Nebulin - Nebulin

NEB
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 NEB, 1ARK
Identifikátory
Aliasy	NEB, nebulin, NEB177D, NEM2
Externí ID	OMIM: 161650 MGI: 97292 HomoloGene: 136285 Genové karty: NEB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	151,734,487 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	52,378,474 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktinová vazba; • strukturní složka svalu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba aktinového vlákna;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • sarkoméra; • Z disk; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • aktinový cytoskelet;
Biologický proces	• klouzání svalového vlákna; • vývoj svalových orgánů; • vývoj somatických svalů; • regulace délky aktinového vlákna; • vývoj svalových vláken; • sestava tenkého vlákna srdečního svalu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4703
	17996
	ENSG00000183091
	ENSMUSG00000026950
	P20929; Q05C45
	n / a
	NM_001164507; NM_001164508; NM_001271208; NM_004543
	NM_010889
	NP_001157979; NP_001157980; NP_001258137; NP_004534; NP_004534.2
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nebulin je aktin - vazebný protein, který je lokalizován na tenkém vláknu sarkomery v kosterní sval. Je to velmi velký protein (600–900 kDa) a váže až 200 aktinových monomerů. Protože jeho délka je úměrná tenké vlákno Předpokládá se, že nebulin působí jako „vládce“ tenkého vlákna a reguluje délku tenkého vlákna během sarkoméra sestavení a působí jako vrstva aktinového vlákna.^[5] Další funkce nebulinu, například role v buněčná signalizace zůstávají nejisté.

Ukázalo se také, že nebulin reguluje interakce aktin-myosin inhibicí ATPáza aktivita v a vápník -klimodulin citlivým způsobem.^[6]

Mutace v nebulinu způsobují některé případy autosomálně recesivní porucha nemaline myopatie.^[7]

Menší člen rodiny proteinů nebulinu, nazývaný mlhovina, je vyjádřen v srdeční sval.

Struktura

Struktura SH3 doména nebulinu byla stanovena pomocí NMR.^[8] SH3 doména z nebulinu se skládá ze 60 aminokyselinových zbytků, z nichž 30 procent je v beta list sekundární struktura (7 řetězců; 18 zbytků).

Fenotyp vyřazení

Od roku 2007 dva knockout myš pro lepší pochopení byly vyvinuty modely pro nebulin in vivo funkce. Bang a kolegové^[9] prokázali, že myši s knockoutem nebulinu umírají postnatálně, mají sníženou délku tenkého vlákna a jsou poškozeny kontraktilní funkce. Postnatální sarkoméra u těchto myší došlo rychle k dezorganizaci a degeneraci, což naznačuje, že nebulin je nezbytný pro udržení strukturní integrity myofibrily. Witt a kolegové^[10] měli podobné výsledky u svých myší, které také zemřely postnatálně se sníženou délkou tenkého vlákna a kontraktilní funkcí. Tyto myši s knockoutem nebulinu jsou zkoumány jako zvířecí modely z nemaline myopatie.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183091 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026950 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ McElhinny AS, Kazmierski ST, Labeit S, Gregorio CC (červenec 2003). „Nebulin: mlhavý, multifunkční obr příčně pruhovaného svalu“. Trendy v kardiovaskulární medicíně. 13 (5): 195–201. doi:10.1016 / S1050-1738 (03) 00076-8. PMID 12837582.
^ Root DD, Wang K (říjen 1994). „Interakce lidských nebulinových fragmentů s aktinem a myosinem citlivá na kalmodulin“. Biochemie. 33 (42): 12581–91. doi:10.1021 / bi00208a008. PMID 7918483.
^ Pelin K, Hilpelä P, Donner K, Sewry C, Akkari PA, Wilton SD, Wattanasirichaigoon D, Bang ML, Centner T, Hanefeld F, Odent S, Fardeau M, Urtizberea JA, Muntoni F, Dubowitz V, Beggs AH, Laing NG Labeit S, de la Chapelle A, Wallgren-Pettersson C (březen 1999). "Mutace v nebulinovém genu spojené s autozomálně recesivní nemalinovou myopatií". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (5): 2305–10. Bibcode:1999PNAS ... 96.2305P. doi:10.1073 / pnas.96.5.2305. PMC 26779. PMID 10051637.
^ PDB: 1 NEB; Politou AS, Millevoi S, Gautel M, Kolmerer B, Pastore A (únor 1998). "SH3 ve svalech: struktura řešení domény SH3 z nebulinu". J. Mol. Biol. 276 (1): 189–202. doi:10.1006 / jmbi.1997.1521. PMID 9514727.
^ Bang ML, Li X, Littlefield R, Bremner S, Thor A, Knowlton KU, Lieber RL, Chen J (červen 2006). „Myši s nedostatkem nebulinu vykazují kratší délky tenkých vláken a sníženou kontraktilní funkci v kosterním svalu“. The Journal of Cell Biology. 173 (6): 905–16. doi:10.1083 / jcb.200603119. PMC 2063916. PMID 16769824.
^ Witt CC, Burkart C, Labeit D, McNabb M, Wu Y, Granzier H, Labeit S (srpen 2006). „Nebulin reguluje in vivo délku tenkého vlákna, kontraktilitu a strukturu Z-disku“. Časopis EMBO. 25 (16): 3843–55. doi:10.1038 / sj.emboj.7601242. PMC 1553189. PMID 16902413.

Další čtení

Björklund AK, Light S, Sagit R, Elofsson A (září 2010). „Nebulin: studie vývoje opakování bílkovin“. Journal of Molecular Biology. 402 (1): 38–51. doi:10.1016 / j.jmb.2010.07.011. PMID 20643138.

externí odkazy

nebulin v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na Nemaline Myopathy
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro Human Nebulin

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183091 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026950 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[mcelhinny-5] McElhinny AS, Kazmierski ST, Labeit S, Gregorio CC (červenec 2003). „Nebulin: mlhavý, multifunkční obr příčně pruhovaného svalu“. Trendy v kardiovaskulární medicíně. 13 (5): 195–201. doi:10.1016 / S1050-1738 (03) 00076-8. PMID 12837582.

[rootwang-6] Root DD, Wang K (říjen 1994). „Interakce lidských nebulinových fragmentů s aktinem a myosinem citlivá na kalmodulin“. Biochemie. 33 (42): 12581–91. doi:10.1021 / bi00208a008. PMID 7918483.

[pelin-7] Pelin K, Hilpelä P, Donner K, Sewry C, Akkari PA, Wilton SD, Wattanasirichaigoon D, Bang ML, Centner T, Hanefeld F, Odent S, Fardeau M, Urtizberea JA, Muntoni F, Dubowitz V, Beggs AH, Laing NG Labeit S, de la Chapelle A, Wallgren-Pettersson C (březen 1999). "Mutace v nebulinovém genu spojené s autozomálně recesivní nemalinovou myopatií". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (5): 2305–10. Bibcode:1999PNAS ... 96.2305P. doi:10.1073 / pnas.96.5.2305. PMC 26779. PMID 10051637.

[pmid9514727-8] PDB: 1 NEB; Politou AS, Millevoi S, Gautel M, Kolmerer B, Pastore A (únor 1998). "SH3 ve svalech: struktura řešení domény SH3 z nebulinu". J. Mol. Biol. 276 (1): 189–202. doi:10.1006 / jmbi.1997.1521. PMID 9514727.

[bang-9] Bang ML, Li X, Littlefield R, Bremner S, Thor A, Knowlton KU, Lieber RL, Chen J (červen 2006). „Myši s nedostatkem nebulinu vykazují kratší délky tenkých vláken a sníženou kontraktilní funkci v kosterním svalu“. The Journal of Cell Biology. 173 (6): 905–16. doi:10.1083 / jcb.200603119. PMC 2063916. PMID 16769824.

[witt-10] Witt CC, Burkart C, Labeit D, McNabb M, Wu Y, Granzier H, Labeit S (srpen 2006). „Nebulin reguluje in vivo délku tenkého vlákna, kontraktilitu a strukturu Z-disku“. Časopis EMBO. 25 (16): 3843–55. doi:10.1038 / sj.emboj.7601242. PMC 1553189. PMID 16902413.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]