Lipoyl syntáza - Lipoyl synthase - Wikipedia
| Lipoyl syntáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 2.8.1.8 | ||||||||
| Číslo CAS | 189398-80-9 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Lipoylsyntáza je enzym, který patří do skupiny radikální SAM Rodina (S-adenosylmethionin). V radikální nadrodině SAM je lipoylsyntáza v podskupině enzymů, které katalyzují reakce inzerce síry. Enzymy v této rodině obsahují dva Klastry 4Fe-4S, ze kterých získají skupiny síry, které budou přeneseny na odpovídající substráty.[1] Tento konkrétní enzym se účastní metabolismu kyseliny lipoové, takže přenáší dva síry ze svého klastru 4Fe-4S na protein N6- (oktanoyl) lysin generací radikálů. Tento enzym je obvykle lokalizován v mitochondriích. Dva organismy, které byly rozsáhle studovány s ohledem na tento enzym, jsou Escherichia coli a Mycobacterium tuberculosis. Vyskytuje se také v jiných organismech, jako jsou kvasinky a rostliny.
Nomenklatura
The systematické jméno této třídy enzymů je protein N6- (oktanoyl) lysin: sirná sulfurtransferáza. Mezi další běžně používaná jména patří:
- LS,
- LipA,
- lipoát syntáza a
- protein 6-N- (oktanoyl) lysin: sirná sulfurtransferáza.
Mechanismus lipoyl syntázy
Lipoylsyntáza používá dva síry z jedné ze svých dvou klastrů [4Fe-4S] a připojuje je k 6. a 8. uhlíku proteinového substrátu N6- (oktanoyl) lysinu, aby jej přeměnila na protein N6- (lipoyl) lysin. Druhý klastr [4Fe-4S] je koordinován radikálním SAM motivem enzymu (CxxxCxxC) a podílí se na radikálním SAM charakteristické chemii k aktivaci substrátu pro následnou inzerci síry.[2] Níže je uvedena celková reakce pro tento enzym:
Celkově vzato, 3 substráty tohoto enzymu jsou protein N6- (oktanoyl) lysin, síra, a S-adenosyl-L-methionin, zatímco jeho 3 produkty jsou protein N6- (lipoyl) lysin, L-methionin, a 5'-deoxyadenosin.
Význam lipoylsyntázy
Tento enzym se účastní kyselina lipoová metabolismus, kde provádí poslední krok v biosyntéze kyseliny lipoové. Kyselina lipoová je kofaktor, který má různé funkce v různých organismech.[3] The kyselina lipoová generace v kvasinkových buňkách zvyšuje počet dělení v buňkách a chrání kvasinkové buňky před peroxidem vodíku.[4] Kyselina lipoová je důležitým kofaktorem v mnoha enzymových systémech a jedním z nich je komplex pyruvátdehydrogenázy.[5] Studie, které potlačovaly funkci lipoylsyntázy u semen Arabidopsis thaliana, ukázaly, že to nemělo nepříznivé účinky na růst a hmotnost semen, ale zkrátilo se doba generování a doba kvetení rostlin. Represe vedla k dřívějším dobám kvetení a snížila doby generování mezi semeny o téměř 10%.[6]
Možné nežádoucí účinky
Bylo zjištěno, že nadměrná exprese tohoto enzymu ve slunečnicových rostlinách nakonec oddělí jeho množství SAM přítomný v transgenních rostlinách Arabidopsis. SAM je molekula, která je vyžadována v dalších enzymatických komplexech nacházejících se v této rostlině, stejně jako v celkové struktuře rostliny, takže toto sekvestrace může způsobit snížení biosyntézy mastných kyselin v semenech Arabidopsis.[7]
Reference
- ^ McLaughlin, Martin I .; Lanz, Nicholas D .; Goldman, Peter J .; Lee, Kyung-Hoon; Booker, Squire J .; Drennan, Catherine L. (2016-08-23). „Krystalografické snímky inzerce síry lipoyl syntázou“. Sborník Národní akademie věd. 113 (34): 9446–9450. doi:10.1073 / pnas.1602486113. ISSN 0027-8424. PMC 5003258. PMID 27506792.
- ^ Jarrett, Joseph T. (2015-02-13). „Biosyntéza kofaktorů a sekundárních metabolitů obsahujících thiol a thioether katalyzovaných radikálovými S-adenosylmethioninovými enzymy“. Journal of Biological Chemistry. 290 (7): 3972–3979. doi:10.1074 / jbc.R114.599308. ISSN 0021-9258. PMC 4326807. PMID 25477512.
- ^ „InterPro“. www.ebi.ac.uk. Citováno 2020-04-20.
- ^ Croce, C. Della; Bronzetti, G .; Cini, M .; Caltavuturo, L .; Poi, G. (10. 10. 2003). "Ochranný účinek kyseliny lipoové proti peroxidu vodíku v kvasinkových buňkách". Toxikologie in vitro. Dvanáctý mezinárodní seminář o toxikologii in vitro. 17 (5): 753–759. doi:10.1016 / j.tiv.2003.06.001. ISSN 0887-2333. PMID 14599473.
- ^ "Kyselina lipoová". Institut Linuse Paulinga. 2014-04-28. Citováno 2020-04-20.
- ^ Zou, Jitao Qi, Q. Katavic, V. Marillia, Elizabeth Taylor, David (1999). „Účinky antisense represi cDNA kinázy pyruvátdehydrogenázy Arabidopsis thaliana na vývoj rostlin“. Molekulární biologie rostlin. 41 (6): 837–49. doi:10.1023 / a: 1006393726018. OCLC 672002645. PMID 10737148.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
- ^ Martins-Noguerol, Raquel; Moreno-Pérez, Antonio Javier; Sebastien, Acket; Troncoso-Ponce, Manuel Adrián; Garcés, Rafael; Thomasset, Brigitte; Salas, Joaquín J .; Martínez-Force, Enrique (2020-02-28). "Dopad exprese genů slunečnice (Helianthus annuus L.) plastidial lipoyl syntázy v glycerolipidovém složení transgenních rostlin Arabidopsis". Vědecké zprávy. 10 (1): 3749. Bibcode:2020NatSR..10,3749 mil. doi:10.1038 / s41598-020-60686-z. ISSN 2045-2322. PMC 7048873. PMID 32111914.
| Tento EC 2.8 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |