MATR3 - MATR3

MATR3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X4D, 1X4F
Identifikátory
Aliasy	MATR3, ALS21, MPD2, VCPDM, matrin 3
Externí ID	OMIM: 164015 MGI: 1298379 HomoloGene: 7830 Genové karty: MATR3
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita strukturních molekul; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • identická vazba na protein; • miRNA vazba;
Buněčná složka	• jaderná matice; • jaderná vnitřní membrána; • membrána; • buněčné jádro;
Biologický proces	• posttranskripční regulace genové exprese; • aktivace vrozené imunitní odpovědi; • proces imunitního systému; • vrozený imunitní systém; • vývoj srdeční chlopně; • vývoj komorového septa;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9782
	17184
	ENSG00000015479; ENSG00000280987
	ENSMUSG00000037236
	P43243
	Q8K310
NM_001194954; NM_001194955; NM_001194956; NM_001282278; NM_018834;
	NM_199189
	NM_010771
NP_001181883; NP_001181884; NP_001181885; NP_001269207; NP_061322;
	NP_954659
	NP_034901
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Matrin-3 je protein že u lidí je kódován MATR3 gen.^[3]^[4]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je lokalizován v jaderná matice. Může hrát roli při transkripci nebo může interagovat s jinými proteiny jaderné matrice za vzniku vnitřní fibrogranulární sítě. Pro tento gen byly identifikovány dvě varianty transkriptu kódující stejný protein.^[4]

Patologie

Mutace v genu Matrin 3 jsou spojeny s familiárními Amyotrofní laterální skleróza.^[5]

Reference

^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Belgrader P, Dey R, Berezney R (červen 1991). „Molekulární klonování matrinu 3. 125kalddaltonový protein jaderné matrice obsahuje rozsáhlou kyselou doménu“. J Biol Chem. 266 (15): 9893–9. PMID 2033075.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MATR3 matrin 3“.
^ Johnson JO, Pioro EP, Boehringer A, Chia R, Feit H, Renton AE, Pliner HA, Abramzon Y, Marangi G, Winborn BJ, Gibbs JR, Nalls MA, Morgan S, Shoai M, Hardy J, Pittman A, Orrell RW , Malaspina A, Sidle KC, Fratta P, Harms MB, Baloh RH, Pestronk A, Weihl CC, Rogaeva E, Zinman L, Drory VE, Borghero G, Mora G, Calvo A, Rothstein JD, Drepper C, Sendtner M, Singleton AB, Taylor JP, Cookson MR, Restagno G, Sabatelli M, Bowser R, Chiò A, Traynor BJ (2014). „Mutace v genu Matrin 3 způsobují familiární amyotrofickou laterální sklerózu“. Nat. Neurosci. 17 (5): 664–6. doi:10.1038 / nn.3688. PMC 4000579. PMID 24686783.

Další čtení

Stuurman N; Meijne AM; van der Pol AJ; et al. (1990). „Jaderná matice z buněk různého původu. Důkazy pro společnou sadu proteinů matice“. J. Biol. Chem. 265 (10): 5460–5. PMID 2180926.
Andersson B; Wentland MA; Ricafrente JY; et al. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W; Andersson B; Worley KC; et al. (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Okumara K; Nogami M; Matsushima Y; et al. (1998). „Mapování lidského jaderného proteinu vázajícího DNA (NP220) na pás chromozomu 2p13.1-p13.2 a jeho vztah k matrinu 3“. Biosci. Biotechnol. Biochem. 62 (8): 1640–2. doi:10,1271 / bbb.62.1640. PMID 9757574.
Nagase T; Ishikawa K; Suyama M; et al. (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XI. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (5): 277–86. doi:10.1093 / dnares / 5.5.277. PMID 9872452.
Hu RM; Han ZG; Song HD; et al. (2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (17): 9543–8. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Zhang Z, Carmichael GG (2001). „Osud dsRNA v jádru: komplex obsahující p54 (nrb) zprostředkovává jadernou retenci promiskuitně upravených RNA A-to-I“. Buňka. 106 (4): 465–75. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4. PMID 11525732. S2CID 18799711.
Bernert G, Fountoulakis M, Lubec G (2003). "Rozdělovač snížil hladiny bílkovin matrinu 3, snížil motorický protein HMP a hlark v mozku fetálního Downova syndromu". Proteomika. 2 (12): 1752–7. doi:10.1002 / 1615-9861 (200212) 2:12 <1752 :: AID-PROT1752> 3.0.CO; 2-Y. PMID 12469345.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Zhang C; Dowd DR; Staal A; et al. (2003). „Nukleární koaktivátor-62 kDa / protein interagující s lyží je koaktivátor spojený s jadernou matricí, který může spojovat transkripci zprostředkovanou receptorem vitaminu D a sestřih RNA“. J. Biol. Chem. 278 (37): 35325–36. doi:10,1074 / jbc.M305191200. PMID 12840015.
Leonard D, Ajuh P, Lamond AI, Legerski RJ (2003). „hLodestar / HuF2 interaguje s CDC5L a podílí se na sestřihu pre-mRNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01486-4. PMID 12927788.
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; et al. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA; Jedrychowski M; Schwartz D; et al. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; et al. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J; Hao T; Shaw C; et al. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Olsen JV; Blagoev B; Gnad F; et al. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM; Chu P; Elisma F; et al. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Valencia CA, Ju W, Liu R (2007). „Matrin 3 je protein vázající Ca2 + / kalmodulin štěpený kaspázami.“ Biochem. Biophys. Res. Commun. 361 (2): 281–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.06.156. PMID 17658460.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[2] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2033075-3] Belgrader P, Dey R, Berezney R (červen 1991). „Molekulární klonování matrinu 3. 125kalddaltonový protein jaderné matrice obsahuje rozsáhlou kyselou doménu“. J Biol Chem. 266 (15): 9893–9. PMID 2033075.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: MATR3 matrin 3“.

[pmid24686783-5] Johnson JO, Pioro EP, Boehringer A, Chia R, Feit H, Renton AE, Pliner HA, Abramzon Y, Marangi G, Winborn BJ, Gibbs JR, Nalls MA, Morgan S, Shoai M, Hardy J, Pittman A, Orrell RW , Malaspina A, Sidle KC, Fratta P, Harms MB, Baloh RH, Pestronk A, Weihl CC, Rogaeva E, Zinman L, Drory VE, Borghero G, Mora G, Calvo A, Rothstein JD, Drepper C, Sendtner M, Singleton AB, Taylor JP, Cookson MR, Restagno G, Sabatelli M, Bowser R, Chiò A, Traynor BJ (2014). „Mutace v genu Matrin 3 způsobují familiární amyotrofickou laterální sklerózu“. Nat. Neurosci. 17 (5): 664–6. doi:10.1038 / nn.3688. PMC 4000579. PMID 24686783.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]