SHANK1 - SHANK1

SHANK1
Identifikátory
Aliasy	SHANK1, SPANK-1, SSTRIP, synamon, SH3 a více domén opakujících se ankyrinů 1
Externí ID	OMIM: 604999 MGI: 3613677 HomoloGene: 22949 Genové karty: SHANK1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	50,719,450 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	44,360,572 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na somatostatinový receptor; • Vazba domény SH3; • ankyrinová opakovaná vazba; • vazba proteinu lešení; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita lešení GKAP / Homer; • identická vazba na protein; • vazba ionotropního glutamátového receptoru; • aktivita signálního komplexu signalizačního receptoru; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • postsynaptická membrána; • membrána; • dendritická páteř; • synapse; • excitační synapse; • intracelulární; • NMDA selektivní komplex glutamátového receptoru; • buněčné spojení; • dendrit; • neuronová projekce; • komplex ionotropních glutamátových receptorů; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • cytosol; • buněčná membrána; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse; • glutamátergická synapse; • neuronová páteř;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • čichové chování; • asociativní učení; • neuromuskulární proces řídící rovnováhu; • negativní regulace sestavy svazku aktinových vláken; • pozitivní regulace vývoje dendritické páteře; • vývoj nervového systému; • regulace aktivity AMPA receptoru; • morfogeneze dendritické páteře; • chování vokalizace; • chování dospělých; • dlouhodobá paměť; • zrání synapsí; • pozitivní regulace excitačního postsynaptického potenciálu; • chování sociálního organismu; • návyk; • stanovení afektu; • vzpřímený reflex; • lokalizace proteinu na synapse; • sestava makromolekulárního komplexu; • organizace postsynapse; • sestava synapse; • morfogeneze mozku; • synaptický růst na neuromuskulárním spojení; • pozitivní regulace synaptického přenosu, glutamatergická; • dlouhodobá synaptická potenciace; • sestava postsynaptické hustoty;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	50944
	243961
	ENSG00000161681
	ENSMUSG00000038738
	Q9Y566
	D3YZU1
	NM_016148
	NM_001034115
	NP_057232
	NP_001029287
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

SH3 a protein s více doménami opakujících se ankyrinů 1 je protein že u lidí je kódován SHANK1 gen.^[5]^[6]

Interakce

SHANK1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161681 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038738 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Zitzer H, Hönck HH, Bächner D, Richter D, Kreienkamp HJ (leden 2000). „Protein interagující s receptorem somatostatinu definuje novou rodinu vícedoménových proteinů přítomných v mozku člověka a hlodavců“. J Biol Chem. 274 (46): 32997–3001. doi:10.1074 / jbc.274.46.32997. PMID 10551867.
^ „Entrez Gene: SHANK1 SH3 a více domén opakujících se ankyrinů 1“.
^ Park E, Na M, Choi J, Kim S, Lee JR, Yoon J, Park D, Sheng M, Kim E (květen 2003). „Rodina Shankových proteinů postsynaptické hustoty interaguje s a podporuje synaptickou akumulaci beta PIX guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rac1 a Cdc42“. J. Biol. Chem. 278 (21): 19220–9. doi:10,1074 / jbc.M301052200. PMID 12626503.
^ Soltau M, Richter D, Kreienkamp HJ (prosinec 2002). „Substrát inzulínového receptoru IRSp53 spojuje postsynaptickou stopku s malým G-proteinem cdc42“. Mol. Buňka. Neurosci. 21 (4): 575–83. doi:10.1006 / mcne.2002.1201. PMID 12504591. S2CID 572407.
^ Okamoto PM, Gamby C, Wells D, Fallon J, Vallee RB (prosinec 2001). „Interakce specifická pro isoformu dynaminu s proteiny lešení shank / ProSAP postsynaptické hustoty a aktinového cytoskeletu“. J. Biol. Chem. 276 (51): 48458–65. doi:10,1074 / jbc.M104927200. PMC 2715172. PMID 11583995.
^ Böckers TM, Mameza MG, Kreutz MR, Bockmann J, Weise C, Buck F, Richter D, Gundelfinger ED, Kreienkamp HJ (říjen 2001). „Synaptické proteiny lešení v mozku krysy. Ankyrinová opakování rodiny proteinů Shank s více doménami interagují s cytoskeletálním proteinem alfa-fodrinem“. J. Biol. Chem. 276 (43): 40104–12. doi:10,1074 / jbc.M102454200. PMID 11509555.

Další čtení

Sheng M, Kim E (2000). "Shank rodina lešenových proteinů". J. Cell Sci. 113 (11): 1851–6. PMID 10806096.
Naisbitt S, Kim E, Tu JC, Xiao B, Sala C, Valtschanoff J, Weinberg RJ, Worley PF, Sheng M (1999). „Shank, nová rodina proteinů postsynaptické hustoty, která se váže na komplex NMDA receptor / PSD-95 / GKAP a cortactin“. Neuron. 23 (3): 569–82. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80809-0. PMID 10433268. S2CID 2209372.
Tu JC, Xiao B, Naisbitt S, Yuan JP, Petralia RS, Brakeman P, Doan A, Aakalu VK, Lanahan AA, Sheng M, Worley PF (1999). „Vazba komplexů mGluR / Homer a PSD-95 rodinou Shank z proteinů postsynaptické hustoty“. Neuron. 23 (3): 583–92. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80810-7. PMID 10433269. S2CID 16429070.
Tobaben S, Südhof TC, Stahl B (2000). „Receptor CL1 spřažený s G proteinem interaguje přímo s proteiny Shankovy rodiny“. J. Biol. Chem. 275 (46): 36204–10. doi:10,1074 / jbc.M006448200. PMID 10958799.
Kreienkamp HJ, Zitzer H, Gundelfinger ED, Richter D, Bockers TM (2000). „Receptor alfa-latrotoxinu nezávislý na vápníku z mozků člověka a hlodavců interaguje s členy vícedoménových proteinů rodiny ProSAP / SSTRIP / Shank“. J. Biol. Chem. 275 (42): 32387–90. doi:10,1074 / jbc.C000490200. PMID 10964907.
Kreienkamp HJ, Zitzer H, Richter D (2001). "Identifikace proteinů interagujících s krysím somatostatinovým receptorem podtypu 2". J. Physiol. Paříž. 94 (3–4): 193–8. doi:10.1016 / S0928-4257 (00) 00204-7. PMID 11087996. S2CID 8791865.
Lim S, Sala C, Yoon J, Park S, Kuroda S, Sheng M, Kim E (2001). „Sharpin, nový protein postsynaptické hustoty, který přímo interaguje s rodinou proteinů stopek“. Mol. Buňka. Neurosci. 17 (2): 385–97. doi:10,1006 / mcne.2000.0940. PMID 11178875. S2CID 45278068.
Böckers TM, Mameza MG, Kreutz MR, Bockmann J, Weise C, Buck F, Richter D, Gundelfinger ED, Kreienkamp HJ (2001). „Synaptické proteiny lešení v mozku krysy. Ankyrinová opakování rodiny proteinů Shank s více doménami interagují s cytoskeletálním proteinem alfa-fodrinem“. J. Biol. Chem. 276 (43): 40104–12. doi:10,1074 / jbc.M102454200. PMID 11509555.
Okamoto PM, Gamby C, Wells D, Fallon J, Vallee RB (2002). „Interakce specifická pro isoformu dynaminu s proteiny lešení shank / ProSAP postsynaptické hustoty a aktinového cytoskeletu“. J. Biol. Chem. 276 (51): 48458–65. doi:10,1074 / jbc.M104927200. PMC 2715172. PMID 11583995.
Soltau M, Richter D, Kreienkamp HJ (2003). „Substrát inzulínového receptoru IRSp53 spojuje postsynaptickou stopku s malým G-proteinem cdc42“. Mol. Buňka. Neurosci. 21 (4): 575–83. doi:10.1006 / mcne.2002.1201. PMID 12504591. S2CID 572407.
Park E, Na M, Choi J, Kim S, Lee JR, Yoon J, Park D, Sheng M, Kim E (2003). „Rodina Shankových proteinů postsynaptické hustoty interaguje s a podporuje synaptickou akumulaci beta PIX guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rac1 a Cdc42“. J. Biol. Chem. 278 (21): 19220–9. doi:10,1074 / jbc.M301052200. PMID 12626503.
Daigo Y, Takayama I, Ward SM, Sanders KM, Fujino MA (2004). "Nové lidské a myší geny kódující protein interagující se stopkou a jeho upregulace v žaludečním fundusu W / WV myši". J. Gastroenterol. Hepatol. 18 (6): 712–8. doi:10.1046 / j.1440-1746.2003.03046.x. PMID 12753155. S2CID 38146288.
Im YJ, Lee JH, Park SH, Park SJ, Rho SH, Kang GB, Kim E, Eom SH (2004). „Krystalová struktura komplexu Shank PDZ-ligand odhaluje interakci PDZ třídy I a novou dimerizaci PDZ-PDZ“. J. Biol. Chem. 278 (48): 48099–104. doi:10,1074 / jbc.M306919200. PMID 12954649.
Suzuki T, Li W, Zhang JP, Tian QB, Sakagami H, Usuda N, Usada N, Kondo H, Fujii T, Endo S (2005). „Nový protein ze skeletu, TANC, pravděpodobně krysí homolog Drosophila roll pebbles (rols), tvoří multiproteinový komplex s různými proteiny postsynaptické hustoty“. Eur. J. Neurosci. 21 (2): 339–50. doi:10.1111 / j.1460-9568.2005.03856.x. PMID 15673434. S2CID 28773407.
Fieulaine S, Juillan-Binard C, Serero A, Dardel F, Giglione C, Meinnel T, Ferrer JL (2006). „Krystalová struktura mitochondriální (typ 1A) peptidové deformylázy poskytuje jasné pokyny pro konstrukci inhibitorů specifických pro bakteriální formy.“. J. Biol. Chem. 280 (51): 42315–24. doi:10,1074 / jbc.M507155200. PMID 16192279.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000161681 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038738 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10551867-5] A ^b Zitzer H, Hönck HH, Bächner D, Richter D, Kreienkamp HJ (leden 2000). „Protein interagující s receptorem somatostatinu definuje novou rodinu vícedoménových proteinů přítomných v mozku člověka a hlodavců“. J Biol Chem. 274 (46): 32997–3001. doi:10.1074 / jbc.274.46.32997. PMID 10551867.

[entrez-6] „Entrez Gene: SHANK1 SH3 a více domén opakujících se ankyrinů 1“.

[pmid12626503-7] Park E, Na M, Choi J, Kim S, Lee JR, Yoon J, Park D, Sheng M, Kim E (květen 2003). „Rodina Shankových proteinů postsynaptické hustoty interaguje s a podporuje synaptickou akumulaci beta PIX guaninového nukleotidového výměnného faktoru pro Rac1 a Cdc42“. J. Biol. Chem. 278 (21): 19220–9. doi:10,1074 / jbc.M301052200. PMID 12626503.

[pmid12504591-8] Soltau M, Richter D, Kreienkamp HJ (prosinec 2002). „Substrát inzulínového receptoru IRSp53 spojuje postsynaptickou stopku s malým G-proteinem cdc42“. Mol. Buňka. Neurosci. 21 (4): 575–83. doi:10.1006 / mcne.2002.1201. PMID 12504591. S2CID 572407.

[pmid11583995-9] Okamoto PM, Gamby C, Wells D, Fallon J, Vallee RB (prosinec 2001). „Interakce specifická pro isoformu dynaminu s proteiny lešení shank / ProSAP postsynaptické hustoty a aktinového cytoskeletu“. J. Biol. Chem. 276 (51): 48458–65. doi:10,1074 / jbc.M104927200. PMC 2715172. PMID 11583995.

[pmid11509555-10] Böckers TM, Mameza MG, Kreutz MR, Bockmann J, Weise C, Buck F, Richter D, Gundelfinger ED, Kreienkamp HJ (říjen 2001). „Synaptické proteiny lešení v mozku krysy. Ankyrinová opakování rodiny proteinů Shank s více doménami interagují s cytoskeletálním proteinem alfa-fodrinem“. J. Biol. Chem. 276 (43): 40104–12. doi:10,1074 / jbc.M102454200. PMID 11509555.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]