RAE1 - RAE1

RAE1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3MMY, 4OWR
Identifikátory
Aliasy	RAE1, MIG14, MRNP41, Mnrp41, dJ481F12.3, dJ800J21.1, export ribonukleové kyseliny 1, Gle2
Externí ID	OMIM: 603343 MGI: 1913929 HomoloGene: 2676 Genové karty: RAE1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	57,379,211 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	173,015,739 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba mikrotubulů; • Vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ubikvitinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderný pór; • buněčné jádro; • jaderný obal; • fibrilární centrum; • mitotická tyč vřetena; • vřetenová tyč; • cytoskelet; • hostitelská buňka;
Biologický proces	• buněčná odpověď na organickou cyklickou sloučeninu; • GO: virový proces 0022415; • regulace organizace mitotického vřetena; • transkripčně závislé svazování DNA genu RNA polymerázy II na jaderné periferii; • Export RNA z jádra; • import bílkovin do jádra; • buněčný cyklus; • buněčné dělení; • export mRNA z jádra; • regulace glykolytického procesu; • Export tRNA z jádra; • proteinová sumoylace; • virová transkripce; • regulace umlčování genů miRNA; • GO: 0046795 intracelulární transport viru; • regulace buněčné reakce na teplo;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8480
	66679
	ENSG00000101146
	ENSMUSG00000027509
	P78406
	Q8C570
	NM_001015885; NM_003610
	NM_175112
	NP_001015885; NP_003601
	NP_780321
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

exportní faktor mRNA je protein že u lidí je kódován RAE1 gen.^[5]^[6]^[7]

Bylo prokázáno, že mutace v genech Schizosaccharomyces pombe Rae1 a Saccharomyces cerevisiae Gle2 vedou k akumulaci mRNA obsahující poly (A) v jádře, což naznačuje, že kódované proteiny se podílejí na exportu RNA. Protein kódovaný tímto genem je homolog kvasinky Rae1. Obsahuje čtyři motivy WD40 a bylo prokázáno, že se lokalizuje do odlišných ohnisek v nukleoplazmě, do jaderného okraje a do struktur podobných mřížce v celé cytoplazmě. Předpokládá se, že tento gen je zapojen do nukleocytoplazmatického transportu a do přímé nebo nepřímé vazby cytoplazmatických mRNP na cytoskelet. Alternativně byly pro tento gen nalezeny sestřižené varianty transkriptu kódující stejný protein.^[7]

Interakce

RAE1 bylo prokázáno komunikovat s NUP98.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101146 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027509 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bharathi A, Ghosh A, Whalen WA, Yoon JH, Pu R, Dasso M, Dhar R (prosinec 1997). „Lidský gen RAE1 je funkční homolog genu Schizosaccharomyces pombe rae1 účastnícího se jaderného exportu Poly (A) + RNA.“ Gen. 198 (1–2): 251–8. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00322-3. PMID 9370289.
^ Kraemer D, Blobel G (září 1997). „mRNA vázající protein mrnp 41 se lokalizuje jak do jádra, tak do cytoplazmy“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (17): 9119–24. Bibcode:1997PNAS ... 94,9119K. doi:10.1073 / pnas.94.17.9119. PMC 23064. PMID 9256445.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RAE1 RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe)“.
^ Pritchard, CE; Fornerod M; Kasper L H; van Deursen J. M. (duben 1999). „RAE1 je převádějící faktor exportu mRNA, který se váže na motiv NUP98 podobný GLEBS v komplexu jaderných pórů prostřednictvím více domén“. J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. doi:10.1083 / jcb.145.2.237. ISSN 0021-9525. PMC 2133102. PMID 10209021.

Další čtení

Nomura M, Zou Z, Joh T a kol. (1997). „Genomické struktury a charakterizace členů rodiny Rae1 kódujících proteiny buněčného povrchu ukotvené GPI a exprimované převážně v embryonálním myším mozku“. J. Biochem. 120 (5): 987–95. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021517. PMID 8982867.
Yoon JH, Whalen WA, Bharathi A a kol. (1997). „Npp106p, nukleoporin Schizosaccharomyces pombe podobný Saccharomyces cerevisiae Nic96p, při exportu mRNA funkčně interaguje s Rae1p“. Mol. Buňka. Biol. 17 (12): 7047–60. doi:10.1128 / MCB.17.12.7047. PMC 232561. PMID 9372936.
Matsuoka Y, Takagi M, Ban T a kol. (1999). "Identifikace a charakterizace subkomplexů jaderných pórů v mitotickém extraktu lidských somatických buněk". Biochem. Biophys. Res. Commun. 254 (2): 417–23. doi:10.1006 / bbrc.1998.9953. PMID 9918853.
Pritchard CE, Fornerod M, Kasper LH, van Deursen JM (1999). „RAE1 je převádějící faktor exportu mRNA, který se váže na motiv NUP98 podobný GLEBS v komplexu jaderných pórů prostřednictvím více domén“. J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. doi:10.1083 / jcb.145.2.237. PMC 2133102. PMID 10209021.
Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP a kol. (2000). „C-koncová doména TAP interaguje s komplexem jaderných pórů a podporuje export specifických substrátů RNA nesoucích CTE“. RNA. 6 (1): 136–58. doi:10.1017 / S1355838200991994. PMC 1369901. PMID 10668806.
Yoon JH, Love DC, Guhathakurta A a kol. (2000). „Mex67p ze Schizosaccharomyces pombe interaguje s Rae1p při zprostředkování exportu mRNA“. Mol. Buňka. Biol. 20 (23): 8767–82. doi:10.1128 / MCB.20.23.8767-8782.2000. PMC 86506. PMID 11073978.
Sabri N, Visa N (2000). „Protein Ct-RAE1 interaguje s částicemi RNP podle Balbianiho kruhu v jaderném póru“. RNA. 6 (11): 1597–609. doi:10.1017 / S1355838200001138. PMC 1370029. PMID 11105759.
Wang X, Babu JR, Harden JM a kol. (2001). "Protein mitotického kontrolního bodu hBUB3 a mRNA exportní faktor hRAE1 interagují s proteiny obsahujícími GLE2p-vazebnou sekvenci (GLEBS)". J. Biol. Chem. 276 (28): 26559–67. doi:10,1074 / jbc.M101083200. PMID 11352911.
O'Callaghan CA, Cerwenka A, Willcox BE a kol. (2001). "Molekulární konkurence pro NKG2D: H60 a RAE1 soutěží nerovnoměrně pro NKG2D s dominancí H60." Imunita. 15 (2): 201–11. doi:10.1016 / S1074-7613 (01) 00187-X. PMID 11520456.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001 Natur.414..865D. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Kraemer D, Dresbach T, Drenckhahn D (2002). "Mrnp41 (Rae 1p) se asociuje s mikrotubuly v HeLa buňkách a v neuronech". Eur. J. Cell Biol. 80 (12): 733–40. doi:10.1078/0171-9335-00216. PMID 11831386.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Faria PA, Chakraborty P, Levay A a kol. (2005). „VSV naruší cestu jaderného exportu mRNA Rae1 / mrnp41“. Mol. Buňka. 17 (1): 93–102. doi:10.1016 / j.molcel.2004.11.023. PMID 15629720.
Benzinger A, Muster N, Koch HB a kol. (2005). „Cílená proteomická analýza 14-3-3 sigma, efektoru p53 běžně umlčeného při rakovině“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (6): 785–95. doi:10,1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Blower MD, Nachury M, Heald R, Weis K (2005). "Pro sestavení mitotického vřetena je vyžadován komplex ribonukleoproteinů obsahujících Rae1". Buňka. 121 (2): 223–34. doi:10.1016 / j.cell.2005.02.016. PMID 15851029. S2CID 242561.
Wong RW, Blobel G, Coutavas E (2007). „K tvorbě bipolárního vřetene je nutná interakce Rae1 s NuMA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (52): 19783–7. Bibcode:2006PNAS..10319783W. doi:10.1073 / pnas.0609582104. PMC 1750899. PMID 17172455.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101146 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027509 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9370289-5] Bharathi A, Ghosh A, Whalen WA, Yoon JH, Pu R, Dasso M, Dhar R (prosinec 1997). „Lidský gen RAE1 je funkční homolog genu Schizosaccharomyces pombe rae1 účastnícího se jaderného exportu Poly (A) + RNA.“ Gen. 198 (1–2): 251–8. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00322-3. PMID 9370289.

[pmid9256445-6] Kraemer D, Blobel G (září 1997). „mRNA vázající protein mrnp 41 se lokalizuje jak do jádra, tak do cytoplazmy“. Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (17): 9119–24. Bibcode:1997PNAS ... 94,9119K. doi:10.1073 / pnas.94.17.9119. PMC 23064. PMID 9256445.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RAE1 RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe)“.

[pmid10209021-8] Pritchard, CE; Fornerod M; Kasper L H; van Deursen J. M. (duben 1999). „RAE1 je převádějící faktor exportu mRNA, který se váže na motiv NUP98 podobný GLEBS v komplexu jaderných pórů prostřednictvím více domén“. J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. doi:10.1083 / jcb.145.2.237. ISSN 0021-9525. PMC 2133102. PMID 10209021.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]