Vesivirus - Vesivirus

Vesivirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Pisoniviricetes
Objednat:Picornavirales
Rodina:Caliciviridae
Rod:Vesivirus
Zadejte druh
Vezikulární exantém viru prasat
Druhy a členské viry[1]

Vesivirus je rod viry, v rodině Caliciviridae.[1] Prasata, mořští savci a kočkovité šelmy slouží jako přirození hostitelé. V současné době existují pouze dva druhy tohoto rodu, včetně druhů typu Vezikulární exantém viru prasat.[1] Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: respirační onemocnění, Kočičí kalicivirus (FCV); zánět spojivek a onemocnění dýchacích cest.[1][2]

Taxonomie

Skupina: ssRNA (+)[1]
Objednávka: Picornavirales
Rodina: Caliciviridae
Rod: Vesivirus

Mezi další neoficiální viry podobné Vesi patří psí kalicivirus, Virus těsnění San Miguel, vesivirus Cro1 a mrož kalicivirus.[3]

Vlastnosti virionu

Morfologie

Viriony se skládají z a kapsid. Virus capsid je neobalený a je kulatý ikosahedrální symetrie a triangulační číslo T = 3. Izometrická kapsida má průměr 35–39 nm. Prázdné viriony mají průměr 23 nm, s triangulační číslo T = 1.[2] Struktura kapsidového povrchu odhaluje pravidelný vzor s charakteristickými rysy, včetně 32 prohlubní ve tvaru misky. The kapsomer uspořádání je jasně viditelné.

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
VesivirusIcosahedralT = 1, T = 3NeobalenéLineárníMonopartitní

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne připojením k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají endocytózu. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Překlad probíhá terminační-reinicializací RNA. Prasata, mořští savci a kočkovité šelmy slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou vzduchem přenášené částice.[2]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
VesivirusKočkovité šelmyHorní dýchací cestyEndocytóza buněčných receptorůLyzaCytoplazmaCytoplazmaAerosol

Fyzikální a chemické vlastnosti

The molekulová hmotnost (Mr) virionů je 15 x 106. Viriony mají a hustota vztlaku v Chlorid cesný (CsCl) 1,33–1,41 g / cm3. The gradient hustoty virionů v Tartarát draselný-glycerol je 1,29 g / cm3. The sedimentační koeficient je 170–187 svedberg (s20, t), u ostatních vrcholí na 160–170 svedberg (s20, t). Pod in vitro podmínky viriony jsou inaktivovány v kyselém prostředí pH 3–5. Viriony nejsou stabilní při zvýšené teplotě v přítomnosti vysoké koncentrace Mg++. Viriony jsou citlivé na léčbu trypsin (v některých kmeny, není citlivý na ošetření jemnými čisticími prostředky, nebo éter nebo chloroform. The infekčnost se zvyšuje po léčbě trypsinem (u některých kmenů).

Genom

The genom není segmentované a obsahuje jedinou lineární molekulu pozitivní smysl, jednovláknové RNA. Menší druhygenomický Nukleová kyselina se někdy vyskytuje také ve virionech. Celý genom je 7700 nukleotidy dlouho. Genom má guanin + cytosin obsah 45–49%. The 5 'konec genomu má protein spojený s genomem (VPg ). The 3 'konec má poly (A) trakt. Každý virion obsahuje kopii v plné délce nebo vadné rušivé kopie.

Proteiny

The virový genom kóduje virový strukturní protein. Viriony se skládají z 1 virového strukturního proteinu (hlavní druh) nebo 2 virových strukturních proteinů (detekováno v Norwalk virus, amyelóza chronický kaskadérský virus a prasečí enterický kalicivirus nachází se v kapsidě.

Virový strukturní protein: Kapsidový protein má a molární hmotnost 58 000–60000 Da; je obalový protein. Kapsidový protein má molekulovou hmotnost menší „rozpustné“ 28–30 kDa.

Antigenicita

Sérologické jsou nalezeny vztahy mezi různými členy (mezi Kočičí kalicivirus ). Křížová reaktivita je nalezeno. Křížová reaktivita mezi stejnými druhy sérotyp, ale ne u druhů jiného sérotypu a některých druhů stejného sérotypu, ale ne u všech. Ačkoli se stupeň antigenní specificity mění se stupněm příbuznosti, antigenicita je odlišná od psí kaliciviry, Norwalk virus séroskupiny stejného rodu.

Dopad na zdraví

Vesivirus infikuje lidi i zvířata.[4] Vesivirus je vysoce infekční a snadno se přenáší, protože puchýře a kůže obsahují velké množství vesiviru. Prostory, které jsou silně kontaminovány vesivirem, mohou být zdrojem infekce několik měsíců.[5]

Jako součást čeledi Calciviridae je vesivirus podle Národního ústavu pro alergie a infekční nemoci hodnocen jako patogen biodefense kategorie B.[6] Patogeny kategorie B jsou organismy / biologickými činiteli s druhou nejvyšší prioritou, protože se mírně rozšiřují, vedou ke střední míře morbidity a nízké úmrtnosti a vyžadují zvláštní zlepšení diagnostické kapacity a lepšího sledování nemoci.[6]

Klinické příznaky vesivirové infekce zahrnují intenzivně svědění vezikul s čirými puchýřky obsahujícími tekutinu, které erodují do mělkých vředů. Puchýřnaté puchýře byly pozorovány na rukou (lidé), ploutvích (lachtani), kopytách (hospodářská zvířata) a hrdle a krku (primáti). Mezi další příznaky vesivirové infekce patří hepatitida (lidská), potraty (hospodářská zvířata), pneumonie (hospodářská zvířata a mořští savci), průjem (hospodářská zvířata), gingivitida (primáti), myokarditida (hospodářská zvířata a mořští savci) a encefalitida (primáti, hospodářská zvířata a mořští savci).[5]

Infekčnost vesiviru a cytopatologie se mohou lišit podle kmene, druhu a typu buňky, která je infikována.[5] Některá zvířata mohou být infikována pouze na krátkou dobu, ale jiná zvířata, jako jsou šimpanzi, mohou mít přetrvávající opakující se infekce.[7]

V roce 2002 byl izolován nový kmen vesiviru (označovaný 2117) jako kontaminace buněčné kultury Buňky vaječníků čínského křečka ve společnosti Boehringer Ingelheim Pharma KG.[8] Vesivirus-2117 není dobře studován. Vesivirus 2117 má však velký rozsah hostitelů a představuje významnou hrozbu pro lidské a zvířecí druhy jako objevující se patogen.[9]

V červnu 2009 Genzym Závod Allston v Massachusetts byl odstaven z důvodu výroby Cerezym, Fabrazyme, Thyrogen a Myozym po infekci buněk vaječníků čínského křečka Vesivirem 2117. K podobné kontaminaci došlo v roce 2008 v belgických zařízeních Geel a dříve v závodě Allston v roce 2008.[10] Úředníci společnosti uvedli, že vesivirus může tyto léky poškodit.[11]

Virové genetické sekvence kmenů Vesivirus 2117, Allston 2008 / US (GQ475302),[12] Geel 2008 Belgie (GQ475303),[13] a Allston 2009 / USA[14] byly publikovány v GenBank.

Reference

  1. ^ A b C d E „Zpráva ICTV Caliciviridae“.
  2. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  3. ^ Farles. Svobodný slovník. Přístup 02. března 2010.
  4. ^ Smith, A .; et al. (2006). "Vesivirová virémie a séroprevalence u lidí". J. Med. Virol. 30 (8): 693–701. doi:10,1002 / jmv.20594. PMC  7166889. PMID  16555277.
  5. ^ A b C Knowles a kol. (2015). "Vezikulární exantém viru prasat". Molekulární detekce zvířecích patogenů. CRC Press. ISBN  978-1-4987-0037-5.
  6. ^ A b „NIAID nově vznikající infekční nemoci / patogeny - NIAID biodefense research“. 26. října 2016. Citováno 20. listopadu 2016.
  7. ^ A.W. Kovář; et al. (1. července 1983). "Izolace a perzistence kaliciviru u trpasličího šimpanze (Pan paniscus)". Věda. 30 (4605): 79–81. Bibcode:1983Sci ... 221 ... 79S. doi:10.1126 / science.6304880. PMID  6304880.
  8. ^ Oehmig, A .; et al. (Duben 2003). „Identifikace kalicivirového izolátu neznámého původu“. Journal of General Virology. 221 (10): 2837–45. doi:10.1099 / vir.0.19042-0. PMID  13679618.
  9. ^ Plavsic, Mark; Shick, Klaudia; Bergmann, Katherine F .; Mallet, Laurent (2016). "Vesivirus 2117: Rozsah infekčnosti buněčné linie a účinnost amplifikace potenciálního náhodného činidla v buněčné kultuře používané pro biologickou produkci". Biologické. 44 (6): 540–545. doi:10.1016 / j.biologic.2016.08.001. PMID  27640083.
  10. ^ Angelo DePalma (15. dubna 2010). „Způsoby výroby virové bezpečnosti“. Novinky z genetického inženýrství a biotechnologie. 30 (8).
  11. ^ Ailworth, Erin; Weisman, Robert (17.06.2009). „Virus uzavírá závod Genzyme, drží léky pro 8 000“. Boston.com.
  12. ^ "Kalicivirus izoluje Allston 2008 / USA, kompletní genom". Citováno 29. října 2016.
  13. ^ „Izolát kaliciviru Geel 2008 / Belgie nestrukturální polyproteinový gen, částečné CD; a prekurzor kapsidového proteinu a malé strukturní proteinové geny, kompletní CD, kompletní genom“. Citováno 29. října 2016.
  14. ^ „Kalicivirus izoluje Allston 2009 / USA, kompletní genom, kompletní genom“. Citováno 29. října 2016.

externí odkazy