Picornavirales - Picornavirales

Picornavirales
Cyklus replikace pikornaviru
Picornavirus replikační cyklus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Pisoniviricetes
Objednat:Picornavirales

Picornavirales je řád viry s obratlovců, hmyz, protist nebo rostlina hostitelé.[1] Jméno má dvojí etymologie.[2] První, picorna- je akronym pro poliovirus, icitlivost na éter, Coxsackievirus, Órphan virus, rhinovirus a ribonkyselina ucleová.[2] Za druhé, piko-, což znamená extrémně malý, kombinuje s RNA popsat tyto velmi malé RNA viry.[2]

Vlastnosti

Rodiny v této objednávce sdílejí řadu společných rysů:

  • Viriony nejsouobaleno, icosahedral a asi 30 nanometrů v průměru.
  • Kapsida má strukturu "pseudo T = 3" a skládá se z 60 protomery každý vyrobený ze tří podobně velkých, ale neidentických beta sudy.
  • Genom je tvořen jedním nebo několika jednovláknovými RNA s) sloužící přímo jako mRNA, bez překrývání otevřené čtecí rámce.
  • Genom má malý protein, VPg, kovalentně připojený k jeho 5 'konec a obvykle poly-adenylovaný 3 'konec.
  • Každá genomová RNA je přeložena do polyprotein (y) výtěžek zralých virových proteinů prostřednictvím jedné nebo více proteinů kódovaných virem.
  • Charakteristickým znakem Picornavirales je konzervovaný modul sekvenčních domén Hel-Pro-Pol, který je typický pro (od amino- po karboxy-konec polyproteinu):
    • A helikáza patřící do nadčeledi III
    • [VPg je kódován mezi těmito dvěma doménami]
    • A chymotrypsinu proteáza kde katalytický zbytek je obvykle a cystein spíše než a serin,
    • A polymeráza patřící do nadčeledi I; tento konzervovaný modul je charakteristickým znakem Picornavirales

Zdá se, že vývoj virů podobných pikorám předcházel oddělení virů eukaryoty do existujících skupin korun.[3]

Taxonomie

Fylogenetický strom reprezentativních virů z řádu Picornavirales

Uznávají se tyto rodiny:[4]

Reference

  1. ^ Le Gall, Olivier; Christian, Peter; Fauquet, Claude M .; King, Andrew M. Q .; Knowles, Nick J .; Nakashima, Nobuhiko; Stanway, Glyn; Gorbalenya, Alexander E. (01.04.2008). „Picornavirales, navrhované pořadí pozitivních sense jednovláknových RNA virů s architekturou virionů pseudo-T = 3“. Archivy virologie. 153 (4): 715–27. doi:10.1007 / s00705-008-0041-x. PMID  18293057. S2CID  2303309.
  2. ^ A b C "Picornaviridae". Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Října 2017. Citováno 5. února 2019.
  3. ^ Koonin, Eugene V .; Vlk, Jurij I.; Nagasaki, Keizo; Dolja, Valerian V. (2008). „Velký třesk evoluce viru připomínající picornu předchází radiaci eukaryotických superskupin“. Příroda Recenze Mikrobiologie. 6 (12): 925–939. doi:10.1038 / nrmicro2030. PMID  18997823. S2CID  205497478.
  4. ^ „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 30. dubna 2020.

externí odkazy