GBP2 - GBP2
Interferonem indukovaný protein vázající guanylát 2 je protein že u lidí je kódován GBP2 gen.[5][6] GBP2 je gen příbuzný nadrodině velkých GTPáz, které mohou být indukovány hlavně interferonem gama.[7]
Lokalizace
Gen GBP2 se nachází v různých kompartmentech v buňce: jádro, cytosol a cytoskelet a také dimer GBP2-GBP5 lokalizovat do Golgiho aparát.[8]
Kromě toho Isoprenylace je povinen regulovat intracelulární lokalizace a membrána sdružení GBP2.[9]
Aktivace
The myší Gen GBP2 není aktivován pouze vysoce interferon-gama v době makrofágy aktivací, ale také stimulací Mýtné receptory, Faktor nekrózy nádorů (TNF) a Interleukin 1 beta.[10]
Výraz
Po stimulaci interferonu gama se myší GPB2 exprimuje v vrozený a adaptivní imunitní buňky.[11]
Struktura
Sekvenční analýza GBP2 ukázala přítomnost RNA vazebná doména, která obsahuje tři RNA rozpoznávací motivy (RRM) a SR doménu. Aminový konec GBp2 sdílí čtyři opakující se motivy Arg-Gly-Gly (RGG) a devět serinových zbytků v kontextu motivů arginin / serin.[12]
Doména SR GBP2 je fosforylace místo pro SR specifickou proteinovou kinázu SRPK (sky1), která vede k nukleární lokalizaci GBP2.[12]
Prasečí GBP2 vykazuje vysokou podobnost, pokud jde o N-terminál, který představuje a kulovitý doménu a obsahují GTPáza funkce. C-terminál však představuje spirálovitou doménu, která je méně konzervovaná.[13]
Interakce
Gen GBP2 může interagovat s RNA prostřednictvím domény RRM1 a RRM2. RRM2 doména může rozpoznat základní motiv GGUC přítomný v RNA. Kromě toho je identifikován nový typ RRM domény, který může interagovat s komplexem THO / TREX.[14]
Gen GBp2 může spolupracovat s komplexem TREX (transkripce-export); A multimerní komplex má různé transkripční faktor a exportní faktory jako Yra1 a Sub2.[14]
Funkce
Interferony jsou cytokiny které mají antivirové účinky a inhibují nádor proliferace buněk. Vyvolávají velké množství geny v jejich cílových buňkách, včetně těch, které kódují proteiny vázající guanylát (GBP). GBP se vyznačují svou schopností specificky vázat guaninové nukleotidy (GMP, HDP, a GTP ). Protein kódovaný tímto genem je a GTPáza který převádí GTP na HDP a GMP.[6] Kromě toho může být gen GBP2 vztahem mezi buněčný povrchový receptor a intracelulární efektory, které mohou přenášet extracelulární informace do buněk i intracelulární signál transdukce protein.[15]
Studie hovězího genu GBP2 ukázala důležitost GBP2 v regulaci buněčné proliferace a odolnosti vůči infekci patogenem, jako například výstava antivirové aktivity proti chřipkovému viru.[11]
GPB2 Podporujte oxidační zabíjení a doručte antimikrobiální peptidy na autophagolysosoma l, poskytuje širokou ochranu hostitele proti různým patogen třídy. Během virové infekce hraje rodina GBP (GBP1, GBP2 a GBP5) zásadní roli při aktivaci kanonických a nekanonických inflammasome reagovat na infekci patogenem prostřednictvím chlamydia muridarum.[16]
Klinický význam
Genová mutace
A missense mutace u pacientů s migrénou byla identifikována 2 GBP2 (A907G). V prvním kroku může dojít k vazomotorické dysfunkci a poté k bolestem hlavy.[15]
Rakovina prsu
GBP2 je považován za kontrolní faktor pro proliferaci a šíření v nádorové buňce. Vysoká exprese GBP2 je spojena s lepší diagnostikou rakoviny prsu. P53 umět upregulate GBP2 a hrají zásadní roli v EU nádor vývoj inhibicí metaloproteináza MM9 stejně jako NF-Kappa B. a Rac protein.[17]
Úroveň transkripce GBP2 je také regulována dvěma transkripčními faktory STAT1 a IRF1. Exprese GBP2 má silnou korelaci s metagenem T buněk, což se jeví jako asociace s infiltrací T buňka v rakovina prsu.[17]
Nedávná studie však ukázala, že GBP2 může regulovat dynamin související protein 1 (Drp1) k blokování translokace Drp1 do mitochondrie které vedou k útlumu závislého na Drp1 mitochondriální štěpení a také invaze buněk rakoviny prsu.[18]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162645 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000028270 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Cheng YS, Patterson CE, Staeheli P (září 1991). „Interferonem indukované proteiny vázající guanylát postrádají konsensuální motiv N (T) KXD a kromě GDP a GTP se vážou na GMP“. Molekulární a buněčná biologie. 11 (9): 4717–25. doi:10,1128 / mcb.11.9.4717. PMC 361367. PMID 1715024.
- ^ A b „Entrez Gene: GBP2 guanylát vázající protein 2, indukovatelný interferonem“.
- ^ Kim BH, Shenoy AR, Kumar P, Bradfield CJ, MacMicking JD (říjen 2012). „IFN-indukovatelné GTPasy v obraně hostitelských buněk“. Mobilní hostitel a mikrob. 12 (4): 432–44. doi:10.1016 / j.chom.2012.09.007. PMC 349020. PMID 23084913.
- ^ „GBP2 Gene“. Databáze lidských genů GeneCards. Citováno 2018-11-07.
- ^ Britzen-Laurent N, Bauer M, Berton V, Fischer N, Syguda A, Reipschläger S, Naschberger E, Herrmann C, Stürzl M (prosinec 2010). „Intracelulární přenos proteinů vázajících guanylát je regulován heterodimerizací hierarchickým způsobem“. PLOS One. 5 (12): e14246. doi:10.1371 / journal.pone.0014246. PMC 2998424. PMID 21151871.
- ^ Degrandi D, Kravets E, Konermann C, Beuter-Gunia C, Klümpers V, Lahme S, Wischmann E, Mausberg AK, Beer-Hammer S, Pfeffer K (leden 2013). „Murine guanylate binding protein 2 (mGBP2) řídí replikaci Toxoplasma gondii“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (1): 294–9. doi:10.1073 / pnas.1205635110. PMC 3538222. PMID 23248289.
- ^ A b Praefcke GJ (listopad 2017). „Regulace vrozených imunitních funkcí proteiny vázajícími guanylát“. International Journal of Medical Microbiology. 308: 237–245. doi:10.1016 / j.ijmm.2017.10.013. PMID 29174633.
- ^ A b Windgassen M, Krebber H (březen 2003). „Identifikace Gbp2 jako nového proteinu vázajícího poly (A) + RNA podílejícího se na cytoplazmatickém přenosu mediálních RNA v kvasinkách“. Zprávy EMBO. 4 (3): 278–83. doi:10.1038 / sj.embor.embor763. PMC 1315891. PMID 12634846.
- ^ Ma G, Huang J, Sun N, Liu X, Zhu M, Wu Z, Zhao S (květen 2008). "Molekulární charakterizace prasečích genů GBP1 a GBP2". Molekulární imunologie. 45 (10): 2797–807. doi:10.1016 / j.molimm.2008.02.007. PMID 18346789.
- ^ A b Martínez-Lumbreras S, Taverniti V, Zorrilla S, Séraphin B, Pérez-Cañadillas JM (leden 2016). „Gbp2 interaguje s THO / TREX prostřednictvím nového typu domény RRM“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (1): 437–48. doi:10.1093 / nar / gkv1303. PMC 4705658. PMID 26602689.
- ^ A b Jiang, Yue (leden 2016). „Šest nových vzácných nesynonymních mutací pro migrénu bez aury identifikovaných sekvenováním exome“. Journal of Neurogenetics. 29: 188–194. doi:10.3109/01677063.2015.1122787.
- ^ Man SM, Place DE, Kuriakose T, Kanneganti TD (leden 2017). "Interferonem indukovatelné proteiny vázající guanylát na rozhraní buněčné autonomní imunity a aktivace inflammasomu". Journal of Leukocyte Biology. 101 (1): 143–150. doi:10,1189 / jlb.4MR0516-223R. PMC 6608036. PMID 27418355.
- ^ A b Godoy P, Cadenas C, Hellwig B, Marchan R, Stewart J, Reif R, Lohr M, Gehrmann M, Rahnenführer J, Schmidt M, Hengstler JG (červenec 2014). „Interferonem indukovatelný protein vázající guanylát (GBP2) je spojen s lepší prognózou u rakoviny prsu a naznačuje účinnou odpověď T buněk“. Rakovina prsu. 21 (4): 491–9. doi:10.1007 / s12282-012-0404-8. PMID 23001506.
- ^ Zhang J, Zhang Y, Wu W, Wang F, Liu X, Shui G, Nie C (říjen 2017). „Protein vázající guanylát 2 reguluje štěpení mitochondrií zprostředkované Drp1 k potlačení invaze buněk rakoviny prsu“. Buněčná smrt a nemoc. 8 (10): e3151. doi:10.1038 / cddis.2017.559. PMC 5680924. PMID 29072687.
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Neun R, Richter MF, Staeheli P, Schwemmle M (červenec 1996). "GTPázové vlastnosti interferonu indukovaného lidského proteinu vázajícího guanylát 2". FEBS Dopisy. 390 (1): 69–72. doi:10.1016 / 0014-5793 (96) 00628-X. PMID 8706832.
- Nitsche EM, Moquin A, Adams PS, Guenette RS, Lakins JN, Sinnecker GH, Kruse K, Tenniswood MP (květen 1996). "Diferenciální zobrazovací RT PCR celkové RNA z fibroblastů lidské předkožky pro vyšetřování androgen-dependentní genové exprese". American Journal of Medical Genetics. 63 (1): 231–8. doi:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (19960503) 63: 1 <231 :: AID-AJMG40> 3.0.CO; 2-M. PMID 8723115.
- Vestal DJ, Gorbacheva VY, Sen GC (listopad 2000). „Různé subcelulární lokalizace pro související interferonem indukované GTPasy, MuGBP-1 a MuGBP-2: důsledky pro různé funkce?“. Journal of Interferon & Cytokine Research. 20 (11): 991–1000. doi:10.1089/10799900050198435. PMID 11096456.
- Lukasiewicz R, Velazquez-Dones A, Huynh N, Hagopian J, Fu XD, Adams J, Ghosh G (srpen 2007). „Strukturálně jedinečné kvasinkové a savčí serin-argininové proteinové kinázy katalyzují evolučně konzervované fosforylační reakce“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (32): 23036–43. doi:10,1074 / jbc.M611305200. PMID 17517895.