VPg - VPg - Wikipedia

Tento článek je o proteinu a genu. Skupina výroby vozidel viz MV-1. Pro další použití viz VPG.

VPg (spojený s genomem virového proteinu) je protein, který je kovalentně připojený k 5 'konci viru pozitivního řetězce RNA a funguje jako primer v době Syntéza RNA v různých rodinách virů včetně Picornaviridae, Potyviridae a Caliciviridae. Existuje několik studií, které ukazují, že možný protein VPg je také přítomen v astroviridae, nicméně, experimentální důkaz toto dosud nebylo poskytnuto a vyžaduje další studium. [1]Aktivita primeru VPg nastává, když dojde k uridylaci proteinu, čímž dojde k uvolnění hydroxyl které lze rozšířit o virově kódované RNA-dependentní RNA polymeráza. U některých rodin virů má VPg také roli v iniciaci translace chováním jako 5 ' mRNA víčko.

VPg byl poprvé popsán v počátečních vyšetřováních poliovirus RNA jako protein kovalentně připojený k 5 'konci genomu.[2][3] a později vidět u kalicivirů.[4]

Připevnění během syntézy RNA

VPg musí podstoupit posttranslační uridylylaci, než bude fungovat jako primer pro replikaci. 3Dpol (RdRp) je schopen syntetizovat Vpg-pUpU-OH pomocí sekvence polyA ve struktuře kmenové smyčky (cis působící replikační prvek ) 2C-ATPázy jako šablony.[5][6][7] Kromě toho je v cis zapotřebí 5 'terminál čtyřlístku, aby se vytvořil komplex replikace preiniciační RNA 3Dpol zapojený do uridylylace VPg.[8]

3CDpro (a proteáza ) štěpí VPg z 3AB vázaného na membránu.

Funguje jako 5 'čepice

Studie, které používaly proteináza K. k odštěpení VPg z virového genomu bylo zjištěno, že virus kalikivirového vezikulárního exantému bez VPg již není infekční[9] zatímco poliovirus si zachovává infekčnost i při nepřítomnosti VPg.[10] Protože VPg sedí na 5 'konci genomu, podobně jako eukaryotické 5' mRNA čepice, bylo provedeno několik experimentů, aby se prozkoumala jeho funkce v translaci. Poliovirus využívá interní místo vstupu ribozomu (IRES) namísto omezení iniciace translace, čímž se ruší požadavek VPg při počáteční infekci[11] zatímco studie s kočičím kalicivirem potvrdily, že protein VPg interaguje přímo s proteinem vázajícím čepici ribozom eIF4E a že tato interakce je nezbytná pro virovou translaci.[12]

Zdroje

Principy virologie autor: S.J. Flint, L.W. Enquist, V.R. Racaniello, A.M. Skalka (ISBN  1-55581-259-7)

  1. ^ Goodfellow I (listopad 2011). „Genomem spojený protein VPg virů obratlovců - mnohostranný protein“. Curr Opin Virol. 1 (5): 355–362. doi:10.1016 / j.coviro.2011.09.003. PMC  3541522. PMID  22440837.
  2. ^ Flanegan JB, Petterson RF, Ambros V, Hewlett MJ, Baltimore D. Kovalentní vazba proteinu na definovanou nukleotidovou sekvenci na 5'-konci virionu a replikativní meziprodukt rnas polioviru. Proc Natl Acad Sci U SA. 1977; 74: 961–965.
  3. ^ Lee YF, Nomoto A, Detjen BM, Wimmer E. Genomem vázaný protein pikornavirů i. Protein kovalentně spojený s poliovirovým genomem rna. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977; 74: 59–63.
  4. ^ Schaffer FL, Ehresmann DW, Fretz MK, Soergel MI. Protein, vpg, kovalentně navázaný na 36s kalicivirus rna. J Gen Virol. 1980; 47 (1): 215–220.
  5. ^ Goodfellow I, Chaudhry Y, Richardson A, Meredith J, Almond J W, Barclay W, Evans D J. Identifikace cis působícího replikačního prvku v oblasti kódující poliovirus. J Virol. 2000; 74: 4590–4600.
  6. ^ Paul A V, Rieder E, Kim D W, van Boom J H, Wimmer E. Identifikace vlásenky RNA v poliovirové RNA, která slouží jako primární templát v in vitro uridylylaci VPg. J Virol. 2000; 74: 10359–10370.
  7. ^ Rieder E, Paul A V, Kim D W, van Boom J H, Wimmer E. Genetické a biochemické studie poliovirového cis-působícího replikačního prvku cre ve vztahu k VPg uridylylaci. J Virol. 2000; 74: 10371–10380.
  8. ^ Lyons T, Murray KE, Roberts AW, Barton DJ. Poliovirus 5'-terminální čtyřlístek RNA je vyžadován v cis pro VPg uridylylaci a zahájení syntézy RNA s negativním řetězcem. J Virol. 2001; 75 (22): 10696–708.
  9. ^ Burroughs JN, Brown F. Přítomnost kovalentně vázaného proteinu na kaliciviru rna. J Gen Virol. 1978; 41 (2): 443–446.
  10. ^ Van der Werf S, Bradley J, Wimmer E, Studier FW, Dunn JJ. Syntéza infekčního polioviru rna purifikovanou t7 rna polymerázou. Proč Natl Acad Sci. 1986; 83: 2330–2334.
  11. ^ Fitzgerald KD, Semler BL. Přemosťování prvků irů v mrnách s eukaryotickým překladovým aparátem. Biochim Biophys Acta. 2009; 1789 (9-10): 518–528.
  12. ^ Goodfellow I, Chaudhry Y, Gioldasi I, Gerondopoulos A, Natoni A, Labrie L, Laliberte JF, Roberts L. Kalicivirová iniciace translace vyžaduje interakci mezi vpg a eif 4 e. EMBO Rep.2005; 6 (10): 968–972.