SPNS2 - SPNS2

SPNS2
Identifikátory
AliasySPNS2, sfingolipidový transportér 2, SLC62A2, DFNB115
Externí IDOMIM: 612584 MGI: 2384936 HomoloGene: 71040 Genové karty: SPNS2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro SPNS2
Genomické umístění pro SPNS2
Kapela17p13.2Start4,498,881 bp[1]
Konec4,539,035 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001124758

NM_001276383
NM_153060

RefSeq (protein)

NP_001118230

NP_001263312
NP_694700

Místo (UCSC)Chr 17: 4,5 - 4,54 MbChr 11: 72,45 - 72,49 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Spinster homolog 2 (Drosophila) je protein že u lidí je kódován SPNS2 gen.[5]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce SPNS2. Podmíněný knockout myš linka, tzv Spns2tm1a (KOMP) Wtsi[16][17] byl vygenerován jako součást International Knockout Mouse Consortium program - vysoce výkonný projekt mutageneze pro generování a distribuci zvířecích modelů nemocí zainteresovaným vědcům.[18][19][20]

Zvířata podstoupila standardizaci fenotypová obrazovka k určení účinků vypuštění.[14][21] Dvacet osm testů bylo provedeno na homozygotech mutant byly pozorovány myši obou pohlaví a devět významných abnormalit, včetně nepřítomnosti boltce reflex, abnormální pigmentace očí a morfologie včetně šedý zákal, snížený počet leukocytových buněk, abnormální sluchový mozkový kmen vyvolaný potenciál, zvýšený obsah kostních minerálů a řada atypické periferní krve lymfocyt parametry.[14] Muži navíc vykazovali snížený počet cirkulujících glukóza a zvýšený oběh bilirubin úrovně.[14]

Ukázalo se, že ortologní protein v zebrafish je transportován sfingosin-1-fosfát (S1P) z buněk během vaskulárního vývoje a lidská SPNS2 může transportovat analogy S1P, včetně imunomodulačního léčiva FTY720-P.[22][23]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183018 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040447 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ "Spinster homolog 2 (Drosophila)". Citováno 2011-12-04.
  6. ^ „Neurologická data hodnocení pro Spns2“. Wellcome Trust Sanger Institute.
  7. ^ „Dysmorfologická data pro Spns2“. Wellcome Trust Sanger Institute.
  8. ^ „Data morfologie očí pro Spns2“. Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ „Data klinické chemie pro Spns2“. Wellcome Trust Sanger Institute.
  10. ^ "Hematologická data pro Spns2". Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. ^ „Data lymfocytů z periferní krve pro Spns2“. Wellcome Trust Sanger Institute.
  12. ^ "Salmonella data infekce pro Spns2 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
  13. ^ "Citrobacter data infekce pro Spns2 ". Wellcome Trust Sanger Institute.
  14. ^ A b C d Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  15. ^ Portál myších zdrojů Wellcome Trust Sanger Institute.
  16. ^ „International Knockout Mouse Consortium“.
  17. ^ "Myší genomová informatika".
  18. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  19. ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  20. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  21. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (červen 2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.
  22. ^ Kawahara A, Nishi T, Hisano Y, Fukui H, Yamaguchi A, Mochizuki N (leden 2009). "Transportér sfingolipidů spns2 funguje při migraci prekurzorů myokardu zebrafish". Věda. 323 (5913): 524–7. Bibcode:2009Sci ... 323..524K. doi:10.1126 / science.1167449. PMID  19074308. S2CID  44826764.
  23. ^ Hisano Y, Kobayashi N, Kawahara A, Yamaguchi A, Nishi T (leden 2011). „Transportér sfingosin 1-fosfátu, SPNS2, funguje jako transportér fosforylované formy imunomodulačního činidla FTY720“. The Journal of Biological Chemistry. 286 (3): 1758–66. doi:10.1074 / jbc.M110.171116. PMC  3023470. PMID  21084291.