Cenová rovnice - Price equation
V teorii vývoj a přírodní výběr, Cenová rovnice (také známý jako Cenová rovnice nebo Priceova věta) popisuje, jak se vlastnost nebo alela změny frekvence v průběhu času. Rovnice používá a kovariance mezi vlastností a zdatností, poskytnout matematický popis evoluce a přirozeného výběru. Poskytuje způsob, jak porozumět účinkům genového přenosu a přirozeného výběru na frekvenci alel v každé nové generaci populace. Cenová rovnice byla odvozena od George R. Price, pracuje v Londýně, aby se odvodil W. D. Hamilton pracuje na příbuzný výběr. Příklady cenové rovnice byly konstruovány pro různé evoluční případy. Cenová rovnice má také aplikace v ekonomika.[1]
Je důležité si uvědomit, že cenová rovnice není fyzikálním ani biologickým zákonem. Není to stručné ani obecné vyjádření experimentálně ověřených výsledků. Jedná se spíše o čistě matematický vztah mezi různými statistickými deskriptory populační dynamiky. Je matematicky platný, a proto nepodléhá experimentálnímu ověření. Jednoduše řečeno, jde o matematické přepracování výrazu „přežití nejschopnějších“, které je ve skutečnosti samozřejmé vzhledem k matematickým definicím „přežití“ a „nejschopnější“.
Prohlášení

Cenová rovnice ukazuje změnu průměrné částky znaku v populaci z jedné generace na druhou () je určen kovariance mezi částkami znaku pro subpopulaci a fitness subpopulací, spolu s očekávanou změnou ve výši hodnoty zvláštnosti kvůli kondici, a to :
Tady je průměrná zdatnost v populaci a a představují průměr populace a kovarianci. 'Zdatnost' je poměr průměrného počtu potomků pro celou populaci k počtu dospělých jedinců v populaci a je stejný poměr pouze pro subpopulaci .
Kovarianční výraz zachycuje účinky přirozeného výběru; pokud kovariance mezi fitness () a hodnota vlastnosti () je pozitivní, pak se předpokládá, že se hodnota vlastnosti v průměru zvýší nad populací . Pokud je kovariance záporná, pak je vlastnost škodlivá a předpokládá se, že sníží frekvenci.
Druhý termín, , představuje jiné faktory než přímý výběr, které mohou ovlivnit vývoj vlastností. Tento termín může zahrnovat genetický drift, mutace zkreslení nebo meiotický pohon. Tento výraz může dále zahrnovat účinky víceúrovňového výběru nebo výběr skupiny.
Price (1972) to označoval jako výraz „změna prostředí“ a oba výrazy označil pomocí parciální derivační notace (NS a ∂ES). Tento koncept životního prostředí zahrnuje mezidruhové a ekologické účinky. Cena to popisuje takto:
Fisher přijal poněkud neobvyklý úhel pohledu na dominanci a epistázi jako na účinky prostředí. Například píše (1941): „Změna podílu kteréhokoli páru genů sama o sobě představuje změnu prostředí, ve kterém se jednotlivci druhu nacházejí.“ Proto považoval účinek přirozeného výběru na M jako omezený na aditivní nebo lineární účinky změn frekvencí genů, zatímco vše ostatní - dominanci, epistázi, populační tlak, klima a interakce s jinými druhy - považoval za záležitost životního prostředí.
— GR. Cena (1972), Vysvětlila Fisherova základní věta[2]
Důkaz
Předpokládejme, že tam je populace jednotlivci, u nichž se množství určité vlastnosti liší. Ty jednotlivce lze seskupit podle množství charakteristiky, kterou každý zobrazuje. Může jich být jen jedna skupina jednotlivci (skládající se z jediné sdílené hodnoty charakteristiky) a tolik jako skupiny po jednom jednotlivci (skládající se z odlišné hodnoty charakteristiky). Indexujte každou skupinu pomocí takže počet členů ve skupině je a hodnota charakteristiky sdílené mezi všemi členy skupiny je . Nyní předpokládejme, že mít charakteristiky je spojena s a zdatnost kde je produkt představuje počet potomků v příští generaci. Označte tento počet potomků ze skupiny podle aby . Nechat být průměrný množství charakteristiky zobrazené potomkem ze skupiny . Označte míru změny charakteristiky ve skupině podle definován
Nyní vezměte být průměrnou charakteristickou hodnotou v této populaci a být průměrnou charakteristickou hodnotou v příští generaci. Změnu průměrné charakteristiky definujte pomocí . To znamená,
Všimněte si, že to je ne průměrná hodnota (jak je možné, že ). Také vezměte být průměrnou zdatností této populace. Cenová rovnice uvádí:
kde funkce a jsou definovány v rovnicích (1) a (2) níže a jsou ekvivalentní k tradičním definicím průměr vzorku a kovariance; nejsou však míněny jako statistické odhady charakteristik populace. Cenová rovnice je zejména deterministická rozdílová rovnice který modeluje trajektorii skutečné střední hodnoty charakteristiky podél toku skutečné populace jednotlivců. Za předpokladu, že průměrná kondice není nula, je často užitečné psát jako
V konkrétním případě tato vlastnost (tj. samotná zdatnost je charakteristikou zájmu), pak přeformuluje Priceova rovnice Fisherova základní věta o přirozeném výběru.
K prokázání cenové rovnice jsou zapotřebí následující definice. Li je počet výskytů dvojice reálných čísel a , pak:
- Průměr z hodnoty je:
- Kovariance mezi a hodnoty je:
Zápis bude také použit, když je to pohodlné.
Předpokládejme, že existuje populace organismů, z nichž všechny mají genetickou charakteristiku popsanou nějakým reálným počtem. Například vysoké hodnoty čísla představují zvýšenou zrakovou ostrost nad jiným organismem s nižší hodnotou charakteristiky. V populaci lze definovat skupiny, které se vyznačují stejnou hodnotou charakteristiky. Nechte dolní index identifikujte skupinu s charakteristikou a nechte být počet organismů v této skupině. Celkový počet organismů je tedy kde:
Průměrná hodnota charakteristiky je definován jako:
Nyní předpokládejme, že populace se množí a počet jednotlivců ve skupině v příští generaci představuje . Takzvaný zdatnost skupiny je definován jako poměr počtu jejích jedinců v příští generaci k počtu jejích jedinců v předchozí generaci. To znamená,
Tedy říkat, že skupina má „vyšší kondici“, se rovná tomu, že její členové produkují více potomků na jednotlivce v příští generaci. Podobně, představuje celkový počet jednotlivců ve všech skupinách, který lze vyjádřit jako:
Dále lze průměrnou zdatnost populace ukázat jako rychlost růstu populace jako celku, jako v:
Přestože celková populace může růst, podíl jednotlivců z určité skupiny se může změnit. Zejména pokud má jedna skupina vyšší kondici než jiná skupina, pak bude mít skupina s vyšší kondicí větší nárůst zastoupení v příští generaci než skupina s nižší kondicí. Průměrná zdatnost představuje růst populace a skupiny s nadprůměrnou zdatností budou mít tendenci úměrně klesat, zatímco skupiny s nadprůměrnou zdatností budou úměrně narůstat.
Spolu s tím, jak se v průběhu času mění podíl jednotlivců v každé skupině, se hodnoty vlastností v jedné skupině mohou u jednotlivých generací mírně lišit (např. mutace ). Tyto dva tlaky společně způsobí, že se průměrná hodnota charakteristiky v celé populaci v průběhu času změní. Za předpokladu hodnoty se u všech členů původní skupiny změnil přesně o stejnou částku, v nové generaci skupiny průměrná hodnota charakteristiky je:
kde jsou (případně nové) hodnoty charakteristiky ve skupině . Rovnice (2) ukazuje, že:
Zavolejte změnu charakteristické hodnoty z populace rodičů na děti aby . Jak je vidět v rovnici (1), operátor očekávané hodnoty je lineární, tak
Kombinace rovnic (7) a (8) vede k
Pojďme nyní spočítat první člen ve výše uvedené rovnosti. Z rovnice (1) víme, že:
Nahrazení definice fitness, (Rovnice (4)), dostaneme:
Dále nahrazením definic průměrné kondice () z rovnice (5) a průměrné charakteristiky dítěte () z rovnice (6) dává cenovou rovnici:
Odvození cenové rovnice spojitého času
Zvažte skupinu skupin s které se vyznačují zvláštním znakem označeným . Číslo jednotlivců patřících do skupiny zažívá exponenciální růst:
který je také známý jako rovnice replikátoru. Nyní si všimněte, že:
Jednoduchá cenová rovnice
Když jsou charakteristické hodnoty neměňte z nadřazené na podřízenou generaci, druhý člen v cenové rovnici bude nulový, což povede ke zjednodušené verzi cenové rovnice:
které lze přepracovat jako:
kde je zlomková způsobilost: .
Tuto jednoduchou cenovou rovnici lze prokázat pomocí definice v rovnici (2) výše. Dává toto základní prohlášení o evoluci: „Pokud je určitá dědičná vlastnost korelována se zvýšením frakční zdatnosti, průměrná hodnota této charakteristiky v dětské populaci se zvýší nad hodnotu v rodičovské populaci.“
Aplikace
Cenová rovnice může popsat jakýkoli systém, který se časem mění, ale nejčastěji se používá v evoluční biologii. The vývoj zraku poskytuje příklad jednoduchého směrového výběru. The vývoj srpkovité anémie ukazuje, jak a výhoda heterozygotů může ovlivnit vývoj vlastností. Cenovou rovnici lze také použít na rysy závislé na populaci, jako je vývoj poměr pohlaví. Cenová rovnice je navíc dostatečně flexibilní k modelování vlastností druhého řádu, jako je vývoj proměnlivosti. Cenová rovnice také poskytuje rozšíření Founderova efektu, který ukazuje změnu populačních vlastností v různých osadách
Dynamická dostatečnost a jednoduchá cenová rovnice
Použitý genetický model někdy kóduje dostatek informací do parametrů použitých cenovou rovnicí, aby bylo možné vypočítat parametry pro všechny následující generace. Tato vlastnost se označuje jako dynamická dostatečnost. Pro zjednodušení se následující část zabývá dynamickou dostatečností jednoduché cenové rovnice, ale platí také pro celou cenovou rovnici.
S odkazem na definici v rovnici (2), jednoduchá cenová rovnice pro znak lze napsat:
Pro druhou generaci:
Jednoduchá cenová rovnice pro dává nám pouze hodnotu pro první generaci, ale nedává nám hodnotu a , které jsou potřebné k výpočtu pro druhou generaci. Proměnné a lze oba považovat za charakteristiky první generace, takže k jejich výpočtu lze použít i cenovou rovnici:
Pět proměnných 0 generace , , , , a musí být známy před pokračováním ve výpočtu tří proměnných první generace , , a , které jsou potřebné k výpočtu pro druhou generaci. Je vidět, že cenovou rovnici nelze obecně použít k šíření vpřed v čase, pokud neexistuje způsob výpočtu vyšších momentů a z nižších momentů způsobem, který je nezávislý na generaci. Dynamická dostatečnost znamená, že takové rovnice lze nalézt v genetickém modelu, což umožňuje použít cenovou rovnici samostatně jako propagátor dynamika modelu dopředu v čase.
Plná cenová rovnice
Jednoduchá cenová rovnice byla založena na předpokladu, že znaky nemění se během jedné generace. Pokud se předpokládá, že se skutečně změní, s Jelikož jde o hodnotu znaku v dětské populaci, musí být použita celá cenová rovnice. Ke změně charakteru může dojít mnoha způsoby. Následující dva příklady ilustrují dvě takové možnosti, z nichž každá zavádí nový vhled do cenové rovnice.
Genotyp fitness
Zaměřujeme se na myšlenku vhodnosti genotypu. Index označuje genotyp a počet typů genotypy v dětské populaci jsou:
který dává fitness:
Protože individuální proměnlivost se nemění, průměrné proměnlivosti budou:
s těmito definicemi nyní platí jednoduchá cenová rovnice.
Rodinná kondice
V tomto případě se chceme podívat na myšlenku, že zdatnost se měří počtem dětí, které má organismus, bez ohledu na jejich genotyp. Všimněte si, že nyní máme dvě metody seskupování, podle počtu řádků a podle genotypu. Právě tato komplikace zavede potřebu úplné cenové rovnice. Počet dětí a -typ organismus má:
který dává fitness:
Nyní máme v dětské populaci znaky, které jsou průměrným charakterem -tý rodič.
s globálními znaky:
s těmito definicemi nyní platí úplná cenová rovnice.
Kritika
Využití změny průměrné charakteristiky () na generaci jako měřítko evolučního pokroku není vždy vhodné. Mohou nastat případy, kdy průměr zůstane nezměněn (a kovariance mezi zdatností a charakteristikou je nulová), zatímco evoluce přesto probíhá.
Kritickou diskusi o použití cenové rovnice lze nalézt ve van Veelen (2005)[3], van Veelen et al. (2012),[4] a van Veelen (2020)[5]. Frank (2012) pojednává o kritice ve Van Veelen et al. (2012).[6]
Kulturní odkazy
Priceova rovnice je uvedena v zápletce a názvu thrilleru z roku 2008 WΔZ.
Cenová rovnice je také uvedena na plakátech v počítačové hře BioShock 2, ve kterém je spotřebitel tonika „Brain Boost“ viděn při odvozování cenové rovnice při současném čtení knihy. Hra se odehrává v padesátých letech minulého století, podstatně před Priceovou prací.
Viz také
Reference
- ^ Knudsen, Thorbjørn (2004). „Obecná teorie výběru a ekonomický vývoj: Cenová rovnice a rozlišení replikátoru / interagátoru“. Journal of Economic Methodology. 11 (2): 147–173. doi:10.1080/13501780410001694109. S2CID 154197796. Citováno 2011-10-22.
- ^ Cena, G.R. (1972). „Fisherova„ základní věta “byla„ jasná “. Annals of Human Genetics. 36 (2): 129–140. doi:10.1111 / j.1469-1809.1972.tb00764.x. PMID 4656569. S2CID 20757537.
- ^ van Veelen, M. (prosinec 2005). "O použití cenové rovnice". Journal of Theoretical Biology. 237 (4): 412–426. doi:10.1016 / j.jtbi.2005.04.026. PMID 15953618.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
- ^ van Veelen, M .; García, J .; Sabelis, M.W .; Egas, M. (duben 2012). „Skupinový výběr a inkluzivní zdatnost nejsou ekvivalentní; cenová rovnice vs. modely a statistiky“. Journal of Theoretical Biology. 299: 64–80. doi:10.1016 / j.jtbi.2011.07.025. PMID 21839750.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
- ^ van Veelen, M. (březen 2020). „Problém s cenovou rovnicí“. Filozofické transakce královské společnosti B. 375 (1797): 1–13. doi:10.1098 / rstb.2019.0355. PMC 7133513. PMID 32146887.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
- ^ Frank, S.A. (2012). "Přirozený výběr IV: Cenová rovnice". Journal of Evolutionary Biology. 25 (6): 1002–1019. arXiv:1204.1515. doi:10.1111 / j.1420-9101.2012.02498.x. PMC 3354028. PMID 22487312.
Další čtení
- Frank, S.A. (1995). „Příspěvky George Price k evoluční genetice“ (PDF). Journal of Theoretical Biology. 175 (3): 373–388. CiteSeerX 10.1.1.136.7803. doi:10.1006 / jtbi.1995.0148. PMID 7475081.
- Frank, S.A. (1997). „Cenová rovnice, Fisherova základní věta, výběr kin a kauzální analýza“ (PDF). Vývoj. 51 (6): 1712–1729. doi:10.2307/2410995. JSTOR 2410995. PMID 28565119.
- Gardner, A. (2008). „Cenová rovnice“ (PDF). Curr. Biol. 18 (5): R198 – R202. doi:10.1016 / j.cub.2008.01.005. PMID 18334191. S2CID 1169263. Archivovány od originál (PDF) dne 16. 12. 2008.
- Grafen, A. (2000). „Vývoj cenové rovnice a přirozený výběr za nejistoty“ (PDF). Sborník královské společnosti B. 267 (1449): 1223–1227. doi:10.1098 / rspb.2000.1131. PMC 1690660. PMID 10902688.
- Harman, Oren (2010). Cena altruismu: George Price a hledání původu laskavosti. Bodley Head. ISBN 978-1-84792-062-1.
- Langdon, W.B. (1998). „8.1 Vývoj populací praktických lékařů: Věta o výběru a kovarianční větě“. Genetické programování a datové struktury. str.167 –208.
- Cena, G.R. (1970). "Výběr a kovariance" (PDF). Příroda. 227 (5257): 520–521. Bibcode:1970Natur.227..520P. doi:10.1038 / 227520a0. PMID 5428476. S2CID 4264723.
- Cena, G.R. (1972). "Rozšíření matematiky výběru kovariancí". Annals of Human Genetics. 35 (4): 485–490. doi:10.1111 / j.1469-1809.1957.tb01874.x. PMID 5073694. S2CID 37828617.
- van Veelen, Matthijs; García, Julián; Sabelis, Maurice W. & Egas, Martijn (2010). „Volání po návratu k přísnosti u modelů“. Korespondence. Příroda. 467 (7316): 661. Bibcode:2010Natur.467..661V. doi:10.1038 / 467661d. PMID 20930826.
- Day, T. (2006). „Pohledy z Priceovy rovnice na evoluční epidemiologii“. Pohledy z Priceovy rovnice na evoluční epidemiologii. Řada DIMACS v diskrétní matematice a teoretické informatice. 71. 23–43. doi:10.1090 / dimacs / 071/02. ISBN 9780821837535.
- „Jak ukončit cenovou rovnici: Výukový program online“.
- "Dobrá show". Radiolab. Sezóna 9. Epizoda 1. New York. 14. prosince 2011. WNYC.
- Markovitch; Witkowski; Panna (2018). "Chemická dědičnost jako výběr skupiny na molekulární úrovni". arXiv:1802.08024 [q-bio.PE ].