Potyviridae - Potyviridae

Potyviridae
Viry-04-02853-g002.png
Genom virus neštovic švestek rodu Potyvirus s tansmisní elektronový mikrofotografie a model viriony
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Stelpaviricetes
Objednat:Patatavirales
Rodina:Potyviridae
Rody

viz text

Potyviridae je rodina pozitivní viry RNA který zahrnuje více než 30% známých rostlinné viry,[1][2] mnohé z nich mají velký zemědělský význam. V současné době je do této rodiny umístěno 228 druhů, které jsou rozděleny mezi 12 rodů a tři nepřiřazené druhy.[3][4][5][6]

Struktura

Genomická mapa typického člena rodu Potyvirus.

Potyvirid viriony jsou neobalené, pružný vláknité tyčinkovité částice. Průměr je kolem 12–15 nm, s délkou 200–300 nm.[4][5]

Genomy jsou lineární a obvykle nesegmentované, mají délku přibližně 8–12 kB,[4][5] skládající se z pozitivní smyslové RNA, která je obklopena proteinovým pláštěm tvořeným jediným virově kódovaným proteinem zvaným a kapsid. Všechny vyvolávají ve svých hostitelích tvorbu virových inkluzních tělísek nazývaných cylindrické inkluze („větrníky“). Skládají se z jednoho proteinu (asi 70%) kDa ) vyrobené ve svých hostitelích z jediného produktu virového genomu.

Životní cyklus

Replikace a pohyb virus sójové mozaiky (SMV)

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstup do hostitelské buňky je dosažen penetrací. Replikace následuje model replikace viru s pozitivním řetězcem RNA. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Překlad probíhá posunem -1 ribozomálního posunu snímků. Virus opouští hostitelskou buňku virovým pohybem vedeným tubulem.[4][5] Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Virus se přenáší prostřednictvím vektoru (často hmyzu nebo roztočů). Přenosové cesty jsou vektorové a mechanické.[4][5]

Přenos

Potyvirus je největší rod v rodině se 183 známými druhy.[7] Tyto viry mají délku 720–850 nm a přenášejí je mšice. Mohou být také snadno přenášeny mechanickými prostředky. Tyto viry sdílely před 6 600 lety společný původ[8] a přenáší je více než 200 druhů mšic.

Druh rodu Makluravirus jsou 650–675 nm dlouhé a jsou přenášeny také mšicemi. Rostlinné viry rodu Ipomovirus jsou přenášeny pomocí běloši a jsou dlouhé 750–950 nm. Tritimovirus a Rymovirus viry jsou dlouhé 680–750 nm a jsou přenášeny prostřednictvím eriophydidní roztoči. (Rymoviry jsou úzce spjaty s potyviry a mohou být nakonec sloučeny s potyviry.[9]) The Bymovirus genom se skládá ze dvou částic místo jedné (275 a 550 nm) a tyto viry jsou přenášeny chytrá houba, Polymyxa graminis.

Taxonomie

Fylogenetický strom rodiny Potyviridae

Rozpoznávají se tyto rody:[6]

Následující druhy nejsou přiřazeny k rodu:[6]

Reference

  1. ^ Riechmann, JL; Lain, S; Garcia, JA (1992). „Hlavní body a vyhlídky molekulární biologie potyviru“. J Gen Virol. 73: 1–16. doi:10.1099/0022-1317-73-1-1. PMID  1730931.
  2. ^ Berger PH a kol. (2005) in Virus Taxonomy: Eighth Report of the InternationalCommittee on the Taxonomy of Viruses, eds Fauquet CM, Mayo MA, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA (Elsevier Academic, San Diego), pp 819–841.
  3. ^ Wylie, SJ; Adams, M; Chalam, C; Kreuze, J; López-Moya, JJ; Ohshima, K; Praveen, S; Rabenstein, F; Stenger, D; Wang, A; Zerbini, FM; Konsorcium pro zprávu o ICTV (březen 2017). „Profil taxonomie viru ICTV: Potyviridae“. The Journal of General Virology. 98 (3): 352–354. doi:10.1099 / jgv.0.000740. PMC  5797945. PMID  28366187.
  4. ^ A b C d E "Potyviridae". Zpráva o ICTV online (10.).
  5. ^ A b C d E „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  6. ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 30. dubna 2020.
  7. ^ Popis rostlinných virů: Rodina Potyviridae
  8. ^ Nigam D, LaTourrette K, Souza PFN, Garcia-Ruiz H (2019) Varianta potyvirů v celém genomu. Front Plant Sci 10: 1439
  9. ^ Popis rostlinných virů: Rodina Potyviridae postava

externí odkazy