Trojúhelník U - Triangle of U

Trojúhelník U
Diagram "trojúhelníku U", ukazující genetické vztahy mezi šesti druhy rodu Brassica. Chromozomy z každého z genomů A, B a C jsou reprezentovány různými barvami.

The trojúhelník U je teorie o vývoji a vztazích mezi členy rostlina rod Brassica. Teorie uvádí, že genomy tří předků diploidní druhy Brassica v kombinaci vytvořit tři společné tetraploidní zelenina a olejnatá semena druhy plodin.[1] Od té doby to bylo potvrzeno studiemi DNA a proteinů.

Teorie je shrnuta trojúhelníkovým diagramem, který ukazuje tři rodové genomy, označené AA, BB a CC, v rozích trojúhelníku a tři odvozené, označené AABB, AACC a BBCC, po jeho stranách.

Teorie byla poprvé publikována v roce 1935 autorem Woo Jang-choon,[2] A korejština -japonský botanik (psaní pod japonským názvem „Nagaharu U“).[3] Woo vyrobil syntetické hybridy mezi diploidní a tetraploidní druhů a zkoumal, jak se chromozomy párovaly ve výsledných triploidech.

Přehled

Těch šest druhů je

GenomyChr.CountDruhPopis
Diploidní
AA2n = 2x = 20Brassica rapa(syn. Brassica campestris) tuřín, čínské zelí
BB2n = 2x = 16Brassica nigračerná hořčice
CC2n = 2x = 18Brassica oleraceazelí, kapusta, brokolice, Růžičková kapusta, květák, kedluben
Tetraploidní
AABB2n = 4x = 36Brassica junceaIndická hořčice
AACC2n = 4x = 38Brassica napusřepka, rutabaga
BBCC2n = 4x = 34Brassica carinataEtiopská hořčice

Kód ve sloupci „Chr.Count“ uvádí celkový počet chromozomů v každé somatické buňce a jejich vztah k počtu „n“ chromozomy v každé úplné genomové sadě (což je také počet nalezený v pylu nebo ovule ) a počet „x“ chromozomů v genomu každé složky. Například každá somatická buňka tetraploidního druhu Brassica napus, s písmenovými značkami AACC a počtem „2n = 4x = 38“, obsahuje dvě kopie genomu A, každá s 10 chromozomy, a dvě kopie genomu C, každá s 9 chromozomy, což je celkem 38 chromozomů. To jsou dvě úplné sady genomu (jedna A a jedna C), tedy „2n = 38“, což znamená „n = 19“ (počet chromozomů v každé gameta ). Je to také čtyřkomponentní genom (dva A a dva C), tedy „4x = 38“.

Tyto tři diploidní druhy existují v přírodě, ale mohou se snadno křížit, protože spolu úzce souvisejí. Tento mezidruhový chov umožnil vznik tří nových druhů tetraploidů Brassica. Říká se, že jsou allotetraploid (obsahující čtyři genomy ze dvou nebo více různých druhů); konkrétněji, amfidiploid (se dvěma genomy, každý ze dvou diploidních druhů).

Údaje z molekulárních studií naznačují, že tři diploidní druhy jsou samy o sobě paleopolyploidy.[4]

Alohexaploidní druh

Nedávno román allohexaploid (AABBCC), který je umístěn ve "středu" trojúhelníku U, byl vytvořen různými prostředky [5] [6] [7], například křížením B. rapa (AA) s B. carinata (BBCC) nebo B. nigra (BB) s B. napus (AACC) nebo B. oleracea (CC) s B. juncea (AABB), následovaná duplikací chromozomů potomků generovaných triploidem (ABC) zdvojnásobený haploid (AABBCC) potomků.

Viz také

Reference

  1. ^ Jules, Janick (2009). Recenze šlechtění rostlin. 31. Wiley. str. 56. ISBN  978-0-470-38762-7.
  2. ^ Nagaharu U (1935). „Analýza genomu v Brassice se zvláštním zřetelem na experimentální tvorbu B. napus a zvláštní způsob oplodnění“. Japonsko. J. Bot. 7: 389–452.
  3. ^ „인터넷 과학 신문 사이언스 타임즈“ (v korejštině). Archivovány od originál dne 2007-09-27.
  4. ^ Martin A. Lysak; Kwok Cheung; Michaela Kitschke & Petr Bu (říjen 2007). „Chromozomální bloky předků se u druhů Brassiceae ztrojnásobují s různým počtem chromozomů a velikostí genomu“ (PDF). Fyziologie rostlin. 145 (2): 402–10. doi:10.1104 / pp.107.104380. PMC  2048728. PMID  17720758. Citováno 2010-08-22.
  5. ^ Chen, Sheng; Nelson, Matthew N .; Chèvre, Anne-Marie; Jenczewski, Eric; Li, Zaiyun; Mason, Annaliese S .; Meng, Jinling; Plummer, Julie A .; Pradhan, Aneeta; Siddique, Kadambot H. M .; Snowdon, Rod J .; Yan, Guijun; Zhou, Weijun; Cowling, Wallace A. (2011-11-01). "Trigenomické mosty pro zlepšení Brassica". Kritické recenze v rostlinných vědách. 30 (6): 524–547. doi:10.1080/07352689.2011.615700. ISSN  0735-2689. S2CID  84504896.
  6. ^ Yang, Su; Chen, Sheng; Zhang, Kangni; Li, Lan; Yin, Yuling; Gill, Rafaqat A .; Yan, Guijun; Meng, Jinling; Cowling, Wallace A .; Zhou, Weijun (2018-08-28). „Genetická mapa s vysokou hustotou alohexaploidní populace rodu Brassica zdvojnásobila populaci haploidů odhaluje kvantitativní znaky loci životaschopnosti a plodnosti pylu. Hranice ve vědě o rostlinách. 9: 1161. doi:10.3389 / fpls.2018.01161. ISSN  1664-462X. PMC  6123574. PMID  30210508.
  7. ^ Gaebelein, Roman; Mason, Annaliese S. (03.09.2018). „Allohexaploidy v rodu Brassica“. Kritické recenze v rostlinných vědách. 37 (5): 422–437. doi:10.1080/07352689.2018.1517143. ISSN  0735-2689. S2CID  91439428.