Ortervirales - Ortervirales
| Ortervirales | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Pararnavirae |
| Kmen: | Artverviricota |
| Třída: | Revtraviricetes |
| Objednat: | Ortervirales |
| Rodiny | |
Ortervirales je objednávka, která obsahuje všechny přijímané druhy jednovláknových RNA viry, které se replikují prostřednictvím a DNA meziprodukt (skupina VI) a všechny přijímané druhy dvouvláknových DNA virů (kromě Hepadnaviridae ), které se replikují prostřednictvím meziproduktu RNA (skupina VII).[1][2] Název je odvozen od zadní strany retro.[3]
Všechny zpětně přepisující viry se navzájem významně podobají. Jejich reverzní transkriptáza proteiny mají společný původ. Kromě toho mají belpaoviry, metaviry, pseudoviry a retroviry společné další společné rysy. Jejich polymeráza proteiny mají podobnou strukturu a zahrnují aspartátová proteáza (retrovirová aspartylproteáza ) a an integráza patřící do nadrodiny rekombináz DDE (viz Gen aktivující rekombinaci [struktura] ). Sdílejí také podobné kapsid a nukleokapsidové proteiny / domény.[4] Caulimoviry také sdílejí některé rysy s belpaoviry, metaviry, pseudoviry a retroviry, jako je homologní aspartát proteáza. Na druhou stranu, Hepadnaviridae rodina se zdá být vzdáleněji příbuzná výše uvedeným rodinám.[1]
Taxonomie
Existuje pět rodin v tomto pořadí:
- Rodina Belpaoviridae — LTR retrotransposon, Rodina Bel / Pao
- Rodina Metaviridae — LTR retrotransposon, Ty3 / cikánská rodina
- Rodina Pseudoviridae — LTR retrotransposon, Rodina Ty1 / copia
- Rodina Retroviridae - retroviry, např. HIV
- Rodina Caulimoviridae - virus infikující rostliny dsDNA-RT
Reference
- ^ A b Krupovic, M; Blomberg, J; Coffin, JM; Dasgupta, I; Fan, H; Geering, AD; Gifford, R; Harrach, B; Hull, R; Johnson, W; Kreuze, JF; Lindemann, D; Llorens, C; Lockhart, B; Mayer, J; Muller, E; Olszewski, N; Pappu, HR; Pooggin, M; Richert-Pöggeler, KR; Sabanadzovic, S; Sanfaçon, H; Schoelz, JE; Seal, S; Stavolone, L; Stoye, JP; Teycheney, PY; Tristem, M; Koonin, EV; Kuhn, JH (4. dubna 2018). "Ortervirales: Nové pořadí virů sjednocující pět rodin virů s reverzním přepisem ". Journal of Virology. 92 (12): e00515–18. doi:10.1128 / JVI.00515-18. PMC 5974489. PMID 29618642.
- ^ „Taxonomy“. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 2018-05-23.
- ^ Jens H. Kuhn, Mart Krupovic, et al.: Vytvoření nové objednávky, Ortervirales, pro 5 rodin virů s reverzním přepisem, ICTV Návrh (Taxoprop) 2017.013D, DOI: 10.1340 / RG.2.2.24914.04804
- ^ Krupovic, M; Koonin, EV (2017). „Homologní kapsidové proteiny svědčí o společném původu retrovirů, caulimovirů, pseudovirů a metavirů“. Journal of Virology. 91 (12): e00210–17. doi:10.1128 / JVI.00210-17. PMC 5446648. PMID 28356531.