Tibrovirus Bas-Kongo - Bas-Congo tibrovirus

Tibrovirus Bas-Kongo
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Negarnaviricota
Třída:Monjiviricetes
Objednat:Mononegavirales
Rodina:Rhabdoviridae
Rod:Tibrovirus
Druh:
Tibrovirus Bas-Kongo
Synonyma
  • Virus Bas-Kongo

Tibrovirus Bas-Kongo (BASV) je špatně charakterizovaný rhabdovirus objevený v krvi pacienta, který přežil těžké onemocnění připomínající hemoragickou horečku.[1] Virus byl pojmenován po bývalé provincii Konžská demokratická republika v Bas-Kongu (nyní Kongo Central ). BASV byl objeven pomocí sekvenování nové generace a pokusy o izolaci viru nebyly úspěšné. RNA BASV byla detekována pouze u jednoho jedince a její role jako lidského patogenu nebyla stanovena.[2]

Objev

Na jaře roku 2009 se u dvou teenagerů žijících v Mangale, malé vesnici v nejzápadnější provincii Demokratické republiky Kongo, vyskytlo závažné onemocnění s příznaky, které zahrnovaly: horečku, bolesti hlavy, bolesti břicha, krvácení z úst a nosu, a krvavý průjem. Oba teenageři zemřeli během několika dní po objevení se příznaků[1]

O více než týden onemocněla 32letá zdravotní sestra, která se o tyto dva teenagery starala. Jeho příznaky byly podobné jako u dvou teenagerů: nazální, oční a orální krvácení; hemateméza a krvavý průjem. Byla mu poskytnuta podpůrná péče a zotavil se. Byl odebrán vzorek krve a podroben sekvenování nové generace. Analýza odhalila přítomnost nového rhabdoviru, BASV, který byl podobný ostatním členům špatně charakterizovaného rodu tibrovirů.[1]

Sdružení nemocí

BASV byl přítomen v krvi infikovaného jedince ve více než 1 milionu kopií RNA / ml plazmy, což naznačuje aktivní infekci.[1]

Přestože je sekvenování nové generace mocným nástrojem pro detekci nových virů, nestanoví jednoznačně BASV jako příčinu nemoci pacienta. Jiní odborníci ve skutečnosti navrhli, že BASV není příčinou nemoci pacienta, a poznamenali, že v oblasti došlo současně k vypuknutí Shigella.[2]

Genom

Celý genom BASV není k dispozici. Byl hlášen genom 11 892 bp,[3] což je pravděpodobně 95% - 98% dokončeno. Genom BASV se skládá z pěti typických genů rhabdoviru (N, P, M, G a L) a tří otevřených čtecích rámců neznámé funkce (U1, U2 a U3).[4]

Replikace

O životním cyklu replikace BASV je známo jen málo, předpokládá se však, že je podobný jinému rhabdoviry. Výzkumu virologie BASV bylo bráněno, protože živý replikující virus není k dispozici.

Incidence a prevalence

Málo je známo o výskytu nebo prevalenci BASV. U infikovaného pacienta byly detekovány protilátky proti BASV a také blízký kontakt, který nevykazoval žádné příznaky onemocnění.[1] Sériový průzkum 50 náhodně vybraných dárců krve v EU Kasai-Oriental Province v Demokratické republice Kongo nezjistil žádné pozitivní vzorky.[5] Tato provincie je však přibližně 2 000 kilometrů od města, kde byl poprvé zjištěn BASV.

Přenos

Přírodní nádrž a cesta přenosu BASV nejsou známy. Algoritmus strojového učení navržený k předpovědi zvířecích rezervoárů a vektorů členovců naznačuje, že přirozeným hostitelem může být dobytek a hmyzí vektor kousání.[6] Tato předpověď je v souladu s tím, co je v současné době známo o přenosovém cyklu jiných tibroviry.

Vztah k jiným rhabdovirům

Fylogenetická analýza polymerázového proteinu (L) odhalila, že BASV je nejblíže příbuzný členům tibrovirus rod.[7] Existuje osm známých tibrovirů, včetně BASV.[8] Ze kousavých pakomárů byly izolovány čtyři tibroviry (Culicoides), tři od lidí a jeden od zdravého vola. S výjimkou Bas-Konga nebyl žádný z ostatních tibrovirů spojován s žádným onemocněním. Experimentální infekce skotu různými tibroviry nevyvolává žádné příznaky onemocnění.[9]

Reference

  1. ^ A b C d E Grard G, Fair JN, Lee D a kol. Nový rhabdovirus spojený s akutní hemoragickou horečkou ve střední Africe [publikovaná korekce se objevuje v PLoS Pathog. 2016 Mar; 12 (3): e1005503] [publikovaná oprava se objeví v PLoS Pathog. 7. září 2017; 13 (9): e1006583]. PLoS Pathog. 2012; 8 (9): e1002924. doi: 10,1371 / journal.ppat.1002924
  2. ^ A b https://science.sciencemag.org/content/bas-congo-virus-not-established-pathogen
  3. ^ „Virus Bas-Congo izoluje gen proteinu BASV-1 N proteinu, částečné CD ...“ Citováno 29. ledna 2020.
  4. ^ Kuhn JS, Pān H, Chiu CY, Stremlau M (25. února 2020). „Lidské tibroviry: komenzály nebo smrtící patogeny?“. Viry. 12 (3): 252. doi:10,3390 / v12030252. PMC  7150972. PMID  32106547.
  5. ^ Steffen I, Liss NM, Schneider BS, Fair JN, Chiu CY, Simmons G. Charakterizace glykoproteinu viru Bas-Congo a jeho funkce v pseudotypovaných virech. J Virol. 2013; 87 (17): 9558–9568. doi: 10.1128 / JVI.01183-13
  6. ^ S. A. Babayan et al., Predikce rezervoárových hostitelů a členovců vektory z evolučních podpisů v genomech RNA viru. Science 362, 577-580 (2018)
  7. ^ Walker PJ, Firth C, Widen SG a kol. Vývoj velikosti a složitosti genomu u rhabdoviridae. PLoS Pathog. 2015; 11 (2): e1004664. Publikováno 2015 13. února doi: 10,1371 / journal.ppat.1004664
  8. ^ https://talk.ictvonline.org/ictv-reports/ictv_online_report/negative-sense-rna-viruses/mononegavirales/w/rhabdoviridae/802/genus-tibrovirus
  9. ^ Cybinski, D. H., St. George, T. D., Standfast, H. A. & McGregor, A. Isolation of tibrogargan virus, a new Australian rhabdovirus, from Culicoides brevitarsis. Veterinary Microbiology 5, 301–308 (1980)