Hlavní nadrodina zprostředkovatele - Major facilitator superfamily

Superrodina hlavního facilitátora
2y5y.png
Krystalová struktura laktosy permeázy LacY.
Identifikátory
SymbolMFS
Pfam klanCL0015
TCDB2.A.1
OPM nadčeleď15
CDDcd06174

The hlavní pomocná rodina (MFS) je nadčeleď z membránové transportní proteiny které usnadňují pohyb malých rozpuštěné látky přes buněčné membrány v reakci na chemiosmotické přechody.[1][2]

Funkce

Hlavní nadrodina zprostředkovatelů (MFS) jsou membránové proteiny, které jsou všudypřítomně exprimovány ve všech královstvích života pro import nebo export cílových substrátů. Původně se předpokládalo, že rodina MFS funguje primárně při příjmu cukrů, ale následné studie ukázaly, že léky, metabolity, oligosacharidy, aminokyseliny a oxyanionty byli všichni přepraveni členy rodiny MFS.[3] Tyto bílkoviny energeticky řídí transport využívající elektrochemický gradient cílového substrátu (uniporter ), nebo působí jako kotransporter kde je transport spojen s pohybem druhého substrátu.

Složit

Základní sklad transportéru MFS je postaven kolem 12[4], nebo v některých případech 14 transmembránové šroubovice[5] (TMH), se dvěma svazky 6- (nebo 7-) šroubovice tvořenými N a C terminálním homologem domén[6] transportéru, které jsou spojeny prodlouženou cytoplazmatickou smyčkou. Obě poloviny proteinového sbalení proti sobě způsobem mušle a mušle, utěsnění prostřednictvím interakcí na koncích transmembránových šroubovic a extracelulárních smyček.[7][8] Toto vytváří velkou vodnou dutinu ve středu membrány, která je alternativně otevřená do cytoplazma nebo periplazma / extracelulární prostor. Podšívkou této vodné dutiny jsou aminokyseliny které váží substrát (substráty) a definují specificitu transportéru.[9][10] Mnoho MFS transportérů je považováno za dimery in vitro a in vivo metody, s určitými důkazy, které by naznačovaly funkční roli oligomerizace.[11]

Mechanismus

Mechanismus střídavého přístupu, o kterém se předpokládá, že je základem transportu většiny transportů MFS, je klasicky popsán jako mechanismus „kolébkového přepínače“.[7][8] V tomto modelu se transportér otevírá buď do extracelulárního prostoru nebo do cytoplazmy a současně utěsňuje protilehlou plochu transportéru, čímž brání kontinuální cestě přes membránu. Například v nejlépe studovaném MFS transportéru Krajkový, laktóza a protony typicky se váží z periplazmy na specifická místa ve vodné štěrbině. To vede k uzavření extracelulárního obličeje a otevření cytoplazmatické strany, což umožňuje substrát do buňky. Po uvolnění substrátu se transportér recykluje do periplazmatické orientace.

Struktura LacY otevřená do periplazmy (vlevo) nebo cytoplazmy (vpravo). Analogy cukru jsou zobrazeny vázané v rozštěpu obou struktur.

Podobně postupují i ​​vývozci a antiporteri z rodiny MFS reakční cyklus, ačkoli exportéři váží substrát v cytoplazmě a vytlačují jej do extracelulárního nebo periplazmatického prostoru, zatímco antiportery váží substrát v obou státech, aby řídily každou konformační změnu. Zatímco většina struktur MFS naznačuje velké, tuhé strukturní změny těla s vazbou substrátu, pohyby mohou být malé v případě malých substrátů, jako je transportér dusičnanů NarK.[12]

Doprava

Zobecněné transportní reakce katalyzované nosiči MFS jsou:

  1. Uniport: S (out) ⇌ S (in)
  2. Symport: S (out) + [H+ nebo Na+] (ven) ⇌ S (dovnitř) + [sv+ nebo Na+] (v)
  3. Antiport: S1 (out) + S.2 (v) ⇌ S1 (v) + S.2 (ven) (S.1 může být H+ nebo rozpuštěná látka)

Specifičnost podkladu

Ačkoli byl původně identifikován jako transportéry cukru, funkce zachovaná před prokaryoty[10] savcům,[13] řada MFS je pozoruhodná velkou rozmanitostí substrátů přepravovaných nadrodinou. Ty se pohybují od malých oxyaniontů[14][15][16] na velké peptidové fragmenty.[17] Ostatní transportéry MFS se vyznačují nedostatkem selektivity, vytlačováním širokých tříd drog a xenobiotik.[18][19][20] Tato substrátová specificita je do značné míry určena specifickými postranními řetězci, které lemují vodnou kapsu ve středu membrány.[9][10] Zatímco jeden substrát se zvláštním biologickým významem se často používá k pojmenování transportéru nebo rodiny, mohou zde být také společně transportované nebo uniklé ionty nebo molekuly. Patří mezi ně molekuly vody[21][22] nebo vazebný iont které energeticky pohánějí dopravu.

Struktury

Krystalová struktura GlpT ve stavu směřujícím dovnitř, se šroubovicovými doménami N a C zbarvenými fialově a modře. Smyčky zbarvené zeleně.

The krystalové struktury Bylo charakterizováno několik transportérů MFS. První stavby byly z glycerol 3-fosfát /fosfát výměník GlpT[8] a laktóza -proton symporter Krajkový,[7] který sloužil k objasnění celkové struktury rodiny proteinů a poskytl počáteční modely pro pochopení transportního mechanismu MFS. Od těchto počátečních struktur byly vyřešeny další struktury MFS, které ilustrují specificitu substrátu nebo stavy v reakčním cyklu.[23][24] Zatímco původní řešené struktury MFS byly bakteriálních transportérů, nedávno struktury prvních eukaryotický struktury byly publikovány. Patří mezi ně fungální transportér fosfátů PiPT[16] transportér dusičnanů rostlin NRT1.1,[11][25] a člověk glukóza přepravce GLUT1.[26]

Vývoj

O původu základního skladu transportéru MFS se v současnosti vedou velké debaty. Všechny v současné době uznávané MFS permázy mají dvě šest domén TMH v jednom polypeptidovém řetězci, i když v některých rodinách MFS jsou přítomny další dvě TMH. Důkazy naznačují, že permeace MFS vznikly tandemovou intragenní duplikací u časných prokaryot. Tato událost generovala topologii 12 transmembránových šroubovice z (předpokládaného) primordiálního 6-šroubovice dimeru. Navíc se dobře konzervovaný MFS specifický motiv mezi TMS2 a TMS3 a související, ale méně dobře konzervovaný motiv mezi TMS8 a TMS9 ukázaly jako charakteristika prakticky pro všechny z více než 300 identifikovaných proteinů MFS.[27] O původu prvotní 6-šroubovité domény se však vedou velké debaty. Zatímco některé funkční a strukturální důkazy naznačují, že tato doména vznikla z jednodušší domény 3 šroubovice,[28][29] chybí bioinformatické nebo fylogenetické důkazy podporující tuto hypotézu.[30][31]

Lékařský význam

Členové rodiny MFS jsou ústředním bodem lidské fyziologie a hrají důležitou roli v řadě nemocí, aberantním působením, transportem léků nebo odolností vůči lékům. Transportér OAT1 transportuje řadu nukleosidových analogů ústředních pro antivirovou terapii.[32] Rezistence na antibiotika je často výsledkem působení genů rezistence na MFS.[33] Bylo také zjištěno, že mutace v transportérech MFS způsobují neurodegerativní onemocnění,[34] cévní poruchy mozku,[35] a nemoci ukládání glukózy.[36]

Mutace nemoci

Mutace spojené s chorobami byly nalezeny u řady lidských transportérů MFS; ti komentovaní v Uniprot jsou uvedeny níže.

Lidské proteiny MFS

U lidí existuje několik proteinů MFS, kde jsou známé jako nosiče rozpuštěných látek (SLC) a Atypické SLC.[62] Dnes existuje 52 rodin SLC,[63] z toho 16 rodin zahrnuje MFS proteiny; SLC2, 15 16, 17, 18, 19, SLCO (SLC21), 22, 29, 33, 37, 40, 43, 45, 46 a 49.[62] Atypické SLC jsou proteiny MFS, sdílející sekvenční podobnosti a evoluční původ s SLC,[62][64][65][66] ale nejsou pojmenovány podle kořenového systému SLC, který pochází ze systému názvosloví genů hugo (HGNC).[67] Všechny atypické SLC jsou podrobně uvedeny v,[62] ale oni jsou: MFSD1,[66] MFSD2A,[68] MFSD2B, MFSD3,[66] MFSD4A,[69] MFSD4B,[70] MFSD5,[64] MFSD6,[65] MFSD6L, MFSD8,[71] MFSD9,[65][69]MFSD10,[65][72] MFSD11,[64] MFSD12, MFSD13A, MFSD14A,[65][73]MFSD14B,[65][73]UNC93A,[74][75] [76]UNC93B1,[77] SV2A, SV2B, SV2C, SVOP, SVOPL, SPNS1,[78] SPNS2, SPNS3 a CLN3.[79] Protože mezi atypickými SLC typu MFS existuje vysoká sekvenční identita a fylogenetická podobnost, lze je rozdělit na 15 AMTF (Atypical MFS Transporter Families), což naznačuje, že existuje alespoň 64 různých rodin včetně SLC proteinů typu MFS.[80]

Reference

  1. ^ Pao SS, Paulsen IT, Saier MH (březen 1998). „Hlavní nadřízená rodina zprostředkovatele“. Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 62 (1): 1–34. doi:10.1128 / MMBR.62.1.1-34.1998. PMC  98904. PMID  9529885.
  2. ^ Walmsley AR, Barrett MP, Bringaud F, Gould GW (prosinec 1998). "Transportéry cukru z bakterií, parazitů a savců: vztahy mezi strukturou a aktivitou". Trendy v biochemických vědách. 23 (12): 476–81. doi:10.1016 / S0968-0004 (98) 01326-7. PMID  9868370.
  3. ^ Marger MD, Saier MH (leden 1993). "Hlavní nadrodina transmembránových facilitátorů, které katalyzují uniport, symport a antiport". Trendy v biochemických vědách. 18 (1): 13–20. doi:10.1016 / 0968-0004 (93) 90081-w. PMID  8438231.
  4. ^ Foster DL, Boublik M, Kaback HR (leden 1983). "Struktura lac nosného proteinu Escherichia coli". The Journal of Biological Chemistry. 258 (1): 31–4. PMID  6336750.
  5. ^ Paulsen IT, Brown MH, Littlejohn TG, Mitchell BA, Skurray RA (duben 1996). „Proteiny rezistence na více léčiv QacA a QacB ze Staphylococcus aureus: membránová topologie a identifikace reziduí podílejících se na substrátové specificitě“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (8): 3630–5. Bibcode:1996PNAS ... 93.3630P. doi:10.1073 / pnas.93.8.3630. PMC  39662. PMID  8622987.
  6. ^ Maiden MC, Davis EO, Baldwin SA, Moore DC, Henderson PJ (12. – 18. Února 1987). "Savčí a bakteriální transportní proteiny cukru jsou homologní". Příroda. 325 (6105): 641–3. Bibcode:1987 Natur.325..641M. doi:10.1038 / 325641a0. PMID  3543693. S2CID  4353429.
  7. ^ A b C Abramson J, Smirnova I, Kasho V, Verner G, Kaback HR, Iwata S (srpen 2003). "Struktura a mechanismus prostupu laktózy Escherichia coli". Věda. 301 (5633): 610–5. Bibcode:2003Sci ... 301..610A. doi:10.1126 / science.1088196. PMID  12893935. S2CID  36908983.
  8. ^ A b C Huang Y, Lemieux MJ, Song J, Auer M, Wang DN (srpen 2003). "Struktura a mechanismus transportéru glycerol-3-fosfátu z Escherichia coli". Věda. 301 (5633): 616–20. Bibcode:2003Sci ... 301..616H. doi:10.1126 / science.1087619. PMID  12893936. S2CID  14078813.
  9. ^ A b Yan N (březen 2013). "Strukturální pokroky u hlavních transportérů superrodin (MFS)". Trendy v biochemických vědách. 38 (3): 151–9. doi:10.1016 / j.tibs.2013.01.003. PMID  23403214.
  10. ^ A b C Kaback HR, Sahin-Tóth M, Weinglass AB (srpen 2001). "Kamikadze přístup k membránovému transportu". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2 (8): 610–20. doi:10.1038/35085077. PMID  11483994. S2CID  31325451.
  11. ^ A b Sun J, Bankston JR, Payandeh J, Hinds TR, Zagotta WN, Zheng N (březen 2014). "Krystalová struktura rostlinného dvoafinitního transportéru dusičnanů NRT1.1". Příroda. 507 (7490): 73–7. Bibcode:2014 Natur.507 ... 73S. doi:10.1038 / příroda13074. PMC  3968801. PMID  24572362.
  12. ^ Zheng H, Wisedchaisri G, Gonen T (květen 2013). "Krystalová struktura výměníku dusičnanů / dusitanů". Příroda. 497 (7451): 647–51. Bibcode:2013Natur.497..647Z. doi:10.1038 / příroda12139. PMC  3669217. PMID  23665960.
  13. ^ Mueckler M, Caruso C, Baldwin SA, Panico M, Blench I, Morris HR, Allard WJ, Lienhard GE, Lodish HF (září 1985). "Pořadí a struktura transportéru lidské glukózy". Věda. 229 (4717): 941–5. Bibcode:1985Sci ... 229..941M. doi:10.1126 / science.3839598. PMID  3839598.
  14. ^ Yan H, Huang W, Yan C, Gong X, Jiang S, Zhao Y, Wang J, Shi Y (březen 2013). "Struktura a mechanismus transportéru dusičnanů". Zprávy buněk. 3 (3): 716–23. doi:10.1016 / j.celrep.2013.03.007. PMID  23523348.
  15. ^ Tsay YF, Schroeder JI, Feldmann KA, Crawford NM (březen 1993). „Gen citlivosti na herbicid CHL1 z Arabidopsis kóduje dusičnanem indukovatelný transportér dusičnanů“. Buňka. 72 (5): 705–13. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90399-b. PMID  8453665.
  16. ^ A b Pedersen BP, Kumar H, Waight AB, Risenmay AJ, Roe-Zurz Z, Chau BH, Schlessinger A, Bonomi M, Harries W, Sali A, Johri AK, Stroud RM (duben 2013). „Krystalová struktura eukaryotického transportéru fosfátů“. Příroda. 496 (7446): 533–6. Bibcode:2013Natur.496..533P. doi:10.1038 / nature12042. PMC  3678552. PMID  23542591.
  17. ^ Doki S, Kato HE, Solcan N, Iwaki M, Koyama M, Hattori M, Iwase N, Tsukazaki T, Sugita Y, Kandori H, Newstead S, Ishitani R, Nureki O (červenec 2013). "Strukturální základ pro dynamický mechanismus protonově vázaného symportu pomocí peptidového transportéru POT". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (28): 11343–8. Bibcode:2013PNAS..11011343D. doi:10.1073 / pnas.1301079110. PMC  3710879. PMID  23798427.
  18. ^ Jiang D, Zhao Y, Wang X, Fan J, Heng J, Liu X, Feng W, Kang X, Huang B, Liu J, Zhang XC (září 2013). „Struktura transportéru YajR naznačuje transportní mechanismus založený na konzervovaném motivu A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (36): 14664–9. Bibcode:2013PNAS..11014664J. doi:10.1073 / pnas.1308127110. PMC  3767500. PMID  23950222.
  19. ^ Putman M, van Veen HW, Konings WN (prosinec 2000). "Molekulární vlastnosti bakteriálních multidrogových transportérů". Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 64 (4): 672–93. doi:10.1128 / mmbr.64.4.672-693.2000. PMC  99009. PMID  11104814.
  20. ^ Yin Y, He X, Szewczyk P, Nguyen T, Chang G (květen 2006). „Struktura transportéru více drog EmrD z Escherichia coli“. Věda. 312 (5774): 741–4. Bibcode:2006Sci ... 312..741Y. doi:10.1126 / science.1125629. PMC  3152482. PMID  16675700.
  21. ^ Li J, Shaikh SA, Enkavi G, Wen PC, Huang Z, Tajkhorshid E (květen 2013). „Přechodná tvorba vodivých stavů v membránových transportérech“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (19): 7696–701. Bibcode:2013PNAS..110.7696L. doi:10.1073 / pnas.1218986110. PMC  3651479. PMID  23610412.
  22. ^ Fischbarg J, Kuang KY, Vera JC, Arant S, Silverstein SC, Loike J, Rosen OM (duben 1990). „Transportéry glukózy slouží jako vodní kanály“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (8): 3244–7. Bibcode:1990PNAS ... 87.3244F. doi:10.1073 / pnas.87.8.3244. PMC  53872. PMID  2326282.
  23. ^ Dang S, Sun L, Huang Y, Lu F, Liu Y, Gong H, Wang J, Yan N (říjen 2010). "Struktura transportéru fukózy v otevřeně konformaci". Příroda. 467 (7316): 734–8. Bibcode:2010Natur.467..734D. doi:10.1038 / nature09406. PMID  20877283. S2CID  205222401.
  24. ^ Kumar H, Kasho V, Smirnova I, Finer-Moore JS, Kaback HR, Stroud RM (únor 2014). "Struktura cukru vázaného LacY". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (5): 1784–8. Bibcode:2014PNAS..111.1784K. doi:10.1073 / pnas.1324141111. PMC  3918835. PMID  24453216.
  25. ^ Parker JL, Newstead S (březen 2014). "Molekulární základ absorpce dusičnanů rostlinným transportérem dusičnanů NRT1.1". Příroda. 507 (7490): 68–72. Bibcode:2014Natur.507 ... 68P. doi:10.1038 / příroda13116. PMC  3982047. PMID  24572366.
  26. ^ Deng D, Xu C, Sun P, Wu J, Yan C, Hu M, Yan N (červen 2014). "Krystalová struktura transportéru lidské glukózy GLUT1". Příroda. 510 (7503): 121–5. Bibcode:2014 Natur.510..121D. doi:10.1038 / příroda13306. PMID  24847886. S2CID  205238604.
  27. ^ Henderson PJ (březen – duben 1990). "Homologní proteiny transportu glukózy prokaryot a eukaryot". Výzkum v mikrobiologii. 141 (3): 316–28. doi:10.1016 / 0923-2508 (90) 90005-b. PMID  2177911.
  28. ^ Madej MG, Dang S, Yan N, Kaback HR (duben 2013). „Evoluční kombinace s transportéry MFS“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (15): 5870–4. Bibcode:2013PNAS..110,5870 mil. doi:10.1073 / pnas.1303538110. PMC  3625355. PMID  23530251.
  29. ^ Madej MG, Kaback HR (prosinec 2013). „Evoluční kombinace s transportéry MFS II“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (50): E4831-8. Bibcode:2013PNAS..110E4831M. doi:10.1073 / pnas.1319754110. PMC  3864288. PMID  24259711.
  30. ^ Västermark A, Lunt B, Saier M (2014). „Zdá se, že hlavní nositelé superrodin zprostředkovatelů, LacY, FucP a XylE z Escherichia coli, vyvinuli pozičně odlišné katalytické zbytky bez přeskupení opakovacích jednotek 3-TMS“. Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 24 (2): 82–90. doi:10.1159/000358429. PMC  4048653. PMID  24603210.
  31. ^ Västermark A, Saier MH (duben 2014). „Superrodina hlavních facilitátorů (MFS) se vyvinula bez přeskupení jednotky se 3 transmembránovými segmenty“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 111 (13): E1162-3. Bibcode:2014PNAS..111E1162V. doi:10.1073 / pnas.1400016111. PMC  3977298. PMID  24567407.
  32. ^ Wada S, Tsuda M, Sekine T, Cha SH, Kimura M, Kanai Y, Endou H (září 2000). „Multispecifický organický aniontový transportér krysy 1 (rOAT1) transportuje zidovudin, acyklovir a další antivirové nukleosidové analogy“. The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics. 294 (3): 844–9. PMID  10945832.
  33. ^ Fluman N, Bibi E (květen 2009). „Bakteriální transport více léčiv čočkou hlavní nadrodiny hlavního zprostředkovatele“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bílkoviny a proteomika. 1794 (5): 738–47. doi:10.1016 / j.bbapap.2008.11.020. PMID  19103310.
  34. ^ Aldahmesh MA, Al-Hassnan ZN, Aldosari M, Alkuraya FS (říjen 2009). „Neuronální ceroidní lipofuscinóza způsobená mutacemi MFSD8: objevuje se společné téma“. Neurogenetika. 10 (4): 307–11. doi:10.1007 / s10048-009-0185-1. PMID  19277732. S2CID  36438803.
  35. ^ A b Meyer E, Ricketts C, Morgan NV, Morris MR, Pasha S, Tee LJ, Rahman F, Bazin A, Bessières B, Déchelotte P, Yacoubi MT, Al-Adnani M, Marton T, Tannahill D, Trembath RC, Fallet-Bianco C, Cox P, Williams D, Maher ER (březen 2010). „Mutace ve FLVCR2 jsou spojeny s proliferativní vaskulopatií a syndromem hydranencefalie-hydrocefalie (Fowlerův syndrom)“. American Journal of Human Genetics. 86 (3): 471–8. doi:10.1016 / j.ajhg.2010.02.004. PMC  2833392. PMID  20206334.
  36. ^ Pascual JM, Wang D, Lecumberri B, Yang H, Mao X, Yang R, De Vivo DC (květen 2004). „Nedostatek GLUT1 a další nemoci přenášející glukózu“. Evropský žurnál endokrinologie. 150 (5): 627–33. doi:10.1530 / eje.0.1500627. PMID  15132717.
  37. ^ Gerin I, Veiga-da-Cunha M, Achouri Y, Collet JF, Van Schaftingen E (prosinec 1997). „Pořadí domnělé translokázy 6-fosfátu glukózy, mutované v glykogenové chorobě typu Ib“. FEBS Dopisy. 419 (2–3): 235–8. doi:10.1016 / s0014-5793 (97) 01463-4. PMID  9428641. S2CID  31851796.
  38. ^ Rajadhyaksha AM, Elemento O, Puffenberger EG, Schierberl KC, Xiang JZ, Putorti ML, Berciano J, Poulin C, Brais B, Michaelides M, Weleber RG, Higgins JJ (listopad 2010). „Mutace v FLVCR1 způsobují ataxii zadního sloupce a retinitis pigmentosa“. American Journal of Human Genetics. 87 (5): 643–54. doi:10.1016 / j.ajhg.2010.10.013. PMC  2978959. PMID  21070897.
  39. ^ Lin P, Li J, Liu Q, Mao F, Li J, Qiu R, Hu H, Song Y, Yang Y, Gao G, Yan C, Yang W, Shao C, Gong Y (prosinec 2008). „Missense mutace v SLC33A1, která kóduje transportér acetyl-CoA, způsobuje autosomálně dominantní spastickou paraplegii (SPG42)“. American Journal of Human Genetics. 83 (6): 752–9. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.11.003. PMC  2668077. PMID  19061983.
  40. ^ Verheijen FW, Verbeek E, Aula N, Beerens CE, Havelaar AC, Joosse M, Peltonen L, Aula P, Galjaard H, van der Spek PJ, Mancini GM (prosinec 1999). „Nový gen, kódující aniontový transportér, je mutován v nemoci akumulace kyseliny sialové“. Genetika přírody. 23 (4): 462–5. doi:10.1038/70585. PMID  10581036. S2CID  5709302.
  41. ^ Coucke PJ, Willaert A, Wessels MW, Callewaert B, Zoppi N, De Backer J, Fox JE, Mancini GM, Kambouris M, Gardella R, Facchetti F, Willems PJ, Forsyth R, Dietz HC, Barlati S, Colombi M, Loeys B, De Paepe A (duben 2006). „Mutace v transportním transportéru glukózy GLUT10 mění angiogenezi a způsobují syndrom arteriální tortuosity“ (PDF). Genetika přírody. 38 (4): 452–7. doi:10.1038 / ng1764. hdl:11379/29243. PMID  16550171. S2CID  836017.
  42. ^ Vázquez-Mellado J, Jiménez-Vaca AL, Cuevas-Covarrubias S, Alvarado-Romano V, Pozo-Molina G, Burgos-Vargas R (únor 2007). „Molekulární analýza genu SLC22A12 (URAT1) u pacientů s primární dnou“. revmatologie. 46 (2): 215–9. doi:10.1093 / revmatologie / kel205. PMID  16837472.
  43. ^ Otonkoski T, Jiao H, Kaminen-Ahola N, Tapia-Paez I, Ullah MS, Parton LE, Schuit F, Quintens R, Sipilä I, Mayatepek E, Meissner T, Halestrap AP, Rutter GA, Kere J (září 2007). "Hypoglykemie vyvolaná fyzickým cvičením způsobená neúspěšným umlčením monokarboxylátového transportéru 1 v pankreatických beta buňkách". American Journal of Human Genetics. 81 (3): 467–74. doi:10.1086/520960. PMC  1950828. PMID  17701893.
  44. ^ Burwinkel B, Kreuder J, Schweitzer S, Vorgerd M, Gempel K, Gerbitz KD, Kilimann MW (srpen 1999). „Mutace OCTN2 transportéru karnitinu u systémového primárního deficitu karnitinu: nová mutace Arg169Gln a rekurentní mutace Arg282ter spojená s neobvyklou abnormalitou sestřihu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 261 (2): 484–7. doi:10.1006 / bbrc.1999.1060. PMID  10425211.
  45. ^ Munroe PB, Mitchison HM, O'Rawe AM, Anderson JW, Boustany RM, Lerner TJ, Taschner PE, de Vos N, Breuning MH, Gardiner RM, Mole SE (srpen 1997). „Spektrum mutací v genu pro Battenovu chorobu, CLN3“. American Journal of Human Genetics. 61 (2): 310–6. doi:10.1086/514846. PMC  1715900. PMID  9311735.
  46. ^ A b Williams AL, Jacobs SB, Moreno-Macías H, Huerta-Chagoya A, Churchhouse C, Márquez-Luna C, García-Ortíz H, Gómez-Vázquez MJ, Burtt NP, Aguilar-Salinas CA, González-Villalpando C, Florez JC, Orozco L, Haiman CA, Tusié-Luna T, Altshuler D (únor 2014). „Varianty sekvencí v SLC16A11 jsou běžným rizikovým faktorem pro diabetes 2. typu v Mexiku“. Příroda. 506 (7486): 97–101. Bibcode:2014Natur.506 ... 97T. doi:10.1038 / příroda12828. PMC  4127086. PMID  24390345.
  47. ^ Matsuo H, Chiba T, Nagamori S, Nakayama A, Domoto H, Phetdee K, Wiriyasermkul P, Kikuchi Y, Oda T, Nishiyama J, Nakamura T, Morimoto Y, Kamakura K, Sakurai Y, Nonoyama S, Kanai Y, Shinomiya N (Prosinec 2008). „Mutace v genu SLC2A9 pro transportér glukózy 9 způsobují renální hypourikémii“. American Journal of Human Genetics. 83 (6): 744–51. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.11.001. PMC  2668068. PMID  19026395.
  48. ^ Zeng WQ, Al-Yamani E, Acierno JS, Slaugenhaupt S, Gillis T, MacDonald ME, Ozand PT, Gusella JF (červenec 2005). „Biotin-responzivní onemocnění bazálních ganglií se mapuje na 2q36.3 a je způsobeno mutacemi v SLC19A3“. American Journal of Human Genetics. 77 (1): 16–26. doi:10.1086/431216. PMC  1226189. PMID  15871139.
  49. ^ Kloeckener-Gruissem B, Vandekerckhove K, Nürnberg G, Neidhardt J, Zeitz C, Nürnberg P, Schipper I, Berger W (březen 2008). „Mutace nosiče rozpuštěné látky SLC16A12 souvisí se syndromem kombinujícím juvenilní kataraktu s mikrokorneou a renální glukosurií“. American Journal of Human Genetics. 82 (3): 772–9. doi:10.1016 / j.ajhg.2007.12.013. PMC  2427214. PMID  18304496.
  50. ^ Labay V, Raz T, Baron D, Mandel H, Williams H, Barrett T, Szargel R, McDonald L, Shalata A, Nosaka K, Gregory S, Cohen N (červenec 1999). „Mutace v SLC19A2 způsobují megaloblastickou anémii reagující na thiamin spojenou s diabetes mellitus a hluchotou“. Genetika přírody. 22 (3): 300–4. doi:10.1038/10372. PMID  10391221. S2CID  26615141.
  51. ^ Kousi M, Siintola E, Dvořáková L, Vlasková H, Turnbull J, Topcu M, Yuksel D, Gokben S, Minassian BA, Elleder M, Mole SE, Lehesjoki AE (březen 2009). „Mutace v CLN7 / MFSD8 jsou častou příčinou variantní pozdně infantilní neuronální ceroidní lipofuscinózy“. Mozek. 132 (Pt 3): 810–9. doi:10.1093 / mozek / awn366. PMID  19201763.
  52. ^ Zaahl MG, Merryweather-Clarke AT, Kotze MJ, van der Merwe S, Warnich L, Robson KJ (říjen 2004). „Analýza genů podílejících se na regulaci železa u jedinců s primárním přetížením železem“. Genetika člověka. 115 (5): 409–17. doi:10.1007 / s00439-004-1166-r. PMID  15338274. S2CID  22266373.
  53. ^ Kusari J, Verma USA, Buse JB, Henry RR, Olefsky JM (říjen 1991). „Analýza genových sekvencí inzulínového receptoru a inzulínově senzitivního transportéru glukózy (GLUT-4) u pacientů s běžným typem nezávislosti na inzulínu diabetes mellitus“. The Journal of Clinical Investigation. 88 (4): 1323–30. doi:10.1172 / JCI115437. PMC  295602. PMID  1918382.
  54. ^ Newton JM, Cohen-Barak O, Hagiwara N, Gardner JM, Davisson MT, King RA, Brilliant MH (listopad 2001). „Mutace v lidském ortologu myšího bílého genu (uw) jsou základem nové formy okulokutánního albinismu, OCA4“. American Journal of Human Genetics. 69 (5): 981–8. doi:10.1086/324340. PMC  1274374. PMID  11574907.
  55. ^ Seifert W, Kühnisch J, Tüysüz B, Specker C, Brouwers A, Horn D (duben 2012). „Mutace v prostaglandinovém transportéru kódujícím gen SLCO2A1 způsobují primární hypertrofickou osteoartropatii a izolované digitální kluby“. Lidská mutace. 33 (4): 660–4. doi:10.1002 / humu.22042. PMID  22331663.
  56. ^ Tokuhiro S, Yamada R, Chang X, Suzuki A, Kochi Y, Sawada T, Suzuki M, Nagasaki M, Ohtsuki M, Ono M, Furukawa H, Nagashima M, Yoshino S, Mabuchi A, Sekine A, Saito S, Takahashi A Tsunoda T, Nakamura Y, Yamamoto K (prosinec 2003). „Intronové SNP ve vazebném místě RUNX1 SLC22A4 kódující transportér organických kationtů je spojeno s revmatoidní artritidou.“ Genetika přírody. 35 (4): 341–8. doi:10.1038 / ng1267. PMID  14608356. S2CID  21564858.
  57. ^ A b van de Steeg E, Stránecký V, Hartmannová H, Nosková L, Hřebíček M, Wagenaar E, van Esch A, de Waart DR, Oude Elferink RP, Kenworthy KE, Sticová E, al-Edreesi M, Knisely AS, Kmoch S, Jirsa M, Schinkel AH (únor 2012). „Úplný nedostatek OATP1B1 a OATP1B3 způsobuje syndrom lidského Rotoru přerušením zpětného vychytávání konjugovaného bilirubinu do jater“. The Journal of Clinical Investigation. 122 (2): 519–28. doi:10,1172 / JCI59526. PMC  3266790. PMID  22232210.
  58. ^ Sakamoto O, Ogawa E, Ohura T, Igarashi Y, Matsubara Y, Narisawa K, Iinuma K (listopad 2000). „Mutační analýza genu GLUT2 u pacientů s Fanconi-Bickelovým syndromem“. Pediatrický výzkum. 48 (5): 586–9. doi:10.1203/00006450-200011000-00005. PMID  11044475.
  59. ^ Wang D, Kranz-Eble P, De Vivo DC (září 2000). "Mutační analýza GLUT1 (SLC2A1) u syndromu nedostatku glut-1". Lidská mutace. 16 (3): 224–31. doi:10.1002 / 1098-1004 (200009) 16: 3 <224 :: AID-HUMU5> 3.0.CO; 2-P. PMID  10980529.
  60. ^ Qiu A, Jansen M, Sakaris A, Min SH, Chattopadhyay S, Tsai E, Sandoval C, Zhao R, Akabas MH, Goldman ID (prosinec 2006). "Identifikace střevního transportéru folátu a molekulární základ pro dědičnou malabsorpci folátu". Buňka. 127 (5): 917–28. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.041. PMID  17129779. S2CID  1918658.
  61. ^ Ruel J, Emery S, Nouvian R, Bersot T, Amilhon B, Van Rybroek JM, Rebillard G, Lenoir M, Eybalin M, Delprat B, Sivakumaran TA, Giros B, El Mestikawy S, Moser T, Smith RJ, Lesperance MM, Puel JL (srpen 2008). „Poškození SLC17A8 kódujícího vezikulární glutamátový transportér-3, VGLUT3, je základem nesyndromické hluchoty DFNA25 a dysfunkce vnitřních vláskových buněk u nulových myší“. American Journal of Human Genetics. 83 (2): 278–92. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.07.008. PMC  2495073. PMID  18674745.
  62. ^ A b C d Perland E, Fredriksson R (březen 2017). "Klasifikační systémy sekundárních aktivních transportérů". Trendy ve farmakologických vědách. 38 (3): 305–315. doi:10.1016 / j.tips.2016.11.008. PMID  27939446.
  63. ^ Hediger MA, Clémençon B, Burrier RE, Bruford EA (01.06.2017). "ABC membránových transportérů ve zdraví a nemoci (řada SLC): úvod". Molekulární aspekty medicíny. 34 (2–3): 95–107. doi:10.1016 / j.mam.2012.12.009. PMC  3853582. PMID  23506860.
  64. ^ A b C Perland E, Lekholm E, Eriksson MM, Bagchi S, Arapi V, Fredriksson R (2016-01-01). „Předpokládané transportéry SLC Mfsd5 a Mfsd11 jsou hojně vyjádřeny v mozku myši a mají potenciální roli v homeostáze energie“. PLOS ONE. 11 (6): e0156912. Bibcode:2016PLoSO..1156912P. doi:10.1371 / journal.pone.0156912. PMC  4896477. PMID  27272503.
  65. ^ A b C d E F Sreedharan S, Stephansson O, Schiöth HB, Fredriksson R (červen 2011). "Dlouhá evoluční konzervace a značná tkáňová specificita několika atypických transportérů rozpuštěných látek". Gen. 478 (1–2): 11–8. doi:10.1016 / j.gene.2010.10.10.011. PMID  21044875.
  66. ^ A b C Perland E, Hellsten SV, Lekholm E, Eriksson MM, Arapi V, Fredriksson R (únor 2017). „Nové proteiny vázané na membránu MFSD1 a MFSD3 jsou předpokládané transportéry SLC ovlivněné změněným příjmem živin“. Journal of Molecular Neuroscience. 61 (2): 199–214. doi:10.1007 / s12031-016-0867-8. PMC  5321710. PMID  27981419.
  67. ^ Gray KA, Seal RL, Tweedie S, Wright MW, Bruford EA (únor 2016). „Přehled nového zdroje genové rodiny HGNC“. Lidská genomika. 10: 6. doi:10.1186 / s40246-016-0062-6. PMC  4739092. PMID  26842383.
  68. ^ Nguyen LN, Ma D, Shui G, Wong P, Cazenave-Gassiot A, Zhang X, Wenk MR, Goh EL, Silver DL (květen 2014). „Mfsd2a je transportér pro esenciální omega-3 mastné kyseliny kyselinu dokosahexaenovou“. Příroda. 509 (7501): 503–6. Bibcode:2014Natur.509..503N. doi:10.1038 / příroda13241. PMID  24828044. S2CID  4462512.
  69. ^ A b Perland E, Hellsten SV, Schweizer N, Arapi V, Rezayee F, Bushra M, Fredriksson R (2017). „Strukturální predikce dvou nových lidských atypických transportérů SLC, MFSD4A a MFSD9, a jejich neuroanatomická distribuce u myší“. PLOS ONE. 12 (10): e0186325. Bibcode:2017PLoSO..1286325P. doi:10.1371 / journal.pone.0186325. PMC  5648162. PMID  29049335.
  70. ^ Horiba N, Masuda S, Ohnishi C, Takeuchi D, Okuda M, Inui K (červenec 2003). "Na (+) - závislý transport fruktózy přes rNaGLT1 v ledvinách potkana". FEBS Dopisy. 546 (2–3): 276–80. doi:10.1016 / s0014-5793 (03) 00600-8. PMID  12832054. S2CID  27361236.
  71. ^ Damme M, Brandenstein L, Fehr S, Jankowiak W, Bartsch U, Schweizer M, Hermans-Borgmeyer I, Storch S (květen 2014). „Genové narušení Mfsd8 u myší poskytuje první zvířecí model pro onemocnění CLN7“. Neurobiologie nemocí. 65: 12–24. doi:10.1016 / j.nbd.2014.01.003. PMID  24423645. S2CID  207068059.
  72. ^ Ushijima H, Hiasa M, Namba T, Hwang HJ, Hoshino T, Mima S, Tsuchiya T, Moriyama Y, Mizushima T (září 2008). "Vyjádření a funkce TETRANu, nového typu membránového transportéru". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 374 (2): 325–30. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.07.034. PMID  18638446.
  73. ^ A b Lekholm E, Perland E, Eriksson MM, Hellsten SV, Lindberg FA, Rostami J, Fredriksson R (01.01.2017). „Předpokládané transportéry vázané na membránu MFSD14A a MFSD14B jsou neuronové a ovlivněny dostupností živin“. Hranice v molekulární neurovědě. 10: 11. doi:10.3389 / fnmol.2017.00011. PMC  5263138. PMID  28179877.
  74. ^ Ceder MM, Lekholm E, Hellsten SV, Perland E, Fredriksson R (2017). „Membránově vázaný UNC93A vázaný na neurony a periferie reaguje na dostupnost živin u myší“. Hranice v molekulární neurovědě. 10: 351. doi:10.3389 / fnmol.2017.00351. PMC  5671512. PMID  29163028.
  75. ^ Campbell CL, Lehmann CJ, Gill SS, Dunn WA, James AA, Foy BD (srpen 2011). „Role endosomálních proteinů při šíření alfaviru v komářích“. Molekulární biologie hmyzu. 20 (4): 429–36. doi:10.1111 / j.1365-2583.2011.01078.x. PMC  3138809. PMID  21496127.
  76. ^ Ceder, Mikaela M .; Aggarwal, Tanya; Hosseini, Kimia; Maturi, Varun; Patil, Sourabh; Perland, Emelie; Williams, Michael J .; Fredriksson, Robert (2020). „CG4928 je životně důležitý pro funkci ledvin u ovocných mušek a membránový potenciál v buňkách: první hloubková charakteristika domnělého nosiče rozpuštěných látek UNC93A“. Hranice v buněčné a vývojové biologii. 8. doi:10.3389 / fcell.2020.580291. ISSN  2296-634X.
  77. ^ Tabeta K, Hoebe K, Janssen EM, Du X, Georgel P, Crozat K, Mudd S, Mann N, Sovath S, Goode J, Shamel L, Herskovits AA, Portnoy DA, Cooke M, Tarantino LM, Wiltshire T, Steinberg BE Grinstein S, Beutler B (únor 2006). „Unc93b1 mutace 3d narušuje prezentaci a signalizaci exogenního antigenu prostřednictvím Toll-like receptorů 3, 7 a 9“. Přírodní imunologie. 7 (2): 156–64. doi:10.1038 / ni1297. PMID  16415873. S2CID  33401155.
  78. ^ Yanagisawa H, Miyashita T, Nakano Y, Yamamoto D (červenec 2003). „HSpin1, transmembránový protein interagující s Bcl-2 / Bcl-xL, indukuje autofagickou buněčnou smrt nezávislou na kaspáze“. Buněčná smrt a diferenciace. 10 (7): 798–807. doi:10.1038 / sj.cdd.4401246. PMID  12815463.
  79. ^ Storch S, Pohl S, Quitsch A, Falley K, Braulke T (duben 2007). „C-koncová prenylace membránového glykoproteinu CLN3 je nutná pro účinné endosomální třídění na lysozomy.“ Provoz. 8 (4): 431–44. doi:10.1111 / j.1600-0854.2007.00537.x. PMID  17286803.
  80. ^ Perland E, Bagchi S, Klaesson A, Fredriksson R (září 2017). "Characteristics of 29 novel atypical solute carriers of major facilitator superfamily type: evolutionary conservation, predicted structure and neuronal co-expression". Otevřená biologie. 7 (9): 170142. doi:10.1098/rsob.170142. PMC  5627054. PMID  28878041.