Protein vázající oktamer bez POU domény - Non-POU domain-containing octamer-binding protein
Protein vázající oktamer bez POU domény (NonO) je a protein že u lidí je kódován NE gen.[5][6][7]
Protein NonO patří do rodiny proteinů Drosophila behavior / human splicing (DBHS).[8] Proteiny v rodině DHBS zahrnují savce SFPQ (sestřihový faktor, bohatý na prolin a glutamin; aka PSF), NONO (protein neobsahující doménu POU obsahující oktamer vázající protein; aka p54nrb) a PSPC1 (složka 1 paraspeckle; aka PSP1) a bezobratlí NONA (protein ne přechodné A) a Hrp65.[9]
Interakce
NONO bylo prokázáno komunikovat s SFPQ,[10] SPI1[11] a Androgenní receptor.[12]
Funkce
NONO je zapojeno do mnoha jaderných procesů a váže se na oba DNA a RNA.[13]
Stejně jako u všech proteinů DBHS je famprotein popsán jako multifunkční jaderný protein.[14] Ukázalo se, že NONO protein je zapojen do mnoha biologických funkcí, včetně sestřihu pre-mRNA; aktivace transkripce; ukončení transkripce; DNA se odvíjí, páruje a udržuje správně cirkadiánní hodiny funkce.[13][15][16][17][18][19]
Bylo zjištěno, že NONO se váže Rasd1 protein, ve výsledném dimeru Rasd1 může působit tak, že moduluje funkci NONO, aby snížil regulaci exprese proteinu CREB geny, NR4A1 a Nr4A2.[20]
NONO se váže na SFPQ a tvoří a heterodimer který interaguje s MATR3 protein.[21] Interakce těchto tří proteinů může být součástí procesu v jádru, který je zodpovědný za retenci RNA, která je defektní, ještě není dostatečně zralá na to, aby mohla být exportována nebo je navržena tak, aby byla zachována v jádro.[21]
Poloha genu
NONO protein (člověk) je kódován NONO gen který se nachází na plusovém vláknu X chromozom.[22]
Role v nemoci
Melanom
Ukázalo se, že NONO je silněji vyjádřeno v melanom buněčné linie a vzorky tkáně melanomu ve srovnání s normálními lidskými buněčnými liniemi a normální kožní tkání.[23] Studie zjistily, že knokaut NONO proteinu z buněčných linií melanomu vede jak ke snížení rychlosti proliferace rakovinných buněk, tak k významnému snížení potenciální migrace rakovinných buněk.[23]
Rakovina prsu
Studie do rakoviny prsu zjistili, že ztráta nebo změna NONO ve spojení se ztrátou estrogenového receptoru hERα vede k agresivnějším rakovinám prsu, které vykazují nárůst obou nádor velikost a metastázy.[24]
Mentální postižení spojené s nekompaktní kardiomyopatií
Studie na lidech a myších toto NONO identifikovaly nulové mutace pravděpodobně povede k rozvoji klinicky rozeznatelného mentální postižení s kognitivními a afektivními deficity.[25] Později bylo zjištěno, že tyto patogenní varianty byly také silně spojeny s kardiomyopatie s nekompakcí levé komory a někdy Ebsteinova anomálie.[26][27]
Struktura
Stejně jako u jiných proteinů rodiny DBHS funguje i NONO proteinová funkce zřídka samostatně a primárně tvoří homo- a heterodimery s jinými proteiny DBHS, aby mohla plnit své různé funkce.[28] Předpokládá se, že tyto dimery mohou mít různé funkce, které jsou specifické pro typ buňky, ve které se nacházejí.[29]
Spekuluje se, že to je fosforylace stav na NONO, který působí tak, že řídí proteiny mnoho různorodých funkcí v jádře.[13]
Specifičnost tkáně
NONO se nachází v jádru většiny savčí buněk a je primárně distribuován v rámci nukleoplazma, lze jej také nalézt koncentrované v subjaderných doménách známých jako paraspeckles.[30]
NONO bylo také pozorováno v mozku, lokalizovaném v cytoplazma z hipokampální neurony které jsou spojeny s transportem RNA granule.[31] Je také vysoce exprimován v srdeční tkáni. [27]
Objev
NONO protein byl poprvé objeven v roce 1993 vědci z Cold Springs Harbor Laboratory. Vzhledem k tomu, že protein byl původně identifikován jako protein vázající RNA, byl pojmenován p54nrb pro protein vázající nukleární RNA, 54 kDa.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000147140 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031311 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Dong B, Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (srpen 1993). „Čištění a cDNA klonování HeLa buněk p54nrb, nukleárního proteinu se dvěma motivy rozpoznávání RNA a rozsáhlé homologie s lidským sestřihovým faktorem PSF a Drosophila NONA / BJ6“. Výzkum nukleových kyselin. 21 (17): 4085–92. doi:10.1093 / nar / 21.17.4085. PMC 310009. PMID 8371983.
- ^ Traish AM, Huang YH, Ashba J, Pronovost M, Pavao M, McAneny DB, Moreland RB (srpen 1997). „Ztráta exprese 55 kDa jaderného proteinu (nmt55) u lidského karcinomu prsu negativního na estrogenový receptor“. Diagnostická molekulární patologie. 6 (4): 209–21. doi:10.1097/00019606-199708000-00005. PMID 9360842.
- ^ „Entrez Gene: NONO Non-POU domain containing, octamer-binding“.
- ^ A b Dong B, Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (srpen 1993). „Čištění a cDNA klonování HeLa buněk p54nrb, nukleárního proteinu se dvěma motivy rozpoznávání RNA a rozsáhlé homologie s lidským sestřihovým faktorem PSF a Drosophila NONA / BJ6“. Výzkum nukleových kyselin. 21 (17): 4085–92. doi:10.1093 / nar / 21.17.4085. PMC 310009. PMID 8371983.
- ^ Passon DM, Lee M, Rackham O, Stanley WA, Sadowska A, Filipovska A, Fox AH, Bond CS (březen 2012). „Struktura heterodimeru lidské NONO a proteinové složky paraspeckle 1 a analýza jeho role při tvorbě subjaderného těla“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 109 (13): 4846–50. doi:10.1073 / pnas.1120792109. PMC 3324020. PMID 22416126.
- ^ Peng R, Dye BT, Pérez I, Barnard DC, Thompson AB, Patton JG (říjen 2002). "PSF a p54nrb váží konzervovaný kmen v U5 snRNA". RNA. 8 (10): 1334–47. doi:10.1017 / S1355838202022070. PMC 1370341. PMID 12403470.
- ^ Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (květen 1996). „Transkripční faktor Spi-1 / PU.1 váže RNA a interferuje s proteinem p54nrb vázajícím RNA“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (19): 11177–81. doi:10.1074 / jbc.271.19.11177. PMID 8626664.
- ^ Ishitani K, Yoshida T, Kitagawa H, Ohta H, Nozawa S, Kato S (červenec 2003). „p54nrb působí jako transkripční koaktivátor pro aktivační funkci 1 lidského androgenního receptoru“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 306 (3): 660–5. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01021-0. PMID 12810069.
- ^ A b C Shav-Tal Y, Zipori D (listopad 2002). "PSF a p54nrb / NonO - multifunkční jaderné proteiny". FEBS Lett. 531 (2): 109–14. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6. PMID 12417296.
- ^ Duvignaud JB, Bédard M, Nagata T, Muto Y, Yokoyama S, Gagné SM, Vincent M (květen 2016). "Struktura, dynamika a interakce p54 (nrb) / NonO RRM1 s 5 'sekvencí sestřihu RNA". Biochemie. 55 (18): 2553–66. doi:10.1021 / acs.biochem. 5b01240. PMID 27064654.
- ^ Basu A, Dong B, Krainer AR, Howe CC (únor 1997). „Intracisternální protein vázající proximální zesilovač A aktivuje transkripci a je identický s proteinem p54nrb / NonO vázajícím RNA a DNA.“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (2): 677–86. doi:10,1128 / mcb.17.2.677. PMC 231793. PMID 9001221.
- ^ Danckwardt S, Kaufmann I, Gentzel M, Foerstner KU, Gantzert AS, Gehring NH, Neu-Yilik G, Bork P, Keller W, Wilm M, Hentze MW, Kulozik AE (červen 2007). „Faktory sestřihu stimulují polyadenylaci pomocí USE na nekanonických 3 'koncích signálů formace“. Časopis EMBO. 26 (11): 2658–69. doi:10.1038 / sj.emboj.7601699. PMC 1888663. PMID 17464285.
- ^ Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (únor 1998). „Transkripční faktor Spi-1 / PU.1 interaguje s potenciálním spojovacím faktorem TLS“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (9): 4838–42. doi:10.1074 / jbc.273.9.4838. PMID 9478924.
- ^ Kameoka S, Duque P, Konarska MM (duben 2004). „p54 (nrb) se asociuje s 5 'spojovacím místem ve velkých transkripčních / sestřihových komplexech“. Časopis EMBO. 23 (8): 1782–91. doi:10.1038 / sj.emboj.7600187. PMC 394241. PMID 15057275.
- ^ Kowalska E, Ripperger JA, Hoegger DC, Bruegger P, Buch T, Birchler T, Mueller A, Albrecht U, Contaldo C, Brown SA (leden 2013). „NONO spojuje cirkadiánní hodiny s buněčným cyklem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (5): 1592–9. doi:10.1073 / pnas.1213317110. PMC 3562797. PMID 23267082.
- ^ Ong SA, Tan JJ, Tew WL, Chen KS (01.01.2011). „Rasd1 moduluje funkci koaktivátoru NonO v cyklické dráze AMP“. PLOS ONE. 6 (9): e24401. doi:10.1371 / journal.pone.0024401. PMC 3168489. PMID 21915321.
- ^ A b Zhang Z, Carmichael GG (srpen 2001). „Osud dsRNA v jádře: komplex obsahující p54 (nrb) zprostředkovává jadernou retenci promiskuitně upravených RNA A-to-I“. Buňka. 106 (4): 465–75. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4. PMID 11525732.
- ^ „NONO - Protein vázající oktamer bez domény POU - Homo sapiens (člověk) - NONO gen a protein“. www.uniprot.org. Citováno 2016-10-14.
- ^ A b Schiffner S, Zimara N, Schmid R, Bosserhoff AK (srpen 2011). „p54nrb je nový regulátor progrese maligního melanomu“. Karcinogeneze. 32 (8): 1176–82. doi:10.1093 / carcin / bgr103. PMID 21642354.
- ^ Pavao M, Huang YH, Hafer LJ, Moreland RB, Traish AM (01.01.2001). „Imunodetekce izoforem nmt55 / p54nrb u lidské rakoviny prsu“. Rakovina BMC. 1: 15. doi:10.1186/1471-2407-1-15. PMC 59838. PMID 11710964.
- ^ Mircsof D, Langouët M, Rio M, Moutton S, Siquier-Pernet K, Bole-Feysot C a kol. (Prosinec 2015). „Mutace v NONO vedou k syndromickému mentálnímu postižení a inhibičním synaptickým defektům“. Přírodní neurovědy. 18 (12): 1731–6. doi:10.1038 / č. 4169. PMC 5392243. PMID 26571461.
- ^ Reinstein E, Tzur S, Cohen R, Bormans C, Behar DM (listopad 2016). „Intelektuální postižení a nekompaktní kardiomyopatie s de novo NONO mutací identifikovanou sekvenováním exome“. European Journal of Human Genetics. 24 (11): 1635–1638. doi:10.1038 / ejhg.2016.72. PMC 5110068. PMID 27329731.
- ^ A b Scott DA, Hernandez-Garcia A, Azamian MS, Jordan VK, Kim BJ, Starkovich M a kol. (Leden 2017). „Vrozené srdeční vady a neshutnění levé komory u mužů s variantami ztráty funkce u NONO“. Journal of Medical Genetics. 54 (1): 47–53. doi:10.1136 / jmedgenet-2016-104039. PMID 27550220.
- ^ Fox AH, Bond CS, Lamond AI (listopad 2005). „P54nrb tvoří heterodimer s PSP1, který se lokalizuje na paraspeckles způsobem závislým na RNA“. Molekulární biologie buňky. 16 (11): 5304–15. doi:10,1091 / mbc.E05-06-0587. PMC 1266428. PMID 16148043.
- ^ Knott GJ, Bond CS, Fox AH (květen 2016). „Proteiny DBHS SFPQ, NONO a PSPC1: víceúčelové molekulární lešení“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (9): 3989–4004. doi:10.1093 / nar / gkw271. PMC 4872119. PMID 27084935.
- ^ Fox AH, Lamond AI (červenec 2010). "Paraspeckles". Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 2 (7): a000687. doi:10.1101 / cshperspect.a000687. PMC 2890200. PMID 20573717.
- ^ Kanai Y, Dohmae N, Hirokawa N (srpen 2004). "Kinesin transportuje RNA: izolace a charakterizace RNA transportující granule". Neuron. 43 (4): 513–25. doi:10.1016 / j.neuron.2004.07.022. PMID 15312650.
Další čtení
- Shav-Tal Y, Zipori D (listopad 2002). "PSF a p54 (nrb) / NonO - multifunkční jaderné proteiny". FEBS Dopisy. 531 (2): 109–14. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6. PMID 12417296.
- Zhang WW, Zhang LX, Busch RK, Farrés J, Busch H (únor 1993). "Purifikace a charakterizace DNA vázajícího heterodimeru 52 a 100 kDa z buněk HeLa". The Biochemical Journal. 290 (Pt 1): 267–72. doi:10.1042 / bj2900267. PMC 1132410. PMID 8439294.
- Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (květen 1996). „Transkripční faktor Spi-1 / PU.1 váže RNA a interferuje s proteinem p54nrb vázajícím RNA“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (19): 11177–81. doi:10.1074 / jbc.271.19.11177. PMID 8626664.
- Peters U, Haberhausen G, Kostrzewa M, Nolte D, Müller U (říjen 1997). „AFX1 and p54nrb: fine mapping, genomic structure, and exclusion as candidate genes of X-linked dystonia parkinsonism“. Genetika člověka. 100 (5–6): 569–72. doi:10,1007 / s004390050553. PMID 9341872.
- Clark J, Lu YJ, Sidhar SK, Parker C, Gill S, Smedley D, Hamoudi R, Linehan WM, Shipley J, Cooper CS (říjen 1997). „Fúze genů sestřihových faktorů PSF a NonO (p54nrb) do genu TFE3 v papilárním karcinomu ledvin“. Onkogen. 15 (18): 2233–9. doi:10.1038 / sj.onc.1201394. PMID 9393982.
- Straub T, Grue P, Uhse A, Lisby M, Knudsen BR, Tange TO, Westergaard O, Boege F (říjen 1998). „Faktor sestřihu RNA PSF / p54 řídí aktivitu DNA-topoizomerázy I přímou interakcí“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (41): 26261–4. doi:10.1074 / jbc.273.41.26261. PMID 9756848.
- Karhumaa P, Parkkila S, Waheed A, Parkkila AK, Kaunisto K, Tucker PW, Huang CJ, Sly WS, Rajaniemi H (květen 2000). „Protein Nuclear NonO / p54 (nrb) je neklasická karboanhydráza“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (21): 16044–9. doi:10.1074 / jbc.275.21.16044. PMID 10821857.
- Straub T, Knudsen BR, Boege F (červen 2000). „PSF / p54 (nrb) stimuluje„ skákání “DNA topoizomerázy I mezi samostatnými šroubovicemi DNA“. Biochemie. 39 (25): 7552–8. doi:10.1021 / bi992898e. PMID 10858305.
- Mathur M, Tucker PW, Samuels HH (duben 2001). „PSF je nový korepresor, který zprostředkovává svůj účinek prostřednictvím Sin3A a vazebné domény DNA nukleárních hormonálních receptorů“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (7): 2298–311. doi:10.1128 / MCB.21.7.2298-2311.2001. PMC 86864. PMID 11259580.
- Zhang Z, Carmichael GG (srpen 2001). „Osud dsRNA v jádru: komplex obsahující p54 (nrb) zprostředkovává jadernou retenci promiskuitně upravených RNA A-to-I“. Buňka. 106 (4): 465–75. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4. PMID 11525732.
- Pavao M, Huang YH, Hafer LJ, Moreland RB, Traish AM (2001). „Imunodetekce izoforem nmt55 / p54nrb u lidské rakoviny prsu“. Rakovina BMC. 1: 15. doi:10.1186/1471-2407-1-15. PMC 59838. PMID 11710964.
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (leden 2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Aktuální biologie. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298.
- Sewer MB, Nguyen VQ, Huang CJ, Tucker PW, Kagawa N, Waterman MR (duben 2002). „Transkripční aktivace lidského CYP17 v adrenokortikálních buňkách H295R závisí na tvorbě komplexu mezi p54 (nrb) / NonO, proteinovým spojovacím faktorem a SF-1, komplexem, který se také podílí na represi transkripce.“. Endokrinologie. 143 (4): 1280–90. doi:10.1210 / en.143.4.1280. PMID 11897684.
- Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
- Emili A, Shales M, McCracken S, Xie W, Tucker PW, Kobayashi R, Blencowe BJ, Ingles CJ (září 2002). „Sestřih a proteiny spojené s transkripcí PSF a p54nrb / nonO se vážou na CTD RNA polymerázy II“. RNA. 8 (9): 1102–11. doi:10.1017 / S1355838202025037. PMC 1370324. PMID 12358429.
- Peng R, Dye BT, Pérez I, Barnard DC, Thompson AB, Patton JG (říjen 2002). "PSF a p54nrb váží konzervovaný kmen v U5 snRNA". RNA. 8 (10): 1334–47. doi:10.1017 / S1355838202022070. PMC 1370341. PMID 12403470.