MED26 - MED26
| Med26 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura řešení n-terminální domény i proteinu s-ii faktoru prodloužení transkripce myší 3 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Med26 N-terminální doména | ||||||||
| Pfam | PF08711 | ||||||||
| InterPro | IPR017923 | ||||||||
| |||||||||
| Podjednotka mediátora 26 Střední doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Med26_M | ||||||||
| Pfam | PF15694 | ||||||||
| |||||||||
| C-koncová doména mediátorové podjednotky 26 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Med26_C | ||||||||
| Pfam | PF15693 | ||||||||
| |||||||||
Mediátor transkripční podjednotky RNA polymerázy II 26 je enzym že u lidí je kódován MED26 gen.[5][6]Je součástí Komplex mediátorů.
Aktivace genové transkripce je vícestupňový proces, který je spouštěn faktory, které rozpoznávají místa zesilovače transkripce v DNA. Tyto faktory spolupracují s koaktivátory k přímé iniciaci transkripce pomocí zařízení RNA polymerázy II. Protein kódovaný tímto genem je podjednotkou komplexu CRSP (kofaktor vyžadovaný pro aktivaci SP1), který je spolu s TFIID nezbytný pro účinnou aktivaci pomocí SP1. Tento protein je také součástí dalších multisubunitových komplexů, např. proteiny spojené s receptorem hormonu štítné žlázy (TR-), které interagují s TR a usnadňují funkci TR na šablonách DNA ve spojení s iniciačními faktory a kofaktory.[6]
Aktivita
MED26 je a transkripce činitel prodloužení což zvyšuje celkově transkripce rychlost RNA polymeráza II reaktivací transkripce zatěžovací komplexy prodloužení transkripce. Dělá to prostřednictvím náboru komplexů obsahujících ELL / EAF a P-TEFb na promotory přímou interakcí s N-terminální doménou (NTD). MED26 NTD také váže TFIID a komplexy TFIID a prodloužení interagují s MED26 prostřednictvím překrývajících se vazebných míst.[7]MED26 NTD může fungovat jako molekulární přepínač přispívající k přechodu Pol II do produktivního prodloužení.
Strom strukturální domény TFIIS jsou konzervovaný z droždí na člověk. Asi 80 N-terminálu zbytky tvoří a protein interakce doména obsahující konzervovaný motiv, kterému se říká LW motiv kvůli invariantu leucin a tryptofan zbytky, které obsahuje. Ačkoli N-terminální doména není nutná pro transkripční činnost, podobná sekvence byl identifikován v jiných transkripční faktory a bílkoviny které jsou převážně jaderný lokalizováno ,:[8][9]
- MED26 (také známý jako CRSP70 a ARC70), podjednotka komplexu Mediator, která je nutná pro aktivitu proteinu Sp1 vázajícího enhancer.
- Elongin A, podjednotka transkripčního elongačního faktoru dříve známého jako SIII. Zvyšuje rychlost transkripce potlačením přechodného pozastavení prodloužení komplex.
- PPP1R10, nukleární regulační podjednotka proteinu fosfatáza 1, který byl dříve známý jako p99, FB19 nebo PNUTS.
- PIBP, malý hypotetický protein, který by mohl být a fosfoinositid vazba protein.
- IWS1, o kterém se předpokládá, že funguje v obou zahájení transkripce a prodloužení. N-terminální doména TFIIS je kompaktní svazek se čtyřmi šroubovicemi. The hydrofobní jádro zbytky šroubovice 2, 3 a 4 jsou mezi doménami TFIIS dobře zachovány spirála 1 je méně konzervovaný.[9]
Interakce
MED26 bylo prokázáno komunikovat s MED8,[10] Cyklin-dependentní kináza 8,[10] POLR2A,[10] MED12[10] a MED28.[10] Působí také synergicky a zprostředkovává interakci mezi ZBYTEK (transkripční faktor zinkového prstu typu Kruppel, který se váže na umlčovací prvek RE1 21 bp přítomný ve více než 900 lidských genech) a Mediator.[11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105085 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045248 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Ryu S, Zhou S, Ladurner AG, Tjian R (únor 1999). „Transkripční kofaktorový komplex CRSP je vyžadován pro aktivitu proteinu Sp1 vázajícího enhancer“. Příroda. 397 (6718): 446–50. doi:10.1038/17141. PMID 9989412. S2CID 4405569.
- ^ A b „Entrez Gene: pro aktivaci transkripce Sp1 je vyžadován kofaktor CRSP7, podjednotka 7, 70 kDa“.
- ^ Takahashi H, Parmely TJ, Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA, Kong SE a kol. (2011). „Lidská mediátorová podjednotka MED26 funguje jako dokovací místo pro faktory prodloužení transkripce“. Buňka. 146 (1): 92–104. doi:10.1016 / j.cell.2011.06.005. PMC 3145325. PMID 21729782.
- ^ Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (říjen 2000). "Struktura konzervované domény společné transkripčním faktorům TFIIS, elongin A a CRSP70". J. Biol. Chem. 275 (40): 31266–8. doi:10,1074 / jbc.M002595200. PMID 10811649.
- ^ A b Ling Y, Smith AJ, Morgan GT (2006). „Sekvenční motiv konzervovaný v různých jaderných proteinech identifikuje doménu proteinové interakce využívanou pro nukleární cílení lidským TFIIS“. Nucleic Acids Res. 34 (8): 2219–29. doi:10.1093 / nar / gkl239. PMC 1450333. PMID 16648364.
- ^ A b C d E Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, Banks CA, Jin J, Cai Y, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC (červen 2004). „Sada konsensuálních podjednotek savčích mediátorů identifikovaných multidimenzionální technologií identifikace proteinů“. Mol. Buňka. 14 (5): 685–91. doi:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
- ^ Ding N, Tomomori-Sato C, Sato S, Conaway RC, Conaway JW, Boyer TG (leden 2009). „MED19 a MED26 jsou synergické funkční cíle transkripčního faktoru umlčujícího RE1 při epigenetickém umlčování exprese neuronových genů“. J. Biol. Chem. 284 (5): 2648–56. doi:10,1074 / jbc.M806514200. PMC 2631966. PMID 19049968.
Další čtení
- Näär AM, Beaurang PA, Zhou S a kol. (1999). "Kompozitní koaktivátor ARC zprostředkovává transkripční aktivaci zaměřenou na chromatin". Příroda. 398 (6730): 828–32. doi:10.1038/19789. PMID 10235267. S2CID 23646963.
- Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (2000). "Struktura konzervované domény společné transkripčním faktorům TFIIS, elongin A a CRSP70". J. Biol. Chem. 275 (40): 31266–8. doi:10,1074 / jbc.M002595200. PMID 10811649.
- Näär AM, Taatjes DJ, Zhai W a kol. (2002). „Lidský CRSP interaguje s CTD RNA polymerázy II a přijímá specifickou konformaci vázanou na CTD“. Genes Dev. 16 (11): 1339–44. doi:10,1101 / gad.987602. PMC 186316. PMID 12050112.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA a kol. (2004). „Savčí homolog transkripčního koaktivátoru intersexu Drosophila melanogaster je podjednotkou savčího mediátorového komplexu“. J. Biol. Chem. 278 (50): 49671–4. doi:10.1074 / jbc.C300444200. PMID 14576168.
- Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ a kol. (2004). "Savčí podjednotka mediátoru, která sdílí vlastnosti s podjednotkou mediátoru Saccharomyces cerevisiae Cse2". J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–51. doi:10,1074 / jbc.M312523200. PMID 14638676.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Mo X, Kowenz-Leutz E, Xu H, Leutz A (2004). "Ras indukuje výměnu komplexu mediátorů na C / EBP beta". Mol. Buňka. 13 (2): 241–50. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00521-5. PMID 14759369.
- Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ a kol. (2004). „Sada konsensuálních podjednotek savčích mediátorů identifikovaných multidimenzionální technologií identifikace proteinů“. Mol. Buňka. 14 (5): 685–91. doi:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID 15175163.
- Zhang X, Krutchinsky A, Fukuda A a kol. (2005). „MED1 / TRAP220 existuje převážně v subpopulaci TRAP / Mediator obohacené RNA polymerázou II a je vyžadován pro transkripci zprostředkovanou ER“. Mol. Buňka. 19 (1): 89–100. doi:10.1016 / j.molcel.2005.05.015. PMID 15989967.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.