Zářez 3 - Notch 3

ZÁŘÍ 3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4ZLP, 5 Kč, 5 Kč
Identifikátory
Aliasy	ZÁŘÍ 3, CADASIL, CASIL, IMF2, LMNS, CADASIL1, zářez 3, zářezový receptor 3
Externí ID	OMIM: 600276 MGI: 99460 HomoloGene: 376 Genové karty: ZÁŘÍ 3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	15,200,995 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	32,166,852 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba enzymu; • kadherinová vazba; • identická vazba na protein; • aktivita signálního receptoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • Golgiho membrána; • receptorový komplex; • buněčná membrána; • nukleoplazma; • extracelulární oblast; • aktinový cytoskelet; • buněčné jádro; • cytosol; • povrch buňky;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace neuronové diferenciace; • negativní regulace buněčné diferenciace; • glomerulární kapilární formace; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj mnohobuněčných organismů; • morfogeneze tepny; • vývoj předního mozku; • neuronový osudový závazek; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace proliferace buněk hladkého svalstva; • regulace vývojového procesu; • pozitivní regulace transkripce cíle receptoru Notch; • Zpracování zářezových receptorů, závislé na ligandu; • negativní regulace signální dráhy Notch;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4854
	18131
	ENSG00000074181
	ENSMUSG00000038146
	Q9UM47
	Q61982
	NM_000435
	NM_008716
	NP_000426
	NP_032742
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Neurogenní lokusový zářezový homologní protein 3 je protein že u lidí je kódován ZÁŘÍ 3 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje třetí objevený lidský homolog zářezu membránového proteinu Drosophilia melanogaster typu I. V Drosophilia, vrubová interakce s jejími buněčně vázanými ligandy (delta, serrate) vytváří mezibuněčnou signální cestu, která hraje klíčovou roli v nervovém vývoji. Homologové vrubových ligandů byly také identifikovány u člověka, ale je třeba určit přesnou interakci mezi těmito ligandy a lidskými vrubovými homology.

Patologie

Mikrograf zobrazeno CADASIL se zářezem 3 imunostain.

Mutace v NOTCH3 byly identifikovány jako základní příčina mozkové autosomálně dominantní arteriopatie se subkortikálním infarktem a leukoencefalopatií (CADASIL ).^[6] Mutace v NOTCH3 byly také identifikovány v turecké rodině s Alzheimerovou chorobou.^[7] Dospělé knock-out myši Notch3 vykazují neúplné neuronální zrání v míšním dorzálním rohu, což vede k trvale zvýšené nociceptivní citlivosti.^[8]Mutace v ZÁŘÍ 3 jsou spojeni s syndrom laterální meningokély.^[9]

Farmaceutický cíl

Notch3 je zkoumán jako cíl pro protinádorová léčiva, protože je nadměrně exprimován u několika typů rakoviny.^[10] Raná klinická hodnocení Pfizer PF-06650808, protilátka proti Notch3 spojená s cytotoxickým léčivem, vykazovala účinnost proti solidním nádorům.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000074181 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038146 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sugaya K, Fukagawa T, Matsumoto K, Mita K, Takahashi E, Ando A, Inoko H, Ikemura T (15. září 1994). „Tři geny v oblasti lidského MHC třídy III poblíž spojení s třídou II: gen pro receptor konečných produktů pokročilé glykosylace, gen PBX2 homeobox a homolog zářezu, lidský protějšek genu myšího nádoru prsu int-3. Genomika. 23 (2): 408–19. doi:10.1006 / geno.1994.1517. PMID 7835890.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NOTCH3 Notch homolog 3 (Drosophila)“.
^ Guerreiro RJ, Lohmann E, Kinsella E, Brás JM, Luu N, Gurunlian N, Dursun B, Bilgic B, Santana I, Hanagasi H, Gurvit H, Gibbs JR, Oliveira C, Emre M, Singleton A (2012). „Exome sekvenování odhaluje neočekávané genetické příčiny nemoci: mutace NOTCH3 v turecké rodině s Alzheimerovou chorobou“. Neurobiol. Stárnutí. 33 (5): 1008.e17–23. doi:10.1016 / j.neurobiolaging.2011.10.009. PMC 3306507. PMID 22153900.
^ Rusanescu G, Mao J (2014). „Notch3 je nezbytný pro neuronální diferenciaci a zrání v míchě dospělých“. J. Cell. Mol. Med. 18 (10): 2103–16. doi:10,1111 / jcmm.12362. PMC 4244024. PMID 25164209.
^ Gripp KW, Robbins KM, Sobreira NL, Witmer PD, Bird LM, Avela K, Makitie O, Alves D, Hogue JS, Zackai EH, Doheny KF, Stabley DL, Sol-Church K (2014). "Zkrácení mutací v posledním exonu NOTCH3 způsobuje syndrom laterální meningokély". Dopoledne. J. Med. Genet. A. 167A (2): 271–81. doi:10,1002 / ajmg.a.36863. PMC 5589071. PMID 25394726.
^ Purow, B (2012). „Inhibice zářezu jako slibný nový přístup k léčbě rakoviny“. Signalizace zářezu v embryologii a rakovině. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 727. 305–319. doi:10.1007/978-1-4614-0899-4_23. ISBN 978-1-4614-0898-7. PMC 3361718. PMID 22399357.
^ http://adcreview.com/pfizer-adc-development-overview-2016/

Další čtení

Lewis J (1996). "Neurogenní geny a neurogeneze obratlovců". Curr. Opin. Neurobiol. 6 (1): 3–10. doi:10.1016 / S0959-4388 (96) 80002-X. PMID 8794055. S2CID 2921624.
Joutel A, Tournier-Lasserve E (2002). "[Molekulární podstata a fyziopatogenní mechanismy CADASILU: model onemocnění mozku malých cév]". J. Soc. Biol. 196 (1): 109–15. doi:10.1051 / jbio / 2002196010109. PMID 12134625.
Guidetti D, Casali B, Mazzei RL, Dotti MT (2006). "Mozková autozomálně dominantní arteriopatie se subkortikálním infarktem a leukoencefalopatií". Clin. Exp. Hyperteny. 28 (3–4): 271–7. doi:10.1080/10641960600549223. PMID 16833034. S2CID 360190.
Beleil OM, Mickey MR, Terasaki PI (1972). "Srovnání míry přežití transplantovaných ledvin mužského a ženského pohlaví". Transplantace. 13 (5): 493–500. doi:10.1097/00007890-197205000-00008. PMID 4557798. S2CID 32855236.
Larsson C, Lardelli M, White I, Lendahl U (1994). „Lidské geny NOTCH1, 2 a 3 jsou umístěny na pozicích chromozomu 9q34, 1p13-p11 a 19p13.2-p13.1 v oblastech translokace spojené s neoplazií.“ Genomika. 24 (2): 253–8. doi:10.1006 / geno.1994.1613. PMID 7698746.
Tournier-Lasserve E, Joutel A, Melki J, Weissenbach J, Lathrop GM, Chabriat H, Mas JL, Cabanis EA, Baudrimont M, Maciazek J (1993). "Mozková autozomálně dominantní arteriopatie se subkortikálním infarktem a mapami leukoencefalopatie na chromozom 19q12". Nat. Genet. 3 (3): 256–9. doi:10.1038 / ng0393-256. PMID 8485581. S2CID 13031278.
Joutel A, Corpechot C, Ducros A, Vahedi K, Chabriat H, Mouton P, Alamowitch S, Domenga V, Cécillion M, Marechal E, Maciazek J, Vayssiere C, Cruaud C, Cabanis EA, Ruchoux MM, Weissenbach J, Bach JF , Bousser MG, Tournier-Lasserve E (1996). „Mutace Notch3 v CADASILu, dědičném stavu nástupu dospělého, který způsobuje mrtvici a demenci“. Příroda. 383 (6602): 707–10. Bibcode:1996 Natur.383..707J. doi:10.1038 / 383707a0. PMID 8878478. S2CID 4351873.
Joutel A, Vahedi K, Corpechot C, Troesch A, Chabriat H, Vayssière C, Cruaud C, Maciazek J, Weissenbach J, Bousser MG, Bach JF, Tournier-Lasserve E (1997). "Silná shlukování a stereotypní povaha mutací Notch3 u pacientů s CADASIL". Lanceta. 350 (9090): 1511–5. doi:10.1016 / S0140-6736 (97) 08083-5. PMID 9388399. S2CID 38044421.
Gray GE, Mann RS, Mitsiadis E, Henrique D, Carcangiu ML, Banks A, Leiman J, Ward D, Ish-Horowitz D, Artavanis-Tsakonas S (1999). "Lidské ligandy receptoru Notch". Dopoledne. J. Pathol. 154 (3): 785–94. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 65325-4. PMC 1866435. PMID 10079256.
Joutel A, Andreux F, Gaulis S, Domenga V, Cecillon M, Battail N, Piga N, Chapon F, Godfrain C, Tournier-Lasserve E (2000). „Ektodoména receptoru Notch3 se hromadí v cerebrovaskulatuře pacientů s CADASILem“. J. Clin. Investovat. 105 (5): 597–605. doi:10.1172 / JCI8047. PMC 289174. PMID 10712431.
Joutel A, Dodick DD, Parisi JE, Cecillon M, Tournier-Lasserve E, Bousser MG (2000). "De novo mutace v genu Notch3 způsobující CADASIL". Ann. Neurol. 47 (3): 388–91. doi:10.1002 / 1531-8249 (200003) 47: 3 <388 :: AID-ANA19> 3.0.CO; 2-Q. PMID 10716263.
Joutel A, Chabriat H, Vahedi K, Domenga V, Vayssière C, Ruchoux MM, Lucas C, Leys D, Bousser MG, Tournier-Lasserve E (2000). Msgstr "Mutace místa sestřihu způsobující deleci sedmi aminokyselin Notch3 v rámci v CADASIL". Neurologie. 54 (9): 1874–5. doi:10.1212 / mn. 54.9.1874. PMID 10802807. S2CID 19374887.
Shimizu K, Chiba S, Saito T, Kumano K, Hirai H (2000). "Fyzická interakce Delta1, Jagged1 a Jagged2 s receptory Notch1 a Notch3". Biochem. Biophys. Res. Commun. 276 (1): 385–9. doi:10,1006 / bbrc.2000.3469. PMID 11006133.
Wu L, Aster JC, Blacklow SC, Lake R, Artavanis-Tsakonas S, Griffin JD (2000). „MAML1, lidský homolog Drosophila mastermind, je transkripční koaktivátor pro receptory NOTCH“. Nat. Genet. 26 (4): 484–9. doi:10.1038/82644. PMID 11101851. S2CID 23335042.
Beatus P, Lundkvist J, Oberg C, Pedersen K, Lendahl U (2001). „Původ ankyrinové repetiční oblasti v intracelulárních doménách Notch je rozhodující pro regulaci aktivity HES promotoru“. Mech. Dev. 104 (1–2): 3–20. doi:10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2. PMID 11404076. S2CID 9526831.
Saxena MT, Schroeter EH, Mumm JS, Kopan R (2001). "Murine notch homologs (N1-4) podstoupit presenilin-dependent proteolysis". J. Biol. Chem. 276 (43): 40268–73. doi:10,1074 / jbc.M107234200. PMID 11518718.
Oliveri RL, Muglia M, De Stefano N, Mazzei R, Labate A, Conforti FL, Patitucci A, Gabriele AL, Tagarelli G, Magariello A, Zappia M, Gambardella A, Federico A, Quattrone A (2001). „Nová mutace v genu Notch3 v italské rodině s mozkovou autozomálně dominantní arteriopatií se subkortikálními infarkty a leukoencefalopatií: spektroskopické nálezy genetické a magnetické rezonance“. Oblouk. Neurol. 58 (9): 1418–22. doi:10.1001 / archneur.58.9.1418. PMID 11559313.
Dichgans M, Herzog J, Gasser T (2001). "Mutace NOTCH3 zahrnující tři cysteinové zbytky v rodině s typickým CADASILem". Neurologie. 57 (9): 1714–7. doi:10.1212 / mnn 57. 17.1714. PMID 11706120. S2CID 21180235.

externí odkazy

NOTCH3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000074181 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038146 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7835890-5] Sugaya K, Fukagawa T, Matsumoto K, Mita K, Takahashi E, Ando A, Inoko H, Ikemura T (15. září 1994). „Tři geny v oblasti lidského MHC třídy III poblíž spojení s třídou II: gen pro receptor konečných produktů pokročilé glykosylace, gen PBX2 homeobox a homolog zářezu, lidský protějšek genu myšího nádoru prsu int-3. Genomika. 23 (2): 408–19. doi:10.1006 / geno.1994.1517. PMID 7835890.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: NOTCH3 Notch homolog 3 (Drosophila)“.

[pmid22153900-7] Guerreiro RJ, Lohmann E, Kinsella E, Brás JM, Luu N, Gurunlian N, Dursun B, Bilgic B, Santana I, Hanagasi H, Gurvit H, Gibbs JR, Oliveira C, Emre M, Singleton A (2012). „Exome sekvenování odhaluje neočekávané genetické příčiny nemoci: mutace NOTCH3 v turecké rodině s Alzheimerovou chorobou“. Neurobiol. Stárnutí. 33 (5): 1008.e17–23. doi:10.1016 / j.neurobiolaging.2011.10.009. PMC 3306507. PMID 22153900.

[pmid25164209-8] Rusanescu G, Mao J (2014). „Notch3 je nezbytný pro neuronální diferenciaci a zrání v míchě dospělých“. J. Cell. Mol. Med. 18 (10): 2103–16. doi:10,1111 / jcmm.12362. PMC 4244024. PMID 25164209.

[9] Gripp KW, Robbins KM, Sobreira NL, Witmer PD, Bird LM, Avela K, Makitie O, Alves D, Hogue JS, Zackai EH, Doheny KF, Stabley DL, Sol-Church K (2014). "Zkrácení mutací v posledním exonu NOTCH3 způsobuje syndrom laterální meningokély". Dopoledne. J. Med. Genet. A. 167A (2): 271–81. doi:10,1002 / ajmg.a.36863. PMC 5589071. PMID 25394726.

[10] Purow, B (2012). „Inhibice zářezu jako slibný nový přístup k léčbě rakoviny“. Signalizace zářezu v embryologii a rakovině. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 727. 305–319. doi:10.1007/978-1-4614-0899-4_23. ISBN 978-1-4614-0898-7. PMC 3361718. PMID 22399357.

[11] ttp://adcreview.com/pfizer-adc-development-overview-2016/

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Signalizační cesta: signální dráha zářezu
Receptor na signální buňce	Delta DLL1 DLL3 DLL4
Ligand	Zubatý JAG1 JAG2
Receptor na přijímací buňce	Zářez 1 Zářez 2 Zářez 3 Zářez 4