Pásovec se opakuje - Armadillo repeat
| Reputovaná doména pásovce | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura 5armadillové domény beta-kateninu.[1] | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Paže | ||||||||
| Pfam | PF00514 | ||||||||
| Pfam klan | CL0020 | ||||||||
| InterPro | IPR000225 | ||||||||
| CHYTRÝ | SM00185 | ||||||||
| STRÁNKA | PS50176 | ||||||||
| SCOP2 | 3bct / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00020 | ||||||||
| Membranome | 350 | ||||||||
| |||||||||
An pásovec opakovat je název charakteristického, opakujícího se aminokyselina sekvence asi 40 zbytky v délce, která se nachází v mnoha bílkovinách. Proteiny, které obsahují opakování pásovce, obvykle obsahují několik tandemově opakováno kopie.[2][3] Každé opakování pásovce se skládá z dvojice alfa šroubovic, které tvoří strukturu vlásenky. Několik kopií opakovaného formuláře známého jako alfa solenoid struktura.
Mezi příklady proteinů, které obsahují opakování pásovce patří β-katenin, α-importin,[4] plakoglobin,[5] adenomatous polypóza coli (APC),[6] a mnoho dalších.
Termín pásovec pochází z historického názvu β-katenin gen v ovocné mušce Drosophila kde byl poprvé objeven opakování pásovce. Ačkoli β-katenin dříve se věřilo, že je to protein zapojený do propojení kadherin buněčné adhezní proteiny k cytoskelet, nedávná práce tomu nasvědčuje β-katenin reguluje homodimerizaci alfa-kateninu, což zase řídí větvení a sdružování.[7] Opakování pásovce se ale nachází v široké škále proteinů s jinými funkcemi. Tento typ proteinové domény je důležitý při transdukci Signály WNT v době embryonální vývoj.
Struktura
Trojrozměrný záhyb opakování pásovce byl poprvé pozorován v krystalové struktuře beta-kateninu, kde 12 tandemové opakování tvoří superhelix z alfa helixy se třemi šroubovicemi na jednotku.[1] Válcová struktura má kladně nabitou drážku, která pravděpodobně interaguje s kyselými povrchy známých interakčních partnerů beta-kateninu.[8]
Reference
- ^ A b Huber AH, Nelson WJ, Weis WI (září 1997). "Trojrozměrná struktura pásovce opakující se oblasti beta-kateninu". Buňka. 90 (5): 871–82. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80352-9. PMID 9298899. S2CID 18612343.
- ^ Peifer M, Berg S, Reynolds AB (1994). "Opakující se aminokyselinový motiv sdílený proteiny s různými buněčnými rolemi". Buňka. 76 (5): 789–91. doi:10.1016/0092-8674(94)90353-0. PMID 7907279. S2CID 26528190.
- ^ Groves MR, Barford D (1999). "Topologická charakteristika helikálních opakujících se proteinů". Aktuální názor na strukturní biologii. 9 (3): 383–9. doi:10.1016 / S0959-440X (99) 80052-9. PMID 10361086.
- ^ Herold A, Truant R, Wiegand H, Cullen BR (říjen 1998). "Určení organizace funkční domény importního alfa jaderného importního faktoru". J. Cell Biol. 143 (2): 309–18. doi:10.1083 / jcb.143.2.309. PMC 2132842. PMID 9786944.
- ^ McCrea PD, Turck CW, Gumbiner B (listopad 1991). "Homolog proteinu pásovce v Drosophila (plakoglobin) spojený s E-kadherinem". Věda. 254 (5036): 1359–61. Bibcode:1991Sci ... 254.1359M. doi:10.1126 / science.1962194. PMID 1962194.
- ^ Hirschl D, Bayer P, Müller O (březen 1996). "Sekundární struktura jediného opakování pásovce z proteinu APC". FEBS Lett. 383 (1–2): 31–6. doi:10.1016/0014-5793(96)00215-3. PMID 8612785. S2CID 36190869.
- ^ Nusse, Roel a Hans Clevers. „Signální, nemocné a vznikající terapeutické modality Wnt / β-katenin.“ Cell, sv. 169, č. 6, 1. června 2017, s. 985–999., Doi: 10.1016 / j.cell.2017.05.016.
- ^ „Pásovec (IPR000225)“. InterPro. EMBL-EBI.
externí odkazy
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů TRG_NLS_Bipartite_1
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů TRG_NLS_MonoCore_2
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů TRG_NLS_MonoExtC_3
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů TRG_NLS_MonoExtN_4
- Pásovec + doména + proteiny v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- Armadillo / plakoglobin ARM opakování v STRÁNKA
 | Tento molekulární biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |