Pyridoxal 5-fosfát syntáza (hydrolyzující glutamin) - Pyridoxal 5-phosphate synthase (glutamine hydrolyzing) - Wikipedia

Pyridoxal 5'-fosfát syntáza (hydrolyzující glutamin)
Identifikátory
EC číslo4.3.3.6
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum

Pyridoxal 5'-fosfát syntáza (hydrolyzující glutamin) (ES 4.3.3.6, PdxST) je enzym s systematické jméno D-ribóza 5-fosfát, D-glyceraldehyd 3-fosfát pyridoxal 5'-fosfát-lyáza.[1][2][3][4][5][6][7][8] Tento enzym katalýzy následující chemická reakce

D-ribóza-5-fosfát + D-glyceraldehyd-3-fosfát + L-glutamin pyridoxal 5'-fosfát + L-glutamát + 3 H2O + fosfát (celková reakce)
(1a) L-glutamin + H2Ó L-glutamát + NH3
(Lb) D-ribóza-5-fosfát + D-glyceraldehyd-3-fosfát + NH3 pyridoxal 5'-fosfát + 4 H2O + fosfát

Enzym lze také použít ribulosa 5-fosfát a dihydroxyaceton fosfát.

Reference

  1. ^ Burns KE, Xiang Y, Kinsland CL, McLafferty FW, Begley TP (březen 2005). "Rekonstituce a biochemická charakterizace nové biosyntetické dráhy pyridoxal-5'-fosfátu". Journal of the American Chemical Society. 127 (11): 3682–3. doi:10.1021 / ja042792t. PMID  15771487.
  2. ^ Raschle T, Amrhein N, Fitzpatrick TB (září 2005). „Na dvou složkách pyridoxal 5'-fosfát syntázy z Bacillus subtilis“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (37): 32291–300. doi:10,1074 / jbc.m501356200. PMID  16030023.
  3. ^ Strohmeier M, Raschle T, Mazurkiewicz J, Rippe K, Sinning I, Fitzpatrick TB, Tews I (prosinec 2006). "Struktura bakteriálního komplexu pyridoxal 5'-fosfát syntáza". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (51): 19284–9. doi:10.1073 / pnas.0604950103. PMC  1748218. PMID  17159152.
  4. ^ Raschle T, Arigoni D, Brunisholz R, Rechsteiner H, Amrhein N, Fitzpatrick TB (březen 2007). "Reakční mechanismus pyridoxal 5'-fosfát syntázy. Detekce chromoforického meziproduktu vázaného na enzym" (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 282 (9): 6098–105. doi:10.1074 / jbc.m610614200. PMID  17189272.
  5. ^ Hanes JW, Keresztes I, Begley TP (2008). "Zachytávání chromoforického meziproduktu v Pdx1 katalyzované biosyntéze pyridoxal 5'-fosfátu". Angewandte Chemie. 47 (11): 2102–5. doi:10.1002 / anie.200704390. PMID  18260082.
  6. ^ Hanes JW, Burns KE, Hilmey DG, Chatterjee A, Dorrestein PC, Begley TP (březen 2008). "Mechanistické studie na pyridoxal fosfát syntáze: reakční cesta vedoucí k chromoforickému meziproduktu". Journal of the American Chemical Society. 130 (10): 3043–52. doi:10.1021 / ja076604l. PMID  18271580.
  7. ^ Hanes JW, Keresztes I, Begley TP (červenec 2008). "13C NMR snímky komplexu reakční souřadnice pyridoxal fosfát syntázy". Přírodní chemická biologie. 4 (7): 425–30. doi:10.1038 / nchembio.93. PMID  18516049.
  8. ^ Wallner S, Neuwirth M, Flicker K, Tews I, Macheroux P (březen 2009). „Disekce příspěvků neměnných aminokyselin ke tvorbě komplexu a katalýze v heteromerním komplexu pyridoxal 5-fosfát syntázy z Bacillus subtilis“. Biochemie. 48 (9): 1928–35. doi:10.1021 / bi801887r. PMID  19152323.

externí odkazy