Virus Umatilla - Umatilla virus

Virus Umatilla
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Duplornaviricota
Třída:Resentoviricetes
Objednat:Reovirales
Rodina:Reoviridae
Rod:Orbivirus
Druh:
Virus Umatilla

Virus Umatilla (UMAV) je virus dsRNA v rodině Reoviridae, podčeleď Sedoreovirinae a rod Orbivirus. Tento arbovirus byl poprvé izolován v roce 1969 v okrese Umatilla v Oregonu ve skupině Culex pipiens komáři.[1] Virový hostitel je Passer domesticus pták s vektory Culex komáři.[2]

Struktura virů

Podle Baltimore klasifikace, Reoviridae jsou ve skupině III kvůli jejich dsRNA genom. Tato rodina virů má lineární a segmentované genomové uspořádání a chybí jim lipidová obálka. Na rozdíl od toho, že mají lipidovou obálku, tyto viry zabalí svůj genom do vícevrstvé kapsidy; vnější kapsida je T = 13 a vnitřní T = 2. Rodina je rozdělena do dvou podskupin a UMAV patří Sedoreovirinae. V této podrodině chybí věže, a proto má hladký povrch.[2]

UMAV je v rodu Orbivirus, který byl původně pojmenován podle tvaru prstenu. Genom viru Umatilla je rozdělen na deset segmentů, přičemž jeden je zabalen do každého virionu. Deset segmentovaných genomů kóduje 7 hlavních strukturálních proteinů a 3 hlavní nestrukturální.[2]

Genóm UMAV je dlouhý 19 402 bp, přičemž 5,695% genomu nekóduje. S UMAV v rodině Reoviridae, je to neobalený virus, ale jádro má průměr asi 30 nm. Deset segmentů této lineární dsRNA ve viru většinou kóduje jeden virový protein.[2]

Replikace

Spolu s dalšími viry v Reoviridae rodina, replikace viru Umatilla se vyskytuje v cytoplazmě. Tento virus je dodáván s některými vlastními replikačními proteiny. Vstup do hostitelské buňky probíhá prostřednictvím buněčných receptorů endocytózy. Tento proces je způsoben interakcí s kyselinou sialovou na hostiteli.[3] Vnější kapsida je odstraněna, protože virus vstupuje do hostitele prostřednictvím endocytózy. Takže dsRNA nikdy nepřichází do přímého kontaktu s cytoplazmou, dochází k časné replikaci ve virovém jádru. K replikaci i sestavení dochází v cytoplazmě hostitelské buňky. Hostitelské ribozomy se používají k překladu virové RNA na mRNA. Viriony se samy shromažďují v cytoplazmě hostitelských buněk a poté odcházejí pučením po smrti hostitelské buňky.[3]

Přenos

Tento virus je přenášen pomocí Culex komáři a nachází se v Passer domesticus ptactvo.[2]

Reference

  1. ^ „Virus ArboCat: Umatilla (UMAV)“. wwwn.cdc.gov. Citováno 2017-11-02.
  2. ^ A b C d E Belaganahalli MN, Maan S, Maan NS, Tesh R, Attoui H, Mertens PP (2011). „Sekvenování genomu viru Umatilla a fylogenetická analýza: identifikace orbiviru úsekové laguny jako nového člena druhu viru Umatilla“. PLOS One. 6 (8): e23605. Bibcode:2011PLoSO ... 623605B. doi:10.1371 / journal.pone.0023605. PMC  3163642. PMID  21897849.
  3. ^ A b „Orbivirus“. ViralZone. EXPASY. Citováno 2017-11-02.