SENP2 - SENP2

SENP2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 TGZ, 1TH0, 2IO0, 2IO1, 2IO2, 2IO3, 3ZO5, 5 AEK
Identifikátory
Aliasy	SENP2, AXAM2, SMT3IP2, SUMO1 / sentrin / SMT3 specifická peptidáza 2, SUMO specifická peptidáza 2
Externí ID	OMIM: 608261 MGI: 1923076 HomoloGene: 11005 Genové karty: SENP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	185,633,551 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	22,049,269 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy cysteinového typu; • aktivita endopeptidázy; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • SUMO-specifická aktivita isopeptidázy; • SUMO-specifická aktivita endopeptidázy; • specifické vazby na proteinovou doménu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • ne membrána; • membrána; • jaderný pór; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • jaderné těleso; • Tělo PML; • cytoplazmatický váček;
Biologický proces	• transport mRNA; • Wnt signální cesta; • proteinová sumoylace; • proteolýza; • negativní regulace ubikvitinace bílkovin; • regulace signální dráhy Wnt; • destabilizace bílkovin; • transport bílkovin; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • pozitivní regulace fosforylace bílkovin; • vývoj srdce; • specifikace hřbetní / břišní osy; • desumoylace proteinů; • negativní regulace vazby na bílkoviny; • regulace endoreduplikace DNA; • negativní regulace vazby chromatinu; • negativní regulace reakce poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53; • diferenciace tukových buněk; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace procesu metabolismu bílkovin; • diferenciace obřích buněk trofoblastu; • vývoj labyrintové vrstvy; • vývoj vrstvy spongiotrofoblastů; • negativní regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	59343
	75826
	ENSG00000163904
	ENSMUSG00000022855
	Q9HC62
	Q91ZX6
	NM_021627
	NM_029457; NM_001357424
	NP_067640
	NP_083733; NP_001344353
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteáza specifická pro sentrin 2 je enzym že u lidí je kódován SENP2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

SUMO1 (UBL1; MIM 601912) je malý protein podobný ubikvitinu, který lze kovalentně konjugovat s jinými proteiny. SENP2 je jednou ze skupiny enzymů, které zpracovávají nově syntetizovanou SUMO1 do konjugovatelné formy a katalyzují dekonjugaci druhů obsahujících SUMO1. [Dodává OMIM]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že SENP2 komunikovat s NUP153.^[5]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163904 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022855 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Hang J, Dasso M (květen 2002). „Sdružení lidské proteázy SUMO-1 SENP2 s jadernými póry“. J. Biol. Chem. 277 (22): 19961–6. doi:10,1074 / jbc.M201799200. PMID 11896061.
^ Nishida T, Kaneko F, Kitagawa M, Yasuda H (říjen 2001). „Charakterizace nové savčí specifické pro isopeptidázu specifickou pro SUMO-1 / Smt3, homolog krysího axamu, což je protein vázající axin podporující degradaci beta-kateninu“. J. Biol. Chem. 276 (42): 39060–6. doi:10,1074 / jbc.M103955200. PMID 11489887.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SENP2 SUMO1 / sentrin / SMT3 specifická peptidáza 2“.
^ Zhang H, Saitoh H, Matunis MJ (září 2002). „Enzymy modifikační dráhy SUMO se lokalizují na vlákna komplexu jaderných pórů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (18): 6498–508. doi:10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002. PMC 135644. PMID 12192048.

Další čtení

Mikolajczyk J, Drag M, Békés M, Cao JT, Ronai Z, Salvesen GS (2007). „Malé proteázy specifické pro ubikvitin (SUMO): profilování specifik a aktivit lidských SENP“. J. Biol. Chem. 282 (36): 26217–24. doi:10,1074 / jbc.M702444200. PMID 17591783.
Drag M, Mikolajczyk J, Krishnakumar IM, Huang Z, Salvesen GS (2008). „Profilování aktivity lidských deSUMOylačních enzymů (SENP) se syntetickými substráty naznačuje neočekávanou specifičnost dvou nově charakterizovaných členů rodiny“. Biochem. J. 409 (2): 461–9. doi:10.1042 / BJ20070940. PMID 17916063.
Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2002). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cIANA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
Kadoya T, Yamamoto H, Suzuki T, Yukita A, Fukui A, Michiue T, Asahara T, Tanaka K, Asashima M, Kikuchi A (2002). „Desumoylační aktivita Axamu, nového proteinu vázajícího Axin, se podílí na downregulaci beta-kateninu“. Mol. Buňka. Biol. 22 (11): 3803–19. doi:10.1128 / MCB.22.11.3803-3819.2002. PMC 133821. PMID 11997515.
Zhang H, Saitoh H, Matunis MJ (2002). „Enzymy modifikační dráhy SUMO se lokalizují na vlákna komplexu jaderných pórů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (18): 6498–508. doi:10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002. PMC 135644. PMID 12192048.
Nejlepší JL, Ganiatsas S, Agarwal S, Changou A, Salomoni P, Shirihai O, Meluh PB, Pandolfi PP, Zon LI (2002). „SUMO-1 proteáza-1 reguluje genovou transkripci prostřednictvím PML“. Mol. Buňka. 10 (4): 843–55. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00699-8. PMID 12419228.
Reverter D, Lima CD (2004). "Základ pro specificitu SUMO proteázy poskytnutou analýzou lidského Senp2 a komplexu Senp2-SUMO". Struktura. 12 (8): 1519–31. doi:10.1016 / j.str.2004.05.023. PMID 15296745.
Itahana Y, Yeh ET, Zhang Y (2006). „Nucleocytoplasmic Shuttling modulates activity and ubiquitination-dependent turnover of SUMO-specific proteease 2“. Mol. Buňka. Biol. 26 (12): 4675–89. doi:10.1128 / MCB.01830-05. PMC 1489137. PMID 16738331.
Reverter D, Lima CD (2006). "Strukturální základ pro interakce proteázy SENP2 s prekurzory SUMO a konjugovanými substráty". Nat. Struct. Mol. Biol. 13 (12): 1060–8. doi:10.1038 / nsmb1168. PMID 17099700. S2CID 25139166.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163904 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022855 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11896061-5] A ^b Hang J, Dasso M (květen 2002). „Sdružení lidské proteázy SUMO-1 SENP2 s jadernými póry“. J. Biol. Chem. 277 (22): 19961–6. doi:10,1074 / jbc.M201799200. PMID 11896061.

[pmid11489887-6] Nishida T, Kaneko F, Kitagawa M, Yasuda H (říjen 2001). „Charakterizace nové savčí specifické pro isopeptidázu specifickou pro SUMO-1 / Smt3, homolog krysího axamu, což je protein vázající axin podporující degradaci beta-kateninu“. J. Biol. Chem. 276 (42): 39060–6. doi:10,1074 / jbc.M103955200. PMID 11489887.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: SENP2 SUMO1 / sentrin / SMT3 specifická peptidáza 2“.

[pmid12192048-8] Zhang H, Saitoh H, Matunis MJ (září 2002). „Enzymy modifikační dráhy SUMO se lokalizují na vlákna komplexu jaderných pórů“. Mol. Buňka. Biol. 22 (18): 6498–508. doi:10.1128 / MCB.22.18.6498-6508.2002. PMC 135644. PMID 12192048.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]