Inhibitor serpinové peptidázy, klade A (alfa-1 antiproteináza, antitrypsin), člen 2 je protein že v lidé je kódován SERPINA2gen. Inhibitor serinové peptidázy, klade Člen 2 patří členu serin rodina proteinů, které mají funkční inhibiční aktivitu serinové proteázy.[3]
SERPINA2 byla známá jako pseudogeny protože měl velmi podobnou strukturu a funkci jako SERPINA 1. Během klonování charakterizace alfa 1- antitrypsin jako gen, bylo zjištěno, že SERPINA2 neměl žádné promotér ale obsahoval podstatné homologie na SERPINA 1genová sekvence.[4]
Extracelulární předpovědi SERPINů a kmeny společných domén ukazují, že ER lokalizace SERPINA2 je s největší pravděpodobností více, tyto společné ER motivy naznačují, že jejich lokalizace je s největší pravděpodobností v ER.[6]
Struktura
Populační studie naznačují, že tento gen je polymorfní. Vymazání, mutace posunu snímků a kritický spustit kodon mutace (ATG na ATA) byly nalezeny v některých populacích, stejně jako an alela který může kódovat funkční protein. Tento gen může být vyvíjející se pseudogen.[7] Referenční genom obsahuje mutaci start kodonu a má a oblast kódování vymazání. Byl vytvořen trojrozměrný model SERPINA2 s použitím nevymazané formy krystalové struktury, která je homologní s proteinem SERPINA1. Model byl vytvořen pomocí swissmodel v EXPASY, a ukázal, že SERPINA2 zachovává a SERPIN reaktivní středová smyčka, která je nejvíce kompatibilní s inhibiční aktivitou vůči proteázám. Konsenzuální sekvence obklopující reaktivní středovou smyčku se značně rozcházela, takže ji nyní obsahuje tryptofan sarin motivy místo methionin serinový motiv.[8]
Funkce
SERPINA2 byl dříve identifikován jako pseudogen; nedávno však došlo k novým důkazům, které to specifikují SERPINA2 produkuje aktivní transkript, který je zodpovědný za kódování proteinu umístěného v endoplazmatické retikulum. Podrobná studie SERPINA2 gen u více etnických skupin to ulevilo přidáním SERPINA2 gen v něm a haplotyp charakterizace částečnou delecí, která má vzory naznačující pozitivní výběr ztráty funkce proteinu SERPINA2.[5]
Studie SERPINA2 ukázaly různé výsledky týkající se rozsahu degenerace sekvence, kterou může podstoupit.[7] Bao a kol. (1988) popisuje ve svých studiích tuto sekvenci s Spojovací místa RNA jsou zachovány v SERPINA2 a při expresi kóduje nový sekreční protein (SERPIN) s odlišnou substrátovou specificitou. Tyto studie u lidí se SERPINA2 dospěly k závěru, že nedávná pozitivní selekce je podporována ztrátou funkce SERPINA2 a pseudogenizací.[9]SERPINA2 geny jsou většinou exprimovány v leukocyty a testy což dává a zbytkový výraz v játra. SERPINA2 byly spojeny s pokračujícím adaptivním procesem spojeným s výhodami v roli plodnosti a hostitele patogen interakce.[8]
Mutace
Kritická mutace přítomná v počátečním kodonu a 2kb delece nad exon IV a část exonu V. K této deleci v počátečním kodonu dochází s frekvencí 30%.[4] Studie s SERPINA2in vitro a in vivo prokázali, že exprimuje stabilní proteiny s n-vazbou glykosylace s molekulovou hmotností 52 kDa a kompatibilní s běžnými SERPINY [8]
Nemoc související
SERPINA2 je členem rodiny SERPIN, které jsou známé jako geny kódující proteiny. Nemoc spojená s tímto genem je emfyzém kvůli nedostatku aat bílkovin. SERPINA2 má podobnou funkci jako SERPINA1 a souvisí s funkcí aktivity inhibitoru peptidázy serinového typu.[10]
Namciu SJ, Friedman RD, Marsden MD, Sarausad LM, Jasoni CL, Fournier RE (březen 2004). "Sekvenční organizace a oblasti připojení matrice genu klastru genu pro inhibitor lidské serinové proteázy na 14q32.1". Savčí genom. 15 (3): 162–78. doi:10.1007 / s00335-003-2311-r. PMID15014966.
Rollini P, Fournier RE (prosinec 1997). "Molekulární vazba genů globulinu lidského alfa 1-antitrypsinu a kortikosteroidů na chromozomu 14q32.1". Savčí genom. 8 (12): 913–6. doi:10,1007 / s003359900610. PMID9383284.
