SERAC1 - SERAC1 - Wikipedia

SERAC1
Identifikátory
AliasySERAC1, serinové aktivní místo obsahující 1
Externí IDOMIM: 614725 MGI: 2447813 HomoloGene: 41900 Genové karty: SERAC1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 6 (lidský)
Chr.Chromozom 6 (lidský)[1]
Chromozom 6 (lidský)
Genomické umístění pro SERAC1
Genomické umístění pro SERAC1
Kapela6q25.3Start158,109,519 bp[1]
Konec158,168,280 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

84947

321007

Ensembl

ENSG00000122335

ENSMUSG00000015659

UniProt

Q96JX3

Q3U213

RefSeq (mRNA)

NM_032861

NM_001033127
NM_001111017
NM_177311
NM_001360148

RefSeq (protein)

NP_116250

NP_001104487
NP_796285
NP_001347077

Místo (UCSC)Chr 6: 158,11 - 158,17 MbChr 17: 6,04 - 6,08 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Serinový protein obsahující aktivní místo 1nebo Protein SERAC1 je protein u lidí, který je kódován SERAC1 gen.[5][6][7] Protein kódovaný tímto genem je a fosfatidylglycerol remodelační protein nalezený na rozhraní mitochondrie a endoplazmatická síťka, kde zprostředkovává fosfolipid výměna. Kódovaný protein hraje hlavní roli v mitochondriální funkce a intracelulární cholesterol obchodování. Vady tohoto genu jsou příčinou 3-methylglutakonová acidurie s hluchotou, encefalopatie a Leighův syndrom (MEGDEL). Dva varianty přepisu, jeden kódující protein a druhý neproteinový kódující, byly nalezeny pro tento gen.[5]

Struktura

The SERAC1 gen se nachází na q rameno z chromozom 6 na pozici 25,3 a pokrývá 58 776 párů bází.[5] The SERAC1 Gen produkuje 18,7 kDa protein složený z 162 aminokyseliny.[8][9] Struktura kódovaného proteinu obsahuje a C-terminál serin -lipáza /esteráza doména obsahující konsenzus lipáza motiv GxSxG a N-terminál sekvence signálu.[10]

Funkce

The SERAC1 gen kóduje a protein nezbytné pro fosfatidylglycerol předělávání. fosfatidylglycerol remodelace je proces změny nebo přestavby konkrétního fosfolipid volala fosfatidylglycerol. Fosfatidylglycerol pomáhá dělat kardiolipin, důležitá složka, která obklopuje Vnitřní mitochondriální membrána. Kardiolipin je zodpovědný za přeměnu energie získané z potravy na buněčně použitelnou formu a potřebnou pro správnou mitochondriální funkci. Kvůli kardiolipin, proces přestavby fosfatidylglycerol je nezbytný pro mitochondriální funkci a intracelulární obchodování s cholesterolem.[11][6][7]

Navíc je SERAC1 zapojen do pohybu cholesterol, což jsou mastné, voskovité látky v buňkách. Cholesterol je součástí buněčné struktury a produkuje hormony a zažívací kyseliny. Protein může být také zapojen do transacylační-acylační reakce k výrobě fosfatidylglycerol -36: 1 a bis (monoacylglycerol ) fosfátová biosyntetická cesta.[11][6][7]

Klinický význam

Mutace v SERAC1 Gen genu byl spojen s poškozením mitochondriální funkce i intracelulárního cholesterol obchodování.[10] Tyto mutace byly většinou spojovány a Leighův syndrom a 3-methylglutakonová acidurie s hluchotou, encefalopatií a Leighovým syndromem, známý jako MEGDEL syndrom.[12]

MEGDEL syndrom

SERAC1 mutace byly silně spojeny se syndromem MGDEL. Syndrom MGDEL (3-methylglutakonová acidurie s hluchotou, encefalopatií a Leigh-like syndromem) je autozomálně recesivní porucha charakterizovaný nástupem opožděného psychomotorického vývoje nebo psychomotorické regrese v dětství, senzorineurální hluchota, spasticita nebo dystonie a zvýšené vylučování Kyselina 3-methylglutakonová. Zobrazování mozku intelektuální a mozeček atrofie stejně jako léze v bazální ganglia připomínající Leighův syndrom. Laboratorní studie ukazují zvýšené sérum laktát a alanin, mitochondriální oxidační fosforylace vady, abnormální mitochondrie neobvyklé fosfatidylglycerol a kardiolipin profily v fibroblasty a abnormální akumulace neesterifikovaných cholesterol uvnitř buněk.[7][6]

The SERAC1 genové mutace, které způsobují tento stav, snižují množství produkovaného proteinu SERAC1 nebo vedou k produkci proteinu s malou nebo žádnou funkcí. Jako výsledek, fosfatidylglycerol přestavba je narušena, což pravděpodobně mění složení kardiolipin. Vědci spekulují, že abnormální kardiolipin ovlivňuje mitochondriální funkci, snižuje produkci buněčné energie a vede k neurologickým a sluchovým problémům charakteristickým pro MEGDEL syndrom. Není jasné, jak mutace genu SERAC1 vedou k abnormálnímu uvolňování Kyselina 3-methylglutakonová v moči.[11][5]

Mutace c.202C> T v tomto genu byla nalezena u pacienta trpícího 3-methylglutakonová acidurie a související příznaky.[13] Dva pacienti s homozygotními G> C transverzemi v SERAC1 Bylo zjištěno, že tento gen vykazuje příznaky syndromu MEGDEL s hluchota, encefalopatie a Leighův syndrom.[10] Další pacient s homozygotem 4 základní pár delece (1167delTCAG) vykazovala příznaky opakujících se infekcí, selhání prosperovat, mentální retardace, spasticita a extrapyramidové příznaky.[14]

Leighův syndrom

Leighův syndrom je progresivní neurodegenerativní porucha charakterizována přítomností ohniskových, bilaterálních léze v jedné nebo více oblastech centrální nervový systém včetně mozkový kmen thalamus, bazální ganglia, mozeček a mícha. Klinické příznaky závisí na oblastech centrálního nervového systému a zahrnují subakutní nástup psychomotorická retardace, hypotonie, ataxie, svalová slabost, ztráta zraku, abnormality pohybu očí, záchvaty, a dysfagie.[15]

Interakce

Ukázalo se, že SERAC1 má Interakce protein-protein s následujícími.[16][6]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000122335 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015659 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C d "Entrez Gene: serinový aktivní web obsahující 1". Citováno 2012-07-24. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  6. ^ A b C d E „Protein SERAC1“. Citováno 2018-08-27. Tento článek zahrnuje text k dispozici pod CC BY 4.0 licence.
  7. ^ A b C d „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  9. ^ „Protein SERAC1“. Znalostní databáze Atlas srdečních organelárních proteinů (COPaKB).
  10. ^ A b C Wortmann SB, Vaz FM, Gardeitchik T, Vissers LE, Renkema GH, Schuurs-Hoeijmakers JH, Kulik W, Lammens M, Christin C, Kluijtmans LA, Rodenburg RJ, Nijtmans LG, Grünewald A, Klein C, Gerhold JM, Kozicz T, van Hasselt PM, Harakalova M, Kloosterman W, Barić I, Pronicka E, Ucar SK, Naess K, Singhal KK, Krumina Z, Gilissen C, van Bokhoven H, Veltman JA, Smeitink JA, Lefeber DJ, Spelbrink JN, Wevers RA, Morava E, de Brouwer AP (červen 2012). „Mutace v genu pro remodelaci fosfolipidů SERAC1 zhoršují mitochondriální funkci a intracelulární obchodování s cholesterolem a způsobují dystonii a hluchotu“. Genetika přírody. 44 (7): 797–802. doi:10,1038 / ng.2325. PMID  22683713. S2CID  2447771.
  11. ^ A b C „SERAC1“. Genetická domácí reference. NCBI. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  12. ^ Lumish HS, Yang Y, Xia F, Wilson A, Chung WK ​​(2014). „Rozšiřující se fenotyp MEGDEL: optická nervová atrofie, mikrocefalie a myoklonická epilepsie u dítěte s mutacemi SERAC1“. Zprávy JIMD. 16: 75–9. doi:10.1007/8904_2014_322. ISBN  978-3-662-44586-0. PMC  4221303. PMID  24997715.
  13. ^ Tort F, García-Silva MT, Ferrer-Cortès X, Navarro-Sastre A, Garcia-Villoria J, Coll MJ, Vidal E, Jiménez-Almazán J, Dopazo J, Briones P, Elpeleg O, Ribes A (2013). „Exome sekvenování identifikuje novou mutaci v SERAC1 u pacienta s 3-methylglutakonovou acidurií“. Molekulární genetika a metabolismus. 110 (1–2): 73–7. doi:10.1016 / j.ymgme.2013.04.021. PMID  23707711.
  14. ^ Wortmann S, Rodenburg RJ, Huizing M, Loupatty FJ, de Koning T, Kluijtmans LA, Engelke U, Wevers R, Smeitink JA, Morava E (květen 2006). „Sdružení 3-methylglutakonové acidurie se senzoricko-neurální hluchotou, encefalopatií a Leigh-like syndromem (asociace MEGDEL) u čtyř pacientů s poruchou oxidační fosforylace“. Molekulární genetika a metabolismus. 88 (1): 47–52. doi:10.1016 / j.ymgme.2006.01.013. PMID  16527507.
  15. ^ "Leighův syndrom". www.uniprot.org.
  16. ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I, Sasarman F, Weraarpachai W, Shoubridge EA, Warscheid B, Rehling P (prosinec 2012). „MITRAC spojuje translokaci mitochondriálních proteinů se sestavením dýchacího řetězce a translační regulací“. Buňka. 151 (7): 1528–41. doi:10.1016 / j.cell.2012.11.053. PMID  23260140.


Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.