3 dioxygenáza. Tento enzym se účastní metabolismus methioninu.

Strukturální studie

Ke konci roku 2007 pouze jeden struktura byl pro tuto třídu enzymů vyřešen pomocí PDB přístupový kód 2HJI.

Reference

  • Wray JW, Abeles RH (1993). "Bakteriální enzym, který katalyzuje tvorbu oxidu uhelnatého". J. Biol. Chem. 268 (29): 21466–9. PMID  8407993.
  • Wray JW, Abeles RH (1995). „Methioninová záchranná cesta v Klebsiella pneumoniae a potkaních játrech. Identifikace a charakterizace dvou nových dioxygenáz“. J. Biol. Chem. 270 (7): 3147–53. doi:10.1074 / jbc.270.7.3147. PMID  7852397.
  • Furfine ES, Abeles RH (1988). "Meziprodukty při přeměně 5'-S-methylthioadenosinu na methionin v Klebsiella pneumoniae". J. Biol. Chem. 263 (20): 9598–606. PMID  2838472.
  • Dai Y, Wensink PC, Abeles RH (1999). „Jeden protein, dva enzymy“. J. Biol. Chem. 274 (3): 1193–5. doi:10.1074 / jbc.274.3.1193. PMID  9880484.
  • Mo H, Dai Y, Pochapsky SS, Pochapsky TC (1999). „Přiřazení 1H, 13C a 15N NMR pro metaloenzym generující oxid uhelnatý z Klebsiella pneumoniae“. J. Biomol. NMR. 14 (3): 287–8. doi:10.1023 / A: 1008396624784. PMID  10481280. S2CID  36731035.
  • Dai Y, Pochapsky TC, Abeles RH (2001). "Mechanistické studie dvou dioxygenáz v methioninové záchranné cestě Klebsiella pneumoniae". Biochemie. 40 (21): 6379–87. doi:10.1021 / bi010110y. PMID  11371200.
  • Al-Mjeni F, Ju T, Pochapsky TC, Maroney MJ (2002). "XAS zkoumání struktury a funkce Ni v aciredukton dioxygenáze". Biochemie. 41 (21): 6761–9. doi:10.1021 / bi012209a. PMID  12022880.
  • Pochapsky TC, Pochapsky SS, Ju T, Mo H, Al-Mjeni F, Maroney MJ (2002). „Modelování a experiment poskytuje strukturu aciredukton dioxygenázy z Klebsiella pneumoniae“. Nat. Struct. Biol. 9 (12): 966–72. doi:10.1038 / nsb863. PMID  12402029. S2CID  38098047.