Enquatrovirus - Enquatrovirus
| Enquatrovirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Uroviricota |
| Třída: | Caudoviricetes |
| Objednat: | Caudovirales |
| Rodina: | Podoviridae |
| Rod: | Enquatrovirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Escherichia N4 | |
Enquatrovirus je rod bakteriofágy v pořadí Caudovirales, v rodině Podoviridae. Bakterie slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje pouze jeden druh v tomto rodu: druh typu Virus Escherichia N4.[1][2][3]
Virus Escherichia N4 je typový druh tohoto rodu a původně byl izolován ze stok v roce Janov, Itálie a infikuje Escherichia coli K-12. Nedávno byla izolována řada geneticky příbuzných fágů, které infikovaly Silicibacter a Sulfitobacter (DSS3ɸ2 a EE36ɸ1)[4] stejně jako řada Pseudomonas fágy (LUZ7, LIT1 a PEV2)[5]
Taxonomie
Skupina: dsDNA
- Rodina: Podoviridae
- Rod: Enquatrovirus
Struktura
Virus virion mít icosahedral (T = 9)[1] hlavy ~ 70 nm a krátké ocasy (10 nm) a obsahují krátká vlákna pocházející ze spojení mezi hlavou a ocasem. Všechny fágy tohoto rodu jsou přísně virulentní a obsahují lineární dsDNA genom (s koncovými opakováními) v rozsahu 70-75kb.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Enquatrovirus | Hlava-ocas | T = 9 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne adsorpcí do hostitelské buňky. Transkripce se šablonami DNA je metoda transkripce. Bakterie slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Enquatrovirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
RNA polymerázy
To je pozoruhodná vlastnost clade fágů je použití tří odlišných RNA polymerázy během jeho infekčního cyklu. Obří virap zapouzdřená polymeráza RNAP, která je injikována společně (časná transkripce), a heterodimerní fágová RNA polymeráza (střední oblast) a hostitelská polymeráza RNA (rozpoznává pozdní promotory).[6]
Reference
- ^ A b C d „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 1. července 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 1. července 2015.
- ^ Lavigne, R .; Seto, D .; Mahadevan, P .; Ackermann, H. W .; Kropinski, A. M. (2008). „Sjednocení klasické a molekulární taxonomické klasifikace: analýza Podoviridae pomocí nástrojů založených na BLASTP“. Výzkum v mikrobiologii. 159 (5): 406–14. doi:10.1016 / j.resmic.2008.03.005. PMID 18555669.
- ^ Zhao, Y .; Wang, K .; Jiao, N .; Chen, F. (2009). "Sekvence genomu dvou nových fágů infikujících mořské růžové znaky". Mikrobiologie prostředí. 11 (8): 2055–64. doi:10.1111 / j.1462-2920.2009.01927.x. PMC 2784036. PMID 19689706.
- ^ Ceyssens, P. J .; Brabban, A .; Rogge, L .; Lewis, M. S .; Pickard, D .; Goulding, D .; Dougan, G .; Noben, J. P .; Kropinski, A .; Kutter, E .; Lavigne, R. (2010). „Molekulární a fyziologická analýza tří fágů Pseudomonas aeruginosa patřících k„ virům podobným N4"". Virologie. 405 (1): 26–30. doi:10.1016 / j.virol.2010.06.011. PMC 3715699. PMID 20619867..
- ^ Choi, K .; McPartland, J .; Kaganman, I .; Bowman, V .; Rothmandenes, L .; Rossmann, M. (2008). „Pohled na transport DNA a proteinů ve dvouvláknových DNA virech: struktura bakteriofága N4“. Journal of Molecular Biology. 378 (3): 726–36. doi:10.1016 / j.jmb.2008.02.059. PMC 2396777. PMID 18374942.