Tibrovirus - Tibrovirus

Tibrovirus
Sweetwater branch virus.jpg
Tibrovirus pobočky Sweetwater (530 nm až 690 nm a dlouhé až 900 nm, průměr 65 nm až 75 nm)[2]
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Negarnaviricota
Třída:Monjiviricetes
Objednat:Mononegavirales
Rodina:Rhabdoviridae
Rod:Tibrovirus
Zadejte druh
Tibrogargan tibrovirus
Druh[1]

Tibrovirus je špatně charakterizovaný rod viry v rodině Rhabdoviridae, objednat Mononegavirales. Od roku 2019 existuje 8 členů rodu tibrovirů[3]. Tibroviry byly izolovány od kousajících pakomárů, skotu a lidí. Žádný z tibrovirů, s výjimkou viru Bas-Kongo, nebyl spojen s žádnými chorobami.

Rodové členy

  • Virus Bas-Kongo (BASV) byl objeven v roce 2009 v Demokratické republice Kongo ve vzorku krve odebraném 32letému muži, který přežil těžké onemocnění připomínající hemoragickou horečku[4]. BASV nemohl být izolován ze vzorku pacienta, nebyl stanoven jako lidský patogen[5].
  • Virus Beatrice Hill (BHV) byl izolován ze skupiny kousavých pakomárů (Culicoides peregrinus) v roce 1984 v severním teritoriu v Austrálii[6]. BHV je špatně charakterizován a nebyly provedeny sérologické studie k posouzení jeho prevalence.
  • Virus Bivensova paže (BAV) byl izolován v letech 1981-1982 z kaluži kousavých pakomárů na Floridě. Protilátky anti-BAV byly detekovány u různých zvířat, včetně skotu, na Floridě a v Karibiku[7]. Neexistují žádné důkazy o lidské infekci nebo nemoci spojené s BAV[7].
  • Virus pobřežních plání (CPV) byl objeven v roce 1981 v severním teritoriu v Austrálii v krvi zdravého, asymptomatického vola[8]. U lidí nebyly nikdy detekovány žádné protilátky proti CPV a s CPV nebylo spojeno žádné onemocnění.
  • Virus Ekpoma 1 (EKV-1) byl objeven v roce 2015 ve vzorku krve odebraném zdravé 45leté ženě žijící v Ekpomě v Nigérii[9]. EKV-1 byl v její krvi přítomen v 4,5 milionu kopií RNA / ml, což naznačuje silnou replikaci. Experimenty využívající virus rekombinantní vezikulární stomatitidy exprimující obalový glykoprotein EKV-1 ukazují, že EKV-1 má velmi široký tropismus a může účinně vstoupit téměř do všech typů lidských buněk[10]. EKV-1 nemohl být izolován ze vzorku krve pacienta a živý replikačně kompetentní virus není k dispozici.
  • Virus Ekpoma 2 (EKV-2) byl objeven v roce 2015 ve vzorku krve odebraném zdravé 19leté ženě žijící v Ekpomě v Nigérii[9]. EKV-2 byl v její krvi přítomen na 45 000 kopií RNA / ml, což naznačuje mírnou replikaci. Experimenty využívající virus rekombinantní vezikulární stomatitidy exprimující obalový glykoprotein EKV-2 ukazují, že EKV-2 má velmi široký tropismus podobný EKV-1[10]. EKV-2 také nemohl být izolován ze vzorku krve pacienta a živý replikačně kompetentní virus není k dispozici.
  • Virus pobočky Sweetwater (SWBV) byl izolován spolu s BAV z kaluží kousavých pakomárů na Floridě v letech 1981-1982. Stejně jako BAV je expozice SWBV u různých zvířat pravděpodobně rozšířená. Neexistují žádné důkazy o expozici člověka nebo nemoci spojené s virem.
  • Virus tibrogargan (TIBV), první objevený tibrovirus, byl izolován ze skupiny kousavých pakomárů (Culicoides brevitarsis) v roce 1976 v australském Peachesteru[11]. TIBV se v Austrálii jeví jako velmi rozšířený u skotu. Průzkum mezi více než 3000 skotem zjistil, že mnoho stád je 100% séropozitivních. Infekce TIBV u lidí nebyla hlášena. TIBV je osiřelý virus a není spojen s žádným onemocněním. Experimentální infekce skotu způsobily virémii, ale nebyly pozorovatelné žádné známky nemoci[12].

Přenos

BHV, BAV, SWBV a TIBV byly izolovány z kousajících midges, což naznačuje, že midges jsou hlavním článkonožkým vektorem pro tyto viry. Není známo, jak se přenášejí BASV, EKV-1 a EKV-2.

Genetická divergence

Tibroviry jsou velmi odlišné. Například celková homologie aminokyselin mezi lidskými tibroviry (tj. BASV, EKV-1 a EKV-2) se pohybuje od 33% do 39%[9].

Morfologie

Tibrovirové viriony jsou obaleny, ale elektronovou mikroskopií byla pozorována pouze morfologie viru Tibrogargan a viru Sweetwater branch[2].

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
TibrovirusVe tvaru kulkySpirálovitýObalLineárníNesegmentovaný

Genom

Genomy tibroviru jsou jednovláknové molekuly RNA s negativním smyslem o délce přibližně 13 kb. Genom kóduje typických pět proteinů nacházejících se ve všech rhabdovirech: nukleokapsid (N), fosfoprotein (P), matrix (M), glykoprotein (G) a polymeráza (L). Existují však tři další geny, U1-U3, které kódují proteiny neznámé funkce.[13]

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky je dosaženo připojením virových G glykoproteinů k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají klatrinem zprostředkovanou endocytózu[14][10]. Replikace následuje model replikace viru s negativním řetězcem RNA. Transkripce negativního řetězce RNA viru pomocí koktání polymerázou je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku pučením a virovým pohybem vedeným tubulem.

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
TibrovirusHovězíŽádnýKlatrinem zprostředkovaná endocytózaPučícíCytoplazmaCytoplazmaZoonóza; kousnutí členovců: pakomárů

Reference

  1. ^ „Virus Taxonomy: 2018b Release“ (html). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Březen 2019. Citováno 3. února 2020.
  2. ^ A b Popov VL, Tesh RB, Weaver SC, Vasilakis N. Elektronová mikroskopie při objevování nových a vznikajících virů ze sbírky Světového referenčního centra pro vznikající viry a arboviry (WRCEVA). Viry. 2019; 11 (5): 477. Publikováno 2019 25. května doi: 10,3390 / v11050477
  3. ^ „Mezinárodní výbor pro taxonomii virů - rod Tibrovirus“.
  4. ^ Grard G, Fair JN, Lee D a kol. Nový rhabdovirus spojený s akutní hemoragickou horečkou ve střední Africe [publikovaná korekce se objevuje v PLoS Pathog. 2016 Mar; 12 (3): e1005503] [publikovaná oprava se objeví v PLoS Pathog. 7. září 2017; 13 (9): e1006583]. PLoS Pathog. 2012; 8 (9): e1002924. doi: 10,1371 / journal.ppat.1002924
  5. ^ Branco, Luis M .; Garry, Robert F. (3. prosince 2018). „Virus Bas-Kongo - není zavedeným patogenem“. Citováno 31. ledna 2020.
  6. ^ Standfast, H. A .; Dyce, A. L .; St George, T. D .; Muller, M. J .; Doherty, R.L .; Carley, J. G .; Filippich, C., Isolation of arboviruses from insects collected at Beatrice Hill, Northern Territory of Australia, 1974-1976. Aust J Biol Sci 1984, 37, (5-6), 351-66   
  7. ^ A b Gibbs, E. P .; Calisher, C. H .; Tesh, R. B .; Lazuick, J. S .; Bowen, R .; Greiner, E. C., virus Bivens Arm: nový rhabdovirus izolovaný z Culicoides insignis na Floridě a souvisí s australským virem Tibrogargan. Veterinární mikrobiol 1989, 19, (2), 141-50   
  8. ^ Cybinski DH, Gard GP. Izolace nového rhabdoviru v Austrálii souvisejícího s virem Tibrogargan. Aust J Biol Sci. 1986; 39 (3): 225–232. doi: 10,1071 / bi9860225
  9. ^ A b C Stremlau MH, Andersen KG, Folarin OA a kol. Objev nových rhabdovirů v krvi zdravých jedinců ze západní Afriky. PLoS Negl Trop Dis. 2015; 9 (3): e0003631. Publikováno 2015 17. března doi: 10,1371 / journal.pntd.0003631
  10. ^ A b C Caì Y, Yú S, Jangra RK a kol. Lidské, nelidské primáty a netopýří buňky jsou široce náchylné na vstup částic tibrovirových buněk. Přední mikrobiol. 2019; 10: 856. Publikováno 2019 26. dubna doi: 10.3389 / fmicb.2019.00856
  11. ^ Cybinski, D. H .; St. George, T. D .; Standfast, H. A .; McGregor, A., Izolace viru Tibrogargan, nového australského rhabdoviru, z Culicoides brevitaris. Veterinární mikrobiol 1980, 5, 301-308   
  12. ^ Cybinski, D. H .; Gard, G. P., Izolace nového rhabdoviru v Austrálii souvisejícího s virem Tibrogargan. Aust J Biol Sci 1986, 39, (3), 225-32   
  13. ^ „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 13. srpna 2015.
  14. ^ Steffen I, Liss NM, Schneider BS, Fair JN, Chiu CY, Simmons G. Charakterizace glykoproteinu viru Bas-Congo a jeho funkce v pseudotypovaných virech. J Virol. 2013; 87 (17): 9558–9568. doi: 10.1128 / JVI.01183-13

externí odkazy