Protocatechuate 3,4-dioxygenase - Protocatechuate 3,4-dioxygenase - Wikipedia
| protocatechuate 3,4-dioxygenase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Protocatechuate 3,4-dioxygenáza hetero24mer, Pseudomonas putida | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 1.13.11.3 | ||||||||
| Číslo CAS | 9029-47-4 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, a protocatechuate 3,4-dioxygenase (ES 1.13.11.3 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- 3,4-dihydroxybenzoát + O.2 3-karboxy-cis, cis-mukonát
Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou 3,4-dihydroxybenzoát (kyselina protocatechuová ) a Ó2, zatímco jeho produkt je 3-karboxy-cis, cis-mukonát.
Tento enzym patří do rodiny oxidoreduktázy, zejména těch, kteří jednají s jedinými dárci s O2 jako oxidant a inkorporace dvou atomů kyslíku do substrátu (oxygenázy). The systematické jméno této třídy enzymů je protocatechuate: kyslík 3,4-oxidoreduktáza (decyklizující). Mezi další běžně používaná jména patří protocatechuate oxygenase, oxidáza protocatechuové kyseliny, protocatechuová 3,4-dioxygenáza, a protocatechuová 3,4-oxygenáza. Tento enzym se účastní degradace benzoátu hydroxylací a Degradace 2,4-dichlorbenzoátu. Zaměstnává jednoho kofaktor, žehlička.
Bylo zjištěno, že tento enzym je účinný při zlepšování stability organických fluoroforů v experimentech s jednou molekulou.[1] Komerční preparáty enzymu izolované z Pseudomonas sp obecně vyžadují další čištění, aby se odstranila silná kontaminující aktivita nukleázy.
Strukturální studie
Ke konci roku 2007, 37 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1EO2, 1EO9, 1EOA, 1EOB, 1EOC, 1YKK, 1YKL, 1YKM, 1YKN, 1YKO, 1YKP, 2BUM, 2BUQ, 2 BUR, 2 ALE, 2BUU, 2BUV, 2BUW, 2BUX, 2KUPIT, 2BUZ, 2BV0, 2PCD, 3PCA, 3 PCB, 3PCC, 3PCD, 3 PCE, 3PCF, 3PCG, 3PCH, 3PCI, 3PCJ, 3ks, 3PCL, 3 PCM, a 3PCN.
Viz také
Reference
- ^ Aitken CE, Marshall RA, Puglisi JD (2008). „Systém zachycování kyslíku pro zlepšení stability barviva v experimentech s jednou molekulou fluorescence“. Biophys. J. 94 (5): 1826–1835. Bibcode:2008BpJ .... 94.1826A. doi:10.1529 / biophysj.107.117689. PMC 2242739. PMID 17921203.
- Fujisawa H, Hayaishi O (1968). „Protocatechuate 3,4-dioxygenase. I. Krystalizace a charakterizace“. J. Biol. Chem. 243 (10): 2673–81. PMID 4967959.
- HRUBÉ SR, GAFFORD RD, TATUM EL (1956). "Metabolismus kyseliny protocatechuové Neurosporou". J. Biol. Chem. 219 (2): 781–96. PMID 13319299.
- Stanier RY, Ingraham JL (1954). "Oxidáza protocatechuové kyseliny". J. Biol. Chem. 210 (2): 799–820. PMID 13211618.
| Tento EC 1.13 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |