Lagovirus - Lagovirus
| Lagovirus | |
|---|---|
 | |
| CryoEM rekonstrukce Virus hemoragické choroby králíka (RHDV) kapsid. EMDB vstup EMD-1933[1] | |
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Orthornavirae |
| Kmen: | Pisuviricota |
| Třída: | Pisoniviricetes |
| Objednat: | Picornavirales |
| Rodina: | Caliciviridae |
| Rod: | Lagovirus |
| Zadejte druh | |
| Virus hemoragické choroby králíka | |
| Druh | |
Lagovirus je rod viry, v rodině Caliciviridae.[2][3] Lagomorphs slouží jako přirození hostitelé. V současné době existují pouze dva druhy tohoto rodu, včetně druhů typu Virus hemoragické choroby králíka. Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: nekrotizující hepatitida vedoucí ke smrtelným krvácením.[4]
Taxonomie
Skupina: ssRNA (+)Objednávka: PicornaviralesRodina: CaliciviridaeRod: Lagovirus
Vlastnosti virionu
Morfologie
Viriony se skládají z a kapsid. Virusová kapsida není obklopena, kulatá s T = 3 ikosahedrální symetrie. Izometrická kapsida má průměr 35–39 nm. Pozorovány jsou také částice se symetrií T = 1 složené ze 60 kapsidových proteinů, které mají průměr asi 15 nm.[4] Kapsidy se objevují zaokrouhlené na šestihranný v obrysu. Struktura povrchu kapsidy odhaluje pravidelný vzor s charakteristickými rysy. The kapsomer uspořádání je jasně viditelné. Capsid s 32 prohlubněmi ve tvaru šálku.
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Lagovirus | Icosahedral | T = 1, T = 3 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky je dosaženo připojením k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají endocytózu. Replikace následuje model replikace pozitivního řetězce viru RNA. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Překlad probíhá terminační-reinicializací RNA. Lagomorphs slouží jako přirozený hostitel.[3][4]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Lagovirus | Lagomorphs | Játra | Endocytóza buněčných receptorů | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Kontakt |
Fyzikální a chemické vlastnosti
The molekulová hmotnost (Mr) virionů je 15×106. Viriony mají a hustota vztlaku v Chlorid cesný (CsCl) 1,33–1,36 g / cm3. The gradient hustoty virionů v Tartarát draselný-glycerol je 1,29 g / cm3. The sedimentační koeficient je 170–187 svedberg (s20, t); z ostatních je vrchol 160–170 svedberg (s20, t) (předpokládá se, že sestává z vadných interferujících částic). Pod in vitro podmínky viriony jsou inaktivovány v kyselém prostředí pH 4,5–7; stabilní v zásaditý prostředí pH 7–10,5. Viriony nejsou stabilní při zvýšené teplotě v přítomnosti vysoké koncentrace Mg++. Viriony jsou citlivé na léčbu trypsin (v některých kmeny, není citlivý na ošetření jemnými čisticími prostředky, nebo éter nebo chloroform. The infekčnost se zvyšuje po léčbě trypsinem (u některých kmenů).
Genom
The genom není segmentované a obsahuje jedinou lineární molekulu pozitivní smysl, ssRNA. Menší druhygenomický Nukleová kyselina se někdy vyskytuje také ve virionech. Enkapsidovaná nukleová kyselina je převážně genomového původu, ale viriony mohou také obsahovat subgenomovou RNA. Celý genom je 7450 nukleotidy dlouho. Genom má guanin + cytosin obsah 49,3–50,1%. The 5 'konec genomu má obvykle protein spojený s genomem (VPg ), nebo methylovaný nukleotidový uzávěr (v případě Virus hepatitidy E. ). The 3 'konec má poly (A) trakt. Každý virion obsahuje kopii v plné délce nebo vadné rušivé kopie.
Proteiny
The virový genom kóduje virový strukturální protein. Viriony se skládají z 1 strukturního proteinu (proteinů) (hlavní druhy lokalizované v kapsidě).
Virový strukturní protein: Kapsidový protein má a molární hmotnost 59 000–71 000 Da; je obalový protein. Kapsidový protein má molekulovou hmotnost menší „rozpustné“ 28–30 kDa.
Antigenicita
Křížová reaktivita je nalezeno. Křížová reaktivita mezi stejnými druhy sérotyp, ale ne u druhů jiného sérotypu a některých druhů stejného sérotypu, ale ne u všech. Ačkoli se stupeň antigenní specificity mění se stupněm příbuznosti, antigenicita je odlišná od séroskupin stejného rodu. Většina druhů rodu je příbuzná antigenicky. Sdílejí některé epitopy ve strukturálních proteinech.
Reference
- ^ Luque, D .; González, J. M .; Gómez-Blanco, J .; Marabini, R .; Chichón, J .; Mena, I .; Angulo, I .; Carrascosa, J. L .; Verdaguer, N .; Trus, B.L .; Bárcena, J .; Castón, J. R. (2012). „Vložení epitopu na N-terminální molekulární přepínač viru králičí hemoragické nemoci T = 3 kapsidový protein vede k větším T = 4 kapsidám“ (PDF). Journal of Virology. 86 (12): 6470–6480. doi:10.1128 / JVI.07050-11. PMC 3393579. PMID 22491457.
- ^ Vinjé, J; Estes, MK; Esteves, P; Zelená, KY; Katayama, K; Knowles, NJ; L'Homme, Y; Martella, V; Vennema, H; Bílá, PA; Konsorcium pro zprávu o ICTV (listopad 2019). „Profil taxonomie virů ICTV: Caliciviridae". The Journal of General Virology. 100 (11): 1469–1470. doi:10.1099 / jgv.0.001332. PMID 31573467.
- ^ A b C "Zpráva ICTV Caliciviridae".
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- Správa ICTVdB (2006). 00.012.0.02. Lagovirus. In: ICTVdB — The Universal Virus Database, verze 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA