PLXNB2 - PLXNB2

PLXNB2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4E71
Identifikátory
Aliasy	PLXNB2, MM1, Nbla00445, PLEXB2, dJ402G11.3, plexin B2
Externí ID	OMIM: 604293 MGI: 2154239 HomoloGene: 66630 Genové karty: PLXNB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	50,307,646 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	89,180,788 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita receptoru semaforinu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • povrch buňky; • extracelulární exosom; • integrální součást plazmatické membrány; • komplex semaforinového receptoru;
Biologický proces	• regulace fosforylace bílkovin; • negativní regulace buněčné adheze; • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 regulace aktivity GTPázy; • pozitivní regulace axonogeneze; • vývoj mnohobuněčných organismů; • uzavření neurální trubice; • vývoj mozku; • regulace tvaru buňky; • proliferace neuroblastů; • regulace migrace neuronů; • semaforin-plexinová signální dráha; • signální transdukce; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů; • homofilní buněčná adheze prostřednictvím molekul adheze na plazmatické membráně; • regulace buněčné migrace; • semaforin-plexinová signální dráha zapojená do vedení axonů; • sestava excitační synapse;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23654
	140570
	ENSG00000196576
	ENSMUSG00000036606
	O15031
	B2RXS4
	NM_012401
	NM_001159521; NM_001284506; NM_138749
NP_036533; NP_001363793; NP_001363794; NP_001363795; NP_001363796;
	NP_001363797; NP_001363798; NP_001363799; NP_001363800; NP_001363801; NP_001363802; NP_001363803; NP_001363804; NP_001363805; NP_001363806; NP_001363807; NP_001363808; NP_001363809; NP_001363810; NP_001363811; NP_001363812; NP_001363813; NP_001363814; NP_001363815
	NP_001152993; NP_001271435; NP_620088
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Plexin-B2 je protein že u lidí je kódován PLXNB2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Členy třídy B plexinů, jako je PLXNB2, jsou transmembránové receptory, které se účastní vedení axonů a migrace buněk v reakci na semaforiny (Perrot et al. (2002)). [Dodáváno společností OMIM]^[7]

Interakce

PLXNB2 bylo prokázáno komunikovat s 11. ARHGEF.^[6]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196576 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036606 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tamagnone L, Artigiani S, Chen H, He Z, Ming GI, Song H, Chedotal A, Winberg ML, Goodman CS, Poo M, Tessier-Lavigne M, Comoglio PM (říjen 1999). „Plexiny jsou velkou rodinou receptorů pro transmembránové, vylučované a GPI ukotvené semaforiny u obratlovců“. Buňka. 99 (1): 71–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID 10520995.
^ ^A ^b Perrot V, Vazquez-Prado J, Gutkind JS (listopad 2002). „Plexin B reguluje Rho prostřednictvím guaninových nukleotidových výměnných faktorů leukemií asociovaných Rho GEF (LARG) a PDZ-RhoGEF“. J Biol Chem. 277 (45): 43115–20. doi:10,1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PLXNB2 plexin B2“.
^ Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (červenec 2002). „Plexin-B1 přímo interaguje s PDZ-RhoGEF / LARG k regulaci morfologie RhoA a růstového kužele“. Neuron. 35 (1): 51–63. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID 12123608.

Další čtení

Shinoura N, Shamraj OI, Hugenholz H, Zhu JG, McBlack P, Warnick R, Tew JJ, Wani MA, Menon AG (1995). "Identifikace a částečná sekvence cDNA, která je odlišně exprimována v lidských mozkových nádorech". Cancer Lett. 89 (2): 215–21. doi:10.1016 / 0304-3835 (95) 03690-X. PMID 7889532.
Trofatter JA, Long KR, Murrell JR, Stotler CJ, Gusella JF, Buckler AJ (1996). „Expresně nezávislý katalog genů z lidského chromozomu 22“. Genome Res. 5 (3): 214–24. doi:10,1101 / gr. 5.3.214. PMID 8593609.
Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Artigiani S, Barberis D, Fazzari P, Longati P, Angelini P, van de Loo JW, Comoglio PM, Tamagnone L (2003). "Funkční regulace semaforinových receptorů proproteinovými konvertázami". J. Biol. Chem. 278 (12): 10094–101. doi:10,1074 / jbc.M210156200. PMID 12533544.
Oinuma I, Katoh H, Harada A, Negishi M (2003). „Přímá interakce Rnd1 s plexinem-B1 reguluje aktivaci Rho zprostředkovanou PDZ-RhoGEF pomocí plexinu-B1 a indukuje kontrakci buněk v buňkách COS-7“. J. Biol. Chem. 278 (28): 25671–7. doi:10,1074 / jbc.M303047200. PMID 12730235.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
Conrotto P, Corso S, Gamberini S, Comoglio PM, Giordano S (2004). „Souhra mezi receptory rozptylového faktoru a plexiny B řídí invazivní růst“. Onkogen. 23 (30): 5131–7. doi:10.1038 / sj.onc.1207650. PMID 15184888.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.

Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196576 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036606 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10520995-5] Tamagnone L, Artigiani S, Chen H, He Z, Ming GI, Song H, Chedotal A, Winberg ML, Goodman CS, Poo M, Tessier-Lavigne M, Comoglio PM (říjen 1999). „Plexiny jsou velkou rodinou receptorů pro transmembránové, vylučované a GPI ukotvené semaforiny u obratlovců“. Buňka. 99 (1): 71–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID 10520995.

[pmid12183458-6] A ^b Perrot V, Vazquez-Prado J, Gutkind JS (listopad 2002). „Plexin B reguluje Rho prostřednictvím guaninových nukleotidových výměnných faktorů leukemií asociovaných Rho GEF (LARG) a PDZ-RhoGEF“. J Biol Chem. 277 (45): 43115–20. doi:10,1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: PLXNB2 plexin B2“.

[pmid12123608-8] Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (červenec 2002). „Plexin-B1 přímo interaguje s PDZ-RhoGEF / LARG k regulaci morfologie RhoA a růstového kužele“. Neuron. 35 (1): 51–63. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID 12123608.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]