Zářez 2 - Notch 2

Zářez 2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2OO4
Identifikátory
Aliasy	Zářez 2AGS2, HJCYS, hN2, Notch-2, notch 2, notch receptor 2
Externí ID	OMIM: 600275 MGI: 97364 HomoloGene: 7865 Genové karty: Zářez 2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	120,100,779 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	98,150,361 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita signálního receptoru;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • receptorový komplex; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • nukleoplazma; • extracelulární oblast; • povrch buňky; • buněčné jádro;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • diferenciace buněk; • krvetvorba; • morfogeneze plicní chlopně; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace přenosu signálu proteinu Ras; • negativní regulace apoptotického procesu; • diferenciace B buněk okrajové zóny; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj nervového systému; • udržování populace kmenových buněk; • vývoj mnohobuněčných organismů; • morfogeneze síňového septa; • regulace vývojového procesu; • přestavba kostí; • zástava buněčného cyklu; • morfogeneze zvířecích orgánů; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Signalizace zářezu zapojená do vývoje srdce; • apoptotický proces; • stanovení osudu buňky; • intracelulární receptorová signální dráha; • negativní regulace genové exprese; • negativní regulace rychlosti růstu; • pozitivní regulace kaskády ERK1 a ERK2; • regulace vývoje osteoklastů; • pozitivní regulace množení keratinocytů; • regulace reorganizace aktinového cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4853
	18129
	ENSG00000134250
	ENSMUSG00000027878
	Q04721
	O35516
	NM_001200001; NM_024408
	NM_010928
	NP_001186930; NP_077719
	NP_035058
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Neurogenní lokusový zářezový homologní protein 2 také známý jako zářez 2 je protein že u lidí je kódován Zářez 2 gen.^[5]

NOTCH2 je spojen s Alagilleův syndrom^[6] a Hajdu – Cheneyův syndrom.^[7]

Funkce

Zářez 2 je členem zářez rodina. Členové této rodiny transmembránových proteinů typu 1 sdílejí strukturní charakteristiky včetně extracelulární domény sestávající z několika podobných epidermálních růstových faktorů (EGF ) repetice a intracelulární doména skládající se z více různých typů domén. Členové rodiny Notch hrají roli v různých vývojových procesech řízením rozhodnutí o osudu buněk. Signální síť Notch je evolučně konzervovaná mezibuněčná signální cesta, která reguluje interakce mezi fyzicky sousedícími buňkami. v Drosophilia, vrubová interakce s jeho ligandy vázanými na buňky (delta, pilovitý) vytváří mezibuněčnou signální cestu, která hraje klíčovou roli ve vývoji. Homologové zářezových ligandů byly také identifikovány u člověka, ale je třeba určit přesné interakce mezi těmito ligandy a lidskými zářezovými homology. Tento protein je štěpen v trans-Golgiho síť a prezentovány na buněčném povrchu jako heterodimer. Tento protein funguje jako receptor pro ligandy vázané na membránu a může hrát roli při vývoji cév, ledvin a jater.^[8]

Mutace v posledním exonu kódování z Notch2 které odstraňují ŠKŮDCE domény a uniknout nesmyslem zprostředkovaný rozpad mRNA bylo prokázáno, že je hlavní příčinou Hajdu-Cheneyův syndrom.^[9]^[10]^[11]

Interakce

NOTCH2 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134250 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027878 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Larsson C, Lardelli M, White I, Lendahl U (květen 1995). „Lidské geny NOTCH1, 2 a 3 jsou umístěny na pozicích chromozomu 9q34, 1p13-p11 a 19p13.2-p13.1 v oblastech translokace spojené s neoplazií.“ Genomika. 24 (2): 253–8. doi:10.1006 / geno.1994.1613. PMID 7698746.
^ Samejima H, Torii C, Kosaki R, Kurosawa K, Yoshihashi H, Muroya K, Okamoto N, Watanabe Y, Kosho T, Kubota M, Matsuda O, Goto M, Izumi K, Takahashi T, Kosaki K (2007). "Screening mutací Alagilleova syndromu v genech JAG1 a NOTCH2 pomocí denaturace vysoce účinné kapalinové chromatografie". Genet. Test. 11 (3): 216–27. doi:10.1089 / gte.2006.0519. PMID 17949281.
^ Simpson MA, Irving MD, Asilmaz E, Gray MJ, Dafou D, Elmslie FV, Mansour S, Holder SE, Brain CE, Burton BK, Kim KH, Pauli RM, Aftimos S, Stewart H, Kim CA, Holder-Espinasse M, Robertson SP, Drake WM, Trembath RC (06.03.2011). „Mutace v NOTCH2 způsobují Hajdu-Cheneyův syndrom, poruchu těžké a progresivní ztráty kostní hmoty“. Genetika přírody. 43 (4): 303–5. doi:10,1038 / ng.779. PMID 21378985.
^ „Entrez Gene: NOTCH2 Notch homolog 2 (Drosophila)“.
^ Simpson MA, Irving MD, Asilmaz E, Gray MJ, Dafou D, Elmslie FV, Mansour S, Holder SE a kol. (2011). „Mutace v NOTCH2 způsobují Hajdu-Cheneyův syndrom, poruchu těžké a progresivní ztráty kostní hmoty“. Genetika přírody. 43 (4): 303–305. doi:10,1038 / ng.779. PMID 21378985.
^ Isidor B, Lindenbaum P, Pichon O, Bézieau S, Dina C, Jacquemont S, Martin-Coignard D, Thauvin-Robinet C, Le Merrer M, Mandel JL, David A, Faivre L, Cormier-Daire V, Redon R, Le Caignec C (2011). „Zkrácené mutace v posledním exonu NOTCH2 způsobují vzácnou kosterní poruchu s osteoporózou“. Genetika přírody. 43 (4): 306–8. doi:10.1038 / ng.778. PMID 21378989.
^ Majewski J, Schwartzentruber JA, Caqueret A, Patry L, Marcadier J, Fryns JP, Boycott KM, Ste-Marie LG, McKiernan FE, Marik I, Van Esch H, Michaud JL, Samuels ME (2011). "Mutace v NOTCH2 v rodinách se syndromem Hajdu-Cheneyho". Hum Mutat. 32 (10): 1114–7. doi:10,1002 / humu.21546. PMID 21681853.
^ ^A ^b Shimizu K, Chiba S, Saito T, Kumano K, Takahashi T, Hirai H (červenec 2001). „Manická ofina a lunatická ofina modifikují různá místa extracelulární oblasti Notch2, což vede k odlišné signalizační modulaci“. J. Biol. Chem. 276 (28): 25753–8. doi:10,1074 / jbc.M103473200. PMID 11346656.
^ ^A ^b ^C Shimizu K, Chiba S, Hosoya N, Kumano K, Saito T, Kurokawa M, Kanda Y, Hamada Y, Hirai H (září 2000). „Vazba Delta1, Jagged1 a Jagged2 na Notch2 rychle indukuje štěpení, nukleární translokaci a hyperfosforylaci Notch2“. Mol. Buňka. Biol. 20 (18): 6913–22. doi:10.1128 / mcb.20.18.6913-6922.2000. PMC 88767. PMID 10958687.
^ Blaumueller CM, Qi H, Zagouras P, Artavanis-Tsakonas S (červenec 1997). „Intracelulární štěpení Notch vede k heterodimernímu receptoru na plazmatické membráně“. Buňka. 90 (2): 281–91. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80336-0. PMID 9244302.
^ Espinosa L, Inglés-Esteve J, Aguilera C, Bigas A (srpen 2003). „Fosforylace glykogen syntázou kinázou-3 beta reguluje aktivitu Notch, odkaz na dráhy Notch a Wnt“. J. Biol. Chem. 278 (34): 32227–35. doi:10,1074 / jbc.M304001200. PMID 12794074.
^ Shimizu K, Chiba S, Kumano K, Hosoya N, Takahashi T, Kanda Y, Hamada Y, Yazaki Y, Hirai H (listopad 1999). „Myš zubatá1 fyzicky interaguje s notch2 a jinými receptory notch. Hodnocení kvantitativními metodami“. J. Biol. Chem. 274 (46): 32961–9. doi:10.1074 / jbc.274.46.32961. PMID 10551863.

Další čtení

Artavanis-Tsakonas S, Rand MD, Lake RJ (1999). "Signalizace zářezu: řízení osudu buněk a integrace signálu ve vývoji". Věda. 284 (5415): 770–6. Bibcode:1999Sci ... 284..770A. doi:10.1126 / science.284.5415.770. PMID 10221902.
Kojika S, Griffin JD (2001). "Vrubové receptory a hematopoéza". Exp. Hematol. 29 (9): 1041–52. doi:10.1016 / S0301-472X (01) 00676-2. PMID 11532344.
Schwarzmeier JD, Hubmann R, Düchler M, Jäger U, Shehata M (2005). "Regulace exprese CD23 Notch2 u B lymfocytární chronické lymfocytární leukémie". Leuku. Lymfom. 46 (2): 157–65. doi:10.1080/10428190400010742. PMID 15621797.
Stifani S, Blaumueller CM, Redhead NJ, Hill RE, Artavanis-Tsakonas S (1993). "Lidské homology Drosophila Enhancer produktu štěpeného genu definují novou rodinu jaderných proteinů". Nat. Genet. 2 (2): 119–27. doi:10.1038 / ng1092-119. PMID 1303260.
Katsanis N, Fitzgibbon J, Fisher EM (1996). „Paralogy mapping: identification of region in the human MHC triplicated into human chromozomes 1 and 9 allows the prediction and isolation of new PBX and NOTCH loci“. Genomika. 35 (1): 101–8. doi:10.1006 / geno.1996.0328. PMID 8661110.
Hsieh JJ, Nofziger DE, Weinmaster G, Hayward SD (1997). „Imortalizace viru Epstein-Barr: Notch2 interaguje s CBF1 a blokuje diferenciaci“. J. Virol. 71 (3): 1938–45. PMC 191274. PMID 9032325.
Blaumueller CM, Qi H, Zagouras P, Artavanis-Tsakonas S (1997). „Intracelulární štěpení Notch vede k heterodimernímu receptoru na plazmatické membráně“. Buňka. 90 (2): 281–91. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80336-0. PMID 9244302.
Bigas A, Martin DI, Milner LA (1998). „Notch1 a Notch2 inhibují myeloidní diferenciaci v reakci na různé cytokiny“. Mol. Buňka. Biol. 18 (4): 2324–33. doi:10,1128 / mcb.18.4.2324. PMC 121486. PMID 9528802.
Berezovska O, Xia MQ, Hyman BT (1998). „Notch je exprimován v dospělém mozku, je exprimován společně s presenilinem-1 a je změněn u Alzheimerovy choroby“. J. Neuropathol. Exp. Neurol. 57 (8): 738–45. doi:10.1097/00005072-199808000-00003. PMID 9720489.
Gray GE, Mann RS, Mitsiadis E, Henrique D, Carcangiu ML, Banks A, Leiman J, Ward D, Ish-Horowitz D, Artavanis-Tsakonas S (1999). "Lidské ligandy receptoru Notch". Dopoledne. J. Pathol. 154 (3): 785–94. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 65325-4. PMC 1866435. PMID 10079256.
Shimizu K, Chiba S, Kumano K, Hosoya N, Takahashi T, Kanda Y, Hamada Y, Yazaki Y, Hirai H (2000). „Myš zubatá1 fyzicky interaguje s notch2 a jinými receptory notch. Hodnocení kvantitativními metodami“. J. Biol. Chem. 274 (46): 32961–9. doi:10.1074 / jbc.274.46.32961. PMID 10551863.
Shimizu K, Chiba S, Hosoya N, Kumano K, Saito T, Kurokawa M, Kanda Y, Hamada Y, Hirai H (2000). „Vazba Delta1, Jagged1 a Jagged2 na Notch2 rychle indukuje štěpení, nukleární translokaci a hyperfosforylaci Notch2“. Mol. Buňka. Biol. 20 (18): 6913–22. doi:10.1128 / MCB.20.18.6913-6922.2000. PMC 88767. PMID 10958687.
Wu L, Aster JC, Blacklow SC, Lake R, Artavanis-Tsakonas S, Griffin JD (2001). „MAML1, lidský homolog Drosophila mastermind, je transkripční koaktivátor pro receptory NOTCH“. Nat. Genet. 26 (4): 484–9. doi:10.1038/82644. PMID 11101851.
Sriuranpong V, Borges MW, Ravi RK, Arnold DR, Nelkin BD, Baylin SB, Ball DW (2001). "Signalizace zářezu indukuje zastavení buněčného cyklu v malobuněčných buňkách rakoviny plic". Cancer Res. 61 (7): 3200–5. PMID 11306509.
Shimizu K, Chiba S, Saito T, Kumano K, Takahashi T, Hirai H (2001). „Manická ofina a lunatická ofina modifikují různá místa extracelulární oblasti Notch2, což vede k odlišné signalizační modulaci“. J. Biol. Chem. 276 (28): 25753–8. doi:10,1074 / jbc.M103473200. PMID 11346656.
Saxena MT, Schroeter EH, Mumm JS, Kopan R (2001). "Murine notch homologs (N1-4) podstoupit presenilin-dependent proteolysis". J. Biol. Chem. 276 (43): 40268–73. doi:10,1074 / jbc.M107234200. PMID 11518718.
Inglés-Esteve J, Espinosa L, Milner LA, Caelles C, Bigas A (2002). „Fosforylace Ser2078 moduluje funkci Notch2 v diferenciaci buněk 32D“. J. Biol. Chem. 276 (48): 44873–80. doi:10,1074 / jbc.M104703200. PMID 11577080.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / UW / NIH vstup na Alagilleův syndrom
OMIM záznamy o Alagilleově syndromu
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q04721 (Neurogenic locus notch homolog protein 2) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134250 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027878 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7698746-5] Larsson C, Lardelli M, White I, Lendahl U (květen 1995). „Lidské geny NOTCH1, 2 a 3 jsou umístěny na pozicích chromozomu 9q34, 1p13-p11 a 19p13.2-p13.1 v oblastech translokace spojené s neoplazií.“ Genomika. 24 (2): 253–8. doi:10.1006 / geno.1994.1613. PMID 7698746.

[pmid17949281-6] Samejima H, Torii C, Kosaki R, Kurosawa K, Yoshihashi H, Muroya K, Okamoto N, Watanabe Y, Kosho T, Kubota M, Matsuda O, Goto M, Izumi K, Takahashi T, Kosaki K (2007). "Screening mutací Alagilleova syndromu v genech JAG1 a NOTCH2 pomocí denaturace vysoce účinné kapalinové chromatografie". Genet. Test. 11 (3): 216–27. doi:10.1089 / gte.2006.0519. PMID 17949281.

[pmid21378985-7] Simpson MA, Irving MD, Asilmaz E, Gray MJ, Dafou D, Elmslie FV, Mansour S, Holder SE, Brain CE, Burton BK, Kim KH, Pauli RM, Aftimos S, Stewart H, Kim CA, Holder-Espinasse M, Robertson SP, Drake WM, Trembath RC (06.03.2011). „Mutace v NOTCH2 způsobují Hajdu-Cheneyův syndrom, poruchu těžké a progresivní ztráty kostní hmoty“. Genetika přírody. 43 (4): 303–5. doi:10,1038 / ng.779. PMID 21378985.

[entrez-8] „Entrez Gene: NOTCH2 Notch homolog 2 (Drosophila)“.

[9] Simpson MA, Irving MD, Asilmaz E, Gray MJ, Dafou D, Elmslie FV, Mansour S, Holder SE a kol. (2011). „Mutace v NOTCH2 způsobují Hajdu-Cheneyův syndrom, poruchu těžké a progresivní ztráty kostní hmoty“. Genetika přírody. 43 (4): 303–305. doi:10,1038 / ng.779. PMID 21378985.

[10] Isidor B, Lindenbaum P, Pichon O, Bézieau S, Dina C, Jacquemont S, Martin-Coignard D, Thauvin-Robinet C, Le Merrer M, Mandel JL, David A, Faivre L, Cormier-Daire V, Redon R, Le Caignec C (2011). „Zkrácené mutace v posledním exonu NOTCH2 způsobují vzácnou kosterní poruchu s osteoporózou“. Genetika přírody. 43 (4): 306–8. doi:10.1038 / ng.778. PMID 21378989.

[pmid21681853-11] Majewski J, Schwartzentruber JA, Caqueret A, Patry L, Marcadier J, Fryns JP, Boycott KM, Ste-Marie LG, McKiernan FE, Marik I, Van Esch H, Michaud JL, Samuels ME (2011). "Mutace v NOTCH2 v rodinách se syndromem Hajdu-Cheneyho". Hum Mutat. 32 (10): 1114–7. doi:10,1002 / humu.21546. PMID 21681853.

[pmid11346656-12] A ^b Shimizu K, Chiba S, Saito T, Kumano K, Takahashi T, Hirai H (červenec 2001). „Manická ofina a lunatická ofina modifikují různá místa extracelulární oblasti Notch2, což vede k odlišné signalizační modulaci“. J. Biol. Chem. 276 (28): 25753–8. doi:10,1074 / jbc.M103473200. PMID 11346656.

[pmid10958687-13] A ^b ^C Shimizu K, Chiba S, Hosoya N, Kumano K, Saito T, Kurokawa M, Kanda Y, Hamada Y, Hirai H (září 2000). „Vazba Delta1, Jagged1 a Jagged2 na Notch2 rychle indukuje štěpení, nukleární translokaci a hyperfosforylaci Notch2“. Mol. Buňka. Biol. 20 (18): 6913–22. doi:10.1128 / mcb.20.18.6913-6922.2000. PMC 88767. PMID 10958687.

[pmid9244302-14] Blaumueller CM, Qi H, Zagouras P, Artavanis-Tsakonas S (červenec 1997). „Intracelulární štěpení Notch vede k heterodimernímu receptoru na plazmatické membráně“. Buňka. 90 (2): 281–91. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80336-0. PMID 9244302.

[pmid12794074-15] Espinosa L, Inglés-Esteve J, Aguilera C, Bigas A (srpen 2003). „Fosforylace glykogen syntázou kinázou-3 beta reguluje aktivitu Notch, odkaz na dráhy Notch a Wnt“. J. Biol. Chem. 278 (34): 32227–35. doi:10,1074 / jbc.M304001200. PMID 12794074.

[pmid10551863-16] Shimizu K, Chiba S, Kumano K, Hosoya N, Takahashi T, Kanda Y, Hamada Y, Yazaki Y, Hirai H (listopad 1999). „Myš zubatá1 fyzicky interaguje s notch2 a jinými receptory notch. Hodnocení kvantitativními metodami“. J. Biol. Chem. 274 (46): 32961–9. doi:10.1074 / jbc.274.46.32961. PMID 10551863.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

Signalizační cesta: signální dráha zářezu
Receptor na signální buňce	Delta DLL1 DLL3 DLL4
Ligand	Zubatý JAG1 JAG2
Receptor na přijímací buňce	Zářez 1 Zářez 2 Zářez 3 Zářez 4