Pseudoviridae - Pseudoviridae
Pseudoviridae | |
---|---|
Klasifikace virů ![]() | |
(bez hodnocení): | Virus |
Oblast: | Riboviria |
Království: | Pararnavirae |
Kmen: | Artverviricota |
Třída: | Revtraviricetes |
Objednat: | Ortervirales |
Rodina: | Pseudoviridae |
Rody | |
Pseudoviridae je rodina viry, který zahrnuje následující rody:[1]
- Rod Pseudovirus; druh druhu: Virus Saccharomyces cerevisiae Ty1
- Rod Hemivirus; druh druhu: Virus kopie Drosophila melanogaster
- Rod Sirevirus; druh druhu: Glycin max. Virus SIRE1
Další Pseudoviridae druh bez klasifikovaného rodu je Virus Phaseolus vulgaris Tpv2-6.
Viry rodiny jsou ve skutečnosti LTR retrotranspozony rodiny Ty1-copia. Replikují se prostřednictvím struktur nazývaných virové částice (VLP). VLP nejsou infekční jako normální viriony, ale přesto tvoří podstatnou součást životního cyklu pseudoviru.[2]
Taxonomie
Pseudoviridae je neoficiálně zařazen do skupiny VI RNA Reverzní přepisující viry a infikovat houby a bezobratlých.
Pseudoviridae zahrnuje velmi odlišné členy a většinu Pseudoviridae zakódovat Gag a Pol do jednoho otevřený čtecí rámec.
Pseudoviridae je součástí objednávky Ortervirales spolu s rodinami Belpaoviridae, Metaviridae, Retroviridae, a Caulimoviridae.[3]
Existuje také druh nepřiřazený k rodu: Virus Phaseolus vulgaris Tpv2-6.
Genom
The genom virů z této rodiny je nesegmentovaný, -RT, pozitivní smysl, jednovláknová RNA a je 4200–9700 nukleotidy dlouho. Genom kóduje strukturní proteiny a nestrukturální bílkoviny které kódy pro RNA-dependentní DNA polymeráza, replika, a reverzní transkriptáza pro reverzní transkripce krok během replikace.
Virologie
Virální kapsid je neobalený a vypadá zhruba sféricky. Kapsida je kulatá s ikosahedrickou symetrií s triangulační číslo (T) = 3 a 4. Je také izometrické na kvazi-izometrický a má průměr 30-50 nm. LTR-retrotranspozony jsou špatně charakterizovány a lipidy nenahlásili.
Genom se integruje do hostitelského genomu a přepisuje se hostitelskou buňkou enzymy jako eukaryotický jaderný RNA polymeráza II. Replikace genomu probíhá v hostiteli cytoplazma, nebo jádro a shromáždění může nastat v cytoplazmě nebo v jádře.
Reference
- ^ Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. „Seznam hlavních druhů ICTV 2018a v1“.; MSL včetně všech aktualizací taxonů od vydání z roku 2017 (# 33)
- ^ "Pseudoviridae - reverzní transkripce virů DNA a RNA - reverzní transkripce virů DNA a RNA (2011)". Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 30. ledna 2020.
- ^ Krupovic M, Blomberg J, Coffin JM, Dasgupta I, Fan H, Geering AD a kol. (Červen 2018). „Ortervirales: Nová objednávka virů sjednocující pět rodin reverzně přepisujících virů“. Journal of Virology. 92 (12). doi:10.1128 / JVI.00515-18. PMC 5974489. PMID 29618642.
externí odkazy
- NCBI ICTVdb
- Pseudoviridae (Darwinova zoologie)