ALDH3B1 - ALDH3B1

ALDH3B1
Identifikátory
AliasyALDH3B1ALDH4, ALDH7, člen rodiny aldehyddehydrogenázy 3, B1
Externí IDOMIM: 600466 MGI: 1914939 HomoloGene: 73890 Genové karty: ALDH3B1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomické umístění pro ALDH3B1
Genomické umístění pro ALDH3B1
Kapela11q13.2Start68,008,578 bp[1]
Konec68,029,282 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001290059
NM_000694
NM_001030010
NM_001161473
NM_001290058

NM_026316

RefSeq (protein)

NP_000685
NP_001025181
NP_001154945
NP_001276987
NP_001276988

NP_080592

Místo (UCSC)Chr 11: 68,01 - 68,03 MbChr 19: 3,91 - 3,93 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Rodina aldehyddehydrogenázy 3, člen B1 také známý jako ALDH3B1 je enzym že u lidí je kódován ALDH3B1 gen.[5][6]

Funkce

The aldehyddehydrogenázy jsou rodinou izozymů, které mohou hrát hlavní roli při detoxikaci aldehydů generovaných metabolismem alkoholu a peroxidací lipidů. Tento konkrétní gen zahrnuje asi 20 kb genomové DNA a skládá se z 9 kódujících exonů. Gen kóduje jediný transkript 2,8 kb, který je vysoce exprimován v ledvinách a plicích. Funkční význam tohoto genu a buněčná lokalizace jeho produktu nejsou v současnosti známy. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.[7]

Modelové organismy

Modelové organismy byly použity při studiu funkce ALDH3B1. Podmíněný knockout myš linka volala Aldh3b1tm1b (EUCOMM) Wtsi byl vygenerován na Wellcome Trust Sanger Institute.[8] Samci a samice prošli standardizací fenotypová obrazovka[9] k určení účinků vypuštění.[10][11][12][13] Další provedená vyšetření: - Hloubková imunologická fenotypizace[14] - hloubková fenotypizace kostí a chrupavek[15]

Aldh3b1 knockout myší fenotyp
CharakteristickýFenotyp
Veškerá data jsou k dispozici na.[9][14][15]
Leukocyty v periferní krvi 6 týdnůNormální
Hematologie 6 týdnůNormální
InzulínNormální
Homozygotní životaschopnost na P14Abnormální
Homozygotní plodnostNormální
Tělesná hmotnostNormální
Neurologické hodnoceníNormální
Síla úchopuNormální
DysmorfologieNormální
Nepřímá kalorimetrieNormální
Zkouška tolerance glukózyNormální
Sluchová odezva mozkového kmeneNormální
DEXANormální
RadiografieNormální
Morfologie očíNormální
Klinická chemieNormální
Hematologie 16 týdnůNormální
Leukocyty v periferní krvi 16 týdnůNormální
Váha srdceNormální
Salmonella infekceNormální
Cytotoxická funkce T buněkNormální
Epidermální imunitní složeníNormální

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000006534 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024885 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Hsu LC, Chang WC, Yoshida A (prosinec 1994). "Klonování cDNA kódující lidský ALDH7, nový člen rodiny aldehyddehydrogenázy". Gen. 151 (1–2): 285–9. doi:10.1016/0378-1119(94)90672-6. PMID  7828891.
  6. ^ Hsu LC, Chang WC, Yoshida A (duben 1997). "Lidské geny pro aldehyddehydrogenázu, ALDH7 a ALDH8: genomová organizace a srovnání genové struktury". Gen. 189 (1): 89–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00839-6. PMID  9161417.
  7. ^ „Entrez Gene: ALDH3B1“.
  8. ^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: vysoká propustnost charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  9. ^ A b „Mezinárodní konsorcium pro fenotypizaci myší“.
  10. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (červen 2011). „Podmíněný knockoutový zdroj pro celogenomové studium funkce myšího genu“. Příroda. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / příroda10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  11. ^ Dolgin E (červen 2011). „Knihovna myší je vyřazena“. Příroda. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  12. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (leden 2007). "Myš ze všech důvodů". Buňka. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  13. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Mouse Genetics Project, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (2013) . „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role mnoha genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  14. ^ A b „Konsorcium pro infekci a imunitu Imunofenotypizace (3i)“.
  15. ^ A b „OBCD Consortium“.

externí odkazy

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.