Pyridoxal 5-fosfát syntáza (hydrolyzující glutamin) - Pyridoxal 5-phosphate synthase (glutamine hydrolyzing) - Wikipedia
Pyridoxal 5'-fosfát syntáza (hydrolyzující glutamin) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
EC číslo | 4.3.3.6 | ||||||||
Databáze | |||||||||
IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
|
Pyridoxal 5'-fosfát syntáza (hydrolyzující glutamin) (ES 4.3.3.6, PdxST) je enzym s systematické jméno D-ribóza 5-fosfát, D-glyceraldehyd 3-fosfát pyridoxal 5'-fosfát-lyáza.[1][2][3][4][5][6][7][8] Tento enzym katalýzy následující chemická reakce
- D-ribóza-5-fosfát + D-glyceraldehyd-3-fosfát + L-glutamin pyridoxal 5'-fosfát + L-glutamát + 3 H2O + fosfát (celková reakce)
- (1a) L-glutamin + H2Ó L-glutamát + NH3
- (Lb) D-ribóza-5-fosfát + D-glyceraldehyd-3-fosfát + NH3 pyridoxal 5'-fosfát + 4 H2O + fosfát
Enzym lze také použít ribulosa 5-fosfát a dihydroxyaceton fosfát.
Reference
- ^ Burns KE, Xiang Y, Kinsland CL, McLafferty FW, Begley TP (březen 2005). "Rekonstituce a biochemická charakterizace nové biosyntetické dráhy pyridoxal-5'-fosfátu". Journal of the American Chemical Society. 127 (11): 3682–3. doi:10.1021 / ja042792t. PMID 15771487.
- ^ Raschle T, Amrhein N, Fitzpatrick TB (září 2005). „Na dvou složkách pyridoxal 5'-fosfát syntázy z Bacillus subtilis“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (37): 32291–300. doi:10,1074 / jbc.m501356200. PMID 16030023.
- ^ Strohmeier M, Raschle T, Mazurkiewicz J, Rippe K, Sinning I, Fitzpatrick TB, Tews I (prosinec 2006). "Struktura bakteriálního komplexu pyridoxal 5'-fosfát syntáza". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (51): 19284–9. doi:10.1073 / pnas.0604950103. PMC 1748218. PMID 17159152.
- ^ Raschle T, Arigoni D, Brunisholz R, Rechsteiner H, Amrhein N, Fitzpatrick TB (březen 2007). "Reakční mechanismus pyridoxal 5'-fosfát syntázy. Detekce chromoforického meziproduktu vázaného na enzym" (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 282 (9): 6098–105. doi:10.1074 / jbc.m610614200. PMID 17189272.
- ^ Hanes JW, Keresztes I, Begley TP (2008). "Zachytávání chromoforického meziproduktu v Pdx1 katalyzované biosyntéze pyridoxal 5'-fosfátu". Angewandte Chemie. 47 (11): 2102–5. doi:10.1002 / anie.200704390. PMID 18260082.
- ^ Hanes JW, Burns KE, Hilmey DG, Chatterjee A, Dorrestein PC, Begley TP (březen 2008). "Mechanistické studie na pyridoxal fosfát syntáze: reakční cesta vedoucí k chromoforickému meziproduktu". Journal of the American Chemical Society. 130 (10): 3043–52. doi:10.1021 / ja076604l. PMID 18271580.
- ^ Hanes JW, Keresztes I, Begley TP (červenec 2008). "13C NMR snímky komplexu reakční souřadnice pyridoxal fosfát syntázy". Přírodní chemická biologie. 4 (7): 425–30. doi:10.1038 / nchembio.93. PMID 18516049.
- ^ Wallner S, Neuwirth M, Flicker K, Tews I, Macheroux P (březen 2009). „Disekce příspěvků neměnných aminokyselin ke tvorbě komplexu a katalýze v heteromerním komplexu pyridoxal 5-fosfát syntázy z Bacillus subtilis“. Biochemie. 48 (9): 1928–35. doi:10.1021 / bi801887r. PMID 19152323.
externí odkazy
- Pyridoxal + 5'-fosfát + syntáza + (glutamin + hydrolyzující) v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)