Autographiviridae - Autographiviridae - Wikipedia

Autographiviridae
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Duplodnaviria
Království:Heunggongvirae
Kmen:Uroviricota
Třída:Caudoviricetes
Objednat:Caudovirales
Rodina:Autographiviridae
Rody

viz text

Synonyma
  • Superskupina T7

Autographiviridae je rodina viry v pořadí Caudovirales. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje v této rodině 371 druhů rozdělených mezi 9 podrodin a 131 rodů.[1][2]

Dějiny

Od 90. let 20. století je termín „superskupina T7“ zaveden pro rozšiřující se skupinu bakteriofágy související s coliphage T7 jako členové rodiny Podoviridae. Enterobacteriaceae fágy SP6 a K1-5 byly první, které byly považovány za odcizenou podskupinu „superskupiny T7“.[3] Pseudomonas fág phiKMV také sdílel společné rysy na úrovni organizace genomu. Na základě dostupných morfologických a proteomických údajů byla tato skupina virů založena jako podčeleď rodiny Podoviridae. Podrodina byla později v roce 2019 pozvednuta na úroveň rodiny.

Definice

Název této rodiny, pojmenovaný Autographiviridae, odkazuje na „auto-graphein“ nebo „samopřepis“ fágy které kódují jejich vlastní (jednu podjednotku) RNA polymeráza, společná charakteristika jeho členů.

Struktura

Viry v Autographiviridae jsou neobalené, s icosahedral a geometrie hlavy a ocasu a T = 7 symetrie. Průměr je kolem 60 nm. Genomy jsou lineární, mají délku přibližně 40–42 kB.[1]

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou a Holin /endolysin /rozpětí bílkoviny. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]

Taxonomie

Rozeznávají se následující podskupiny:[2]

Následující rody nejsou přiřazeny k podčeledi:[2]

Reference

  1. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
  2. ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 4. května 2020.
  3. ^ D., Scholl; J., Kieleczawa; Kemp, P .; Rush, J .; Richardson, C. C .; Merril, C .; Adhya, S .; Molineux, I. J. (2004). "Genomická analýza bakteriofágů SP6 a K1-5, odcizené podskupiny superskupiny T7". Journal of Molecular Biology. 335 (5): 1151–71. doi:10.1016 / j.jmb.2003.11.035. PMID  14729334.

externí odkazy