Autographiviridae - Autographiviridae - Wikipedia
Autographiviridae | |
---|---|
Klasifikace virů ![]() | |
(bez hodnocení): | Virus |
Oblast: | Duplodnaviria |
Království: | Heunggongvirae |
Kmen: | Uroviricota |
Třída: | Caudoviricetes |
Objednat: | Caudovirales |
Rodina: | Autographiviridae |
Rody | |
Synonyma | |
|
Autographiviridae je rodina viry v pořadí Caudovirales. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje v této rodině 371 druhů rozdělených mezi 9 podrodin a 131 rodů.[1][2]
Dějiny
Od 90. let 20. století je termín „superskupina T7“ zaveden pro rozšiřující se skupinu bakteriofágy související s coliphage T7 jako členové rodiny Podoviridae. Enterobacteriaceae fágy SP6 a K1-5 byly první, které byly považovány za odcizenou podskupinu „superskupiny T7“.[3] Pseudomonas fág phiKMV také sdílel společné rysy na úrovni organizace genomu. Na základě dostupných morfologických a proteomických údajů byla tato skupina virů založena jako podčeleď rodiny Podoviridae. Podrodina byla později v roce 2019 pozvednuta na úroveň rodiny.
Definice
Název této rodiny, pojmenovaný Autographiviridae, odkazuje na „auto-graphein“ nebo „samopřepis“ fágy které kódují jejich vlastní (jednu podjednotku) RNA polymeráza, společná charakteristika jeho členů.
Struktura
Viry v Autographiviridae jsou neobalené, s icosahedral a geometrie hlavy a ocasu a T = 7 symetrie. Průměr je kolem 60 nm. Genomy jsou lineární, mají délku přibližně 40–42 kB.[1]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku lýzou a Holin /endolysin /rozpětí bílkoviny. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]
Taxonomie
Rozeznávají se následující podskupiny:[2]
- Beijerinckvirinae
- Colwellvirinae
- Corkvirinae
- Krylovirinae
- Melnykvirinae
- Molineuxvirinae
- Okabevirinae
- Slopekvirinae
- Studiervirinae
Následující rody nejsou přiřazeny k podčeledi:[2]
- Aegirvirus
- Aqualcavirus
- Ashivirus
- Atuphduovirus
- Ayakvirus
- Ayaqvirus
- Banchanvirus
- Bifseptvirus
- Bonnellvirus
- Cheungvirus
- Chosvirus
- Cuernavacavirus
- Cyclitvirus
- Ermolevavirus
- Foturvirus
- Foussvirus
- Fussvirus
- Gajwadongvirus
- Gyeongsanvirus
- Igirivirus
- Jalkavirus
- Jiaoyazivirus
- Kafavirus
- Kajamvirus
- Kakivirus
- Kalppathivirus
- Kelmasvirus
- Kembevirus
- Krakvirus
- Lauvirus
- Limelightvirus
- Lingvirus
- Lirvirus
- Lullwatervirus
- Maculvirus
- Napahaivirus
- Nohivirus
- Oinezvirus
- Paadamvirus
- Pagavirus
- Pairvirus
- Pedosvirus
- Pekhitvirus
- Pelagivirus
- Percyvirus
- Piedvirus
- Podivirus
- Pollyceevirus
- Poseidonvirus
- Powvirus
- Pradovirus
- Qadamvirus
- Scottvirus
- Sednavirus
- Serkorvirus
- Sieqvirus
- Stompelvirus
- Stopalavirus
- Stopavirus
- Stupnyavirus
- Tangaroavirus
- Tawavirus
- Tiamatvirus
- Tiilvirus
- Tritonvirus
- Voetvirus
- Votkovvirus
- Waewaevirus
- Wuhanvirus (nezaměňovat s těžký akutní respirační syndrom koronavirus 2 )
Reference
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b C „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 4. května 2020.
- ^ D., Scholl; J., Kieleczawa; Kemp, P .; Rush, J .; Richardson, C. C .; Merril, C .; Adhya, S .; Molineux, I. J. (2004). "Genomická analýza bakteriofágů SP6 a K1-5, odcizené podskupiny superskupiny T7". Journal of Molecular Biology. 335 (5): 1151–71. doi:10.1016 / j.jmb.2003.11.035. PMID 14729334.