Orbivirus - Orbivirus

Orbivirus
Viry-10-00481-g001.BTV.png
Cryo-EM proteinové struktury a virus katarální horečky ovcí kapsid
Negativně obarvená částice podobná „viru katarální horečky ovcí“, která způsobila cytopatický účinek v buňkách BHK-21. Měřítko = 50 nm
Negativně obarvené Virus katarální horečky ovcí –Jako částice, která způsobila a cytopatický účinek v BHK-21 buňky. Měřítko = 50 nm
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Duplornaviricota
Třída:Resentoviricetes
Objednat:Reovirales
Rodina:Reoviridae
Podčeleď:Sedoreovirinae
Rod:Orbivirus
Zadejte druh
Virus katarální horečky ovcí
Druh

The rod Orbivirus je členem Reoviridae rodina, v podčeledi Sedoreovirinae. Na rozdíl od ostatních reovirů jsou orbiviry arboviry. Tento rod aktuálně obsahuje 22 druh (včetně druh druhu Virus katarální horečky ovcí ) a nejméně 130 různých sérotypy.[1][2] Orbiviry mohou infikovat a replikovat se v širokém rozsahu hostitelů členovců a obratlovců. Orbiviry jsou pojmenovány podle svých charakteristik Kobliha - tvarované kapsomery (Orbis v latinský znamená prsten).

Mnoho orbivirů je přenášeno klíšťata nebo hematofágové hmyzí vektory (Culicoides, komáři a písek letí ) a mají širokou škálu hostitelů, která zahrnuje dobytek, kozy a ovce, divoký přežvýkavci, koňovití, velbloudovití, vačnatci, lenost, netopýři, ptactvo, velký psí a kočičí masožravci, a lidé.

Tři ekonomicky nejdůležitější orbiviry jsou Virus katarální horečky ovcí, Virus africké nemoci koní, a Virus epizootické hemoragické choroby, z nichž všechny jsou přenášeny pomocí Culicoides druh.

Virion

Virony jsou neobalené částice o průměru 70–80 nm. The virus částice jsou sférického vzhledu a mají icosahedral symetrie.[3] Vnější a vnitřní kapsid vrstva obklopuje genom a mají T = 13 a T = 2 symetrii.[2] Viron je sestrojen ze dvou soustředných proteinových skořápek, subcore vrstvy, která obsahuje 120 kopií / částice VP3 a povrchové vrstvy jádra složené ze 780 kopií / částice VP7. VP1, VP4 a VP6 jsou malé enzymatické proteiny, které jsou zabaleny spolu s 10 segmenty genomu v centrálním prostoru jádra viru. Vnější kapsidová vrstva orbiviru je složena ze dvou dalších strukturních proteinů (VP2 a VP5), které zprostředkovávají připojení a penetraci buněk během zahájení infekce. Vnější kapsidové proteiny jsou variabilnější než základní proteiny a většina nestrukturálních proteinů a specifičnost jejich reakcí s neutralizujícími protilátkami určuje sérotyp viru.

Genom

Tyto viry mají dvouvláknovou strukturu RNA genomy, takže jsou klasifikovány jako viry třídy III. Jejich genom je lineární a je segmentován do 10 segmentů různých délek. Jedna kopie každého genového segmentu je zabalena do každého virionu. Ve většině případů každý genový segment kóduje jeden otevřený čtecí rámec (ORF). Genom kóduje sedm hlavních strukturních proteinů (VP1 – VP7) a tři hlavní nestrukturální proteiny (NS1-NS3). Výjimky z pravidla jednoho proteinu jeden gen jsou segment 9 (Seg-9) a segment 10 (Seg-10), které oba kódují dva téměř identické proteiny iniciované z fázových kodonů AUG blízko sebe blízko předních konců (VP6 a VP6a kódovaný Seg-9: NS3 a NS3a kódovaný Seg-10)

ORF pokrývá téměř celou délku genomového segmentu 9 a kóduje VP6 (virová helikáza). Druhý ORF (OrfX) je také přítomen v tomto segmentu a kóduje čtvrtý nestrukturální protein (NS4), který byl předpovězen sekvenční analýzou různých orbivirů včetně segmentu 9 viru Great Island, který obsahoval dlouhý NS4 ORF (kolem 21 kDa). V roce 2011 byla experimentálně potvrzena existence NS4 jak u orbivirů přenášených hmyzem, tak u klíšťat.[4]

NS1 je nejhojnější protein v buňkách infikovaných BTV. Tvoří tubuly, které se mohou podílet na translokaci částic viru potomstva do buněčné membrány. NS2 je fosforylován buněčnými kinázami a je důležitým proteinem matrice granulárních virových inkluzních tělísek, která se tvoří v cytoplazmě infikovaných buněk. Tato virová inkluzní tělíska fungují jako centra virové replikace. Membránové glykoproteiny NS3 a NS3a jsou exprimovány ve velkém počtu v buňkách hmyzu, ale ne v buňkách savců. Podílejí se na uvolňování částic viru potomstva z infikovaných buněk a mohou se podílet na stanovení jak vektorové kompetence, tak virulence.

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
OrbivirusIcosahedralT = 13, T = 2NeobalenéLineárníSegmentované

Replikace

Mnoho orbivirů přednostně infikuje vaskulární endoteliální buňky. Orbiviry vstoupit hostitelskou buňku endocytóza a vnější kapsida je následně odstraněna. Celý cyklus virová replikace probíhá uvnitř cytoplazmy hostitelské buňky. K transkripci virového genomu na mRNA dochází v jádrové částice a mRNA je translatována na proteiny pomocí ribozomů hostitelské buňky. Virové proteiny jsou syntetizovány 2–14 dní po počáteční infekci. Nové virony se samy shromažďují v cytoplazmě a poté se uvolňují z hostitelské buňky pučící. Během nadějného procesu přechodně získají lipidovou obálku, kterou lze detekovat po krátkou dobu po jejich uvolnění, ale ta se následně ztratí.

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
OrbivirusObratlovci; komáři; midges; komáři; písečné mušky; klíšťatavaskulární endoteliální buňkyEndocytóza buněčných receptorůBuněčná smrtCytoplazmaCytoplazmaKousnutí členovců

Patogeneze

Orbiviry primárně způsobují choroby zvířat. Odlišný Orbivirus druhy mají různé specificity hostitele. Orbiviry jsou vektorem přenášené patogeny přenášené mezi hostiteli obratlovců vektory, jako jsou komáři, komáři, komáři, mouchy a klíšťata. Virus katarální horečky ovcí (BTV) je Orbivirus to způsobuje katarální horečka ovcí u ovcí, skotu, koz a divokých kopytníků. BTV je v čele molekulárních studií poslední tři desetiletí a nyní představuje jeden z nejlépe pochopených virů na molekulární a strukturální úrovni.[5][6] Jiné druhy orbivirů jsou odpovědné za další nemoci zvířat, jako jsou Africký mor koní a virus koní encefalosy.[7]

Klasifikace

Taxonomie ICTV

Skupina: dsRNA

[1]

Séroskupiny

Tento rod byl rozdělen do několika (alespoň 14) séroskupin.[8][9] Séroskupiny byly v některých případech rozděleny do podskupin. Řada těchto virů ještě nebyla přiřazena do séroskupiny. Séroskupiny se rozlišují na základě čtyřnásobného nebo většího rozdílu v testech založených na protilátkách. Tyto testy zahrnují ELISA a testy fixace komplementu.

Druh

V tomto rodu je v současné době 22 uznávaných druhů virů a 13 nepřiřazených virů

Druhy (se základními viry):

  • Virus africké nemoci koní
  • Virus katarální horečky ovcí
  • Virus Chuzan
  • Virus Corriparta
  • Virus epizootické hemoragické choroby
  • Virus koňské encefalosy
  • Virus Eubenengee
    • Virus Eubenengee
    • Virus Ngoupe
    • Tilligerry virus
  • Virus Great Island
    • Broadhaven virus
    • Virus Great Island
    • Kemerovo virus
    • Virus Lipovnik
    • Tribec viry
  • Virus Lake Clarendon
  • Virus Palyam
    • Virus CSIRO Village
  • Virus Pata
  • Virus peruánské nemoci koní
    • Virus Elsey
  • Virus řeky St Croix
  • Virus Umatilla
    • Virus Stretch Lagoon
    • Virus Umatilla
  • Wallal virus
  • Virus Warrego
  • Wongorrův virus
  • Virus Yunnan
    • Virus středního bodu

Vektorové skupiny

Je známo, že tyto viry přenášejí midges (Culicoides ), komáři, a klíšťata. Zdá se, že viry přenášené určitým typem vektoru jsou geneticky i sérologicky příbuzné.

Midge vektorová skupina

  • Virus africké nemoci koní
  • Virus katarální horečky ovcí
  • Virus Chuzan
  • Virus epizootické hemoragické choroby
  • Virus koňské encefalosy
  • Virus Eubenengee
  • Virus Palyam
  • Wallal virus
  • Virus Warrego

Skupina vektoru proti komárům

  • Virus Corriparta
  • Virus peruánské nemoci koní
  • Wongorrův virus
  • Virus Umatilla
  • Virus Yunnan

Zaškrtněte vektorovou skupinu

  • Broadhaven virus
  • Virus Great Island
  • Kemerovo virus
  • Virus Lipovnik
  • Tribec viry

Neurčený vektor

Vektor (y) viru řeky St Croix nejsou známy a na základě jeho genomové sekvence se tento virus nejeví jako skupina s žádnou jinou skupinou vektorů.

Poznámky

Skupina klíšťat může být předků ostatních skupin.[10]

Dějiny

V roce 1719 způsobil virus africké nemoci koní první velkou zaznamenanou epidemii orbivirů a zabil 1 500 zvířat. K historicky nejvýznamnějšímu vypuknutí orbiviru došlo v letech 1854–1855, kdy AHSV infikovala 70 000 koní. AHSV byl objeven jako virus v roce 1900 a katarální horečka ovcí následovala krátce nato v roce 1905. Ohniska se vyskytovala sporadicky ve 20. a 21. století.[3]

Viz také

Reference

  1. ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
  2. ^ A b „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  3. ^ A b Knipe, David M. (17. června 2013). Polní virologie. Wolters Kluwer Health. ISBN  9781451105636.
  4. ^ Belhouchet M, Mohd Jaafar F, Firth AE, Grimes JM, Mertens PP, Attoui H (2011) Detection of a quarter orbivirus nonstructure protein. PLoS One 6 (10): e25697.
  5. ^ Roy P (2008). „Molekulární disekce viru katarální horečky ovcí“. Živočišné viry: Molekulární biologie. Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-22-6.
  6. ^ Roy P (2008). „Struktura a funkce viru katarální horečky ovcí a jeho proteinů“. Segmentované dvouvláknové RNA viry: Struktura a molekulární biologie. Caister Academic Press. ISBN  978-1-904455-21-9.
  7. ^ Viljoen a Huismans (1989) Charakterizace viru koňské encefalosy a vývoj genomových sond. J. gen. Virol. 70, 2007–2015.
  8. ^ Dilcher M, Hasib L, Lechner M, Wieseke N, Middendorf M, Marz M, Koch A, Spiegel M, Dobler G, Hufert FT, Weidmann M (2000) Genetická charakterizace viru Tribeč a viru Kemerovo, dva klíšťaty přenášené na člověka patogenní orbiviry. Virologie
  9. ^ Warrell DA, Cox TM, Firth JD (2003) Oxfordská učebnice medicíny. Oxford
  10. ^ Belaganahalli MN, Maan S. PLoS One 6 (8): e23605.

externí odkazy