Phikmvvirus - Phikmvvirus

Phikmvvirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Duplodnaviria
Království:Heunggongvirae
Kmen:Uroviricota
Třída:Caudoviricetes
Objednat:Caudovirales
Rodina:Autographiviridae
Podčeleď:Krylovirinae
Rod:Phikmvvirus
Zadejte druh
Virus Pseudomonas phiKMV

Phikmvvirus je rod viry že infikovat bakterie. V současné době existuje 16 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Virus Pseudomonas phiKMV.[1][2]Bakteriofág phiKMV[3] a jeho příbuzní jsou známí jako velmi virulentní fágy, produkující velký (3–15 mm (0,12–0,59 palce) průměr) čirý plakety na vnímavém hostiteli.[4][5] Jedinou hlášenou výjimkou je fág LKA1, který poskytuje malé plaky (1 mm (0,039 palce)) obklopené halo. Zatímco všechny ostatní P. aeruginosa- specifické phikmvviry používají Typ IV pili jako primární receptor se částice LKA1 váží na bakterii lipopolysacharid vrstva.

Taxonomie

Rozeznávají se tyto druhy:[2]

Virologie

Elektronový mikroskop zobrazování purifikovaných fágových částic odhalilo tyto fágy jako typické členy Podoviridae, s průměrem hlavy přibližně 60 nm (2.4×10−6 in) a podsaditý ocas o délce 8–10 nm. Fág phiKMV se sice podobá dobře studovanému podovirus T7 celkově genom architektura, to byla první známá Fág podobný T7 který kódoval jednu podjednotku RNA polymeráza gen po proudu jeho DNA metabolické geny místo v rané genomové oblasti. Na základě těchto vlastností rod Phikmvvirus je zařazen do Autographiviridae.[6]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
PhikmvvirusHlava-ocasT = 7NeobalenéLineárníMonopartitní

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne absorpcí do hostitelské buňky. Transkripce založená na DNA je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou a proteiny holin / endolysin / spanin. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
PhikmvvirusBakterieŽádnýInjekceLyzaCytoplazmaCytoplazmaPasivní difúze

Reference

  1. ^ A b „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  2. ^ A b „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 4. května 2020.
  3. ^ Lavigne, Rob; Burkal'tseva, Maria V .; Robben, Johan; Sykilinda, Nina N .; Kurochkina, Lidia P .; Grymonprez, Barbara; Jonckx, Bart; Krylov, Victor N .; et al. (2003). „Genom bakteriofága φKMV, infikující virus podobný T7 Pseudomonas aeruginosa". Virologie. 312 (1): 49–59. doi:10.1016 / S0042-6822 (03) 00123-5. PMID  12890620.
  4. ^ Ceyssens, P.-J .; Lavigne, R .; Mattheus, W .; Chibeu, A .; Hertveldt, K .; Mast, J .; Robben, J .; Volckaert, G. (2006). "Genomická analýza Pseudomonas aeruginosa Fágy LKD16 a LKA1: Založení podskupiny KMV v rámci superskupiny T7 ". Journal of Bacteriology. 188 (19): 6924–31. doi:10.1128 / JB.00831-06. PMC  1595506. PMID  16980495.
  5. ^ Lammens, E .; Ceyssens, P.-J .; Voet, M .; Hertveldt, K .; Lavigne, R .; Volckaert, G. (2009). "Reprezentativní rozdílová analýza (RDA) bakteriofágových genomů". Časopis mikrobiologických metod. 77 (2): 207–13. doi:10.1016 / j.mimet.2009.02.006. PMID  19232531.
  6. ^ Lavigne, Rob; Seto, Donald; Mahadevan, Padmanabhan; Ackermann, Hans-W .; Kropinski, Andrew M. (2008). „Sjednocení klasické a molekulární taxonomické klasifikace: analýza Podoviridae pomocí nástrojů založených na BLASTP“. Výzkum v mikrobiologii. 159 (5): 406–14. doi:10.1016 / j.resmic.2008.03.005. PMID  18555669.

externí odkazy